| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 3780114 | 374 (3.430) | coding (288/1191 nt) | lldD | L‑lactate dehydrogenase, FMN‑linked | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 430 total aligned reads displayed.
AACGTGGAAGATTTGTCAGAAGTGGCGCTGCGCCAGCGTATTCTGAAAAACATGTCCGACTTAAGCCTGGAAACGACGCTGTTTAATGAGAAATTGTCGATGCCGGTGGCACTGGCTCCGGTGGGTTTGTGTGGCATGTATGCGCGTCGTGGCGAAGTTCAGGCAGCCAAAGCGGCGGACGCGCATGGTATTCCGTTTACTCTCTCGACGGTTTCCGTTTGCCCGATTGAAGAAGTCGCGCCAGCCATCAAGCGCCCAATGTGGTTCCAGCTTTATGTACTGCGCGATCGCGGCTT > NC_000913/3779938‑3780233 | aCGTGTAAGATTTGTCAGAAGTGGCGCTGCGCCAGCGTATTCTGAAAAACATGTCCGACTTAAGCCTGGAAACGACGCTGTTTAATGAGAAATTGTCGATGCCGGTGGCACTGGCTCCGGTGGGTTTGTGTGGCATGTATGCGcgtcgt < 3:964572/149‑1 (MQ=255) cGTGGAAGATTTGTCAGAAGTGGCGCTGCGCCAGCGTATTCTGAAAAACATGTCCGACTTAAGCCTGGAAACGACGCTGTTTAATGAGAAATTGTCGATGCCGGTGGCACTGGCTCCGGTGGGTTTGTGTGGCATGTATGCGCGTCGTg < 2:788514/149‑1 (MQ=255) cGTGGAAGATTTGTCAGAAGTGGCGCTGCGCCAGCGTATTCTGAAAAACATGTCCGACTTAAGCCTGGAAACGACGCTGTTTAATGAGAAATTGTCGATGCCGGTGGCACTGGCTCCGGTGGGTTTGTGTGGCATGTATGCGCGTCGTg < 4:588160/149‑1 (MQ=255) gTGGAAGATTTGTCAGAAGTGGCGCTGCGCCAGCGTATTCTGAAAAACATGTCCGACTTAAGCCTGGAAACGACGCTGTTTAATGAGAAATTGTCGATGCCGGTGGCACTGGCTCCGGTGGGTTTGTGTGGCATGTATGCGCGTCGTgg < 3:78347/149‑1 (MQ=255) ggAAGATTTGTCAGGAGTGGCGCTGCGCCAGCGTATTCTGAAAAACATGTCCGACTTAAGCCTGGAAACGACGCTGTTTAATGAGAAATTGTCGATGCCGGTGGCACTGGCTCCGGTGGGTTTGTGTGGCATGTATGCGCGTCGTGGCg > 1:799689/1‑149 (MQ=255) ggAAGATTTGTCAGAAGTGGCGCTGCGCCAGCGTATTCTGAAAAACATGTCCGACTTAAGCCTGGAAACGACGCTGTTTAATGAGAAATTGTCGATGCCGGTGGCACTGGCTCCGGTGGGTTTGTGTGGCATGTATGCGCGTCGTGGCg > 1:691261/1‑149 (MQ=255) aaGATTTGTCAGAAGTGGCGCTGCGCCAGCGTATTCTGAAAAACATGTCCGACTTAAGCCTGGAAACGACGCTGTTTAATGAGAAATTGTCGATGCCGGTGGCACTGGCTCCGGTGGGTTTGTGTGGCATGTATGCGCGTCGTGGCGaa < 2:135893/149‑1 (MQ=255) aTTTGTCAGAAGTGGCGCTGCGCCAGCGTATTCTGAAAAACATGTCCGACTTAAGCCTGGAAACGACGCTGTTTAATGAGAAATTGTCGATGCCGGTGGCACTGGCTCCGGTGGGTTTGTGTGGCATGTATGCGCGTCGTGGCGAAGtt < 4:286041/149‑1 (MQ=255) ttGTCAGAAGTGGCGCTGCGCCAGCGTATTCTGAAAAACATGTCCGACTTAAGCCTGGAAACGACGCTGTTTAATGAGAAATTGTCGATGCCGGTGGCACTGGCTCCGGTGGGTTTGTGTGGCATGTATGCGCGTCGTGGCGAAGTTCa > 3:800633/1‑149 (MQ=255) tCAGAAGTGGCGCTGCGCCAGCGTATTCTGAAAAACATGTCCGACTTAAGCCTGGAAACGACGCTGTTTGATGAGAAATTGTCGATGCCGGTGGCACTGGCTCCGGTGGGTTTGTGTGGCATGTATGCGCGTCGTGGCGAAGTTCAGGc > 2:1035242/1‑149 (MQ=255) tCAGAAGTGGCGCTGCGCCAGCGTATTCTGAAAAACATGTCCGACTTAAGCCTGGAAACGACGCTGTTTAATGAGAAATTGTCGATGCCGGTGGCACTGGCTCCGGTGGGTTTGTGTGGCATGTATGCGCGTCGTGGCGAAGTTCAGGc > 3:404967/1‑149 (MQ=255) tCAGAAGTGGCGCTGCGCCAGCGTATTCTGAAAAACATGTCCGACTTAAGCCTGGAAACGACGCTGTTTAATGAGAAATTGTCGATGCCGGTGGCACTGGCTCCGGTGGGTTTGTGTGGCATGTATGCGCGTCGTGGCGAAGTTCAGGc < 1:931610/149‑1 (MQ=255) aGAAGTGGCGCTGCGCCAGCGTATTCTGAAAAACATGTCCGACTTAAGCCTGGAAACGACGCTGTTTAATGAGAAATTGTCGATGCCGGTGGCACTGGCTCCGGTGGGTTTGTGTGGCATGTATGCGCGTCGTGGCGAAGTTCAGGCAg > 3:757068/1‑149 (MQ=255) 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tgtgtgGCATGTATGCGCGTCGTGGCGAAGTTCAGGCAGCCAAAGCGGCGGACGCGCATGGTATTCCGTTTACTCTCTCGACGGTTTCCGTTTGCCCGATTGAAGAAGTCGCGCCAGCCATCAAGCGCCCAATGTGGTTCCAGCTTTAt < 2:476958/149‑1 (MQ=255) tgGCATGTATGCGCGTCGTGGCGAAGTTCAGGCAGCCAAAGCGGCGGACGCGCATGGTATTCCGTTTACTCTCTCGACGGTTTCCGTTTGACCGATTGAAGAAGTCGCGCCAGCCATCAAGCGCCCAATGTGGTTCCAGCTTTATGTAc < 4:1010058/149‑1 (MQ=255) ggCATGTATGCGCGTCGTGGCGAAGTTCAGGCAGCCAAAGCGGCGGACGCGCATGGTATTCCGTTTACTCTCTCGACGGTTTCCGTTTGCCCGATTGAAGAAGTCGCGCCAGCCATCAAGCGCCCAATGTGGTTCCAGCTTTATGTACt < 1:410154/149‑1 (MQ=255) cATGTATGCGCGTCGTGGCGAAGTTCAGGCAGCCAAAGCGGCGGACGCGCATGGTATTCCGTTTACTCTCTCGACGGTTTCCGTTTGCCCGATTGAAGAAGTCGCGCCAGCCATCAAGCGCCCAATGTGGTTCCAGCTTTATGTACTgc < 4:630555/149‑1 (MQ=255) tATGCGCGTCGTGGCGAAGTTCAGGCAGCCAAAGCGGCGGACGCGCATGGTATTCCGTTTACTCTCTCGACGGTTTCCGTTTGCCCGATTGAAGAAGTCGCGCCAGCCATCAAGCGCCCAATGTGGTTCCAGCTTTATGTACTGCGCGa > 2:844373/1‑149 (MQ=255) aTGCGCGTCGTGGCGAAGTTCAGGCAGCCAAAGCGGCGgacgcgcatacatgccacacaaacccaccggagccagtgccaccggcatcgacaatttctcattaaacagcgtcgtttccaggcttaagtcggacatgtttttcagaatac < 4:45789‑M2/149‑112 (MQ=255) gcgcGTCcgccgctttggctgcctgaacttcgccacgacgcgcatacatgccacacaaacccaccgga < 3:728772‑M1/68‑62 (MQ=255) gcgTCGTGGCGAAGTTCAGGCAGCCAAAGCGGCGGACGCGCATGGTATTCCGTTTACTCTCTCGACGGTTTCCGTTTGCCCGATTGAAGAAGTCGCGCCAGCCATCAAGCGCCCAATGTGGTTCCAGCTTTATGTACAGCGCGATcgcg > 3:683321/1‑149 (MQ=255) cgtcgtGGCGAAGTTCAGGCAGCCAAAGCGGCGGACGCGCATGGTATTCCGTTTACTCTCTCGACGGTTTCCGTTTGCCCGATTGAAGAAGTCGCGCCAGCCATCAAGCGCCCAATGTGGTTCCAGCTTTATGTACTGCGCGATCGCgg < 4:577372/149‑1 (MQ=255) cgTCcgccgctttggctgcctgaacttcgccacgacgcgcatacatgccacacaaacccaccggagccagtgccaccggcatcgacaatttctcattaaacagcgtcgtttccaggcttaagtcggacatgtttttcagaatacgctgg < 3:635071‑M1/149‑146 (MQ=255) gTCcgccgctttggctgcctgaacttcgccacgacgcgcatacatgccacacaaacccaccggagccagtgccaccggcatcgacaatttctcattaaacagcgtcgtttccaggcttaagtcggacatgtttttcagaatacgctggc < 4:559327‑M1/149‑147 (MQ=255) tcgtGGCGAAGTTCAGGCAGCCAAAGCGGCGGACGCGCATGGt < 4:160117/43‑1 (MQ=255) | AACGTGGAAGATTTGTCAGAAGTGGCGCTGCGCCAGCGTATTCTGAAAAACATGTCCGACTTAAGCCTGGAAACGACGCTGTTTAATGAGAAATTGTCGATGCCGGTGGCACTGGCTCCGGTGGGTTTGTGTGGCATGTATGCGCGTCGTGGCGAAGTTCAGGCAGCCAAAGCGGCGGACGCGCATGGTATTCCGTTTACTCTCTCGACGGTTTCCGTTTGCCCGATTGAAGAAGTCGCGCCAGCCATCAAGCGCCCAATGTGGTTCCAGCTTTATGTACTGCGCGATCGCGGCTT > NC_000913/3779938‑3780233 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |