| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 4450215 = | 150 (0.820) | 4 (0.020) | 4/248 | NT | 2.7% | coding (254/957 nt) | ytfQ | galactofuranose ABC transporter periplasmic binding protein |
| ? | NC_000913 | 4450233 = | 144 (0.810) | coding (272/957 nt) | ytfQ | galactofuranose ABC transporter periplasmic binding protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 169 total aligned reads displayed.
ACCAATGTGGCGAAAAGTGAAGCCGAAAAGCGCGGAATCACGTTGAAAATTGCCGATGGTCAGCAAAAGCAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCTATATGACCACCGTCACTGCCGACAACATCCTCGAAGGCAAGTTGATTGGTGA > NC_000913/4450085‑4450377 | aCCAATGTGGCGAAAAGTGAAGCCGAAAAGCGCGGAATCACGTTGAAAATTGCCGATGGTCAGCAAAAGCAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGAc > 4:1493966/1‑149 (MQ=255)aCCAATGTGGCGAAAAGTGAAGCCGAAAAGCGCGGAATCACGTTGAAAATTGCCGATGGTCAGCAAAAGCAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGAc > 4:1584517/1‑149 (MQ=255) gtgGCGAAAAGTGAAGCCGAAAAGCGCGGAATCACGTTGAAAATTGCCGATGGTCAGCAAAAGCAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTg < 3:858340/149‑1 (MQ=255) gtgGCGAAAAGTGAAGCCGAAAAGCGCGGAATCACGTTGAAAATTGCCGATGGTCAGCAAAAGCAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTg < 2:614995/149‑1 (MQ=255) gtgGCGAAAAGTGAAGCCGAAAAGCGCGGAATCACGTTGAAAATTGCCGATGGTCAGCAAAAGCAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTg < 3:1493966/149‑1 (MQ=255) tgGCGAAAAGTGAAGCCGAAAAGCGCGGAATCACGTTGAAAATTGCCGATGGTCAGCAAAAGCAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTgg > 2:789675/1‑149 (MQ=255) gAAAAGTGAAGCCGAAAAGCGCGGAATCACGTTGAAAATTGCCGATGGTCAGCAAGAGCAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAAc < 4:1373606/149‑1 (MQ=255) gAAAAGTGAAGCCGAAAAGCGCGGAATCACGTTGAAAATTGCCGATGGTCAGCAAAAGCAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAAc > 3:855957/1‑149 (MQ=255) aaaGTGAAGCCGAAAAGCGCGGAATCACGTTGAAAATTGCCGATGGTCAGCAAAAGCAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCg < 2:56594/149‑1 (MQ=255) aaGTGAAGCCGAAAAGCGCGGAATCACGTTGAAAATTGCCGATGGTCAGCAAAAGCAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCgg < 4:1637537/149‑1 (MQ=255) aGTGAAGCCGAAAAGCGCGGAATCACGTTGAAAATTGCCGATGGTCAGCAAAAGCAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGt < 2:153213/149‑1 (MQ=255) tGAAGCCGAAAAGCGCGGAATCACGTTGAAAATTGCCGATGGTCAGCAAAAGCAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGtt > 2:219073/1‑137 (MQ=255) tGAAGCCGAAAAGCGCGGAATCACGTTGAAAATTGCCGATGGTCAGCAAAAGCAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTa < 1:1556055/148‑1 (MQ=255) tGAAGCCGAAAAGCGCGGAATCACGTTGAAAATTGCCGATGGTCAGCAAAAGCAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTAt > 1:98635/1‑149 (MQ=255) aGCCGAAAAGCGCGGAATCACGTTGAAAATTGCCGATGGTCAGCAAAAGCAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTaa < 3:888808/149‑1 (MQ=255) gCCGAAAAGCGCGGAATCACGTTGAAAATTGCCGATGGTCAGCAAAAGCAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTaaa > 1:1619869/1‑149 (MQ=255) gCCGAAAAGCGCGGAATCACGTTGAAAATTGCCGATGGTCAGCAAAAGCAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTaaa < 2:1603237/149‑1 (MQ=255) ccGAAAAGCGCGGAATCACGTTGAAAATTGCCGATGGTCAGCAAAAGCAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTaaaa < 3:309933/149‑1 (MQ=255) 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< 4:1529864/149‑1 (MQ=255) gTCAGCAAAAGCAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTc < 4:52652/149‑1 (MQ=255) aGCAAAAGCAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGAt < 4:1598683/149‑1 (MQ=255) aGCAAAAGCAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGAt < 2:962228/149‑1 (MQ=255) aGCAAAAGCAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGAt > 1:1633275/1‑149 (MQ=255) aGCAAAAGCAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGAt < 2:108/149‑1 (MQ=255) 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acaAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCTATATGACCACCGTCa > 4:862500/1‑149 (MQ=255) gggTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCTATATGACCACCGTCACTGcc > 4:1206168/1‑149 (MQ=255) gggTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCTATATGACCACCGTCACTGcc > 2:200879/1‑149 (MQ=255) cGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCTATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCTATATGACCACCGTCACTGCCGACTACATc < 4:484247/149‑1 (MQ=255) gATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCTATATGACCACCGTCACTGCCGACAACATcc > 1:215878/1‑149 (MQ=255) aTCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCTATATGACCACCGTCACTGCCGACAACATCCt < 1:789675/149‑1 (MQ=255) tCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCTATATGACCACCGTCACTGCCGACAACATCCTc > 4:261258/1‑149 (MQ=255) acctgtcgcgaccaccggagcgaCAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATc > 1:1715391‑M2/24‑86 (MQ=255) acctgtcgcgaccaccggagcgaCAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATc < 2:1715391‑M2/63‑1 (MQ=255) ttATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCTATATGACCACCGTCACTGCCGACAACATCCTCGaa < 4:1085389/149‑1 (MQ=255) ttATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCTATATGACCACCGTCACTGCCGACAACATCCTCGaa < 1:15847/149‑1 (MQ=255) tATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCTATATGACCACCGTCACTGCCGACAACATCCTCGAAg < 3:1535749/149‑1 (MQ=255) tcgcgaccaccggagcgaCAGGTTAGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGa < 1:324318‑M2/34‑1 (MQ=255) tcgcgaccaccggagcgaCAGGTTAGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGa > 2:324318‑M2/19‑52 (MQ=255) ccGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCTATATGACCACCGTCACTGCCGACAACATCCTCGAAGGCAAGtt < 2:189217/149‑1 (MQ=255) cGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCTATATGACCACCGTCACTGCCGACAACATCCTCTAAGGCAAGTTg < 3:986582/149‑1 (MQ=255) ggtggtCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCTATATGACCACCGTCACTGCCGACAACATCCTCGAAGGCAAGTTGa < 3:331058/149‑1 (MQ=255) tggtCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCTATATGACCACCGTCACTGCCGACAACATCCTCGAAGGCAAGTTGAtt < 1:313719/149‑1 (MQ=255) tggtCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCTATATGACCACCGTCACTGCCGACAACATCCTCGAAGGCAAGTTGAtt < 2:1232967/149‑1 (MQ=255) tggtCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCTATATGACCACCGTCACTGCCGACAACATCCTCGAAGGCAAGTTGAtt < 3:495729/149‑1 (MQ=255) tCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCTATATGACCACCGTCACTGCCGACAACATCCTCGAAGGCAAGTTGATTGGt < 3:217966/149‑1 (MQ=255) tCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCTATATGACCACCGTCACTGCCGACAACATCCTCGAAGGCAAGTTGATTGGt < 2:1633275/149‑1 (MQ=255) tCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCTATATGACCACCGTCACTGCCGACAACATCCTCGAAGGCAAGTTGATTGGt < 1:1022560/149‑1 (MQ=255) gaCAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCTATATGACCACCGTCACTGCCGACAACATCCTCGAAGGCaa < 3:740115‑M2/133‑1 (MQ=255) | ACCAATGTGGCGAAAAGTGAAGCCGAAAAGCGCGGAATCACGTTGAAAATTGCCGATGGTCAGCAAAAGCAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCTATATGACCACCGTCACTGCCGACAACATCCTCGAAGGCAAGTTGATTGGTGA > NC_000913/4450085‑4450377 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |