| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3209213 | 121 (0.920) | 3 (0.020) | 3/480 | 12.3 | 2.5% | coding (1190/1464 nt) | ttdT | L‑tartrate/succinate antiporte |
| ? | NC_000913 | = 3209256 | 117 (0.930) | coding (1233/1464 nt) | ttdT | L‑tartrate/succinate antiporte | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
CATTATCAGTTGGGACGACATTGTCAGTAATAAAGCGGCGTGGAACGTTTTCTTCTGGCTGGCCTCGCTTATCACCCTCGCCACCGGACTCAACAACACCGGTTTTATTAGCTGGTTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTGGGGAGCATTCTTACAC‑CATACGCCACCGGCCCCAGTCCGATTTACTACGGCAGTGGTTATCTGCCAACGGCGGATTACTGGCGACTGGGGGCGATTTTTGGGCTGATATTCCTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATA > NC_000913/3208995‑3209526 | cattagtatgctggACGACATTGTCAGTAATAAAGCGGCGTGGAACGTTTTCTTCTGGCTGGACTAGCTTATCACCCTCGCCACCGGACTCAACAACACCGGTTTTATTAGTTGGTTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGcc < 4:237909/264‑1 (MQ=255)cATTATCAGTTGGGACGACATTGTCAGTAATAAAGCGGCGTGGAACGTTTTCTTCTGGCTGGCCTCGCTTATCACCCTCGCCACCGGACTCAACAACACCGGTTTTATTAGCTGGTTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCTAGCGCCACGGCGTATACCGCCGCTCTCGCACCGATGAGGATTGCTGCTGCGCTGGCGCTGc > 2:20221/1‑275 (MQ=255) gTTGGGAGAAGACTGTCAGTAATGAGACGGCAGGGAACGTTTGGTTCGGGTTGGCCGAGCTTATCACCCTGCCCCCCGGACTTAACAACACCGGGTTTATTAGCTGGTTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTAGTGGTGGCGTTGATTGTGTTGTTTTATCTACTGCGCTGCTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGaaaaagtagcg < 3:355324/274‑11 (MQ=255) gTTGGGACGACATTGTCAGTAATAAAGCGGCGTGGAACGTTTTCTTCTGGCTGGCCTCGCTTATCACCCTCGCCACCGGACTCAACAACACCGGTTTTATTAGCTGGTTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCAAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTTCGCTAATTGTTCGCCAGCGCCAGGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGGTGATTGCTGCTTCGCTGGCGCTGCCGGAAAt > 1:302844/1‑274 (MQ=255) gTTGGGACGACATTGTCAGTAATAAAGCGGCGTGGAACGTTTTCTTCTGGCTGGCCTCGCTTATCACCCTCGCCACCGAACTCAACAACACCGGGTTTATTAGCGGGTTTGTCAACATGTTAGCCGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCATCGATGGTGATGGTGGCGTTGTGTGATGTGTTTTATCTAACGGACTACTTGTTCGACAGCGCCAAGGCGTATACCTACGCTCTCGCAGTGATTCAGATTGCTGCTGAGCTGGCGATGGCGGAAATc > 4:400247/1‑275 (MQ=255) gggACGACATTGTCAGTAATAAAGCGGCGTGGAACGTTTTCTTCTGGCTGGCCTCGCTTATCACCCTCGCCACCGGACTCAACAACACCGGTTTTATTAGCTGGTTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATTTACTGCGCTACTTTTTCGCAAGCGCCACGGCGTATCCTTCCGCTCTATTCGCGATGTTGATGCCTGCTGCGCTTGCGATGCCGAACATCCCg > 4:605407/1‑275 (MQ=255) gggACGACATTGTCAGTAATAAAGCGGCGTGGAACGTTTTCTTCTGGCTGGCCTCGCTTATCACACTCGCCACCGGACTCAACAACACCGGTTTTATTAGCTGGTTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGATATTCGCCAACGATGGTGAGGGTGGCGTTGATCGTGGTGTTTTATCTACTGTGCTACTTTTTCGTCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCCCCCGCCACCATGATAATTGCGGCTGCGTTGGTGATGCGGGAAATccc > 3:359770/1‑274 (MQ=255) gacgacATTGTCAGTAATAAAGCGGCGTGGAACGTTTTCTTCTGGCTGGCCTCGCTTATCACCCTCGCCACCGGACTCAACAACACCGGTTTTATTAGCTGGTTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTGTATCTACTGCGCTCCTTTTTCGCCAGCGCACCGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCt > 1:484555/1‑275 (MQ=255) acATTGTCAGTAATAAAGCGGCGTGGAACGTTTTCTTCTGGCTGGCCTCGCTTATCACCCTCGCCACCGGACTCAACAACACCGGTTTTANTAGCTGGTTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCACCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGGTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATCCCGCCGCCCTCGCACCGATGCTGTTTGAGGCTGCGCTGGCGCTGCCGGAGACCCCGCtctg > 4:350880/1‑271 (MQ=255) ggaaggaataaAGCGGCGTGGGACTTTTTCTGCTGGCTGGCCTTGCTTATCACCCTCGCCACCGGACTCAACAACACCGGTTTTATTAGCTGGTTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGtt < 4:91383/269‑1 (MQ=255) gTCAGTAATAAAGCGGCGTGGAACGTTTTCTTCTGGCTGGCCTCGCTTATCACCCTCGCCACCGGACTCAACAACACCGGTTTTATTAGCTGGTTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGAGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGATACTTTTTCGCCATCGCCACGGCGTATACCTCCCCCTCCGCCCCGATGATGATTGCTGCTGCGCCGGCGATTCCGGAAATCCCGCTTCCGGtttt > 3:422434/1‑275 (MQ=255) gTCAGTAATAAAGCGGCGTGGAACGTTTTCTTCTGGATGGCCTCGCTTATCACCATCGCCACCGGACTCAACAACACCGGTTTTATTAGCTGGTGTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGAGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGtt < 2:558543/275‑1 (MQ=255) aGTAATAAAGCGGCGTGGAACGTTTTCTTCTGGCTGGCCTCGCTTATCACCCTCGCCACCGGACTCAACAACACCGGTTTTATTAGCTGGTTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTGTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCTATGCCGGAAACCCCGCTGCCGGTGTTCTGc > 4:598696/1‑276 (MQ=255) taataaAGCGGCGTGGAACGTTTTCTTCTGGCTGGCCTCGCTTATCACCCTCGCCACCGGACTCAACAACACCGGTTTTATTAGCTGGTTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGc < 1:564135/274‑1 (MQ=255) taaAGCGGCGTGGAACGTTTTCTTCTGGCTGGCCTCGCTTATCACCCTCGCCACCGGACTCAACAACACCGGTTTTATTAGCTGGTTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTACACCTCCGCTCTCGCACCGATGATTATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCCCCCGGTGTTCCGCCTGa > 3:57293/1‑275 (MQ=255) aGCGGCGTGGAACGTTTTCTTCTGGCTGGCCTCGCTTATCACCCTCGCCACCGGACTCAACAACACCGGTTTTATTAGCTGGTTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGAtgg > 3:12611/1‑275 (MQ=255) 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cgTGGAACGTTTTCTTCTGGCTGGCCTCGCTTATCACCCTCGCCACCGGACTCAACAACACCGGTTTTATTAGCTGGTTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGAtggttggt > 3:303076/1‑275 (MQ=255) cgTGGAACGTTTTCTTCTGGCTGGCCTCGCTTATCACCCTCGCCACCGGACTCAACAACACCGGTTTTATTAGCTGGTTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTGTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCTGCTCTCGCACCCATCATTATTGCTCCCCCGCTGGCGTGGCCCGACATCCCGCTGCCGGTGTGCTCCCTGAtggtctgcg > 4:27790/1‑271 (MQ=255) ttttCTTCTGGCTGGCCTCGCTTATCACCCTCGCCACCGGACTCAACAACACCGGTTTTATTAGCTGGTTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAAtt < 1:471312/275‑1 (MQ=255) 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tctgggCTCGCTTATCACCCTCGCCACCGGACTCAACAACACCGGTTTTATTAGCTGGTTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTGGGGAg < 2:492466/275‑1 (MQ=255) gtggtccTTGCTTATCGCCCTCGCCACCGTACTCAAAAACACCGGTTTTATTAGGTGGTTTGGCAGACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTGGGGAg < 4:603392/271‑1 (MQ=255) gctggctcagCTTATCACCCTCGCCACCGGAGTCAACAACACCGGTTTTATTAGCTGGTTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTGGGGAg < 4:317515/267‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |