| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3280885 = | 79 (0.500) | 8 (0.050) | 7/256 | NT | 9.2% | pseudogene (185/375 nt) | agaW | pseudogene, N‑acetylgalactosamine‑specific enzyme IIC component of PTS;enzyme; Central intermediary metabolism: Amino sugars; PTS system N‑acetylgalactosameine‑specific IIC component 2 |
| ? | NC_000913 | 3280913 = | 82 (0.540) | pseudogene (213/375 nt) | agaW | pseudogene, N‑acetylgalactosamine‑specific enzyme IIC component of PTS;enzyme; Central intermediary metabolism: Amino sugars; PTS system N‑acetylgalactosameine‑specific IIC component 2 | |||||
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
GAAAACCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTATCGTCGGCACGGCGTTTGCCATTACTACTGGCGTGAAACCCGATGTCGCAGTAGGTGTCGCCGTACCTTTCGCTGTCGCAGTACAGATGGGGATTACCTTCCTGTTCTCGGTGATGTCCGGCGTGATGTCTCGCTGCGACCTGGCAACAAACCCGCGCCGCATTTGATGCTGGTGCCGACGGCCTGGTGCATTGCTATAACGGGATGACAGGTTTACATCACCG > NC_000913/3280615‑3281159 | gAAAACCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTg > 2:400699/1‑275 (MQ=255) cTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGGGGATGGGGCTGGCCCCGc > 2:516685/1‑274 (MQ=255) tGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCTGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGACGTTTAACCGGCGGTACGCTGGAAGTGGTGTGGATGGGGCGGGCACCGCTg > 2:158990/1‑275 (MQ=255) agCCTGCTGTGGACCTTTTTAAATTACTTTGCGGGATTCATCATGTAAACCAGCCGGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGAGATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGAACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTa < 2:117808/274‑1 (MQ=255) ccTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTTGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGGCGCCTAACGTGATTATCGGTACTa > 2:475741/1‑275 (MQ=255) gACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGAACTGCATACCGGACTTTTAACCGGCGGTCCGCTGGAACTGGTGTGGAGTGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCCAACGGGGTTAACGGttcgtcctgcggca > 4:417274/1‑262 (MQ=255) aaaTTACTTTGAGGGATTCATCATGTAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAg < 1:34662/232‑1 (MQ=255) tttGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTTGAACTTGTGTGGATGGTGCTGGCCCCGCTGGCGTGCGCACAGCCGCCTAAAGTGCTTATAGATACTATCGTACGACCGTCGTTTGCCATtac > 4:230953/1‑275 (MQ=255) tttGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGCTGGGATGGGGCTGGCTCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGCTTTCCGGTACCACCGTCGGCCCGGCGTCTCCCATta > 4:216052/1‑274 (MQ=255) aGGGATTCATCATGGAAATCAGTCTGTTTGAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTAGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTATCGTCGGCACGGCGTTTGCCATTactact < 4:399133/275‑1 (MQ=255) ttCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGCTGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCCCAGCCGCCTAACGGGATTAACGGTACTCTCGTCGGCACGGCGTTTTCCATTACTACTGGCGt > 4:279012/1‑275 (MQ=255) ttCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCCAACGGTATTATCGGTACTATCGTCGGCCCGGCGTTTCCCCTTACTCCTGGCg > 4:464081/1‑274 (MQ=255) tcatGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTAt < 2:507867/229‑1 (MQ=255) tCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGGTGGGCATTATAGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTATCGTCGGCACGGCGGTTGCCATTACTACTGGCGTGAAACCCGATGt < 2:230954/274‑1 (MQ=255) ccTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCCCCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTTGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCACCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTCACGTGATTATCGGTACTATCGTCGGCACGGCGGTTGCCATTACTACTGGCGTGAAACCCGATGTCGCa > 2:298348/1‑274 (MQ=255) tATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTATCGTCGGAACGGCGTTTGCCATTACTACTGGCGGGAAAACCGATGTCGCAGTAGGTGTCGCCGTACCTTTCGCTGTCg > 2:148912/1‑275 (MQ=255) tATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACGGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTATCTTCGGCACGGCGTTTGCCATTACTACTGGCGTGAAACCCGATGTCGCCGTGGGTGTCGCCGTACCTTTCGCTGTCg > 2:419537/1‑275 (MQ=255) tATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGGCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGNCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCCAACGGTATTATCGGTACCAtcccnngcc > 4:545565/1‑199 (MQ=255) tCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGc < 8:658539/147‑1 (MQ=255) ttATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGcccc > 8:51150/1‑148 (MQ=255) aTCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTATCGTCGGCACGGCGTTTGCCATTACTACTGGCGTGAAACCCGATGTCGCAGTAGGTGTCGCCGTACCTTTCGCTGTCGCAGTACAGa < 4:400698/274‑1 (MQ=255) tGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTggcg < 8:109618/148‑1 (MQ=255) acaggaaggtaatccccatctgtactgcgacagcgaaaggtacggcgacacctactgcgacatcgggtttcacgccagtagtaatggcaaacgccgtgccgacgatagtaccgataatcacgttaggcGGCTg > 7:423241‑M1/129‑133 (MQ=255) acaggaaggtaatccccatctgtactgcgacagcgaaaggtacggcgacacctactgcgacatcgggtttcacgccagtagtaatggcaaacgccgtgccgacgatagtaccgataatcacgttaggcGGCTg < 8:423241‑M1/5‑1 (MQ=255) gTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGccc > 4:448236/1‑128 (MQ=255) gTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAgccg < 7:51150/148‑1 (MQ=255) aaCGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCt < 2:448237/128‑1 (MQ=255) aCGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTATCGTCGGCACGGCGTTTGCCATTACTACTGGCGTTAAACCCGATGTCGCAGTAGGTGTCGCCGTACCTTTCGCTTGCGCAGTACACATGGGGATTACCTTccgtttcccg > 4:322651/1‑267 (MQ=255) catctgtactgcgacagcgaaaggtacggcgacacctactgcgacatcgggtttcacgccagtagtaatggcaaacgccgtgccgacgatagtaccgataatcacgttaggcGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAgc > 8:743770‑M1/113‑139 (MQ=255) catctgtactgcgacagcgaaaggtacggcgacacctactgcgacatcgggtttcacgccagtagtaatggcaaacgccgtgccgacgatagtaccgataatcacgttaggcGGCTGGCCCCACTGGCGGGCGCACAgc < 7:743770‑M1/27‑1 (MQ=255) tatGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCt > 8:696036/1‑105 (MQ=255) tatGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCt < 7:696036/105‑1 (MQ=255) tatGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGt < 6:39572/148‑1 (MQ=255) gcgaaaggtacggcgacacctactgcgacatcgggtttcacgccagtagtaatggcaaacgccgtgccgacgatagtaccgataatcacgttaggcGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAgc > 8:278562‑M1/97‑123 (MQ=255) gcgaaaggtacggcgacacctactgcgacatcgggtttcacgccagtagtaatggcaaacgccgtgccgacgatagtaccgataatcacgttaggcGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAgc < 7:278562‑M1/27‑1 (MQ=255) ccGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGGTGGTCGGGCTGGTACTTTGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTATCGTCGGCACGGCGTTTGCCATTACTACTGGCGTGAAACCCGATGTCGCAGTAGGTGTCGCCGTACCTTTCGCTGTCGCAGTACAGATGGGGATTACCTTCCTGTTCTCGGTGATGTCCGGCGTGATGt < 2:417275/275‑1 (MQ=255) cGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTAt < 7:902701/137‑1 (MQ=255) cGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTATCGTCGGCACGGCGTTTGCCATTACTACTGGCGTGAAACCCGATGTCGCAGTAGGTTTCGCCGTACCTTTCGCTGTCCCAGTAACAATGGGGGTTACCTTCCCGGTCTCGGTTATTTCCGGCggggtttc > 4:5612/1‑268 (MQ=255) cGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTATCGTCGGCACGGCGTTTGCCATTACTACTGGCGTGAAACCCGATGTCGCAGTAGGTGTCGCCGTACCTTTCGCTGTCTCAGTACCGATGGGGATTACCTTCCTGTTCTCGGTTATGTCCGGCGTGATggc > 1:109323/1‑273 (MQ=255) cccGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTCCTATCGTCGGCACGGCGTTTGCCATTACTAATGGCGTGAAACCCGATGTCGGAGTAGGTGTCGCCGTACCTTTCCCTGTCGCAGTACAAGTGGGGATTACCTTCCTGTTACGGGGTATGTCCGGCGTGATggccc > 4:191961/1‑271 (MQ=255) cccGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTATCGTCGGCACGGCGTTTGCCATTACTACTGGCGTGAAACCCGATGTCGCAGTAGGTGTCGCCGTACCTTTCGCTGTCGCAGTACAGCTGGGGATTACCTTCCTGTTCTCGGTGATGTCCGGCGTGATGtctc > 1:49319/1‑275 (MQ=255) ccTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTAt < 6:223358/135‑1 (MQ=255) ccTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTAt > 5:223358/1‑135 (MQ=255) cTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTATCGTCGGCACGGCGTTTGCCATTACTACTGGCGTGAAACCCGATGTCGCAGTAGGTGTCGCCGTACCTTTCGCt > 2:215627/1‑207 (MQ=255) cTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTATCGTCGGCACGGCGTTTGCCATTACTACTGGCGTGAAACCCGATGTCGCAGTAGGTGTCGCCGTACCTTTCGCTGTCGCAGTACAGATGGGGATTACCTTCCTGTTCTCGGTGATGTCCGGCGTGATGTCTCGCTGCGACCt < 2:5612/275‑1 (MQ=255) cTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTATCGTCGGCACGGCGTTTGCCATTACTACTGGCGTGAAACCCGATGTCGCAGTAGGTGTCGCCGTACCTTTCGCTGTCGCAGTACAGATGGGGATTACCTTCCTGTTCTCGGTGATGTCCGGCGTGATGTCTCGCTGCGACCt > 2:419748/1‑275 (MQ=255) cGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTATCGTCGGCACGGCGttt > 5:1091134/1‑148 (MQ=255) gCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTATCGTCGGCACGGCGTTTGCCATTACTACTGGCGTGAAAcc < 2:571540/169‑1 (MQ=255) gCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTATCGTCGGCACGGCGTTTGCCATTACTACTGGCGTGAAACCCGATGTCGCAGTAGGTGTCGCCGTACCTTTCGCTGTCg < 4:215626/207‑1 (MQ=255) cGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGca < 5:359924/98‑1 (MQ=255) cGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTg > 6:64761/1‑113 (MQ=255) cGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTg < 5:64761/113‑1 (MQ=255) gTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTATCGTCGGCACGGCGTTTGCCAtt < 6:1091134/148‑1 (MQ=255) gcgacatcgggtttcacgccagtagtaatggcaaacgccgtgccgacgatagtaccgataatcacgttaggcg < 7:516321‑M1/1‑1 (MQ=255) gcgacatcgggtttcacgccagtagtaatggcaaacgccgtgccgacgatagtaccgataatcacgttaggcg > 8:516321‑M1/73‑73 (MQ=255) ggCTGGTACTTGGCGATCGGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTATCGTCGGCACGGCGTTTGCCATTACTACTGGCGTGAAACCCGATGTCGCAGTAGGTGTCGCCGTACCTTTCGCTGTCGCAGTACAGATGGGGATTACCTTCCTGTTCTCGGTGATGTCCGGCGTGATGTCTCGCTGCGACCTGGCAACAAACCCgcgc < 2:216053/275‑1 (MQ=255) tGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTATCGTCGGCACGGCGTTTGCCATTACTACTGGCGTGAAACCCGATGTCGCAGTAGGTGTCGCCGTACCTTTCGCTGTCGCAGTACAGATGGGGATTACCTTCCTGTTCTCGGTGATGTCCGGCGTGATGTCTCGCTGCGACCTGGCAACAAACCCGcgccg < 2:322652/274‑1 (MQ=255) ttGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTATCGTCGGCACGGCGTTTGCCATTACTACTGGCGTGAAACCCGATGTCGCAGTAGGTGTCGCCGTACCTTTCGCTGTCGCAGTACAGATGGGGATTACCTTCCTGTTCTCGGTGATGTCCGGCGTGATGTCTCGCTGCGACCTGGCAACAAACCCGCGCCGCATTTGa < 2:464082/275‑1 (MQ=255) gccagtagtaatggcaaacgccgtgccgacgatagtaccgataatcacgttaggcGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAg < 5:824651‑M1/26‑1 (MQ=255) gccagtagtaatggcaaacgccgtgccgacgatagtaccgataatcacgttaggcGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAg > 6:824651‑M1/56‑81 (MQ=255) cATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTATCGTCGGCACGGCGtt < 7:193533/113‑1 (MQ=255) cATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTATCGTCGGCACGGCGtt > 8:193533/1‑113 (MQ=255) aatggcaaacgccgtgccgacgatagtaccgataatcacgttaggcggc > 5:843620‑M1/47‑49 (MQ=255) aatggcaaacgccgtgccgacgatagtaccgataatcacgttaggcggc < 6:843620‑M1/3‑1 (MQ=255) aTACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGGGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTATCGTCGGCACGGCGTTTGCCATTACTACTGGCGTGAAACCCGATGTCGCAGTAGGTGTCGCCGTACCTTTCGCTGTCGCAGTACAGATGGGGATTACCTTCCTGTTCTCGGTGATGTCCGGCGTGATGTCTCGCTGCGACCTGGCAACAAACCCGCGCCGCATTTGATGCTGGTGCCGa < 2:31258/275‑1 (MQ=255) aCCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATc < 7:127778/87‑1 (MQ=255) aCCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATc > 8:127778/1‑87 (MQ=255) ggAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTATCGTCGGCACGGCGTTTGCCATTACTACTGGCGTGAAACCCGATGTCGc > 5:893848/1‑140 (MQ=255) ggAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTATCGTCGGCACGGCGTTTGCCATTACTACTGGCGTGAAACCCGATGTCGc < 6:893848/140‑1 (MQ=255) gAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAAGTGGTGTGGATggg < 5:845601/40‑1 (MQ=255) gAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATggg > 6:845601/1‑40 (MQ=255) aaTTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTATCGTCGGCACGGCGTTTGCCATTACTACTGGCGTGAAACCCGATGTCGCAGTAGGTGTCGCCGTACCTTTCGCTGTCGCAGTACAGATg > 2:541419/1‑178 (MQ=255) aaTTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTATCGTCGGCACGGCGTTTGCCATTACTACTGGCGTGAAACCCGATGTCGCAGTAGGTGTCGCCGTACCTTTCGCTGTCGCAGTACAGATGGGGATTACCTTCCTGTTCTCGGTGATGTCCGGCGTGATGTCTCGCTGCGACCTGGCAACAAACCCGCGCCGCATTTGATGCTGGTGCCGACGGCCTg > 2:183541/1‑275 (MQ=255) tttCACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTATCGTCGGCACGGCGTTTGCCATTACTACTGGCGTGAAACCCGATGTCGCAGTAGGTGTCGCCGTACCTTTCGCTGTCGCAGTACAGATGGGGATTACCTTCCTGTTCTCGGTGATGTCCg < 1:90606/206‑1 (MQ=255) tttAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTATCGTCGGCACGGCGTTTGcc > 6:667170/1‑106 (MQ=255) tttAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTATCGTCGGCACGGCGTTTGcc < 5:667170/106‑1 (MQ=255) tttAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTATCGTCGGCACGGCGTTTGCCATTACTACTGGCg < 6:969/119‑1 (MQ=255) tttAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTATCGTCGGCACGGCGTTTGCCATTACTACTGGCg > 5:969/1‑119 (MQ=255) ttAACCGGCGGTACGCTGGACCTGGNTTGGNTGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCNCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTATCGTCGGCACGGCGTTTGCCATTACTACTGGCGTGAAACCCGATGTCGCAGTAGGTGTCGCCGTACCTTTCGCTGTCGCAGTACAGATGGGGa < 4:541418/178‑1 (MQ=255) tagcagggggTACTCTGGAACTGGGGGTGATGGGGCTGCGCCCGCTGGCGGGGGCACATCCGCCTAACGTGATTATCGGTACAATCGTCGGCACGGCGTTTGCCATTACTACTGGCGTGAAACCCGATGTCGCAGTAGGTGTCGCCGTACCTTTCGCTGCCGAATTACAGATGGGGATTACCTTCCTGGTCTCGGTGATGTCCGGCGTGATGTCTCGCTGCGACCTGGCAACAAACCCGCGCCGCATTTGATGCTGGTGCCGACGGCCTGGTGCa < 4:475740/267‑1 (MQ=255) taCCGGGGGGAAGCTGGACCTGGTGGGGTTGGTGGTGGGCCCGCTGGCGGGGCCACGGCAGCCTCACGGGATTATCGGGACTATCGTCGGCATGGCGTTTGCCATTACTACTGGCGTGAAACCCGATGTCGAAGTAGCTGTCGCCGTACCTTTCGCTGTCGAAGTACAGATGGGGATTACCTTCCTGTTCTGGGTGATGGCCGGCGTGATGTCTCGCTGCGACCGGGCAACAAACCCGCGCCGCATTTGATGCTGGTGCCGACGGCCTGGTGCa < 4:309640/273‑1 (MQ=255) ggcggTACGCTGGAACTGGTGTGGATCGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTATCGTCGGCACGGCGTTTGCCATTACTACTGGCGTGAAACCCGATGTCGCAGTAGGTGTCGCCGTACCtt > 6:245943/1‑148 (MQ=255) cggTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTATCGTCGGCACGGCGTTTGCCATTACTACTGGCGTGAAACCCTATGTCGCAGTAGGTGTCGCCGTACCTTTCGCTGTCGCATTACAGATGGGGATTACCTTCCTTTTCTCGTTGATGTCCGTCGTGATGTCTCGCTGCGACCTGTCACCAAACCCGCGCCGCACTTTATGCTGGTCCCGACGGCCTGGTCCATCGCtat > 1:86942/1‑275 (MQ=255) taggCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCGCCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTAGCGGTACTATCGTCGGCACGGCGTTTGCCATTACTACTGGCGTGAAACCCGATGTCGCAGTAGGTGTCGCCGTACCTTTCGCTGTCGCAGTACAGATGGGGATTACCTTCCTGTTCTCGGTGATGTCCGGCGTGATGTCTCGCTGCGACCTGGCAACAAACCCGCGCCGCATTTGATGCTGGTGCCGACGGCCTGGTGCATTGCTATAAc < 2:191962/272‑1 (MQ=255) aCGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTATCGTCGGCACGGCGTTTGCCATtac > 6:420806/1‑98 (MQ=255) aCGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTATCGTCGGCACGGCGTTTGCCATtac < 5:420806/98‑1 (MQ=255) cGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTATCGTCGGCACGGCGTTTGCCATTACTACTGGCGTGAAACCCGATGTCGCAGTAGGTGTCGCCGTACCTTTCGCTGTCGCAGTACAGATGGGGATTACCTTCCTGTTCTCGGTGATGTCCGGCGTGATGTCTCGCTGCGACCTGGCAACAAACCCGCGCCGCATTTGATGCTGGTGCCGACGGCCTGGTGCATTGCTATAACgg < 2:279013/275‑1 (MQ=255) gCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATTGGTACTATCGTCGGCACGGCGTTTGCCATTACTACTGGCGTGAAACCCGATGTCGCAGTAGGTGTCGCCGTACCTTTCGCTGTc < 5:245943/148‑1 (MQ=255) aaCTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCGGGCGGGCGAACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTATCGTCGGCACGGCGTTTGCCATTACTACTGGCGTGAAACCCGATGTCGCAGTAGGTGTCGCCGTACCTTTCGCTGTCGCAGTACAGATGGGGATTACCTTCCTGTTCTCGGTGATGTCCGGCGTGATGTCTCGCTGCGACCTGGCAACAAACCCGCGCCGCATTTGATGCTGGTGCCGACGGCCTGGTGCATTGCTATAACGGGATGAc < 2:402447/275‑1 (MQ=255) atcacgttaggcGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGcac < 5:171066‑M1/24‑1 (MQ=255) atcacgttaggcGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGcac > 6:171066‑M1/13‑36 (MQ=255) gtgtGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTATCGTCGGCACGGCGTTTGCCATTACTACTGGCGTGAAACCCGATGTCGCAGTAGGTGTCGCCGTACCTTTCGCTGTCGCAGTACAGATGGGGATTACCTTCCTGTTCTCGGTGATGTCCGGCGTGATGTCTCGCTGCGACCTGGCAACAAACCCGCGCCGCATTTGATGCTGGTGCCGACGGCCTGGTGCCTTGCTATAACGGGATGACAGGt > 2:392054/1‑274 (MQ=255) tgtgGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTATCGTCGGCACGGCGTTTGCCAtt > 7:701074/1‑83 (MQ=255) tgtgGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTATCGTCGGCACGGCGTTTGCCAtt < 8:701074/83‑1 (MQ=255) gATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTATCGTCGGCACGGCGTTTGCCATTACTACTGGCGTGAAACCCGATGTCGCAGTAGGTGTCGCCGTACCTTTCGCTGNCGCAGGNCAGATg > 3:27148/1‑145 (MQ=255) aTGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTATCGTCGGCACGGCGTTTGCCATTACTACTGGCGTGAAACCCGa < 8:1034959/98‑1 (MQ=255) aTGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTATCGTCGGCACGGCGTTTGCCATTACTACTGGCGTGAAACCCGa > 7:1034959/1‑98 (MQ=255) tGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTATCGTCGGCACGGCGTTTGCCATTACTACTGGCGTGAAACCCGATGTCGCAGTAGGTGTCGCCGTACCTTTCGCTGTCGCAGTACAGATGGGGAt > 7:597930/1‑148 (MQ=255) gggCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTATCGTCGGCACGGCGTTTGCCATTACTACTGGCGTGAAACCCGATGTCGCAGTAGGTGTCGCCGTACCTTTCGCTGTCGCAGTACAGATGGGGa < 1:27148/145‑1 (MQ=255) GGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTATCGTCGGCACGGCGTTTGCCATTACTACTGGCGTGAAACCCGATGTCGCAGTAGGTGTCGCCGTACCTTTCGCTGTCGCAGTACAGATGGGGATTACCTTCCTGTTCTCGGTGATGTCCGGCGTGATGTCTCGCTGCGACCTGGCAACAAACCCGCGCCGCATTTGTTGCTGGTGCCGACGGCCTTGTTCATTGCTATTACGGAATGacagggttaaatacacg < 2:226232‑M1/275‑9 (MQ=255) | GAAAACCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGGCGCACAGCCGCCTAACGTGATTATCGGTACTATCGTCGGCACGGCGTTTGCCATTACTACTGGCGTGAAACCCGATGTCGCAGTAGGTGTCGCCGTACCTTTCGCTGTCGCAGTACAGATGGGGATTACCTTCCTGTTCTCGGTGATGTCCGGCGTGATGTCTCGCTGCGACCTGGCAACAAACCCGCGCCGCATTTGATGCTGGTGCCGACGGCCTGGTGCATTGCTATAACGGGATGACAGGTTTACATCACCG > NC_000913/3280615‑3281159 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |