New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 180 total aligned reads displayed.
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ctgattaacagcctgaatgaagctcaggctgTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCACGAACTTCCAGACCTGCagag < 7:972229‑M2/78‑1 (MQ=255) aCGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCACGAACTTCCAGACCTGCaga > 5:1118927/1‑107 (MQ=255) aCGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCACGAACTTCCAGACCTGCaga < 6:1118927/107‑1 (MQ=255) gattaacagcctgaatgaagctcaggctgTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAg < 6:311763‑M2/49‑1 (MQ=255) gattaacagcctgaatgaagctcaggctgTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAg > 5:311763‑M2/30‑78 (MQ=255) cGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCACGAACTTCCAGAcc > 4:226467/1‑100 (MQ=255) cGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCACGAACTTCCAGACCTGCAGAGTTAAAGACGCTCTTATGGTTCGGCCAGCTTGGGTTGCTCACCCACACACGCTTAACGCTGGTATTTTTTGCCAGGAAATCGGCAGCCACGCGTAGTGCGCCAGTGCCCCCCGGAGTCTGTGCCGTGCGAGCACGTTTGTCATTGATCAGGGCGCTATCTTTACCAAAc > 1:96955/1‑275 (MQ=255) attaacagcctgaatgaagctcaggctgTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCACGAACTTCCAGACCTGCAGAGTTAAAGACGCTCtt > 7:476161‑M2/29‑120 (MQ=255) attaacagcctgaatgaagctcaggctgTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCACGAACTTCCAGACCTGCAGAGTTAAAGACGCTCtt < 8:476161‑M2/92‑1 (MQ=255) cGCCAGCCTGAGCTTAATTCAGGCTGTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCACGAACTTCCAGACCTGCAGAGTTAAAGACGCTCTTATGGTTCGGCCAGCTTGGGTTGCTCACCCACACACGCTTAACGCTGGTATTTTTTGCCAGGAAATCGGCAGCCACGCGTAGTGCGCCAGTGCCCCCCGGAGTCTGTGCCGTGCGAGCACGTTTGTCATTGATCAGGGCGCTACCTTTACCAAAcag < 4:246222/274‑1 (MQ=255) gCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCACGAACTTCCAGACCTGCa < 2:226468/100‑1 (MQ=255) gcctgaatgaagctcaggctgTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCACGAACTTCCAGACCTGCAGAGTTAAAGACGCTCTTAt < 7:909411‑M2/94‑1 (MQ=255) tcattcaGGCTGTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCAtaataa < 7:813674/60‑1 (MQ=255) tcattcaGGCTGTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCACGAACTTCCAGACCTGCAGAGTTAAAGACGCTCTTATGGTTCGGc > 5:848407/1‑114 (MQ=255) tcattcaGGCTGTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCACGAACTTCCAGACCTGCAGAGTTAAAGACGCTCTTATGGTTCGGc < 6:848407/114‑1 (MQ=255) ttcaGGCTGTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCACGAACTTCCAGACCTGc < 5:657578/83‑1 (MQ=255) ttcaGGCTGTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCACGAACTTCCAGACCTGc < 5:1082801/83‑1 (MQ=255) ttcaGGCTGTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCACGAACTTCCAGACCTGc > 6:1082801/1‑83 (MQ=255) tcaggctgTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCa > 8:1115835‑M2/9‑65 (MQ=255) tcaggctgTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCa < 7:1115835‑M2/57‑1 (MQ=255) tcaggctgTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCACGAACTTCCAGACCTGCAGAGTTAAAGACGCTCTTATGGTTCGGc < 6:83782‑M2/102‑1 (MQ=255) tcaggctgTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCACGAACTTCCAGACCTGCAGAGTTAAAGACGCTCTTATGGTTCGGCCAGCTTGGGTTGCTCACCCACACACGCt > 6:485904‑M2/9‑138 (MQ=255) tcaggctgTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCACGAACTTCCAGACCTGCAGAGTTAAAGACGCTCTTATGGTTCGGCCAGCTTGGGTTGCTCACCCACACACGCTTAACGCTGGt > 5:463105‑M2/9‑148 (MQ=255) ggctgTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCACGAACTTCCAGACCTGCAGAGTTAAAGACGCTCTTATGGTTCGGCCAGCTTGGGTTGCTCACCCACACACGCTTAACGCTGGTATTTTTTGCCAGGAAATCGGCAGCCACGCGTAGTGCGCCAGTGCCCCCCGGAGTCTGTGCCGTGCGAGCACGTTTGTCATTGATCAGGGCGCTACCTTTACCAAACAGCAGTTCCTGAGTGCAGCGAc < 1:118438‑M2/268‑1 (MQ=255) ggctgTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCACGAACTTCCAGACCTGCAGAGTTAAAGACGCTCTTATGGTTCGGCCAGCTTGGGTTGCTCACCCACACACGCTTAACGCTGGTATTTTTTGCCAGGAAATCGGCAGCCACGCGTAGTGCGCCAGTGCCCCCCGGAGTCTGTGCCGTGCGAGCACGTTTGTCATTGATCAGGGCGCTACCTTTACCAAACAGCAGTTCCTGAGTGCAGCGACCa < 2:243280‑M2/270‑1 (MQ=255) ttAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCACGAACTTCCAGACCTGCAGAGTTAAAGACGCTCTTATGGTTCGGCCAGCTTGGGt < 6:86473/112‑1 (MQ=255) | AACACGCTCGTTGTACAGGCCAAAGTTTTTAGAGTAGGAACTGGCAACAATCAGCTCTTTATGCATAGCCGCGAAAGCGCGCAGTCCTTCAGCATCTTCTTCCAGACCACGGGCAAAACCCTGGTAAGCGAAGTCAAACAGCGGTAACCAGCCTTTCTCAACGGAGAGTTGTGCCAGTGTTTGCCATTGTTCCAGCGTAGGGTCGATACCGGTTGGGTTATGGCAGCAGCCATGGAACAGCA‑CTACGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCACGAACTTCCAGACCTGCAGAGTTAAAGACGCTCTTATGGTTCGGCCAGCTTGGGTTGCTCACCCACACACGCTTAACGCTGGTATTTTTTGCCAGGAAATCGGCAGCCACGCGTAGTGCGCCAGTGCCCCCCGGAGTCTGTGCCGTGCGAGCACGTTTGTCATTGATCAGGGCGCTACCTTTACCAAACAGCAGTTCCTGAGTGCAGCGACCA > NC_000913/984945‑985488 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |