| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 4621981 | 124 (1.330) | 4 (0.050) | 4/188 | NT | 3.2% | coding (213/1332 nt) | yjjJ | putative protein kinase |
| ? | NC_000913 | = 4622003 | 122 (1.390) | coding (235/1332 nt) | yjjJ | putative protein kinase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 166 total aligned reads displayed.
GCAATCAGTCAGGCGACGTTCTCACGCCTTGTTGCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGATCTCCGACCGCAGGGCTTTTTAGGGCGCGCGTG > NC_000913/4621835‑4622127 | gtcagGCGACGTTCTCACGCCTTGTTGCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGTTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCa > 3:29464/1‑148 (MQ=255) tcagGCGACGTTCTCACGCCTTGTTGCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCAt > 3:182338/1‑148 (MQ=255) tcagGCGACGTTCTCACGCCTTGTTGCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCAt > 2:363621/1‑148 (MQ=255) tcagGCGACGTTCTCACGCCTTGTTGCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCCTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGCCGATACCGGAAAGGCGCAt > 1:901631/1‑148 (MQ=255) cagGCGACGTTCTCACGCCTTGTTGCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATa > 3:432566/1‑148 (MQ=255) gCGACGTTCTCACGCCTTGTTGCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAAt > 3:484773/1‑148 (MQ=255) cGACGTTCTCACGCCTTGTTGCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGaa < 2:707124/135‑1 (MQ=255) cGACGTTCTCACGCCTTGTTGCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGaa > 1:707124/1‑135 (MQ=255) aCGTTCTCACGCCTTGTTGCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCg < 4:484773/148‑1 (MQ=255) aCGCCTTGTTGCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAgg < 1:792801/128‑1 (MQ=255) cGCCTTGTTGCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGc < 3:672746/140‑1 (MQ=255) cGCCTTGTTGCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGc > 4:672746/1‑140 (MQ=255) gCCTTGTTGCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACAtccg < 3:1128095‑M2/148‑5 (MQ=255) ccTTGTTGCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACAtccgg < 1:438540‑M2/148‑6 (MQ=255) agagAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGc < 4:432566/148‑1 (MQ=255) gagaAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGcc > 1:101724/1‑148 (MQ=255) gaagcacGGGTGATTCGCTTTGGTAACGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCTCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGCCGGGTGGACGATATCGTAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATACGGTTGTGCTGGgcgc > 2:627031/7‑148 (MQ=255) gaagaTCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGc < 1:1009270/148‑1 (MQ=255) aagaTCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCa < 2:101724/148‑1 (MQ=255) aagaTCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCa < 2:1082707/148‑1 (MQ=255) aTCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAggg > 3:916830/1‑148 (MQ=255) tCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGa < 1:363621/148‑1 (MQ=255) tCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGa < 4:182338/148‑1 (MQ=255) ggTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGt > 4:107554/1‑148 (MQ=255) gTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAg > 1:569841/1‑141 (MQ=255) gTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAg < 2:569841/141‑1 (MQ=255) aTTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTc < 2:438540/148‑1 (MQ=255) ttCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGc > 1:949637/1‑135 (MQ=255) ttCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCt < 3:1080344/148‑1 (MQ=255) tCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATaa < 2:107342/105‑1 (MQ=255) tCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATaa > 1:107342/1‑105 (MQ=255) tCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGa < 2:843560/139‑1 (MQ=255) cTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGt > 4:906064/1‑142 (MQ=255) cTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTa < 4:916830/148‑1 (MQ=255) ttGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAAc > 3:1046506/1‑148 (MQ=255) ggTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTc < 4:829275/139‑1 (MQ=255) ggTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTc > 3:829275/1‑139 (MQ=255) gTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAtgtcggcgaatttatgcgcctttccggt > 3:373413‑M1/1‑86 (MQ=255) tAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGaa < 4:1103772/86‑1 (MQ=255) cACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGa > 2:370107/1‑125 (MQ=255) cACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGa < 4:853181/125‑1 (MQ=255) cACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGa > 3:853181/1‑125 (MQ=255) cACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGa < 3:713183/148‑1 (MQ=255) 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aCCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGCGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGATCTCCg < 4:755907/125‑1 (MQ=255) ccGGAtgtcggcgaatttatgcgcctttccggtatcgtccacccgccagacgggaatacgctcaattccgcgataaggacgcagcagtgcatatcgcgttgcccg > 3:34825‑M1/1‑5 (MQ=255) ccGGAtgtcggcgaatttatgcgcctttccggtatcgtccacccgccagacgggaatacgctcaattccgcgataaggacgcagcagtgcatatcgcgttgcccg < 4:34825‑M1/105‑101 (MQ=255) ccGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGATCTCCGACCg > 2:563743/1‑128 (MQ=255) cGGAtgtcggcgaatttatgcgcctttccggtatcgtccacccgccagacgggaatacgctcaattccgcgataaggacgcagcagtgcatatcgcgttgcccgtgctttaccaaagcgaatcacccgatcttctctggcaacaaggc < 3:1128095‑M1/148‑145 (MQ=255) ggAtgtcggcgaatttatgcgcctttccggtatcgtccacccgccagacgggaatacgctcaattccgcgataaggacgcagcagtgcatatcgcgttgcccgtgctttaccaaagcgaatcacccgatcttctctggcaacaaggcg < 4:44784‑M1/148‑146 (MQ=255) gAAAGGCGCATAAATTCGCCGACAtccggtatcgtccacccgccagacggga > 2:154099‑M2/1‑24 (MQ=255) gAAAGGCGCATAAATTCGCCGACAtccggtatcgtccacccgccagacggga < 1:154099‑M2/52‑29 (MQ=255) gAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGTGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGCTGGt < 1:428711/95‑1 (MQ=255) gAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGATCTCCGACCGCAGGGCttt < 1:562536/134‑1 (MQ=255) gAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGATCTCCGACCGCAGGGCTTTTTAGGGCGCGCGTg < 2:56159/148‑1 (MQ=255) aaaGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGa < 2:1101075/114‑1 (MQ=255) | GCAATCAGTCAGGCGACGTTCTCACGCCTTGTTGCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGATCTCCGACCGCAGGGCTTTTTAGGGCGCGCGTG > NC_000913/4621835‑4622127 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |