| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 3780085 | 364 (3.110) | 4 (0.040) | 4/244 | NT | 1.1% | coding (259/1191 nt) | lldD | L‑lactate dehydrogenase, FMN‑linked |
| ? | NC_000913 | = 3780114 | 374 (3.430) | coding (288/1191 nt) | lldD | L‑lactate dehydrogenase, FMN‑linked | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 423 total aligned reads displayed.
TGCGCCAGCGTATTCTGAAAAACATGTCCGACTTAAGCCTGGAAACGACGCTGTTTAATGAGAAATTGTCGATGCCGGTGGCACTGGCTCCGGTGGGTTTGTGTGGCATGTATGCGCGTCGTGGCGAAGTTCAGGCAGCCAAAGCGGCGGACGCGCATGGTATTCCGTTTACTCTCTCGACGGTTTCCGTTTGCCCGATTGAAGAAGTCGCGCCAGCCATCAAGCGCCCAATGTGGTTCCAGCTTTATGTACTGCGCGATCGCGGCTTTATGCGTAACGCGCTGGAGCGAGCAAAAG > NC_000913/3779966‑3780262 | tGCGCCAGCGTATTCTGAAAAACATGTCCGACTTAAGCCTGGAAACGACGCTGTTTAATGAGAAATTGTCGATGCCGGTGGCACTGGCTCCGGTGGGTTTGTGTGGCATGTATGCGCGTCGTGGCGAAGTTCAGGCAGCCAAAgcggcg < 1:103355/149‑1 (MQ=255) gcCAGCGTATTCTGAAAAACATGTCCGACTTAAGCCTGGAAACGACGCTGTTTAATGAGAAATTGTCGATGCCGGTGGCACTGGCTCCGGTGGGTTTGTGTGGCATGTATGCGCGTCGTGGCGAAGTTCAGGCAGCCAAAGCGGCGgac > 1:850929‑M2/1‑146 (MQ=255) gTATTCTGAAAAACATGTCCGACTTAAGCCTGGAAACGACGCTGTTTAATGAGAAATTGTCGATGCCGGTGGCACTGGCTCCGGTGGGTTTGTGTGGCATGTATGCGCGTCGTGGCGAAGTTCAGGCAGCCAAAGCGGCGgacgcgcat < 4:376459‑M2/149‑10 (MQ=255) gTATTCTGAAAAACATGTCCGACTTAAGCCTGGAAACGACGCTGTTTAATGAGAAATTGTCGATGCCGGTGGCACTGGCTCCGGTGGGTTTGTGTGGCATGTATGCGCGTCGTGGCGAAGTTCAGGCAGCCAAAGCGGCGgacgcgcat > 4:624757‑M2/1‑140 (MQ=255) tATTCTGAAAAACATGTCCGACTTAAGCCTGGAAACGACGCTGTTTAATGAGAAATTGTCGATGCCGGTGGCACTGGCTCCGGTGGGTTTGTGTGGCATGTATGCGCGTCGTGGCGAAGTTCAGGCAGCCAAAGCGGCGGACGCGCATg < 3:59218/149‑1 (MQ=255) tATTCTGAAAAACATGTCCGACTTAAGCCTGGAAACGACGCTGTTTAATGAGAAATTGTCGATGCCGGTGGCACTGGCTCCGGTGGGTTTGTGTGGCATGTATGCGCGTCGTGGCGAAGTTCAGGCAGCCAAAGCGGCGGACGCGCATg > 1:925580/1‑149 (MQ=255) ttCTGAAAAACATGTCCGACTTAAGCCTGGAAACGACGCTGTTTAATGAGAAATTGTCGATGCCGGTGGCACTGGCTCCGGTGGGTTTGTGTGGCATGTATGCGCGTCGTGGCGAAGTTCAGGCAGCCAAAGCGGCGGACGCGCATGGt > 2:786104/1‑149 (MQ=255) tGAAAAACATGTCCGACTTAAGCCTGGAAACGACGCTGTTTAATGAGAAATTGTCGATGCCGGTGGCACTGGCTCCGGTGGGTTTGTGTGGCATGTATGCGCGTCGTGGCGAAGTTCAGGCAGCCAAAGCGGCGGACGCGCATGGTAtt > 3:393028/1‑149 (MQ=255) tGAAAAACATGTCCGACTTAAGCCTGGAAACGACGCTGTTTAATGAGAAATTGTCGATGCCGGTGGCACTGGCTCCGGTGGGTTTGTGTGGCATGTATGCGCGTCGTGGCGAAGTTCAGGCAGCCAAAGCGGCGGACGCGCATGGTAtt > 2:724868/1‑149 (MQ=255) aaaaaCATGTCCGACTTAAGCCTGGAAACGACGCTGTTTAATGAGAAATTGTCGATGCCGGTGGCACTGGCTCCGGTGGGTTTGTGTGGCATGTATGCGCGTCGTGGCGAAGTTCAGGCAGCCAAAGCGGCGGACGCGCATGGTATTcc < 1:772000/149‑1 (MQ=255) aaCATGTCCGACTTAAGCCTGGAAACGACGCTGTTTAATGAGAAGTTGTCAAGGCCGGTGGCACTGGCTCCGGTGGGTTTGTGTGGCATGTATGCGCGTCGTGGCGAAGTTCAGGCAGCCAAAGCGGCGGACGCGCATGGTATTCCGtt < 1:496260/149‑1 (MQ=255) aaCATGTCCGACTTAAGCCTGGAAACGACGCTGTTTAATGAGAAATTGTCGATGCCGGTGGCACTGGCTCCGGTGGGTTTGTGTGGCATGTATGCGCGTCGTGGCGAAGTTCAGGCAGCCAAAGCGGCGGACGCGCATGGTATTCCGtt < 4:540674/149‑1 (MQ=255) cATGTCCGACTTAAGCCTGGAAACGACGCTGTTTAATGAGAAATTGTCGATGCCGGTGGCACTGGCTCCGGTGGGTTTGTGTGGCATGTATGCGCGTCGTGGCGAAGTTCAGGCAGCCAAAGCGGCGGACGCGCATGGTATTCCGTTTa < 1:1042720/149‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) aaaGCGGCGGACGCGCATGGTATTCCGTTTACTCTCTCGACGGTTTCCGTTTGCCCGATTGAAGAAGTCGCGCCAGCCATCAAgc > 3:173862/1‑85 (MQ=255) aaaGCGGCGGACGCGCATGGTATTCCGTTTACTCTCTCGACGGTTTCCGTTTGCCCGATTGAAGAAGTCGCGCCAGCCATCAAgc < 4:173862/85‑1 (MQ=255) aaaGCGGCGGACGCGCATGGTATTCCGTTTACTCTCTCGACGGTTTCCGTTTGCCCGATTGAAGAAGTCGCGCCAGCCATCAAGCGCCCAATGTGGTTCCAGCTTTATGTACTgc > 4:1009090/1‑115 (MQ=255) aaaGCGGCGGACGCGCATGGTATTCCGTTTACTCTCTCGACGGTTTCCGTTTGCCCGATTGAAGAAGTCGCGCCAGCCATCAAGCGCCCAATGTGGTTCCAGCTTTATGTACTgc < 3:1009090/115‑1 (MQ=255) aaaGCGGCGGACGCGCATGGTATTCCGTTTACTCTCTCGACGGTTTCCGTTTGCCCGATTGAAGAAGTCGCGCCAGCCATCAAGCGCCCAATGTGGTTCCAGCTTTATGTACTGCGCGATCGCGGCTTTATGCGTAACGCGCTGgagcg > 2:202098/1‑149 (MQ=255) aaGCGGCGGACGCGCATGGTATTCCGTTTACTCTCTCGACGGTTTCCGTTTGCCCGATTGAAGAAGTCGCGCCAGCCATCAAGCGCCCAATGTGGTTCCAGCTTTATGTACTGCGCGATCGCGGCTTTATGCGTAACGCGCTGgagcga < 2:973347/149‑1 (MQ=255) aGCGGCGGACGCGCATGGTATTCCGTTTACTCTCTCGACGGTTTCCGTTTGCCCGATTGAAGAAGTCGCGCCAGCCATCAAGCGCCCAATGTGGTTCCAGCTTTATGTACTGCGCGATCGCGGCTTTATGCGTAACGCGCTGgagcgag < 4:606192/149‑1 (MQ=255) cggACGCGCATGGTATTCCGTTTACTCTCTCGACGGTTTCCGTTTGCCCGATTGAAGAAGTCGCGCCAGCCATCAAGCGCCCAATGTGGTTCCAGCTTTATGTACTGCGCGATCGCGGCTTTATGCGTAACGCGCTGGAGCGAGCaaaa < 1:670525/149‑1 (MQ=255) cggACGCGCATGGTATTCCGTTTACTCTCTCGACGGTTTCCGTTTGCCCGATTGAAGAAGTCGCGCCAGCCATCAAGCGCCCAATGTGGTTCCAGCTTTATGTACTGCGCGATCGCGGCTTTATGCGTAACGCGCTGGAGCGAGCaaaa < 4:223810/149‑1 (MQ=255) ggACGCGCATGGTATTCCGTTTACTCTCTCGACGGTTTCCGTTTGCCCGATTGAAGAAGTCGCGCCAGCCATCAAGCGCCCAATGTGGTTCCAGCTTTATGTACTGCGCGATCGCGGCTTTATGCGTAACGCGCTGGAGCGAGCAAAag < 2:799689/149‑1 (MQ=255) | TGCGCCAGCGTATTCTGAAAAACATGTCCGACTTAAGCCTGGAAACGACGCTGTTTAATGAGAAATTGTCGATGCCGGTGGCACTGGCTCCGGTGGGTTTGTGTGGCATGTATGCGCGTCGTGGCGAAGTTCAGGCAGCCAAAGCGGCGGACGCGCATGGTATTCCGTTTACTCTCTCGACGGTTTCCGTTTGCCCGATTGAAGAAGTCGCGCCAGCCATCAAGCGCCCAATGTGGTTCCAGCTTTATGTACTGCGCGATCGCGGCTTTATGCGTAACGCGCTGGAGCGAGCAAAAG > NC_000913/3779966‑3780262 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |