New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 198 total aligned reads displayed.
AACCAGAGTACAAGCGCCAACACGCTCGTTGTACAGGCCAAAGTTTTTAGAGTAGGAACTGGCAACAATCAGCTCTTTATGCATAGCCGCGAAAGCGCGCAGTCCTTCAGCATCTTCTTCC‑AGACCACGGGCAAAACCCTGGTAAGCGAAGTCAAACAGCGGTAACCAGCCTTTCTCAACGGAGAGTTGTGCCAGTGTTTGCCATTGTTCCAGCGTAGGGTCGATACCGGTTGGGTTATGGCAGCAGCCATGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCACGAACTTCCAGACCTGCAGAGTTAAAGACGCTCTTATGGTTCGGCCAGCTTGGGTTGCTCACCCACACACGCTTAACGCTGGTATTTTTTGCCAGGAAATCGGCAGCCACGCGTAGTGCGCCAGTGCCCCCCGGAGTCTGTGCCGTGCGAGCACGTTTGTCATTGATCAGGGCGCTACCTTTACCAAACAG > NC_000913/984927‑985466 | tggtcgctgcactcaggaactgctgtttggtaaaggtagcgccctgatcaatgacaaacgtgctcgcacggcacagactccggggggcactggcgcactacgcgtggctgccgatttcctggcaaaaaataccagcgttaagcgtgtgtgggtgagcaacccaagctggccgaaccataagagcgtctttaactctgcaggtctggaagttcgtgaatacgcttattatgatgcggaaaatcacactcttgacttcgatgcactgattaaCAGcc < 2:243280‑M1/5‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) tATGGCAGCAGCCATGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAATCAGTGCATCGa < 7:891083/72‑1 (MQ=255) tATGGCAGCAGCCATGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCACGAACtt > 6:486641/1‑120 (MQ=255) tATGGCAGCAGCCATGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCACGAACtt < 5:486641/120‑1 (MQ=255) caTGGCTGCTGCCATGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAg < 5:903140/104‑1 (MQ=255) aTGGCAGCAGCCATGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGcatca > 5:1028168/1‑97 (MQ=255) cagcagCCATGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCACGAACTTCCAGAcc < 6:239329/122‑1 (MQ=255) gcagcCATGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCACGAACTTCCAGACCTGCAGAGt > 7:539196/1‑128 (MQ=255) cagcCATGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGc > 7:418177/1‑86 (MQ=255) cagcCATGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGc < 8:418177/86‑1 (MQ=255) cagcCATGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCACGAACTTCCAGACCTGCAGAGTTAAAGACGCTCTTATGGTTCGGCCAGCTTGGGTTGCTCACCCACACACGCTTAACGCTGGTATTTTTTGCCAGGAAATCGGCAGCCACGAGTAGTGCGCCAGAGCCCCCCGGAGTCTGTGCCGTGCGAGCACGTTTGTCATTGATCAg > 2:433100/1‑275 (MQ=255) aTGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGcatc > 6:1047803/1‑84 (MQ=255) aTGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCACGAACTTCCAGACCTGCAGAGTTAAAGACg > 8:1014772/1‑130 (MQ=255) aTGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCACGAACTTCCAGACCTGCAGAGTTAAAGACGct < 8:533725/132‑1 (MQ=255) tGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTATTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCACGAACTTCCAGACCTGCAGAGt < 6:1060673/121‑1 (MQ=255) aaCAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCACGAACTTCCAGACCTGCAGAGTTAAAGACGCTCtt < 6:848394/131‑1 (MQ=255) cACTACGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCACGAACTTCCAGACCTGCAGAGTTAAAGACGCTCTTATGGTTCGGCCAGCTTGGGTTGCTCACCCACACACGCTTAACGCTGGTATTTTTTGCCAGGAAATCGGCAGCCACGCGTAGTGCGCCAGTGCCCCCCGGAGTCTGTGCCGTGCGAGCCCGTTTGTCATTGATCAGGGCGTTACCTTTa > 2:195862/1‑274 (MQ=255) tACGTGGCCAGCCTGATCTTCATTCAGGCTGTTAATTCGTGCATCGAAGGCAAGGGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCACGAACTTCCAGACCTGCAGAGTTAAAGACGCTCGTATGGTTCGGCCAGCTTGGGTTGCTCACCCACACACGCTTAACGCTGGTATTTTTTGCCAGGAAATCGGCAGCCACGCGTAGTGCGCCAGTGCCCCCCGGAGTCTGTGCCGTGCGAGCACGTTTGTCATTGATCAGGGCGCTACCTTTACCa < 2:412992/274‑1 (MQ=255) aCGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCACGAACTTCCAGACCTGCaga > 5:1118927/1‑107 (MQ=255) cGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCACGAACTTCCAGACCTGCAGAGTTAAAGACGCTCTTATGGTTCGGCCAGCTTGGGTTGCTCACCCACACACGCTTAACGCTGGTATTTTTTGCCAGGAAATCGGCAGCCACGCGTAGTGCGCCAGTGCCCCCCGGAGTCTGTGCCGTGCGAGCACGTTTGTCATTGATCAGGGCGCTATCTTTACCAAAc > 1:96955/1‑275 (MQ=255) ggCCAGGCTAAGGTTCATTCAGGGTGTTGAGAAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGAATTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCACGAACTTCCAGACCTGCAGAGTTAAAGACGCTCTTATGGGTCGGCCAGCTTGGGTTGCTCACCCACACACGCTTAACGCTGGTATTTTTTGCCAGGAAATCGGCAGCCACGCGTAGTGCGCCAGTGCCCCCCGGAGTCTGTGCCGTGCGAGCACGTTTGTCATTGATCAGGGCGCTACCTTTACCAAAcag < 4:235602/273‑1 (MQ=255) cGCCAGCCTGAGCTTAATTCAGGCTGTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCACGAACTTCCAGACCTGCAGAGTTAAAGACGCTCTTATGGTTCGGCCAGCTTGGGTTGCTCACCCACACACGCTTAACGCTGGTATTTTTTGCCAGGAAATCGGCAGCCACGCGTAGTGCGCCAGTGCCCCCCGGAGTCTGTGCCGTGCGAGCACGTTTGTCATTGATCAGGGCGCTACCTTTACCAAAcag < 4:246222/274‑1 (MQ=255) cGCCAGCCGTAGCTTCATGCAGGCTTTTCATCAGTTCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATACGCGTATTCACGAACTTCCAGACCTGCAGAGTTAAAGACGCTCTTATGGTTCGGCCAGCTTGGGTTGCTCACCCACACACGCTTAACGCTGGTATTTTTTGCCAGGAAATCGGCAGCCACGCGTAGTGCGCCAGTGCCCCCCGGAGTCTGTGCCGTGCGAGCACGTTTGTCATTGATCAGGGCGCTACCTTTACCAAAcag < 4:307030/274‑1 (MQ=255) gCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCACGAACTTCCAGACCTGCa < 2:226468/100‑1 (MQ=255) | AACCAGAGTACAAGCGCCAACACGCTCGTTGTACAGGCCAAAGTTTTTAGAGTAGGAACTGGCAACAATCAGCTCTTTATGCATAGCCGCGAAAGCGCGCAGTCCTTCAGCATCTTCTTCC‑AGACCACGGGCAAAACCCTGGTAAGCGAAGTCAAACAGCGGTAACCAGCCTTTCTCAACGGAGAGTTGTGCCAGTGTTTGCCATTGTTCCAGCGTAGGGTCGATACCGGTTGGGTTATGGCAGCAGCCATGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCACGAACTTCCAGACCTGCAGAGTTAAAGACGCTCTTATGGTTCGGCCAGCTTGGGTTGCTCACCCACACACGCTTAACGCTGGTATTTTTTGCCAGGAAATCGGCAGCCACGCGTAGTGCGCCAGTGCCCCCCGGAGTCTGTGCCGTGCGAGCACGTTTGTCATTGATCAGGGCGCTACCTTTACCAAACAG > NC_000913/984927‑985466 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |