New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 4621981 | 124 (1.330) | 4 (0.050) | 4/188 | NT | 3.2% | coding (213/1332 nt) | yjjJ | putative protein kinase |
? | NC_000913 | = 4622003 | 122 (1.390) | coding (235/1332 nt) | yjjJ | putative protein kinase | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
CGCCTTGTTGCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGATCTCCGACCGCAGGGCTTTTTAGGGCGCGCGTGGGGCAGGAAGTTAGCC > NC_000913/4621859‑4622143 | cGCCTTGTTGCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACAtcc < 4:44784‑M2/148‑4 (MQ=255) agagAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGc < 4:432566/148‑1 (MQ=255) agagAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGc > 4:713183/1‑148 (MQ=255) gagaAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGcc > 1:101724/1‑148 (MQ=255) agaagaTCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTtgt > 3:922368/1‑140 (MQ=255) gaagaTCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGc < 1:1009270/148‑1 (MQ=255) aagaTCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCa < 2:101724/148‑1 (MQ=255) aagaTCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCa < 2:1082707/148‑1 (MQ=255) aTCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAggg > 3:916830/1‑148 (MQ=255) tCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGa < 4:182338/148‑1 (MQ=255) tCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGa < 1:363621/148‑1 (MQ=255) ggTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGt < 4:428157/148‑1 (MQ=255) ggTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGt > 4:107554/1‑148 (MQ=255) gTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAg > 1:569841/1‑141 (MQ=255) gTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAg < 2:569841/141‑1 (MQ=255) aTTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTc < 2:438540/148‑1 (MQ=255) ttCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCAGTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCt > 4:1080344/1‑148 (MQ=255) ttCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGc > 1:949637/1‑135 (MQ=255) ttCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGc < 2:949637/135‑1 (MQ=255) ttCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCt < 3:1080344/148‑1 (MQ=255) tCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGa < 2:843560/139‑1 (MQ=255) cTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGt > 4:906064/1‑142 (MQ=255) cTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGt < 3:906064/142‑1 (MQ=255) cTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTa < 4:916830/148‑1 (MQ=255) tttGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAAATGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTaa < 3:107554/148‑1 (MQ=255) ttGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAAc > 3:1046506/1‑148 (MQ=255) tGGTAAAGCAAGGACAATGCGATATGCTCTTCTGCTTCCTTATCCCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGGAAGGCGCATAAACGCGCCGGAATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGCAGTTGTCTGGTAACa < 1:627031/148‑1 (MQ=255) ggTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTc < 4:829275/139‑1 (MQ=255) gCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAg < 2:1074568/148‑1 (MQ=255) cACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGa > 3:853181/1‑125 (MQ=255) cACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGa < 1:370107/125‑1 (MQ=255) cACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGa < 4:853181/125‑1 (MQ=255) cACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGa < 3:713183/148‑1 (MQ=255) cGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACAtccgg < 4:34825‑M2/105‑6 (MQ=255) cGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACAtccgg > 3:34825‑M2/1‑100 (MQ=255) gggCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATgg < 3:44784/148‑1 (MQ=255) ggCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCt < 1:759262/129‑1 (MQ=255) 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tGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTAtt > 2:642914/1‑143 (MQ=255) aGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGt > 2:736380/1‑86 (MQ=255) aGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGt < 1:736380/86‑1 (MQ=255) cGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGAtc > 4:792780/1‑148 (MQ=255) aTTCCCTTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTgg > 2:607429/1‑85 (MQ=255) aTTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTgg < 3:96000/85‑1 (MQ=255) aTTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTgg > 4:96000/1‑85 (MQ=255) aTTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTgg < 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tACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGATCTCCGACCGCAGGGCTTTTTa > 3:24832/1‑142 (MQ=255) aCCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGATCTCCGACCGCAGGGCTTTTTAGGgcgcg > 1:56159/1‑148 (MQ=255) aCCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGCGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGATCTCCg < 4:755907/125‑1 (MQ=255) ccGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGATCTCCGACCg < 1:563743/128‑1 (MQ=255) gAAAGGCGCATAAATTCGCCGACAtccggtatcgtccacccgccagacggga < 1:154099‑M2/52‑29 (MQ=255) gAAAGGCGCATAAATTCGCCGACAtccggtatcgtccacccgccagacggga > 2:154099‑M2/1‑24 (MQ=255) gAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGTGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGCTGGt < 1:428711/95‑1 (MQ=255) gAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGt > 2:428711/1‑95 (MQ=255) gAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGATCTCCGACCGCAGGGCttt > 2:562536/1‑134 (MQ=255) gAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGATCTCCGACCGCAGGGCTTTTTAGGGCGCGCGTg < 2:56159/148‑1 (MQ=255) aaaGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGa > 1:1101075/1‑114 (MQ=255) aaaGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGa < 2:1101075/114‑1 (MQ=255) ggCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGATCTCCGACCGCAGGGc < 1:472661/127‑1 (MQ=255) cATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGa > 3:874500/1‑107 (MQ=255) cATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGATCTCCGa < 3:172835/114‑1 (MQ=255) tAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGATCTCCg > 2:182512/1‑111 (MQ=255) aaTTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGATCTCCGACCGCAGGGCTTTTTAGGGCGCGCGTGGGGCAGGAAGtt < 1:441717/148‑1 (MQ=255) ttCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGATCTCCGACCGCAGGGCTTTTTAGGGCGCGCGTGGGGCAGGAAg > 3:965038/1‑144 (MQ=255) cGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGATCTGCGACCGCAGGGCTTTTTAGGGCGCGCGTGGGGCAGGAAGTTAGcc > 3:983006/1‑148 (MQ=255) | CGCCTTGTTGCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGATCTCCGACCGCAGGGCTTTTTAGGGCGCGCGTGGGGCAGGAAGTTAGCC > NC_000913/4621859‑4622143 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |