| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 427779 | 116 (0.780) | coding (133/1848 nt) | secD | SecYEG protein translocase auxillary subunit | |||||
Only 100 of 160 total aligned reads displayed.
GGTCGCGTAACCAAAGTAGCGGAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGTATGCGCTTCCCAACCTGTTTGGTGAGGATCCGGCTGTTCAGATCACTGGTGCGCGCGGAGTCGCCGCCAGTGAGCAAACGCTGATCCAGGTCCAGAAAACGTTACAAGAAGAAAAAATAACTGCTAAGTCTGTGGCACTGGAAGAGGGCGCTATTCTTGCGCGCTTCGACTCCACTGACACCCAGTTGCGCGCTCGTGAAGCATTAATGGGCGTTATGGGTGACAAATACGTCGTGGCGCTTAACCTTGCCCCGGCAACGCCGCGCTGGCTGGCAGCTATTCACGCTGAGCCGATGAAGCTCGGCCTTGACCTGCGTGGCG > NC_000913/427494‑428034 | acaacTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGAAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGTATGCGCTTCCCAACCTGTTTGGTGAGGATCCGGCTGTTCAGATCACTGGTGCGCGCGGAGTCGCCGCCAGTGAGCAAACGCTGATCCAGGTCCAGAAAACGTTACaa < 2:257895/270‑1 (MQ=255) gAAGGATTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTTCCTTCCTGCCGAAAGGCACCATGAATGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGTATGCGCTTCCCAACCTGTTTGGTGAGGATCCGGCTGTTCAGATCACTGGTGCGCGCGGAGTCGCCGCCAGTGAGCAAACGCTGATCCAGGTCCAGAAAACGTTACAAGAAGaaaa < 4:92954/275‑1 (MQ=255) gtagtTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGTATGCGCTTCCCAACCTGTTTGGTGAGGATCCGGCTGTTCAGATCACTGGTGCGCGCGGAGTCGCCGCCAGTGAGCAAACGCTGATCCAGGTCCAGAAAACGTTACAAGAAGAAAAAAt < 2:420716/275‑1 (MQ=255) gACTTCGTAGCTGCAGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGTGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGTATGCGCTTCTCAACCTGTTTGGTGAGGATCCGGCTGTTCAGATCACTGGTGCGCGCGGAGTCGCAGCCAGTGAGCAAACGCTGCGCCAGGTCCAGAAAAAGTTACAAGCAGAAAAAATAACTGCTAAGTCtgt > 2:252277/1‑275 (MQ=255) tCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGAACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGTATGCGCTTCCCAACCTGTTTGGTGAGGATCCGGCTGTTCAGATCACTGGTGCGCGCGGAGTCGCCGCCAGTGAGCAAACGCTGATCCAGGTCCAGAAAACGTTACAAGAAGAAAAAATAACTGCTAAGTCTGTGGCa < 2:356458/275‑1 (MQ=255) cGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGTATGCGCTTCCCAACCTGTTTGGTTAGGATCCGGCTGTTCAGATCACTGGTGCGCGCGGAGTCGCCGCCAGTTAGCAAACGCTGATCCAGGTCCAGAACACGTTACAAGAACAAAAAATAAACGATAAGTCGTTGGCAc > 4:312004/1‑275 (MQ=255) tCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGTATGCGCTTCCCAACCTGTTTGGTGAGGATCCGGCTGTTCAGATCACTGGTGCGCGCGGAGTCGCCGCCAGTGAGCAAACGCTGATCCAGGTCCAGAAAACGTTACAAGAAGAAAAAATAACTGCTAAGTCTGTGGCACTGGAAGAggg < 2:143505/274‑1 (MQ=255) 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aCCTGTTTGGTGAGGATCCGGCTGTTCAGATCACTGGTGCGCGCGGAGTCGCCGCCAGTGAGCAAACGCTGATCCAGGTCCAGAAAACg > 7:468859/1‑89 (MQ=255) cTGTTTGGTGAGGATCCGGCTGTTCAGATCACTGGTGCGCGCGGAGTCGCCGCCAGTGAGCAAACGCTGATcc < 5:585404/73‑1 (MQ=255) cTGTTTGGTGAGGATCCGGCTGTTCAGATCACTGGTGCGCGCGGAGTCGCCGCCAGTGAGCAAACGCTGATcc > 6:585404/1‑73 (MQ=255) tttGGTGAGGATCCGGCTGTTCAGATCACTGGTGCGCGCGGAGTCGCCGCCAGTGAGCAAACGCTGATCCAGGTCCAGAAAACGt < 5:237137/85‑1 (MQ=255) tttGGTGAGGATCCGGCTGTTCAGATCACTGGTGCGCGCGGAGTCGCCGCCAGTGAGCAAACGCTGATCCAGGTCCAGAAAACGt > 6:237137/1‑85 (MQ=255) ttGGTGAGGATCCGGCTGTTCAGATCACTGGTGCGCGCGGAGTCGCCGCCAGTGAGCAAACGCTGATCCAGGTCCAGAAAACGTTACAAGAAGAAAAAATAACTGCTAAGTCTGTGGCAc < 7:425284/120‑1 (MQ=255) ttGGTGAGGATCCGGCTGTTCAGATCACTGGTGCGCGCGGAGTCGCCGCCAGTGAGCAAACGCTGATCCAGGTCCAGAAAACGTTACAAGAAGAAAAAATAACTGCTAAGTCTGTGGCAc > 8:425284/1‑120 (MQ=255) ttGGTGAGGATCCGGCTGTTCAGATCACTGGTGCGCGCGGAGTCGCCGCCAGTGAGCAAACGCTGATCCAGGTCCAGAAAACGTTACAAGAAGAAAAAATAACTGCTAAGTCTGTGGCACTGGAag > 8:532855/1‑126 (MQ=255) ttGGTGAGGATCCGGCTGTTCAGATCACTGGTGCGCGCGGAGTCGCCGCCAGTGAGCAAACGCTGATCCAGGTCCAGAAAACGTTACAAGAAGAAAAAATAACTGCTAAGTCTGTGGCACTGGAag < 7:532855/126‑1 (MQ=255) gAGGATCCGGCTGTTCAGATCACTGGTGCGCGCGGAGTCGCCGCCAGTGAGCAAACGCTGATCCAGGTCCAGAAAACGTTACAAGAAGAAAAAATAACTGCTAAGTCTGTGGCAc < 7:27461/115‑1 (MQ=255) gAGGATCCGGCTGTTCAGATCACTGGTGCGCGCGGAGTCGCCGCCAGTGAGCAAACGCTGATCCAGGTCCAGAAAACGTTACAAGAAGAAAAAATAACTGCTAAGTCTGTGGCAc > 8:27461/1‑115 (MQ=255) gagccGGCGGTGCAGAACAATGGTGCGCGCGGGGTCGCAGCCAGTGAGCAAACACTGATCCAGGTCCAGAAAACGTTACAAGAAGAAAAAATAACTGCTAAGTCTGTGGCACTGGAAGAGGGCGCTATTCTTGCGCGCTTCGACTCCACTGACACCCAGTTGCGCGCTCGTGAAGCAGTAATGGGCGTTATGGGTGACAAATACGTCGTGGCGCTTAACCTTGCCCCGGCAACGCCGCGCTGGCTGGCAGCTATTCACGCTGAGCCGATGAAGCt < 4:335553/272‑1 (MQ=255) gCTGTTCAGATCACTGGTGCGCGCGGAGTCGCCGCCAGTGAGCAAACGCTGATCCAGGTCCAGAAAACGTTACAAGAAGAAAAAATAACTGCTAAGTCtg > 5:122490/1‑100 (MQ=255) gttcagttcaCTGGTGCGCGCGGAGTCGCCGCCAGTCAGCAAACGCTGATCCAGGTCCAGAAAACGTTACAAGAAGAAAAAATAACTGCTAAGTCTGTGGCACTGGAAGAGGGCGCTATTCTTGCGCGCTTCGACTCCACTGACAccc < 7:757590/148‑1 (MQ=255) ttCAGATCACTGGTGCGCGCGGAGTCGCCGCCAGTGAGCAAACGCTGATCCAGGTCCAGAAAACGTTACAAGAAGAAAAAATAACTGCTAAGTCTGTGGCACTGGAAGAGGGCGCTATTCTTGCGCGCTTCGACTCCACTGACACCCAGTTGCGCGCTCGTGAAGCATTAATGGGCGtt > 2:469702/1‑179 (MQ=255) cAGATCACTGGTGCGCGCGGAGTCGCCGCCAGTGAGCAAACGCTGATCCAGGTCCAGAAAACGTTACAAGAAGAAAAAATAACTGCTAAGTCTGTGGCACTGGAAGAGGGCGCTATTCTTGCGCGCTTCGACTCCACTGACACCCAGTTGCGCGCTCGTGAAGCATTAATGGGCGTTATGGGTGACAAATACGTCGTGGCGCTTAACCTTGCCCCGGCAACGCCTCGCTGGCTGGCCGCTATTCACGCTTGGCCCCATAAGCCCGGCCTTGAcc > 4:154126/1‑274 (MQ=255) gATCACTGGTGCGCGCGGAGTCGCCGCCAGTGAGCAAACGCTGATCCAGGTCCAGAAAACGTTACAAGAAGAAAAAATAACTGCt < 2:334739/85‑1 (MQ=255) gATCACTGGTGCGCGCGGAGTCGCCGCCAGTGAGCAAACGCTGATCCAGGTCCAGAAAACGTTACAAGAAGAAAAAATAACTGCTAAGTCTGTGGCACTGGAAGAGGGCGCTATTCTTGCGCGCTTCGACTCCACTGACACCCAGTTGCGCGCTCGTGAAGCATTAATGGGCGTTATgg < 4:469701/179‑1 (MQ=255) tCACTGGTGCGCGCGGAGTCGCCGCCAGTGAGCAAACGCTGATCCAGGTCCAGAAAACGTTACAAGAAGaaaaa > 5:1074515/1‑74 (MQ=255) tCACTGGTGCGCGCGGAGTCGCCGCCAGTGAGCAAACGCTGATCCAGGTCCAGAAAACGTTACAAGAAGaaaaa < 6:1074515/74‑1 (MQ=255) aCTGGTGCGCGCGGAGTCGCCGCCAGTGAGCAAACGCTGATCCAGGTCCAGAAAACGTTACAAGAAGAAAAAATAACTGCTAAGTCTGTGGCACTGGAAGAGGGCGCTATTCTTGCGCGCTTCGACTCCACTGACACCCAGTTGCGCGCTCGTGAAGCATTAATGGGCGTTATGGGTGACAAATACGTCGTGGCGCTTAACCTTGCCCCGGCAACGCCGCGCTGGCTGGCAGCTATTCACGCTGAGCCGAAGAAGCCCGGCCTTGACCTGctggg > 4:197692/1‑271 (MQ=255) cTGGcggcgactccgcgcgcaccagtgatctgaacagccggatcctcaccaaacaggttgggaagcgcatacagcagaccgatgacaatcaccacgatcagcatgacgtacttccacaaaggataacggt < 8:636959‑M1/130‑127 (MQ=255) tGGTGCGCGCGGAGTCGCCGccagtgagctgaacagccggatcctcaccaaacaggttgggaagcgcatacagcagaccgatgacaatcaccacgatcagca > 5:866214‑M2/1‑20 (MQ=255) tGGTGCGCGCGGAGTCGCCGccagtgagctgaacagccggatcctcaccaaacaggttgggaagcgcatacagcagaccgatgacaatcaccacgatcagca < 6:866214‑M2/102‑83 (MQ=255) tGGTGCGCGCGGAGTCGCCGCCAGTGAGCAAACGCTGATCCAGGTCCAGAAAACGTTACCAGACGAAAAAATAACTGCTAAGTCTGTGGCACTGGAAGAGGGCGCTATTCTTGCGCGCTTCGACTCCACTGACACCCAGTTGCGCGCTCGTGAAGCATTAATGGGCGATATGGGTGACAAATACGTCGTGGCGCTTAACCTTGCCACGGCACCGCCGCGCTGGCTGGCAGGTCTTCCCGCTGAGCCGGTGACGCTCGGCCTTGACCttgtgagcg > 4:299766/1‑267 (MQ=255) tGGTGCGCGCGGAGTCGCCGCCAGTGAGCAAACGCTGATCCAGGTCCAGAAAACGTTACAAGAAGAAAAAATAACTGCTAAGTCTGTGGCACTGGAAGAGGGCGCTATTCTTGCGCGCTTCGACTCCACTGACACCCAGTTGCGCGCTCGTGAAGCATTAATGGCCGTTATGGGTGACAAATACGTCGTGGCGCTTAACCTTGCCCCGGCAACGCCGCGCTGGCTGGCAGCCATTCACGCTGAGCCGCTGAAGCTCGGCCTTGAccccctgggcg > 4:389709/1‑266 (MQ=255) ggTGCGCGCGGAGTCGCCGcgagtgatctgaacagccggatcctcaccaaacaggttgggaagcgcatacagcagaccgatgacaatcaccacg > 8:105031‑M2/1‑19 (MQ=255) ggTGCGCGCGGAGTCGCCGccagtgatctgaacagccggatcctcaccaaacaggttgggaagcgcatacagcagaccgatgacaatcaccacg < 7:105031‑M2/94‑76 (MQ=255) | GGTCGCGTAACCAAAGTAGCGGAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGTATGCGCTTCCCAACCTGTTTGGTGAGGATCCGGCTGTTCAGATCACTGGTGCGCGCGGAGTCGCCGCCAGTGAGCAAACGCTGATCCAGGTCCAGAAAACGTTACAAGAAGAAAAAATAACTGCTAAGTCTGTGGCACTGGAAGAGGGCGCTATTCTTGCGCGCTTCGACTCCACTGACACCCAGTTGCGCGCTCGTGAAGCATTAATGGGCGTTATGGGTGACAAATACGTCGTGGCGCTTAACCTTGCCCCGGCAACGCCGCGCTGGCTGGCAGCTATTCACGCTGAGCCGATGAAGCTCGGCCTTGACCTGCGTGGCG > NC_000913/427494‑428034 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |