| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4384575 = | 294 (1.050) | 3 (0.010) | 3/258 | NT | 1.0% | coding (737/1503 nt) | yjeM | putative transporter |
| ? | NC_000913 | 4384614 = | 283 (1.050) | coding (776/1503 nt) | yjeM | putative transporter | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 332 total aligned reads displayed.
GCATCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAATCGGTTATTCGCTGGCAATATTTTTATGGGGCGTCAGCACAAACTGGCAGCAGGTATTAAGTAATGGTTCCGTTAACCTCGGCAATATTACCTATGTGCTGATGAAGAGCCTTGGGATGACGCTGGG > NC_000913/4384427‑4384722 | gCATCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGtttt < 2:629160/149‑1 (MQ=255)gCATCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGtttt < 1:1717900/149‑1 (MQ=255)agcgacaatgacgcttaaggtgacaaatgcagtgcattacccagcgtcatcccaaagctcttcatcaggacataggtaatattgccgaggttaacggcaacattacttaataccagctgccagtttgtgctgacgccccataaaaatat > 4:750278‑M1/149‑149 (MQ=255) cATCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGttttt < 4:333063/149‑1 (MQ=255) cATCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGttttt < 3:1649728/149‑1 (MQ=255) caacaatgccgctgcaggtgacaaatgcagtgaattacccagcgtcatcccaaggctttttatcagcacataggaatattgccgaggttaacggaaccattacttaatacctgctgccagtttgtgctgacgccccataaaaataTTGc > 3:1700340‑M1/146‑149 (MQ=255) cACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGcc > 2:1104868/1‑149 (MQ=255) aCCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCg > 4:1789111/1‑149 (MQ=255) ccGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGc > 2:1913818/1‑149 (MQ=255) gggTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTa > 1:1190398/1‑149 (MQ=255) gggTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTa < 1:2125710/149‑1 (MQ=255) aTCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCa > 2:59019/1‑149 (MQ=255) gTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAATCg > 3:256994/1‑149 (MQ=255) gTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAATCg > 4:1328901/1‑149 (MQ=255) gTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAATCg > 4:1570170/1‑149 (MQ=255) gTCCGGACTGGCAATGGTATGGTTTGTGGTATTTCGCATTTTTGGCCATGGGGGAATCCTAGCGGTTGTTGGGCTGCGCGATAAAACGAAAAATGCAGAAAGGAACTGTGCGAAAGGGGTGGTTTGAACCGCTATTGTTATTTCAAtag > 2:246006/1‑147 (MQ=255) tCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAATCgg < 3:594296/149‑1 (MQ=255) tCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAATCgg > 2:395663/1‑149 (MQ=255) 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cTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAATCGGTTATTc < 3:325841/149‑1 (MQ=255) gCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAATCGGTTATTCGCt < 2:508215/149‑1 (MQ=255) cAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAATCGGTTATTCGCTg < 3:2161563/149‑1 (MQ=255) aaTGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAATCGGTTATTCGCTgg < 2:2345781/149‑1 (MQ=255) aaTGCTATCGTTTGTGGTACTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAATCGGTTATTCGCTgg < 3:822218/149‑1 (MQ=255) aTCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAATCGGTTATTCGCTGGCAatat < 3:1124709/149‑1 (MQ=255) tttGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAATCGGTTATTCGCTGGCAATAttttt < 1:2179359/149‑1 (MQ=255) ttGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAATCGGTTATTCGCTGGCAATATTTTTa < 1:322884/149‑1 (MQ=255) tgGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTAtt > 2:1385691/1‑116 (MQ=255) tgGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTAtt < 1:1385691/116‑1 (MQ=255) tgGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAATCGGTTATTCGCTGGCAATATTTTTATgg > 2:2126164/1‑149 (MQ=255) 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1:203969/149‑1 (MQ=255) aaGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAATCGGTTATTCGCTGGCAATATTTTTATGGGGCGTCAGCACAAACTGGCAGCAGGTATTAAGTAATGGTTCCGTTAACCTCGGCAATATTACCTATGTGCtgat < 3:1212549/149‑1 (MQ=255) aaGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAATCGGTTATTCGCTGGCAATATTTTTATGGGGCGTCAGCACAAACTGGCAGCAGGTATTAAGTAATGGTTCCGTTAACCTCGGCAATATTACCTATGTGCtgat < 1:980401/149‑1 (MQ=255) aGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAATCGGTTATTCGCTGGCAATATTTTTATGGGGCGTCAGCACAAACTGGCAGCAGGTATTAAGTAATGGTTCCGTTAACCTCGGCAATATTAc > 4:136146/1‑136 (MQ=255) aGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAATCGGTTATTCGCTGGCAATATTTTTATGGGGCGTCAGCACAAACTGGCAGCAGGTATTAAGTAATGGTTCCGTTAACCTCGGCAATATTAc < 3:136146/136‑1 (MQ=255) aGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAATCGGTTATTCGCTGGCAATATTTTTATGGGGCGTCAGCACAAACTGGCAGCAGGTATTAAGTAATGGTTCCGTTAACCTCGGCAATATTACCTATGTGCtgatg > 1:2482461/1‑149 (MQ=255) aaCTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAATCGGTTATTCGCTGGCAATATTTTTATGGGGCGTCAGCACAAACTGGCAGCAGGTATTAAGTAATGGTTCCGTTAACCTCGGCAATATTACCTATGTGCTGATGaa > 1:1856272/1‑149 (MQ=255) aCTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAATCGGTTATTCGCTGGCAATATTTTTATGGGGCGTCAGCACAAACTGGCAGCAGGTATTAAGTAATGGTTCCGTTAACCTCGGCAATATTACCTATGTGCTGATGAag < 2:1531544/149‑1 (MQ=255) aCTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAATCGGTTATTCGCTGGCAATATTTTTATGGGGCGTCACCACAAACTGGCAGCAGGTATTAAGTAATGGTTCCGTTAACCTCGGCAATATTACCTATGTGCTGATGAag < 4:1711462/149‑1 (MQ=255) tttGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAATCGGTTATTCGCTGGCAATATTTTTATGGGGCGTCAGCACAAACTGGCAGCAGGTATTAAGTAATGGTTCCGTTAACCTCGGCAATATTACCTATGTGCTGATGAagag > 3:1836811/1‑149 (MQ=255) tttGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAATCGGTTATTCGCTGGCAATATTTTTATGGGGCGTCAGCACAAACTGGCAGCAGGTATTAAGTAATGGTTCCGTTAACCTCGGCAATATTACCTATGTGCTGATGAagag > 3:2106066/1‑149 (MQ=255) 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1:1301854/1‑149 (MQ=255) ttGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAATCGGTTATTCGCTGGCAATATTTTTATGGGGCGTCAGCACAAACTGGCAGCAGGTATTAAGTAATGGTTCCGTTAACCTCGGCAATATTACCTATGTGCTGATGAAGAGCCTTGGGATGACg > 3:416388/1‑149 (MQ=255) gTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAATCGGTTATTCGCTGGCAATATTTTTATGGGGCGTCAGCACAAACTGGCAGCAGGTATTAAGTAATGGTTCCGTTAACCTCGGCAATATTACCTATGTGCTGATGAAGAGCCTTGGGATGACGCt < 1:1052367/149‑1 (MQ=255) ttttGCCGCTATTGTTATTTCAATCGGTTATTCGCTGGCAATATTTTTATGGGGCGTCAGCACAAACTGGCAGCAGGTATTAAGTAATGGTTCCGTTAACCTCGGCAATATTACCTATGTGCTGATGAAGAGCCTTGGGATGACGCTgg < 4:2391701/149‑1 (MQ=255) | GCATCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAATCGGTTATTCGCTGGCAATATTTTTATGGGGCGTCAGCACAAACTGGCAGCAGGTATTAAGTAATGGTTCCGTTAACCTCGGCAATATTACCTATGTGCTGATGAAGAGCCTTGGGATGACGCTGGG > NC_000913/4384427‑4384722 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |