New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 838 total aligned reads displayed.
GGCAGGACGGAGATAAAGTCTTACCGCTTGAGCGCAAAGAGCTCCTTGGCCAATTATTACTCGACGAGATCGTGACCCGTTATGATGAAAAAAATCGACGTTAAGATTCTGGACCCGCGCGTTGGGAAGGAATTTCCGCTCCCGACTTATGCCACCTCTGGCTCTGCCGGACTTGACCTGCGTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTCAACCTGGCGAACGCATCGCCCAGATGATTTTTGTTCCGGTAGTACAGGCTGAATTTAATCTGGTGGAAGATTTCGACGCCACCGACCGCGGTGAAGGCGGCTTTGGTCACTCTGGTCGTCAGTAACACATA > NC_000913/3813848‑3814393 | aGGACGGAGATAAAGTCTTACCGCTTGAGCGCAAAGAGCTCCTTGGCCAATTATTACTCGACGAGATCGTGACCCGTTATGATGAAAAAAATCGACGTTAAGATTCTGGACCCGCGCGTTGGGAAGGAATTTCCGCTCCCGACTTATGCCACCTCTGGCTCTGCCGGACTTGACCTGCGTGCCTGTCTCAACGACGACGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATCCATATTGCCGCTCCTTCACTggcggc > 1:185584/1‑275 (MQ=255) aaaaGAGCTCCTTGGCCAAGTATTACTCGACGAGATCGTGACCCGTTATGATGAAAAAAATCGACGTTAAGATGCTGGACCCGCGCGTTGGGAAGGAATTTCCGCTCCCGACTTATGCCACCTCTGGCTCTGCCGGACTTGACCTGCGTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACAt < 1:87839/274‑1 (MQ=255) aaggaccctgttgCCAATTATTACCCGACGAGATCCGGACCCGTTATGATGAAAAAAATCGACGTTAAGATTCTGGACCCGCGCGTTGGGAAGGAATTTCCGCCCCCGACTTATGCCACCTCTGGCTCTGCCGGACTTGACCTGCGTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATaa < 4:77094/263‑1 (MQ=255) ccccTTGGCCAATTATCACTCGACGAGATCGTGACCCGTTATGATGAAAAAAATCGACGTTAAGATTCTGGACCCGCGCGTTGGGAAGGAATTTCCGCTCCCGACTTATGCCACCTCTGGCTCTGCCGCACTTGACCTGCGTGCCTGTCCCAACGACGCCGTAGCACTGGCTCCGGGTGACCCTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTCCCGATCCTTCCCTGGCGGCAAAGACTCCTCCCCGGTCCCGTTTGGGACCTaaagac > 4:304784/3‑270 (MQ=255) aaTTATTACTCGACGAGATCGTGACCCGTTATGATGAAAAAAATCGACGTTAAGATTCTGGACCCGCGCGTTGGGAAGGAATTTCCGCTCCCGACTTATGCCACCTCTGGCTCTGCCGGACTTGACCTGCGTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCcgc > 2:58923/1‑241 (MQ=255) cTCGACGAGATCGTGACCCGTTATGATGAAAAAAATCGACGTTAAGATTCTGGACCCGCGCGTTGGGAAGGAATTTCCGCTCCCGACTTATGCCACCTCTGGCTCTGCCGGACTTGACCTGCGTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCcg < 4:630186/232‑1 (MQ=255) cgaGATCGTGACCCGTTATGATGAAAAAAATCGACGTTAAGATTCTGGACCCGCGCGTTGGGAAGGAATTTCCGCTCCCGACTTATGCCACCTCTGGCTCTGCCGGACTTGACCTGCGTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCACTGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTgg > 1:118206/1‑273 (MQ=255) 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ttCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATaa > 8:225421/1‑79 (MQ=255) ttCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGAc < 7:995069/125‑1 (MQ=255) ccGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCgt < 7:756410/149‑1 (MQ=255) gACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCgtgt > 7:250034/1‑149 (MQ=255) gACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCgtgt > 5:824213/1‑149 (MQ=255) gACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCgtgt > 6:131985/1‑149 (MQ=255) ggCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAAcc < 4:335158/146‑1 (MQ=255) ggCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTg < 6:528201/149‑1 (MQ=255) gCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTCAACCTGGCGAACGCa < 3:151202/184‑1 (MQ=255) aTTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCa > 5:114594/1‑149 (MQ=255) ttCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAg < 7:830301/149‑1 (MQ=255) cATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGa < 6:1026710/149‑1 (MQ=255) tatTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACa > 6:892292/1‑149 (MQ=255) ttGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGAtt < 2:728184/96‑1 (MQ=255) ttGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGc > 7:406911/1‑149 (MQ=255) ccGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTc < 6:626847/149‑1 (MQ=255) gttcattCAGTGGCGGCGATGATGCTGCCGCGGTAGGGATTGGGACATGAGCTTGGGATCGTGCTTGGTTACCTGGTAGGATTGATGGATTTGGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACGGCTTGAc < 6:379108/144‑1 (MQ=255) gATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTg < 5:637130/42‑1 (MQ=255) aTCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCAcc > 8:635720/1‑149 (MQ=255) tCCTTCACATGCGGCAATGATGCTGCCGGGCTGCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTCAACCTGGCGAACGCATCGCCCAGATGATTTTTGTTCCGGTAGTACAGGCTGAATTTAATCTGGTGGAAGATTTCGACGCCACCGACCGCGGTGAAGGCGGCTTTGGTCACTCTGGTCGTCAGt < 4:131790/275‑1 (MQ=255) cTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCAtt > 8:540136/1‑149 (MQ=255) cTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCAtt > 5:926706/1‑149 (MQ=255) cACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTCaa > 5:230734/1‑149 (MQ=255) tGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTCAACCt < 7:5173/149‑1 (MQ=255) tGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTCAACCt < 8:504621/149‑1 (MQ=255) | GGCAGGACGGAGATAAAGTCTTACCGCTTGAGCGCAAAGAGCTCCTTGGCCAATTATTACTCGACGAGATCGTGACCCGTTATGATGAAAAAAATCGACGTTAAGATTCTGGACCCGCGCGTTGGGAAGGAATTTCCGCTCCCGACTTATGCCACCTCTGGCTCTGCCGGACTTGACCTGCGTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTCAACCTGGCGAACGCATCGCCCAGATGATTTTTGTTCCGGTAGTACAGGCTGAATTTAATCTGGTGGAAGATTTCGACGCCACCGACCGCGGTGAAGGCGGCTTTGGTCACTCTGGTCGTCAGTAACACATA > NC_000913/3813848‑3814393 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |