| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 985196 = | 98 (1.050) | 10 (0.120) | 10/184 | NT | 11.4% | coding (514/1191 nt) | aspC | aspartate aminotransferase, PLP‑dependent |
| ? | NC_000913 | 985219 = | 65 (0.760) | coding (491/1191 nt) | aspC | aspartate aminotransferase, PLP‑dependent | |||||
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
GACCACGGGCAAAACCCTGGTAAGCGAAGTCAAACAGCGGTAACCAGCCTTTCTCAACGGAGAGTTGTGCCAGTGTTTGCCATTGTTCCAGCGTAGGGTCGATACCGGTTGGGTTATGGCAGCAGCCATGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCACGAACTTCCAGACCTGCAGAGTTAAAGACGCTCTTATGGTTCGGCCAGCTTGGGTTGC > NC_000913/985049‑985333 | gACCACGGGCAAAACCCTGGTAAGCGAAGTCAAACAGCGGTAACCAGCCTTTCTCAACGGAGAGTTGTGCCAGTGTTTGCCATTGTTCCAGCGTAGGGTCGATACCGGTTGGGTTATGGCAGCAGCCATGGAACAGCACTACGTCGcc > 4:653940/1‑148 (MQ=255) ggCAAAACCCTGGTAAGCGAAGTCAAACAGCGGTAACCAGCCTTTCTCAACGGAGAGTTGTGCCAGTGTTTGCCATTGTTCCAGCGTAGGGTCGATACCGGTTGGGTTATGGCAGCAGCCATGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGa > 1:358543/1‑148 (MQ=255) accagcgttaagcgtgtgtgggtgagcaacccaagctggccgaaccataagagcgtctttaactctgcaggtctggaagttcgtgaatacgcttattatgatgcggaaaatcacactcttgacttcgatgcactgattaaCAGCCTGa > 1:463105‑M1/141‑148 (MQ=255) aaaCCCTGGTAAGCGAAGTCAAACAGCGGTAACCAGCCTTTCTCAACGGAGAGTTGTGCCAGTGTTTGCCATTGTTCCAGCGTAGGGTCGATACCGGTTGGGTTATGGCAGCAGCCATGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCtt < 2:358543/148‑1 (MQ=255) agcgtgtgtgggtgagcaacccaagctggccgaaccataagagcgtctttaactctgcaggtctggaagttcgtgaatacgcttattatgatgcggaaaatcacactcttgacttcgatgcactgattaaCAGCCTGa > 2:485904‑M1/131‑138 (MQ=255) agcgtgtgtgggtgagcaacccaagctggccgaaccataagagcgtctttaactctgcaggtctggaagttcgtgaatacgcttattatgatgcggaaaatcacactcttgacttcgatgcactgattaaCAGCCTGa < 1:485904‑M1/8‑1 (MQ=255) aGTCAAACAGCGGTAACCAGCCTTTCTCAACGGAGAGTTGTGCCAGTGTTTGCCATTGTTCCAGCGTAGGGTCGATACCGGTTGGGTTATGGCAGCAGCCATGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTg > 2:846377/1‑127 (MQ=255) aGTCAAACAGCGGTAACCAGCCTTTCTCAACGGAGAGTTGTGCCAGTGTTTGCCATTGTTCCAGCGTAGGGTCGATACCGGTTGGGTTATGGCAGCAGCCATGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTg < 1:846377/127‑1 (MQ=255) aaCAGCGGTAACCAGCCTTTCTCAACGGAGAGTTGTGCCAGTGTTTGCCATTGTTCCAGCGTAGGGTCGATACCGGTTGGGTTATGGCAGCAGCCATGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCtt > 3:1112975/1‑127 (MQ=255) aaCAGCGGTAACCAGCCTTTCTCAACGGAGAGTTGTGCCAGTGTTTGCCATTGTTCCAGCGTAGGGTCGATACCGGTTGGGTTATGGCAGCAGCCATGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCtt < 4:1112975/127‑1 (MQ=255) aaCAGCGGTAACCAGCCTTTCTCAACGGAGAGTTGTGCCAGTGTTTGCCATTGTTCCAGCGTAGGGTCGATACCGGTTGGGTTATGGCAGCAGCCATGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGc < 2:956407/136‑1 (MQ=255) aaCAGCGGTAACCAGCCTTTCTCAACGGAGAGTTGTGCCAGTGTTTGCCATTGTTCCAGCGTAGGGTCGATACCGGTTGGGTTATGGCAGCAGCCATGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGt < 2:169717/139‑1 (MQ=255) aaCAGCGGTAACCAGCCTTTCTCAACGGAGAGTTGTGCCAGTGTTTGCCATTGTTCCAGCGTAGGGTCGATACCGGTTGGGTTATGGCAGCAGCCATGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGt > 1:169717/1‑139 (MQ=255) aCAGCGGTAACCAGCCTTTCTCAACGGAGAGTTGTGCCAGTGTTTGCCATTGTTCCAGCGTAGGGTCGATACCGGTTGGGTTATGGCAGCAGCCATGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCttcat > 4:911412/1‑129 (MQ=255) aCAGCGGTAACCAGCCTTTCTCAACGGAGAGTTGTGCCAGTGTTTGCCATTGTTCCAGCGTAGGGTCGATACCGGTTGGGTTATGGCAGCAGCCATGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAATCAg < 3:613050/145‑1 (MQ=255) aCAGCGGTAACCAGCCTTTCTCAACGGAGAGTTGTGCCAGTGTTTGCCATTGTTCCAGCGTAGGGTCGATACCGGTTGGGTTATGGCAGCAGCCATGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAATCAg > 4:613050/1‑145 (MQ=255) 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aGCCTTTCTCAACGGAGAGTTGTGCCAGTGTTTGCCATTGTTCCAGCGTAGGGTCGATACCGGTTGGGTTATGGCAGCAGCCATGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCttc < 2:345799/115‑1 (MQ=255) tctcAACGGAGAGTTGTGCCAGTGTTTGCCATTGTTCCAGCGTAGGGTCGATACCGGTTGGGTTATGGCAGCAGCCATGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAg > 2:126947/1‑115 (MQ=255) tctcAACGGAGAGTTGTGCCAGTGTTTGCCATTGTTCCAGCGTAGGGTCGATACCGGTTGGGTTATGGCAGCAGCCATGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAg < 1:126947/115‑1 (MQ=255) ataagagcgtctttaactctgcaggtctggaagttcgtgaatacgcttattatgatgcggaaaatcacactcttgacttcgatgcactgattaaCAGCCTGAGCTTCATTCAGGc > 4:909411‑M1/95‑115 (MQ=255) ataagagcgtctttaactctgcaggtctggaagttcgtgaatacgcttattatgatgcggaaaatcacactcttgacttcgatgcactgattaaCAGCCTGAGCTTCATTCAGGc < 3:909411‑M1/21‑1 (MQ=255) aagagcgtctttaactctgcaggtctggaagttcgtgaatacgcttattatgatgcggaaaatcacactcttgacttcgatgcactgattaaCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAAt < 4:476161‑M1/28‑1 (MQ=255) aagagcgtctttaactctgcaggtctggaagttcgtgaatacgcttattatgatgcggaaaatcacactcttgacttcgatgcactgattaaCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAAt > 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aCGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCACGAACTTCCAGACCTGCAGAGTTaa < 4:337175/112‑1 (MQ=255) aCGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCACGAACTTCCAGACCTGCAGAGTTaa > 3:337175/1‑112 (MQ=255) | GACCACGGGCAAAACCCTGGTAAGCGAAGTCAAACAGCGGTAACCAGCCTTTCTCAACGGAGAGTTGTGCCAGTGTTTGCCATTGTTCCAGCGTAGGGTCGATACCGGTTGGGTTATGGCAGCAGCCATGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCACGAACTTCCAGACCTGCAGAGTTAAAGACGCTCTTATGGTTCGGCCAGCTTGGGTTGC > NC_000913/985049‑985333 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |