| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 183661 | 44 (0.470) | 13 (0.150) | 10/180 | NT | 22.5% | intergenic (+41/+48) | cdaR/yaeH | carbohydrate diacid regulon transcriptional regulator; autoregulator/UPF0325 family protein |
| ? | NC_000913 | = 183674 | 50 (0.590) | intergenic (+54/+35) | cdaR/yaeH | carbohydrate diacid regulon transcriptional regulator; autoregulator/UPF0325 family protein | |||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
TGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAATCTCGCTGATCTTATTGGTTACGACTGACTCCAGGTGACGTAAGTCGTCGAGGATCTTACGCTTA > NC_000913/183514‑183808 | tGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTC > 4:786341‑M1/1‑148 (MQ=255)tGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTC > 1:759888‑M1/1‑148 (MQ=255) ttAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCtacccttcgggc < 2:311644‑M1/148‑13 (MQ=255) aaTCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAg < 4:962760‑M2/148‑2 (MQ=255) aaTCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAg > 4:141039‑M2/1‑147 (MQ=255) aTCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAga > 3:962760‑M2/1‑146 (MQ=255) aTCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAga < 4:193428‑M2/148‑3 (MQ=255) cGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCtacccttcgggctgagg > 2:815438‑M1/1‑131 (MQ=255) cGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCtacccttcgggctgagg < 1:815438‑M1/148‑18 (MQ=255) atatCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAgagggga < 2:395918‑M2/148‑8 (MQ=255) tGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAga > 3:728212‑M2/1‑121 (MQ=255) tGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAga < 4:728212‑M2/123‑3 (MQ=255) ttGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCtacccttcgggctgagggga > 2:235083‑M1/1‑104 (MQ=255) ttGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCtacccttcgggctgagggga < 1:235083‑M1/124‑21 (MQ=255) ttGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCtacccttcgggctgag < 2:282973‑M1/120‑17 (MQ=255) ttGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCtacccttcgggctgag > 1:282973‑M1/1‑104 (MQ=255) ttGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAgagg > 4:519652‑M2/1‑117 (MQ=255) ttGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAgagg < 3:519652‑M2/121‑5 (MQ=255) ttGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCg < 3:193428/148‑1 (MQ=255) gCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAACGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAgagg > 2:954820‑M2/1‑113 (MQ=255) cAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGa > 4:339374/1‑106 (MQ=255) ttGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTa < 1:395918/148‑1 (MQ=255) cAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGattat < 2:441915/138‑1 (MQ=255) cAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGattat > 1:441915/1‑138 (MQ=255) gctgTATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCa > 4:860927/1‑148 (MQ=255) tgTATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGc < 1:911482/79‑1 (MQ=255) aTGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTcc < 1:790296/142‑1 (MQ=255) aTGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTcc > 2:790296/1‑142 (MQ=255) gtgGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAggg > 3:979205/1‑82 (MQ=255) gtgGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAggg < 4:979205/82‑1 (MQ=255) ggCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGc < 1:62978/93‑1 (MQ=255) ggCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGc > 2:62978/1‑93 (MQ=255) tACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAgagg < 3:812752‑M2/81‑5 (MQ=255) tACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGtt < 4:217493/124‑1 (MQ=255) tACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGtt > 3:217493/1‑124 (MQ=255) aCTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCtacccttcgggctgaggg < 3:799157‑M1/78‑19 (MQ=255) aCTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCtacccttcgggctgaggg > 4:799157‑M1/1‑60 (MQ=255) aCTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAgagggg > 4:885596‑M2/1‑73 (MQ=255) aCTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAATCTCGc < 3:860927/148‑1 (MQ=255) cTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGAt > 3:564599/1‑132 (MQ=255) cTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGAt < 4:564599/132‑1 (MQ=255) aTGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCtacccttcgggctgagg < 3:405884‑M1/72‑18 (MQ=255) aTGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCtacccttcgggctgagg > 4:405884‑M1/1‑55 (MQ=255) aTGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAg > 2:321243‑M2/1‑68 (MQ=255) aTGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAg < 1:321243‑M2/69‑2 (MQ=255) gagCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCa < 1:544548/131‑1 (MQ=255) gagCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCa > 2:544548/1‑131 (MQ=255) gagCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAATCTCGCTGATCTTAtt > 3:651261/1‑148 (MQ=255) cGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAATCTCGCTGATCTTATTGGt < 4:651261/148‑1 (MQ=255) gTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAgagg > 3:835700‑M2/1‑58 (MQ=255) gTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAgagg < 4:835700‑M2/62‑5 (MQ=255) gTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGAt < 2:41295/118‑1 (MQ=255) tAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGa > 3:254044/1‑91 (MQ=255) gTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGt > 2:632494/1‑65 (MQ=255) gTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGt < 1:632494/65‑1 (MQ=255) cTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCtt > 1:1114496/1‑91 (MQ=255) cTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCtt < 2:1114496/91‑1 (MQ=255) cATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAATCTCGCTGATCTTAt > 1:947056/1‑107 (MQ=255) cATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAATCTCGCTGATCTTAt < 2:947056/107‑1 (MQ=255) cATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAATCTCGCTGATCTTATTGGTTACGACTGACTCCAGGTGACGTa < 1:1074963/134‑1 (MQ=255) cATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAATCTCGCTGATCTTATTGGTTACGACTGACTCCAGGTGACGTa > 2:1074963/1‑134 (MQ=255) cATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAATCTCGCTGATCTTATTGGTTACGACTGACTCCAGGTGACGTAAGTCGTCGAGGATc > 3:993565/1‑148 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ccTCtacccttcgggctgaggggaatgagccagcgccgcctcaaccttaacgcataacctaccgctcttcatccagttgtaacgccacatacagcagcaacctgtcatcaaaattgc < 1:954820‑M1/117‑114 (MQ=255) ccTCtacccttcgggctgaggggaatgagccagcgccgcctcaaccttaacgcataacctaccgctcttcatccagttgta > 4:812752‑M1/1‑4 (MQ=255) ccTCtacccttcgggctgaggggaatgagccagcgccgcctcaaccttaacgcataacctaccgctcttcatccagttgta < 3:812752‑M1/81‑78 (MQ=255) ccTCtacccttcgggctgaggggaatgagccagcgccgcctcaaccttaacgcataacctac < 4:835700‑M1/62‑59 (MQ=255) ccTCAGCCCGAAGGGTAgaggggaatgagccagcgccgcctcaaccttaacgcataacctaccgctcttcatccagttgtaacgccacatacagcagcaacctgtcatcaaaattgcccaaatcaagcccggtcagttccgatatacg > 2:815438‑M2/1‑17 (MQ=255) ccTCAGCCCGAAGGGTAgaggggaatgagccagcgccgcctcaaccttaacgcataacctaccgctcttcat > 4:405884‑M2/1‑17 (MQ=255) ccTCAGCCCGAAGGGTAgaggggaatgagccagcgccgcctcaaccttaacgcataacctaccgctcttcat < 3:405884‑M2/72‑56 (MQ=255) ccTCAGCCCGAAGGGTATAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAATCTCGCTGATCTTATTGGTTa > 3:337911/1‑107 (MQ=255) ccTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAATCTCGCTGATCTTATTGGTTa < 4:337911/107‑1 (MQ=255) cTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAATCTCGCTGATCTTATTGGTTACGACTGACTCCAGGTGACGTAAGtcgtcg > 3:181573/1‑135 (MQ=255) cTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAATCTCGCTGATCTTATTGGTTACGACTGACTCCAGGTGACGTAAGtcgtcg < 4:181573/135‑1 (MQ=255) tctacccttcgggctgaggggaatgagccagcgccgcctcaaccttaacgcataacctaccgctcttcatccagttgtaacgccacatacagcagcaacctgtcatcaaaattgcccaaatcaagcccggtcagttccgatatacgat > 3:962760‑M1/1‑2 (MQ=255) tctacccttcgggctgaggggaatgagccagcgccgcctcaaccttaacgcataacctaccgctcttcatccagttgtaacgccacatacagcagcaacctgtcatcaaaattgcccaaatcaagcccggtcagttccgatatacgat < 4:193428‑M1/148‑147 (MQ=255) tctacccttcgggctgaggggaatgagccagcgccgcctcaaccttaacgcataacctaccgctcttcatccagttgtaacgccacatacagcagcaacctgtcatcaaaattgcccaaatca > 3:728212‑M1/1‑2 (MQ=255) tCAGCCCGAAGGGTAgaggggaatgagccagcgccgcctcaaccttaacgcataacctaccgctcttcatccagttgtaacgccacatacagcagcaacctgtcatcaaaattgcccaaatcaagcccggtcagttccgatatacgat < 3:786341‑M2/148‑134 (MQ=255) ctacccttcgggctgaggggaatgagccagcgccgcctcaaccttaacgcataacctaccgctcttcatccagttgtaacgccacatacagcagcaacctgtcatcaaaattgcccaaatcaagcccggtcagttccgatatacgatt < 4:962760‑M1/148‑148 (MQ=255) ctacccttcgggctgaggggaatgagccagcgccgcctcaaccttaacgcataacctaccgctcttcat < 1:321243‑M1/69‑69 (MQ=255) ctacccttcgggctgaggggaatgagccagcgccgcctcaaccttaacgcataacctaccgctcttcat > 2:321243‑M1/1‑1 (MQ=255) cAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGttt > 2:744111/1‑66 (MQ=255) cAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGttt < 1:744111/66‑1 (MQ=255) cAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAATCTCGCTGATCTTAt < 1:447025/98‑1 (MQ=255) cAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAATCTCGCTGATCTTATTGGTTACGACTGACTCCAGGTGACGTAAGTCGTCGAGGATCt > 4:871100/1‑140 (MQ=255) cAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAATCTCGCTGATCTTATTGGTTACGACTGACTCCAGGTGACGTAAGTCGTCGAGGATCt < 3:871100/140‑1 (MQ=255) cAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAATCTCGCTGATCTTATTGGTTACGACTGACTCCAGGTGACGTAAGTCGTCGAGGATCTTACGCTTa < 2:637440/148‑1 (MQ=255) | TGGAGTATCGGCTTAATCGTATATCGGAACTGACCGGGCTTGATTTGGGCAATTTTGATGACAGGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCTGGCTCATTCCCCTCAGCCCGAAGGGTAGAGGGGAATGCCCGAATTAACCGTCAGTTCGGGATTATTTACGCGTTAGTTTTTCCAGATCGGCTTCAATCTCGCTGATCTTATTGGTTACGACTGACTCCAGGTGACGTAAGTCGTCGAGGATCTTACGCTTA > NC_000913/183514‑183808 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |