| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 321549 = | 74 (1.140) | 7 (0.110) | 6/248 | NT | 9.6% | intergenic (+468/‑59) | rclR/ykgE | reactive chlorine species (RCS)‑specific activator of the rcl genes/cysteine‑rich LutA family protein; putative electron transport chain YkgEFG component |
| ? | NC_000913 | 321566 = | 61 (0.990) | intergenic (+485/‑42) | rclR/ykgE | reactive chlorine species (RCS)‑specific activator of the rcl genes/cysteine‑rich LutA family protein; putative electron transport chain YkgEFG component | |||||
GCGATGCCGAAAGAAATAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCACGAGACTCCGTGCTGCTACTGGAAAAACTCGGCTGTCGCGTAAATTTCCC > NC_000913/321419‑321714 | gCGATGCCGAAAGAAATAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGaaa > 3:332665/1‑149 (MQ=255) gagtttttccagtagcagcacggagtctcgtgccattcttgatttcagggcgtcaccaatacaggtgacaaagaaattgacattcacaactaatactccattacttcatgcccatttatgcccgatgttTCCCCCCCGGTGGGGGGGaa > 2:219228‑M1/130‑149 (MQ=255) cGATGCCGAAAGAAATAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAAc < 2:448669/149‑1 (MQ=255) gaaagaaaTAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGc > 2:53610/1‑149 (MQ=255) tAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATgg < 1:354719/149‑1 (MQ=255) tATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTa < 3:67695/149‑1 (MQ=255) ttGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCg > 2:486334/1‑126 (MQ=255) ttGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCg < 1:486334/126‑1 (MQ=255) ttGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAAt > 1:335014/1‑149 (MQ=255) tGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATg < 1:72602/149‑1 (MQ=255) gCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATgg > 3:238425/1‑149 (MQ=255) cATTTGATGTTTGGCTGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGACATATTTATTGATGATTAATCCCCC‑‑GGTGGGAGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAAgggc < 2:227609/149‑2 (MQ=255) cATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGa < 2:343666/149‑1 (MQ=255) cATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGa < 4:332665/149‑1 (MQ=255) cATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGa < 1:315464/149‑1 (MQ=255) aTTTGACGTTTGGATAAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTAATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAg < 2:173074/149‑1 (MQ=255) gACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATg > 1:23/1‑142 (MQ=255) gACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATg < 2:23/142‑1 (MQ=255) tcttgatttcagggcgtcaccaatacaggtgacaaagaaattgacattcacaactaatactccattacttcatgcccatttatgcccgatgttTCCCCCCCGGTGGGGGGGaaa < 1:305211‑M1/21‑1 (MQ=255) tcttgatttcagggcgtcaccaatacaggtgacaaagaaattgacattcacaactaatactccattacttcatgcccatttatgcccgatgttTCCCCCCCGGTGGGGGGGaaa > 2:305211‑M1/94‑114 (MQ=255) ttgatttcagggcgtcaccaatacaggtgacaaagaaattgacattcacaactaatactccattacttcatgcccatttatgcccgatgttTCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCgg < 1:312800‑M1/25‑1 (MQ=255) ttgatttcagggcgtcaccaatacaggtgacaaagaaattgacattcacaactaatactccattacttcatgcccatttatgcccgatgttTCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCgg > 2:312800‑M1/92‑116 (MQ=255) gTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGt > 2:21515/1‑149 (MQ=255) gATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGa > 3:136406/1‑149 (MQ=255) tGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAAt > 2:432153/1‑149 (MQ=255) tGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAAt > 4:485044/1‑149 (MQ=255) aTTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAAt < 2:144606/149‑1 (MQ=255) aTTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAAt > 1:280282/1‑149 (MQ=255) aTCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTc > 1:497899/1‑149 (MQ=255) tCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCt < 2:412945/149‑1 (MQ=255) aTTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCttt < 2:309429/149‑1 (MQ=255) aTTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCttt < 2:497899/149‑1 (MQ=255) tttGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTg > 1:49697/1‑149 (MQ=255) gTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCa > 1:168121/1‑149 (MQ=255) aTACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCt > 3:128607/1‑149 (MQ=255) tACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCtt > 3:518514/1‑140 (MQ=255) tACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCtt < 4:518514/140‑1 (MQ=255) tACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTg > 4:157686/1‑149 (MQ=255) tACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAATAATGGAGTATTAGTtgt < 1:308485/125‑1 (MQ=255) tACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAATAATGGAGTATTAGTtgt > 2:308485/1‑125 (MQ=255) aaaTGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTAt > 2:586460/1‑149 (MQ=255) aaTGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTAtt < 3:578198/149‑1 (MQ=255) gggTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGAc > 3:460231/1‑149 (MQ=255) gggTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGAc > 3:89144/1‑149 (MQ=255) aTGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGa > 1:507688/1‑149 (MQ=255) tGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGaa < 1:21515/149‑1 (MQ=255) gTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGaaa < 2:479183/149‑1 (MQ=255) tGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATc > 4:576236/1‑149 (MQ=255) cTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCaa > 2:283924/1‑149 (MQ=255) cTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCaa < 1:53610/149‑1 (MQ=255) gCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGaa > 1:78251/1‑149 (MQ=255) ccAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGaa < 2:465091/148‑1 (MQ=255) ccAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGaa > 1:465091/1‑148 (MQ=255) ccAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAAt > 3:9014/1‑149 (MQ=255) cAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATg > 2:115596/1‑149 (MQ=255) aTTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGc > 4:74303/1‑149 (MQ=255) cattacttcatgcccatttatgcccgatgttTCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCgg > 1:153566‑M1/32‑56 (MQ=255) cattacttcatgcccatttatgcccgatgttTCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCgg < 2:153566‑M1/25‑1 (MQ=255) aaaGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCACgaga < 4:136406/149‑1 (MQ=255) aaaGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCACgaga < 3:157686/149‑1 (MQ=255) aaaGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCACgaga > 2:403676/1‑149 (MQ=255) aaGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCACGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCACGAGAc > 3:356903/1‑149 (MQ=255) tatttattGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCACGAGACTCCGtgctgc < 4:128607/149‑1 (MQ=255) attGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCACGAGACTCCGTGCTGCTACTg < 3:576236/149‑1 (MQ=255) ttGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCACGAGACTCCGTGCTGCTACTgg < 2:507688/149‑1 (MQ=255) atgatTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCACGAGACTCCGTGCTGCTACTGGaaa > 2:559252/1‑149 (MQ=255) ccgatgtttcccccccaccgggggaAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATg > 1:153566‑M2/26‑56 (MQ=255) ccgatgtttcccccccaccgggggaAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATg < 2:153566‑M2/31‑1 (MQ=255) ccgatgtttcccccccaccgggggaAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCaa < 1:312800‑M2/91‑1 (MQ=255) ccgatgtttcccccccaccgggggaAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCaa > 2:312800‑M2/26‑116 (MQ=255) 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atCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCaa > 4:523859/1‑109 (MQ=255) CCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCACGAGACTCCGTGCTGCTACTGGAAAAACTCGGCTg < 1:496217‑M1/149‑1 (MQ=255) CCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCACGAGACTCCGTGCTGCTACTGGAAAAACTCGGCTg < 2:137650‑M1/149‑1 (MQ=255) CC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACTCCCTGAAATCAAGAATGGCACGAGACTCCGTGCTGCTACTGGAAAAACTCGGCTGTc > 3:485044‑M1/1‑149 (MQ=255) ggggggAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCACGAGACTCCGTGCTGCTAc < 2:162286/125‑1 (MQ=255) ggggggAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCACGAGACTCCGTGCTGCTAc > 1:162286/1‑125 (MQ=255) aaCATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCACGAGACTCCGTGCTGCTACTGGAAAAACTCGGCTGTCGCGTAAATTTccc < 3:74303/149‑1 (MQ=255) | GCGATGCCGAAAGAAATAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCACGAGACTCCGTGCTGCTACTGGAAAAACTCGGCTGTCGCGTAAATTTCCC > NC_000913/321419‑321714 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |