New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
TGGTATGGAAGAGGGCATGTTCCCAAGCCAGATGTCGCTGGATGAAGGCGGGCGTCTGGAAGAAGAACGCCGTCTGGCCTACGTTGGCGTAACCCGCGCGATGCAGAAACTGACGCTGACCTACGCGGAAACCCGCCGTCTGTATGGTAAAGAGGTTTACCATCGCCCGTCGCGCTTTATCGGCGAGCTGCCGGAAGAGTGTGTGGAAGAGGTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAGGCACCATTGTCAATATGGAAGGCA‑GCGGTGAGCATAGCCGTTTGCAGGTGGCATTTCAGGGCCAGGGTATTAAATGGCTGGTGGCGGCA‑TACGCCCGGCTGGAGTCGGTGTAACGTTGCCGGATGCGGTGCTGCGCACCTTATTTGGCCTAAAAAATCATTCAGATTCAATAAATTGCAACGTCATGTAGGCCGGATAGGGCGTTTACGCCGC > NC_000913/3999701‑4000245 | tGGTATGGAAGAGGGCATGTTCCCAAGCCAGATGTCCCTGGATGAAGGCGGGCGTCTGGAAGAAGAACGCCGTCTGGCCTACGTTGGCGTAACCCGCGCGATGCAGAAACTGACGCTGACCTACGCGGAAACCCGCCGTCTGTATGGTAAAGAGGTTTACCATCGCCCGTCGCGCTTTATCGGCGAGCTGCCGGAAGAGGGTGTGGAAGAGGGGTGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGATCAGCCATCCGCGGCTGGGGAGGCCAATGGTCg > 2:544355/1‑275 (MQ=255) 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8:843510‑M1/97‑1 (MQ=255) TCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAGGCACCATTGTCAATATGGAAGGCA‑GCGGTGAGCATAGCCGTTTGCAGGTGGCATTTCAGGGCCAg > 8:1044590‑M1/1‑148 (MQ=255) CAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAGGCACCATTGTCAatat < 5:678187‑M1/98‑1 (MQ=255) CAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAGGCACCATTGTCAATATGGAAGGCA‑GCGGTGAGCATAGCCGTTTGCAGGTGGCATTTCAGGGCCa > 7:221232‑M1/1‑146 (MQ=255) CAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAGGCACCATTGTCAATATGGAAGGCA‑GCGGTGAGCATAGCCGTTTGCAGGTGGCATTTCAGGGCCa < 8:221232‑M1/146‑1 (MQ=255) aGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAGGCACCATTGTCAATATGGAAGGCA‑GCGGTGAGCATAGCCGTTTGCAGGTGGCATTTCAGGGCCAggg < 8:540003/148‑1 (MQ=255) gCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAGGCACCATTGTCAATATGGAAGGCA‑GCGGTGAGCATAGCCGTTTGCAGGTGGCAttt > 7:497466/1‑136 (MQ=255) cGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAGGCACCATTGTCAATATGGAAGGCA‑GCGGTGAGCATAGCCGTTTGCAGGTGGCATTTCAGGGcc < 6:975999/142‑1 (MQ=255) cGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAGGCACCATTGTCAATATGGAAGGCA‑GCGGTGAGCATAGCCGTTTGCAGGTGGCATTTCAGGGcc > 5:975999/1‑142 (MQ=255) tgATGGGTACTCGGATGGTCGAGAACGCCAGCGGCAACAAGCTCGGCCAGCGCGGACGCCACGCTAAGGTTGGTGAAGGCACCATTGTCAATATGGAAGGCA‑GCGGTGAGCATAGCCGTTTGCAGGTGGCATTTCAGGGCCAGGGTATTAAATGGCTGGTGGCGGCA‑TACGCCCGGCTGGAGTCGGTGTAACGTTGCCGGATGCGGTGCTGCGCACCTTATTTGGCCTAAAAAATCATTCAGATTCAATAAATTGCAACGTCATGTAGGCCGGAt < 1:150093/274‑1 (MQ=255) ggATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAGGCACCATTGTCAATATGGAAGGCA‑GCGGTGAGCATAGCCGTTTGCAGGt < 6:703597/127‑1 (MQ=255) ggATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAGGCACCATTGTCAATATGGAAGGCA‑GCGGTGAGCATAGCCGTTTGCAGGt > 5:703597/1‑127 (MQ=255) 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tACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAGGCACCATTGTCAATATGGAAGGCA‑GCGGTGAGCATAGCCGTTTGCAGGTGGCATTTCAGGGCCAGGGTAt > 8:426466/1‑141 (MQ=255) aCGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAGGCACCATTGTCAATATGGAAGGCA‑GCgg < 5:566137/98‑1 (MQ=255) aCGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAGGCACCATTGTCAATATGGAAGGCA‑GCgg > 6:566137/1‑98 (MQ=255) gCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAGGCACCATTGTCAATATGGAAGGCA‑GCGGTGAGCATAGCCGtt > 6:223172/1‑110 (MQ=255) gCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAGGCACCATTGTCAATATGGAAGGCA‑GCGGTGAGCATAGCCGtt < 5:223172/110‑1 (MQ=255) atggTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAGGCACCATTGTCAATATGGAAGGCA‑GCGGTGAGCATAGCCGtt > 6:452019‑M2/5‑106 (MQ=255) atggTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAGGCACCATTGTCAATATGGAAGGCA‑GCGGTGAGCATAGCCGTTTGCAGGTGGCATTTCAGGGCCAg < 8:665384‑M2/125‑1 (MQ=255) 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ggTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAGGCACCATTGTCAATATGGAAGGCA‑GCGGTGAGCATAGCCGTTTGCAGGTGGCATTTCAGGGCCAGGGTATCAAATGNCTGGTGGCGGCA‑TACGCACGGCTGGAGTCGGTGTAACGTGTCCGGAGGCGGGTCTGCGCACCCTATTTGGCCTANAAAACCATTTATATTCAATAATTTGCAACGNNCTTAAGGCCGGAAAGGGCAGTTacgccga > 3:70586‑M2/3‑274 (MQ=255) gTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAGGCACCATTGTCAATATGGAAGGCA‑GCGGTGAGCATAGCCg > 6:687302‑M2/2‑101 (MQ=255) | TGGTATGGAAGAGGGCATGTTCCCAAGCCAGATGTCGCTGGATGAAGGCGGGCGTCTGGAAGAAGAACGCCGTCTGGCCTACGTTGGCGTAACCCGCGCGATGCAGAAACTGACGCTGACCTACGCGGAAACCCGCCGTCTGTATGGTAAAGAGGTTTACCATCGCCCGTCGCGCTTTATCGGCGAGCTGCCGGAAGAGTGTGTGGAAGAGGTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAGGCACCATTGTCAATATGGAAGGCA‑GCGGTGAGCATAGCCGTTTGCAGGTGGCATTTCAGGGCCAGGGTATTAAATGGCTGGTGGCGGCA‑TACGCCCGGCTGGAGTCGGTGTAACGTTGCCGGATGCGGTGCTGCGCACCTTATTTGGCCTAAAAAATCATTCAGATTCAATAAATTGCAACGTCATGTAGGCCGGATAGGGCGTTTACGCCGC > NC_000913/3999701‑4000245 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |