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Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
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gAAGAGTGTGTGGAAGAGGTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAGGCACCATTg > 8:216693/1‑148 (MQ=255) aaGAGTGTGTGGAAGAGGTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGa < 6:728033/136‑1 (MQ=255) aaGAGTGTGTGGAAGAGGTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGa > 5:728033/1‑136 (MQ=255) gtgtgGAAGAGGTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAGGCACCATTGTCAATATGGAAGGCA‑GCGGTGAGCATAGCCGTTTGCAGGTGGCATTTCAGGGCCAGGGTATTAAATGGCTGGTGGCGGCA‑TACGCCCGGCTGGAGTCGGTGTAACGTTGCCGGATGCGGTTCTGCGCACCTTa > 2:313650/1‑274 (MQ=255) gtgGAAGAGGTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGc < 8:160192/99‑1 (MQ=255) gtgGAAGAGGTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGc > 7:160192/1‑99 (MQ=255) tgGAAGAGGTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAGGCACCATTGTCAATATGGa < 7:216693/148‑1 (MQ=255) aaGAGGTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAg < 5:748606/126‑1 (MQ=255) aaGAGGTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAg > 6:748606/1‑126 (MQ=255) agagGTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAGGCACCATTGTCAATATGGa > 5:775067/1‑144 (MQ=255) gagGTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAGGCACCATTGTCAATATGGAAGGCA‑GCGGTGAGCATAGCCGTTTGCAGGTGGCATTTCAGGGCCAGGGTATTAAATGGCTGGTGGCGGCA‑TACGCCCGGCTGGAGTCGGTGTAACGTTGCCGGATGCGGTGCTGCGCACCTTATTTTGCCTa > 2:521980/1‑275 (MQ=255) gTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAg > 1:39092/1‑42 (MQ=255) tGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTgg < 5:695753/115‑1 (MQ=255) tGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTgg > 6:695753/1‑115 (MQ=255) tGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAGGCACCATTGTCAATATGGa < 6:348267/139‑1 (MQ=255) tGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAGGCACCATTGTCAATATGGa > 5:348267/1‑139 (MQ=255) 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cccGGGCAGCCATCAGCGGAGGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGAGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAGGCACCATTGTCAATATTGAAGGCA‑GCGGTGAGCATAGCCGTTTGCAGGTGGCATTTCAGGGCCAGGGTATTAAATGGCTGGTGGCGGCA‑TACGCCCGGCTGGAGTCGGTGTAACGTTGCCGGATGCGGTGCTGCGCACCTTATTTGGCCTAAAAAATCATTCAGATTCAATAAATTGCa < 1:69917/274‑1 (MQ=255) ccGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAGGCACCATTGTCAATATGGAAGGCA‑GCGGTGAGCATAGCCGTTTGCAGGTGGCATTTCAGGGCCAGGGTATTAAATGGCTGGTGGCGGCA‑TACGCCCGGCTGGAGTCGGTGTAACGTTGCCGGATGCGGTGCTGCGCACCTTATTTGGCCT‑AAAAATCATTCAGATTCAATAAATTGCAACg > 4:367841/1‑275 (MQ=255) gTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAGGCTCCATTGTCAATATGGAAg > 5:810520/1‑112 (MQ=255) gTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAGGCACCATTGTCAATATGGAAg < 6:810520/112‑1 (MQ=255) | CCTGGAGTTCCCGCAGGTGTTTATCGTTGGTATGGAAGAGGGCATGTTCCCAAGCCAGATGTCGCTGGATGAAGGCGGGCGTCTGGAAGAAGAACGCCGTCTGGCCTACGTTGGCGTAACCCGCGCGATGCAGAAACTGACGCTGACCTACGCGGAAACCCGCCGTCTGTATGGTAAAGAGGTTTACCATCGCCCGTCGCGCTTTATCGGCGAGCTGCCGGAAGAGTGTGTGGAAGAGGTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAGGCACCATTGTCAATATGGAAGGCA‑GCGGTGAGCATAGCCGTTTGCAGGTGGCATTTCAGGGCCAGGGTATTAAATGGCTGGTGGCGGCA‑TACGCCCGGCTGGAGTCGGTGTAACGTTGCCGGATGCGGTGCTGCGCACCTTATTTGGCCTAAAAAATCATTCAGATTCAATAAATTGCAACG > NC_000913/3999674‑4000214 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |