| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| ? | NC_000913 | 985219 = | 65 (0.760) | coding (491/1191 nt) | aspC | aspartate aminotransferase, PLP‑dependent | |||||
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
TCAAACAGCGGTAACCAGCCTTTCTCAACGGAGAGTTGTGCCAGTGTTTGCCATTGTTCCAGCGTAGGGTCGATACCGGTTGGGTTATGGCAGCAGCCATGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCACGAACTTCCAGACCTGCAGAGTTAAAGACGCTCTTATGGTTCGGCCAGCTTGGGTTGCTCACCCACACACGCTTAACGCTGGT > NC_000913/985078‑985358 | tCAAACAGCGGTAACCAGCCTTTCTCAACGGAGAGTTGTGCCAGTGTTTGCCATTGTTCCAGCGTAGGGTCGATACCGGTTGGGTTATGGCAGCAGCCATGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAATCa > 4:1099611/1‑148 (MQ=255) aaCAGCGGTAACCAGCCTTTCTCAACGGAGAGTTGTGCCAGTGTTTGCCATTGTTCCAGCGTAGGGTCGATACCGGTTGGGTTATGGCAGCAGCCATGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGt < 2:169717/139‑1 (MQ=255) aaCAGCGGTAACCAGCCTTTCTCAACGGAGAGTTGTGCCAGTGTTTGCCATTGTTCCAGCGTAGGGTCGATACCGGTTGGGTTATGGCAGCAGCCATGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGt > 1:169717/1‑139 (MQ=255) aCAGCGGTAACCAGCCTTTCTCAACGGAGAGTTGTGCCAGTGTTTGCCATTGTTCCAGCGTAGGGTCGATACCGGTTGGGTTATGGCAGCAGCCATGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAATCAg > 4:613050/1‑145 (MQ=255) aCAGCGGTAACCAGCCTTTCTCAACGGAGAGTTGTGCCAGTGTTTGCCATTGTTCCAGCGTAGGGTCGATACCGGTTGGGTTATGGCAGCAGCCATGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAATCAGTGc > 1:169090/1‑148 (MQ=255) cAGCGGTAACCAGCCTTTCTCAACGGAGAGTTGTGCCAGTGTTTGCCATTGTTCCAGCGTAGGGTCGATACCGGTTGGCTTATGGCAGCAGCCATGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAATCAGTGCa > 4:377219/1‑148 (MQ=255) aGCGGTAACCAGCCTTTCTCAACGGAGAGTTGTGCCAGTGTTTGCCATTGTTCCAGCGTAGGGTCGATACCGGTTGGGTTATGGCAGCAGCCATGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAATCa < 3:551602/142‑1 (MQ=255) ggTAACCAGCCTTTCTCAACGGAGAGTTGTGCCAGTGTTTGCCATTGTTCCAGCGTAGGGTCGATACCGGTTGGGTTATGGCAGCAGCCATGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAATCAGTGCATCGa < 3:1099611/148‑1 (MQ=255) cAGCCTTTCTCAACGGAGAGTTGTGCCAGTGTTTGCCATTGTTCCAGCGTAGGGTCGATACCGGTTGGGTTATGGCAGCAGCCATGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAATCAGTGCATCGa > 4:123535/1‑142 (MQ=255) cAGCCTTTCTCAACGGAGAGTTGTGCCAGTGTTTGCCATTGTTCCAGCGTAGGGTCGATACCGGTTGGGTTATGGCAGCAGCCATGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAATCAGTGCATCGa < 3:123535/142‑1 (MQ=255) aagagcgtctttaactctgcaggtctggaagttcgtgaatacgcttattatgatgcggaaaatcacactcttgacttcgatgcactgattaaCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAAt > 3:476161‑M1/93‑120 (MQ=255) aagagcgtctttaactctgcaggtctggaagttcgtgaatacgcttattatgatgcggaaaatcacactcttgacttcgatgcactgattaaCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAAt < 4:476161‑M1/28‑1 (MQ=255) aCGGAGAGTTGTGCCAGTGTTTGCCATTGTTCCAGCGTAGGGTCGATACCGGTTGGGTTATGGCAGCAGCCATGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAATCAGTGCATCGAAGTCa > 2:865020/1‑135 (MQ=255) aCGGAGAGTTGTGCCAGTGTTTGCCATTGTTCCAGCGTAGGGTCGATACCGGTTGGGTTATGGCAGCAGCCATGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAATCAGTGCATCGAAGTCa < 1:865020/135‑1 (MQ=255) ggAGAGTTGTGCCAGTGTTTGCCATTGTTCCAGCGTAGGGTCGATACCGGTTGGGTTATGGCAGCAGCCATGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAATCAGTGCATCGa > 1:1115797/1‑128 (MQ=255) 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ttGGGTTATGGCAGCAGCCATGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTCAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCACGGACTTCCAGACCTGCAGAGTTaa < 4:571285/144‑1 (MQ=255) ttGGGTTATGGCAGCAGCCATGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTCAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCACGGACTTCCAGACCTGCAGAGTTaa > 3:571285/1‑144 (MQ=255) gTTATGGCAGCAGCCATGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCACGAACTTCCAGACCTGCAGAGTTAAAGACGctc < 4:118626/148‑1 (MQ=255) ttATGGCAGCAGCCATGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAATCAGTGCATCGAAGTCAAGAGTGTGATTTTCCGCATCATAATAAGCGTATTCACGAACTTCCAGACCTGCAGAGTTAAAGACGctct > 4:618564/1‑148 (MQ=255) tATGGCAGCAGCCATGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAATCAGTGCATCGa < 3:891083/72‑1 (MQ=255) tATGGCAGCAGCCATGGAACAGCACTACGTCGCCAGCCTGAGCTTCATTCAGGCTGTTAATCAGTGCATCGa > 4:891083/1‑72 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |