| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2042125 | 75 (0.800) | 12 (0.140) | 8/180 | NT | 14.2% | intergenic (+100/‑243) | zinT/yodB | zinc and cadmium binding protein, periplasmic/cytochrome b561 homolog |
| ? | NC_000913 | = 2042138 | 77 (0.920) | intergenic (+113/‑230) | zinT/yodB | zinc and cadmium binding protein, periplasmic/cytochrome b561 homolog | |||||
Only 100 of 164 total aligned reads displayed.
TATCAGTTGAGTAGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAATATGCACTAT > NC_000913/2041978‑2042269 | tGAGTAGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCtcatca > 1:538675/1‑148 (MQ=255) gaagaaGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGtcatagtgatgagcg < 2:462411‑M1/148‑16 (MQ=255) gaagTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGtcatagtgatgagcgtgt < 4:1071966‑M1/148‑19 (MQ=255) gaagTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGAcgtgt > 3:852862‑M2/1‑143 (MQ=255) aagTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCtcat < 1:286719/134‑1 (MQ=255) aagTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGAcgtgtc > 1:471571‑M2/1‑142 (MQ=255) tCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGAcgtg > 1:57131‑M2/1‑136 (MQ=255) gAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACt > 4:619186/1‑130 (MQ=255) gAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACt < 3:619186/130‑1 (MQ=255) aaaTGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGAcg < 1:833449‑M2/132‑3 (MQ=255) aaaTGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATtaata < 3:298779/148‑1 (MQ=255) gTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATg < 1:101678/122‑1 (MQ=255) ctcATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGa < 2:627513/121‑1 (MQ=255) cATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTCGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACt < 3:774524/115‑1 (MQ=255) cATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACt > 4:774524/1‑115 (MQ=255) gTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGtcatagtgatgagcgtgt < 4:1114950‑M1/118‑19 (MQ=255) aTTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGAcgtgtc > 3:492047‑M2/1‑111 (MQ=255) cATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGAcgtg < 2:386479‑M2/110‑5 (MQ=255) cATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTaa > 1:13176/1‑145 (MQ=255) aTGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACt > 2:12541/1‑101 (MQ=255) ccTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGc < 2:687482/125‑1 (MQ=255) tCGATGCCGCTTTAGTAAGTTTTCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCtc > 1:685214/1‑84 (MQ=255) tCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGtcatagtgatgagcg < 3:821384‑M1/96‑16 (MQ=255) tCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGAcgtgtctgt > 3:183072‑M2/1‑94 (MQ=255) tCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGAcgtgtc < 1:894002‑M2/100‑7 (MQ=255) tCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGtata < 1:796898/106‑1 (MQ=255) tCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACG > 3:709119‑M1/1‑81 (MQ=255) cGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCtcatc > 4:2360/1‑86 (MQ=255) aTGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGa < 3:386268/91‑1 (MQ=255) cTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCtc < 4:947402/75‑1 (MQ=255) cTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAAc > 4:416215/1‑132 (MQ=255) tAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGAcgtgtc > 1:108298‑M2/1‑79 (MQ=255) aaGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGtcatagtgatgagcgtgt > 2:978094‑M1/1‑65 (MQ=255) aaGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGtcatagtgatgagcgtgt < 1:978094‑M1/83‑19 (MQ=255) aaGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGa < 1:601017/78‑1 (MQ=255) aaGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGa > 2:601017/1‑78 (MQ=255) aaGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGAcgtgtctg > 2:382848‑M2/1‑78 (MQ=255) aaGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGAcgtg < 2:709890‑M2/82‑5 (MQ=255) aaGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGAcgtg > 1:709890‑M2/1‑78 (MQ=255) aaGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATa < 3:1015747/142‑1 (MQ=255) ttATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGtcatagtgatgagcg < 1:1098175‑M1/77‑16 (MQ=255) ttATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGtcatagtgatgagcg > 2:1098175‑M1/1‑62 (MQ=255) tCATAACTGCCACTAGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATaa > 4:845212/1‑118 (MQ=255) cATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGtcatagtgatgagcgtgtct > 2:988400‑M1/1‑58 (MQ=255) cATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGc < 3:449836/100‑1 (MQ=255) cATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGc > 4:449836/1‑100 (MQ=255) cATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATAcaca < 1:115624/132‑1 (MQ=255) aTAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAg > 2:870450/1‑105 (MQ=255) aTAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTAGATTAATAAGCTAACCCGCATTGAg < 1:870450/105‑1 (MQ=255) tAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATac < 1:1016039/127‑1 (MQ=255) tAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATac > 2:1016039/1‑127 (MQ=255) aaCTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATtaata > 3:947886/1‑86 (MQ=255) aCTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTaa > 2:237494/1‑106 (MQ=255) 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agctagctACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTa > 3:294537/1‑148 (MQ=255) gctaCAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAata < 4:294537/148‑1 (MQ=255) aCAGACACGtcatagtgatgagcgtgtctgtagctagcttgcgttcagtggcgtttgtggatggaccagtggcagttatgataacttactaaagcggcatcga < 4:183072‑M1/103‑95 (MQ=255) aCAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATAc < 2:936453/87‑1 (MQ=255) aCAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTta > 2:441191/1‑127 (MQ=255) aCAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTta < 1:441191/127‑1 (MQ=255) cAGACACGtcatagtgatgagcgtgtctgtagctagcttgcgttcagtggcgtttgtggatggaccagtggcagttatgataactt < 1:382848‑M1/86‑79 (MQ=255) cAGACACGtcatagtgatgagcgtgtctgtagctagcttgcgttcagtggcgtttgtggatggaccagtggcagttatgataactt > 2:382848‑M1/1‑8 (MQ=255) cAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCAt < 3:628231/120‑1 (MQ=255) aGACACGCTCATCACTATGAcgtgtctgtagctagcttgcgttcagtggcgtttgtggatggaccagtggcagttatg < 1:988400‑M2/78‑59 (MQ=255) gACACGtcatagtgatgagcgtgtctgtagctagcttgcgttcagtggcgtttgtggatggaccagtggcagttatgataacttactaaagcggcatcgaggcgttatcatgagaat < 4:492047‑M1/117‑112 (MQ=255) gACACGtcatagtgatgagcgtgtctgtagctagcttgcgttcagtggcgtttgtggatggaccagtggcagttatgataactta < 2:108298‑M1/85‑80 (MQ=255) gACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAATATGCACt > 3:1079479/1‑148 (MQ=255) aacacgtcatagtgatgagcgtgtctgtagctagcttgcgttcagtggcgtttgtggatggaccagtggcagttatgataacttactaaagcggcatcga > 2:894002‑M1/2‑6 (MQ=255) 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cacGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGcc < 1:453552/86‑1 (MQ=255) cGtcatagtgatgagcgtgtctgtagctagcttgcgttcagtggcgtttgtggatggaccagtggcagttatgataacttactaaagcggcatcgaggcgttatcatgagaatactcaatgagacatcattt > 2:833449‑M1/1‑2 (MQ=255) cGtcatagtgatgagcgtgtctgtagctagcttgcgttcagtggcgtttgtggatggaccagtggcag < 2:15447‑M1/68‑67 (MQ=255) cGtcatagtgatgagcgtgtctgtagctagcttgcgttcagtggcgtttgtggat > 3:425328‑M1/1‑2 (MQ=255) cGCTCATCACTATGAcgtgtctgtagctagcttgcgttcagtggcgtttgtggatggaccagtggcagttatgataa > 2:1098175‑M2/1‑15 (MQ=255) cGCTCATCACTATGAcgtatctgtagctagcttgcgttcagtggcgtttgtggatggaccagtggcagttatgataacttactaaagcggcatcga > 4:821384‑M2/1‑15 (MQ=255) | TATCAGTTGAGTAGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAATATGCACTAT > NC_000913/2041978‑2042269 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |