| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3884921 | 91 (1.030) | 4 (0.050) | 4/238 | NT | 4.3% | coding (106/258 nt) | yidD | membrane protein insertion efficiency factor, UPF0161 family inner membrane protein |
| ? | NC_000913 | = 3884957 | 94 (1.150) | coding (142/258 nt) | yidD | membrane protein insertion efficiency factor, UPF0161 family inner membrane protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
CCTCGATAACCGTGCTCTCTCGGAAGCGTTGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATACCAGAGAACA > NC_000913/3884777‑3885069 | ccTCGATAACCGTGCTCTCTCGGAAGCGTTGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTg > 1:483904/1‑149 (MQ=255) cTCGATAACCGTGCTCTCTCGGAAGCGTTGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGt < 2:614686/149‑1 (MQ=255) cTCGATAACCGTGCTCTCTCGGAAGCGTTGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGt < 1:252425/149‑1 (MQ=255) tCGATAACCGTGCTCTCTCGGAAGCGTTGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGtt > 2:11776/1‑149 (MQ=255) gATAACCGTGCTCTCTCGGAAGCGTTGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCa > 1:128792/1‑149 (MQ=255) aaCCGTGCTCTCTCGGAAGCGTTGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGc < 4:635432/149‑1 (MQ=255) cGTGCTCTCTCGGAAGCGTTGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTAc < 4:570598/149‑1 (MQ=255) cGTGCTCTCTCGGAAGCGTTGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTAc < 3:599144/149‑1 (MQ=255) gTGCTCTCTCGGAAGCGTTGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACg > 3:709214/1‑149 (MQ=255) tctctcGGAAGCGTTGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAAt > 2:253224/1‑149 (MQ=255) tctcGGAAGCGTTGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTg > 4:523829/1‑149 (MQ=255) tctcGGAAGCGTTGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTg > 2:545333/1‑149 (MQ=255) ctcGGAAGCGTTGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGa < 4:77327/149‑1 (MQ=255) tcGGAAGCGTTGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAg < 1:586985/149‑1 (MQ=255) tcGGAAGCGTTGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAg < 4:270276/149‑1 (MQ=255) tcGGAAGCGTTGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAA < 3:558585‑M1/126‑1 (MQ=255) gAAGCGTTGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCa > 1:657249/1‑149 (MQ=255) gAAGCGTTGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCa > 1:107530/1‑149 (MQ=255) 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ttATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTttgga > 4:736914‑M2/1‑144 (MQ=255) tATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTttggag > 4:433142‑M2/1‑143 (MQ=255) aTGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTttggagt > 1:545333‑M2/1‑142 (MQ=255) aTGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTttggagt > 2:338739‑M2/1‑142 (MQ=255) gcgcCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGAt > 1:191563/1‑149 (MQ=255) cgccgcCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAAacctgcgcaatgcctcaattccgtagcttgaacaggttggagtgaaa < 2:9785‑M1/149‑48 (MQ=255) gccgccACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATaa > 3:14115/1‑149 (MQ=255) gccgccACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATaa > 3:482400/1‑149 (MQ=255) cTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAAc < 1:501840/95‑1 (MQ=255) cTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAAc > 2:501840/1‑95 (MQ=255) gTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAgtt < 2:805249/149‑1 (MQ=255) tGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGACCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGa > 1:677633/1‑149 (MQ=255) gCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGATACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTGCGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACg < 2:128792/149‑1 (MQ=255) tCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATAAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGt > 4:330715/1‑149 (MQ=255) gcgGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGa > 1:770724/1‑149 (MQ=255) gggTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCATTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGaaa > 3:15221/1‑149 (MQ=255) 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gTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCAttt > 4:698322/1‑149 (MQ=255) tCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTg < 4:505828/149‑1 (MQ=255) cGTTTCACTCCAACCTGTTCGAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTGTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGa < 1:11776/149‑1 (MQ=255) tttCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATa < 2:737221/149‑1 (MQ=255) tttCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATa < 4:14115/149‑1 (MQ=255) tttCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATa < 4:482400/149‑1 (MQ=255) tCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTttggagtgaaacgacaatgcggcccgagtagcggactaatcaggcgttgatagacccgaatgagggctatcaggacccgcgagccaggcgacagtggcggcgcc > 1:9785‑M2/1‑45 (MQ=255) cACTCCAAacctgcgcaatgcctcaattccgtagcttgaacaggttggagtgaaacgacaatgcggcccgagtagcggactaatcaggcgttgatagacccgaatgagggctatcaggacccgcgagccaggcgacagtggcggcgcca > 4:274501‑M1/1‑8 (MQ=255) aCTCCAAacctgcgcaatgcctcaattccgtagcttgaacaggttggagtgaaacgacaatgcggcccgagtagcggactaatcaggcgttgatagacccgaatgagggctatcaggacccgcgagccaggcgacagtggcggcgccat > 1:545333‑M1/1‑7 (MQ=255) cTCCAAacctgcgcaatgcctcaattccgtagcttgaacaggttggagtgaaacgacaatgcggcccgagtagcggactaatcaggcgttgatagacccgaatgagggctatcaggacccgcgagccaggcgacagtggcggcgccata > 4:433142‑M1/1‑6 (MQ=255) cTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTttggagtgaaacgacaatgcggcccgagtagcggactaatcaggcgttgatagacccgaatgagg < 2:492789‑M2/107‑66 (MQ=255) cTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTttggagtgaaacgacaatgcggcccgagtagcggactaatcaggcgttgatagacccgaatgagg > 1:492789‑M2/1‑42 (MQ=255) cTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGc < 4:258168/92‑1 (MQ=255) cTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGc > 3:258168/1‑92 (MQ=255) cTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACTCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATACCaga > 3:225150/1‑149 (MQ=255) tCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATACCagag > 1:671381/1‑149 (MQ=255) tCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATACCagag > 3:295724/1‑149 (MQ=255) cAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGAtcccg > 1:751343/1‑120 (MQ=255) cAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGAtcccg < 2:751343/120‑1 (MQ=255) aaacctgcgcaatgcctcaattccgtagcttgaacaggttggagtgaaacgacaatgcggcccgagtagcggactaatcaggcgttgatagacccgaatgagggctatcaggacccgcgagccaggcgacagtggcggcgccataattt > 2:657249‑M1/1‑2 (MQ=255) aaCCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATACCAGAGAac > 4:721243/1‑149 (MQ=255) aacctgcgcaatgcctcaattccgtagcttgaacaggttggagtgaaacgacaatgcggcccgagtagcggactaatcaggcgttgatagacccgaatgagggctatcaggacccgcgagccaggcgacagtggcggcgccataatttt < 3:129041‑M1/149‑149 (MQ=255) | CCTCGATAACCGTGCTCTCTCGGAAGCGTTGGAAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATACCAGAGAACA > NC_000913/3884777‑3885069 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |