New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 4639198 = | 77 (0.820) | 4 (0.050) | 4/188 | NT | 4.4% | coding (1021/1353 nt) | creD | inner membrane protein |
? | NC_000913 | 4639248 = | 101 (1.150) | coding (1071/1353 nt) | creD | inner membrane protein | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
TTCTTTGTTTTTGAAACGCTCACCGCGCAACGTTTACACCCAATGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGTGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGA > NC_000913/4639105‑4639395 | tCTTTGTTTTTGAAACGCTCACCGCGCAACGTTTACACCCAATGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGAt < 1:472709/148‑1 (MQ=255) ttGTTTTTGAAACGCTCACCGCGCAACGTTTACACCCAATGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTgg < 2:774705/148‑1 (MQ=255) cACCGCGCAACGTTTACACCCAATGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGa > 2:683654/1‑143 (MQ=255) cACCGCGCAACGTTTACACCCAATGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGa < 1:683654/143‑1 (MQ=255) cAACGTTTACACCCAATGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGtatttatt < 4:163310/148‑1 (MQ=255) cccAATGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTa > 1:195339/1‑148 (MQ=255) ccAATGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTg > 1:497421/1‑108 (MQ=255) ccAATGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTg < 2:497421/108‑1 (MQ=255) ccaTGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGa < 1:27550/121‑1 (MQ=255) cAATGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGa > 2:27550/1‑123 (MQ=255) cAATGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGtatttatt > 3:803714/1‑135 (MQ=255) cAATGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGtatttatt < 1:24701/135‑1 (MQ=255) cAATGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGtatttatt > 2:24701/1‑135 (MQ=255) cAATGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGtatttatt < 4:803714/135‑1 (MQ=255) gCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTgg > 3:802811/1‑108 (MQ=255) gCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGaaa > 1:435283/1‑148 (MQ=255) tttGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTgg < 4:295333/148‑1 (MQ=255) cTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCAtgt > 4:827486/1‑148 (MQ=255) ttCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCAtgttg > 1:29238/1‑148 (MQ=255) aTTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTgg > 4:414366/1‑130 (MQ=255) tGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGtt < 2:499487/126‑1 (MQ=255) tGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGtt > 1:499487/1‑126 (MQ=255) gATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGa > 1:165155/1‑89 (MQ=255) gATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGa < 2:165155/89‑1 (MQ=255) tGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGt < 3:206474/92‑1 (MQ=255) tGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGt > 4:206474/1‑92 (MQ=255) gTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCaa < 4:364520/126‑1 (MQ=255) gTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCaa > 3:364520/1‑126 (MQ=255) tttATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATa < 2:351848/80‑1 (MQ=255) tttATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCt > 1:1087755/1‑148 (MQ=255) ttGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTAtt < 4:47159/104‑1 (MQ=255) ttGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTAtt > 3:47159/1‑104 (MQ=255) ctctTGCTGGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTgg < 2:647325/111‑1 (MQ=255) ctctTGCTGGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTgg > 1:647325/1‑111 (MQ=255) tctTGCTGGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTAt > 4:909837/1‑99 (MQ=255) tctTGCTGGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTAt < 3:909837/99‑1 (MQ=255) tctTGCTGGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCt < 2:29238/148‑1 (MQ=255) ctTGCTGGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGc > 3:842394/1‑93 (MQ=255) ctTGCTGGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGc < 4:842394/93‑1 (MQ=255) ctggcgattatccatgccacggtaaaaccggtatgttcagaaagcgccagTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATg > 1:46129‑M2/51‑148 (MQ=255) CTGGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGaa > 2:936318‑M1/1‑71 (MQ=255) CTGGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGaa < 1:936318‑M1/71‑1 (MQ=255) CTGGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGtatttatt > 4:486809‑M1/1‑82 (MQ=255) CTGGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGtatttatt < 3:486809‑M1/82‑1 (MQ=255) ggcgattatccatgccacggtaaaaccggtatgttcagaaagcgccagTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTgg < 1:472416‑M2/55‑1 (MQ=255) ggcgattatccatgccacggtaaaaccggtatgttcagaaagcgccagTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTgg > 2:472416‑M2/49‑103 (MQ=255) GGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAg > 2:930156‑M1/1‑111 (MQ=255) GGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAg < 1:930156‑M1/111‑1 (MQ=255) GGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCAt > 4:723871‑M1/1‑114 (MQ=255) GGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCAt < 3:723871‑M1/114‑1 (MQ=255) cTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATTAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGa > 2:1080560/1‑148 (MQ=255) cTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGt < 2:554784/96‑1 (MQ=255) cTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGt > 1:554784/1‑96 (MQ=255) cTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGttt < 2:276789/117‑1 (MQ=255) cTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCtgttgt < 4:672967/133‑1 (MQ=255) cTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGa > 1:721766/1‑148 (MQ=255) cTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGAtgtg < 1:1080560/148‑1 (MQ=255) tGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGTgg < 2:435283/148‑1 (MQ=255) gAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGTggg > 2:494435/1‑148 (MQ=255) gAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGTggg > 3:680593/1‑148 (MQ=255) aaCATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGTgg < 2:235086/146‑1 (MQ=255) tACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGa < 2:162392/53‑1 (MQ=255) tACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAg > 3:387204/1‑96 (MQ=255) tACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGTGGGGACTg < 4:756861/148‑1 (MQ=255) aCCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGTGGGGACTGc > 4:113945/1‑148 (MQ=255) ccGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATATTGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGtt > 1:732067/1‑84 (MQ=255) ccGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGtt < 2:732067/84‑1 (MQ=255) ccGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATgg < 1:829185/130‑1 (MQ=255) ccGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATgg > 2:829185/1‑130 (MQ=255) cGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATaa > 1:57139/1‑47 (MQ=255) cGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATaa < 2:57139/47‑1 (MQ=255) cGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGAtgt < 1:71162/137‑1 (MQ=255) cGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGAtgt > 2:71162/1‑137 (MQ=255) ggTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTCGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGTGGGGACTGCTCa > 3:1002346/1‑148 (MQ=255) tttACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGtattt < 1:266542/55‑1 (MQ=255) tttACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGa < 1:480733/130‑1 (MQ=255) cGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGTgg > 4:91289/1‑130 (MQ=255) cGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGTGGGGACTGCTCAACTCTGcc > 3:906058/1‑148 (MQ=255) tGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATgttgtt > 1:55304/1‑91 (MQ=255) tGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATgttgtt < 2:55304/91‑1 (MQ=255) tGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAAc > 1:305630/1‑75 (MQ=255) tGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGTGGGGACTg < 2:684504/129‑1 (MQ=255) tGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGTGGGGACTg > 1:684504/1‑129 (MQ=255) tGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGTGGGGACTGCt > 2:461322/1‑131 (MQ=255) ggATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTCGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGTGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAgcgc < 4:1002346/148‑1 (MQ=255) aTAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCAt < 1:36022/77‑1 (MQ=255) aTAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCAt > 2:36022/1‑77 (MQ=255) aTAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTgg < 4:293899/106‑1 (MQ=255) aTAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTgg > 3:293899/1‑106 (MQ=255) aTAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGTGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAgcgcgc > 3:561759/1‑148 (MQ=255) tCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGTGGGGACTGCTCAACTCTGc < 1:184144/133‑1 (MQ=255) cgccagTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGTGGGGACTGCTCAActc > 3:115905‑M2/7‑129 (MQ=255) gccagTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGTGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCtgttgt < 4:561759‑M2/143‑1 (MQ=255) ccagTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCAtgttgt > 2:109885‑M2/5‑75 (MQ=255) ccagTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCAtgttgt < 1:109885‑M2/71‑1 (MQ=255) ccagTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGTGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTgttgtt < 3:994348‑M2/144‑1 (MQ=255) cagTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCa < 2:956842‑M2/65‑1 (MQ=255) cagTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCa > 1:956842‑M2/4‑68 (MQ=255) cagTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCAtgt > 3:792020‑M2/4‑71 (MQ=255) cagTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCAtgt < 4:792020‑M2/68‑1 (MQ=255) | TTCTTTGTTTTTGAAACGCTCACCGCGCAACGTTTACACCCAATGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGTGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGA > NC_000913/4639105‑4639395 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |