New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_000913 | 4450233 = | 144 (0.810) | coding (272/957 nt) | ytfQ | galactofuranose ABC transporter periplasmic binding protein | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 166 total aligned reads displayed.
GGCTGGCGTGCCGCAGAAACCAATGTGGCGAAAAGTGAAGCCGAAAAGCGCGGAATCACGTTGAAAATTGCCGATGGTCAGCAAAAGCAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCTATATGACCACCGTCACTGCCGACAACATCCTCGAAGG > NC_000913/4450067‑4450362 | ggCTGGCGTGCCGCAGAAACCAATGTGGCGAAAAGTGAAGCCGAAAAGCGCGGAATCACGTTGAAAATTGCCGATGGTCAGCAAAAGCAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTAt < 2:612408/149‑1 (MQ=255) ggCTGGCGTGCCGCAGAAACCAATGTGGCGAAAAGTGAAGCCGAAAAGCGCGGAATCACGTTGAAAATTGCCGATGGTCAGCAAAAGCAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTAt < 1:983162/149‑1 (MQ=255) cGTGCCGCAGAAACCAATGTGGCGAAAAGTGAAGCCGAAAAGCGCGGAATCACGTTGAAAATTGCCGATGGTCAGCAAAAGCAGGAAAGCCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGAGCTTTATCGCTcc < 3:1206063/149‑1 (MQ=255) 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gAAACCAATGTGGCGAAAAGTGAAGCCGAAAAGCGCGGAATCACGTTGAAAATTGCCGATGGTGAGCAAAAGCAGGAAAACCAGATTAAAGAAGTACGCTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCATTATCGCTCCGGTGGTcgc > 4:1195523/1‑149 (MQ=255) gAAACCAATGTGGCGAAAAGTGAAGCCGAAAAGCGCGGAATCACGTTGAAAATTGCCGATGGTCAGCAAAAGCAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTcgc < 3:1589680/149‑1 (MQ=255) cAATGTGGCGAAAAGTGAAGCCGAAAAGCGCGGAATCACGTTGAAAATTGCCGATGGTCAGCAAAAGCAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAg > 3:968230/1‑149 (MQ=255) cAATGTGGCGAAAAGTGAAGCCGAAAAGCGCGGAATCACGTTGAAAATTGCCGATGGTCAGCAAAAGCAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAg < 3:923830/149‑1 (MQ=255) cAATGTGGCGAAAAGTGAAGCCGAAAAGCGCGGAATCACGTTGAAAATTGCCGATGGTCAGCAAAAGCAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAg > 1:1586181/1‑149 (MQ=255) gtgGCGAAAAGTGAAGCCGAAAAGCGCGGAATCACGTTGAAAATTGCCGATGGTCAGCAAAAGCAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTg < 2:1016370/149‑1 (MQ=255) gtgGCGAAAAGTGAAGCCGAAAAGCGCGGAATCACGTTGAAAATTGCCGATGGTCAGCAAAAGCAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTg < 3:1493966/149‑1 (MQ=255) gtgGCGAAAAGTGAAGCCGAAAAGCGCGGAATCACGTTGAAAATTGCCGATGGTCAGCAAAAGCAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTg < 2:614995/149‑1 (MQ=255) tgGCGAAAAGTGAAGCCGAAAAGCGCGGAATCACGTTGAAAATTGCCGATGGTCAGCAAAAGCAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTgg > 2:789675/1‑149 (MQ=255) tgGCGAAAAGTGAAGCCGAAAAGCGCGGAATCACGTTGAAAATTGCCGATGGTCAGCAAAAGCAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTgg < 1:719177/149‑1 (MQ=255) 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< 4:43538/149‑1 (MQ=255) acaAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCTATATGACCACCGTCa > 2:1086110/1‑149 (MQ=255) acaAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCTATATGACCACCGTCa > 4:862500/1‑149 (MQ=255) gggTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCTATATGACCACCGTCACTGcc > 2:200879/1‑149 (MQ=255) cGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCTATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCTATATGACCACCGTCACTGCCGACTACATc < 4:484247/149‑1 (MQ=255) gATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGAGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCTATATGACCACCGTCACTGCCGACAACATcc > 3:1067155/1‑149 (MQ=255) aTCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCTATATGACCACCGTCACTGCCGACAACATCCt > 3:52898/1‑149 (MQ=255) aTCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCTATATGACCACCGTCACTGCCGACAACATCCt < 1:789675/149‑1 (MQ=255) tCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCTATATGACCACCGTCACTGCCGACAACATCCTc > 4:261258/1‑149 (MQ=255) ttATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCTATATGACCACCGTCACTGCCGACAACATCCTCGaa < 4:1085389/149‑1 (MQ=255) ttATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCTATATGACCACCGTCACTGCCGACAACATCCTCGaa < 3:1584517/149‑1 (MQ=255) ttATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCTATATGACCACCGTCACTGCCGACAACATCCTCGaa < 1:15847/149‑1 (MQ=255) | GGCTGGCGTGCCGCAGAAACCAATGTGGCGAAAAGTGAAGCCGAAAAGCGCGGAATCACGTTGAAAATTGCCGATGGTCAGCAAAAGCAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCTATATGACCACCGTCACTGCCGACAACATCCTCGAAGG > NC_000913/4450067‑4450362 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |