New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_000913 | 1451587 = | 112 (0.760) | intergenic (‑238/+10) | tynA/paaZ | tyramine oxidase, copper‑requiring/oxepin‑CoA hydrolase and 3‑oxo‑5,6‑dehydrosuberyl‑CoA semialdehyde dehydrogenase |
Only 100 of 155 total aligned reads displayed.
GGGGCTTCCCATTATTAACCTCGTCAGATGTTGTGTTCTTGTTAGCAACCGCGCTCTGTGGGCGGTTTAGTCAGGTTCACATTATCAGTACTGATGCAAAGGGGATTGCCTGCACCTGCCAGGTTGTTTGGCAGGTGTGCCAGCTTTTCATACAGTGGATGCCCTGAAAATAGATGTACACATCATGCATAATGTGACAACGTCACAAAACTTAGTGAAATAAAAGGGCAACTATTCGCCGTTGCCCTTCATTCACCGATTAATCGACAAAATCACCGTGCTGCCTGGCCACCAGCGTCAGAATTGAATACAGCGCCACCGGGGTTTGATGCTGATTGAATACCTCTACAGCCCATT‑CCACCACACCTGTTGGTTTTTCTTCTGCGCTACGCTGTTTTTTCAGCGTCTTGCGCTTACAGGTGAGACGCACCTGGATGGTATCGCCTGGCTTTACGGGTTCGATAAAACGCAAGCTTTCCAGCCCGTAGTTAGCAATGACCGGACCGACACCGGCATCGACAAAC > NC_000913/1451338‑1451861 | cTTCCCATTATTAACCTCGTCAGATGTTGTGTTCTTGTTAGCAACCGCGCTCTGTGGGCGGTTTAGTCAGGTTCACATTATCAGTACTGATGCAAAGGGGATTGCCTGCACCGGCCAGCTTGTTTGGCCGGTGTGCCAGCTTTTCATACAGTGGCTGCCCGGAAAATAGAGGTACACATCATGCATAATGTGAAAACNTCACAAAACTTAGTGAAATAAAAGCACAACTATCCGCCGTTGCCATTCATTCACCCATTAATCTACAAAATCaaca > 3:130614/1‑271 (MQ=255) 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5:2741‑M1/134‑1 (MQ=255) ACTATTCGCCGTTGCCCTTCATTCACCGATTAATCGACAAAATCACCGTGCTGCCTGGCCACCAGCGTCAGAATTGAATACAGCGCCACCGGGGTTTGa < 6:1112887‑M1/99‑1 (MQ=255) ACTATTCGCCGTTGCCCTTCATTCACCGATTAATCGACAAAATCACCGTGCTGCCTGGCCACCAGCGTCAGAATTGAATACAGCGCCACCGGGGTTTGa > 5:1112887‑M1/1‑99 (MQ=255) ACTATTCGCCGTTGCCCTTCATTCACCGATTAATCGACAAAATCACCGTGCTGCCTGGCCACCAGCGTCAGAATTGAATACAGCGCCACCGGGGTTTGATg > 8:1019008‑M1/1‑101 (MQ=255) ccGTTGCCCTTCATTCACCGATTAATCGACAAAATCACCGTGCTGCCTGGCCACCAGCGTCAGAATTGAATACAGCGCCACCGGGGTTTGATGCTGATTGaa < 7:1004736/102‑1 (MQ=255) ccGTTGCCCGTCATTCACCGATTAATCGACAAAATCACCGGGATGCCTGGCCACCAGCGTCAGAATTGAATACAGCGCCACCGGGGTTTGATGCTGATTGAATACCTCTACAGCCCATT‑CCACCACACCTGTTGGTTTTTCTTCTGCGCTACGCTGTTTTTTCAGCGTCTTGCGCTTACAGGTGAGACGAACCTGGATGGTATCGCCTGGCTTTACGGGTTCGATAAAACGCAAGCTTTCCAGCCCGTAGTTAGCAATGACCGGACCGACACCgg < 2:417123/275‑1 (MQ=255) 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6:302963‑M2/146‑1 (MQ=255) cattcaCCGATTAATCGACAAAATCACCGTGCTGCCTGGCCACCAGCGTCAGAATTGAATACAGCGCCACCGGGGTTTGATGCTGCTTGAATACCTCTACAGCCCATT‑CCACCACACCTGTTGGTTTTTCTTCTGCGCTACGCTGTTTTTTCAGCGTCTTTCGCTTACAGGTGAGACGCACCTGGATGGTATCGCCTGGCTTTACGGGTTCGATAAAACGCAAGCTTTCCCGCCCGTAGTTAGCAATTACCGGCCCGACCGCGGCCGCGACCAAc > 1:127488/1‑275 (MQ=255) cattcaCCGATTAATCGACAAAATCACCGTGCTGCCTGGCCACCAGCGTCAGAATTGAATACAGCGCCACCGGGGTTTGATGCTGATTGAATACCTCTACAGCCCATT‑CCACCACACCTGTTGGTTTTTCTTCTGCGCTACGCTGTTTTTTCAGCGTCTTGCGCTTACAGGTGAGACGCACCTGGATGGTATCGCCTGGCTTTACGGGTTCGATAAAACGCAAGCTTTCCAGCCCGTAGTTAGCAATGACCGGACCGACACCGGCATCGACAAAc < 2:362490/275‑1 (MQ=255) | GGGGCTTCCCATTATTAACCTCGTCAGATGTTGTGTTCTTGTTAGCAACCGCGCTCTGTGGGCGGTTTAGTCAGGTTCACATTATCAGTACTGATGCAAAGGGGATTGCCTGCACCTGCCAGGTTGTTTGGCAGGTGTGCCAGCTTTTCATACAGTGGATGCCCTGAAAATAGATGTACACATCATGCATAATGTGACAACGTCACAAAACTTAGTGAAATAAAAGGGCAACTATTCGCCGTTGCCCTTCATTCACCGATTAATCGACAAAATCACCGTGCTGCCTGGCCACCAGCGTCAGAATTGAATACAGCGCCACCGGGGTTTGATGCTGATTGAATACCTCTACAGCCCATT‑CCACCACACCTGTTGGTTTTTCTTCTGCGCTACGCTGTTTTTTCAGCGTCTTGCGCTTACAGGTGAGACGCACCTGGATGGTATCGCCTGGCTTTACGGGTTCGATAAAACGCAAGCTTTCCAGCCCGTAGTTAGCAATGACCGGACCGACACCGGCATCGACAAAC > NC_000913/1451338‑1451861 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |