New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 4286330 = | 136 (0.820) | 4 (0.020) | 3/258 | NT | 2.9% | coding (1042/1959 nt) | acs | acetyl‑CoA synthetase |
? | NC_000913 | 4286367 = | 136 (0.830) | coding (1005/1959 nt) | acs | acetyl‑CoA synthetase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 154 total aligned reads displayed.
CACTCCCACGCTTCCGGGTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGCCTTCAAACATCAGCGTGGTCGCACCGCAGGCCAGCGGGCCGTACAGCAAGTAACTGTGTCCGGTCACCCAGCCCACATCGGCGGTGCACCAGTAGATATCA > NC_000913/4286182‑4286478 | cACTCCCACGCTTCCGGGTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCtt > 3:451141/1‑149 (MQ=255) aCTCCCACGCTTCCGGGTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTg < 2:151166/149‑1 (MQ=255) cTCCCACGCTTCCGGGTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGt < 3:1207264/149‑1 (MQ=255) tCCCACGCTTCCGGGTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTc > 4:879041/1‑149 (MQ=255) tCCCACGCTTCCGGGTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTc > 3:744672/1‑149 (MQ=255) cccACGCTTCCGGGTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTcc < 3:1405548/149‑1 (MQ=255) ccACGCTTCCGGGTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTcca > 2:514959/1‑149 (MQ=255) ccACGCTTCCGGGTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTcca < 3:1122124/149‑1 (MQ=255) ccACGCTTCCGGGTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTcca < 3:1222504/149‑1 (MQ=255) ccACGCTTCCGGGTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTcca > 3:264203/1‑149 (MQ=255) ccACGCTTCCGGGTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTcca > 1:577491/1‑149 (MQ=255) ccACGCTTCCGGGTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTcca > 4:1343186/1‑149 (MQ=255) aCGCTTCCGGGTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTccacc > 1:1422581/1‑149 (MQ=255) cGCTTCCGGGTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTccacca < 1:663349/149‑1 (MQ=255) gTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTc < 2:686171/135‑1 (MQ=255) gTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTc > 1:686171/1‑135 (MQ=255) ttAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCAt > 2:766550/1‑149 (MQ=255) tAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATa < 3:454539/149‑1 (MQ=255) 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aaCCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAg < 2:1117468/138‑1 (MQ=255) aCCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGt > 1:1449926/1‑149 (MQ=255) ccGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTc < 4:785806/141‑1 (MQ=255) ccGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGtt < 2:1019727/149‑1 (MQ=255) ccGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGtt < 2:1084159/149‑1 (MQ=255) ccGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGtt < 1:24324/149‑1 (MQ=255) gagaATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTgg < 2:627319/149‑1 (MQ=255) gaATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGt > 3:157868/1‑149 (MQ=255) cgcAGCGACGTACGGTGTGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCTGGCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGAAGCTTGTCCACCACCAGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTTGGTACGcc < 4:927169/149‑1 (MQ=255) cgcAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGcc < 1:839940/149‑1 (MQ=255) 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taGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGCCTTCAAACATCAGCGTGGTCGCACCGCAGGCCAGCGGGCCGTACAGCAAGTAACTGTGTCCGGTCACCCAGCCCACATc < 3:1330484/149‑1 (MQ=255) gagaATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGCCTTCAAACATCAGCGTGGTCGCACCGCAGGCCAGCGGGCCGTACAGCAAGTAACTGTGTCCGGTCACCCAGCCCACATcgg > 1:629002/1‑149 (MQ=255) gagaATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGCCTTCAAACATCAGCGTGGTCGCACCGCAGGCCAGCGGGCCGTACAGCAAGTAACTGTGTCCGGTCACCCAGCCCACATcgg > 4:344592/1‑149 (MQ=255) gaATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGCCTTCGAACATCAGCGTGGTCGCACCGCAGGCCAGCGGGCCGTACAGCAAGTAACTGTGTCCGGTCACCCAGCCCACATcggcg < 1:514959/149‑1 (MQ=255) gaATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGCCTTCAAACATCAGCGTGGTCGCACCGCAGGCCAGCGGGCCGTACAGCAAGTAACTGTGTCCGGTCAGCCAGCCCACATcggcg > 3:941462/1‑149 (MQ=255) 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tGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGCCTTCAAACATCAGCGTGGTCGCACCGCAGGCCAGCGGGCCGTACAGCAAGTAACTGTGTCCGGTCACCCAGCCCACATCGGCGGTGCACCAGTa < 3:375157/149‑1 (MQ=255) tGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGCCTTCAAACATCAGCGTGGTCGCACCGCAGGCCAGCGGGCCGTACAGCAAGTAACTGTGTCCGGTCACCCAGCCCACATCGGCGGTGCACCAGTa > 4:375157/1‑149 (MQ=255) tGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGCCTTCAAACATCAGCGTGGTCGCACCGCAGGCCAGCGGGCCGTACAGCAAGTAACTGTGTCCGGTCACCCAGCCCACATCGGCGGTGCACCAGTa < 4:132340/149‑1 (MQ=255) gATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGCCTTCAAACATCAGCGTGGTCGCACCGCAGGCCAGCGGGCCGTACAGCAAGTAACTGTGTCCGGTCACCCAGCCCACATCGGCGGTGCACCAGTAg < 1:1386416/149‑1 (MQ=255) gATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGCCTTCAAACATCAGCGTGGTCGCACCGCAGGCCAGCGGGCCGTACAGCAAGTAACTGTGTCCGGTCACCCAGCCCACATCGGCGGTGCACCAGTAg > 2:1143212/1‑149 (MQ=255) 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CACTCCCACGCTTCCGGGTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGCCTTCAAACATCAGCGTGGTCGCACCGCAGGCCAGCGGGCCGTACAGCAAGTAACTGTGTCCGGTCACCCAGCCCACATCGGCGGTGCACCAGTAGATATCA > NC_000913/4286182‑4286478 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |