New junction evidence | |||||||||||
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Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 828 total aligned reads displayed.
TTACCGCTTGAGCGCAAAGAGCTCCTTGGCCAATTATTACTCGACGAGATCGTGACCCGTTATGATGAAAAAAATCGACGTTAAGATTCTGGACCCGCGCGTTGGGAAGGAATTTCCGCTCCCGACTTATGCCACCTCTGGCTCTGCCGGACTTGACCTGCGTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTCAACCTGGCGAACGCATCGCCCAGATGATTTTTGTTCCGGTAGTACAGGCTGAATTTAATCTGGTGGAAGATTTCGACGCCACCGACCGCGGTGAAGGCGGCTTTGGTCACTCTGGTCGTCAGTAACACATACGCATCCGAATAA > NC_000913/3813868‑3814406 | gcAAGGAGCTCCTTGGCCAATTATTACTCGACGAGATCGGTACCCGTTATGATGAAAAAAATCGACGTTAAGATTCTGGACCCGCGCGTTGGGAAGGAATTTCCGCTCCCGACTTATGCCACCTCTGGCTCTGCCGGACTTGACCTGCGTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGAc < 2:349944/274‑1 (MQ=255) gtcccTTGGCCAATTGTTATACGCCCGGTGCGGGACCCGTTATGCTGAAAACACTCGCCGTGAAGATTCTTGCCCGGCGCGTTGGGAAGGAATTTCCGCTCCCGACTTCTGCCACCTCTGGCTCTGCCGGACTTGGCCTGCGTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCa < 4:312193/271‑1 (MQ=255) cgaGATCGTGACCCGTTATGATGAAAAAAATCGACGTTAAGATTCTGGACCCGCGCGTTGGGAAGGAATTTCCGCTCCCGACTTATGCCACCTCTGGCTCTGCCGGACTTGACCTGCGTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCACTGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTgg > 1:118206/1‑273 (MQ=255) gTTATGATGAAAAAAATCGACGTTAAGATTCTGGACCCGCGCGTTGGGAAGGAATTTCCGCTCCCGACTTATGCCACCTCTGGCTCTGCCGGACTTGACCTGCGTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATc > 2:212306/1‑270 (MQ=255) ttATGATGAAAAAAATCGACGTTAAGATTCTGGACCCGCGCGTTGGGAAGGAATTTCCGCTCCCGACTTATGCCACCTCTGGCTCTGCCGGACTTGACCTGCGTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTggg > 1:66940/1‑226 (MQ=255) ttATGATGAAAAAAATCGACGTTAACATTCTGGACCCGCGCGTTGGGAAGGAATTTCCGCTCCCGACTTATGCCACCTCTGGCTCTGCCGGACTTGACCTGCGTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGCTCCGACCGGGCTGGCGCTTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCCGCCATGATCCTGCCGCGCTCCGCCTTGGGCCATAAGCACGGTATCCTGCTTGGTAACCTGGTCGGATTGATCAATTCt > 2:44905/1‑275 (MQ=255) tgatgaAAAAAATCGACGTTAAGATTCTGGACCCGCGCGTTGGGAAGGAATTTCCGCTCCCGACTTATGCCACCTCTGGCTCTGCCGGACTTGACCTGCGTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGAtt < 4:212306/270‑1 (MQ=255) aaaaTCGACGTTAAGATTCTGGACCCGCGCGTTGGGAAGGAATTTCCGCTCCCGACTTATGCCACCTCTGGCTCTGCCGGACTTGACCTGCGTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAggg < 2:64259/275‑1 (MQ=255) gcgctTTGGGAAGGCGTTTGCGTTCCCGCNNNGTGCCACCGCTGGCTCTGCCGGACTTGACCTGCGTGCCTGTCACCACGACGCAGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCGGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAAcc < 3:208571/275‑1 (MQ=255) cgcgTTGGGAAGGAATTTCCGCTCCCGACTTATGCCACCTCTGGCTCTGCCGGACTTGACCTGCGTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCCCGGGATCTGTCTTTGTAACCTGGAGGGATTGATCGATTCTGGATATCCGGGCCAGTGGATGTTTTTGCTTTGGAAccc > 4:15356/1‑274 (MQ=255) 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taaaaaggacagcAACGCCGCCTTCGAACTGGTCCCGTGTGACACTTCGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACAGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGGTTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTCAACCTGGCGAACGCATCGCCCAAATGATTTTTGTTcca < 4:371455/262‑2 (MQ=255) gTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGt > 8:935867/1‑149 (MQ=255) gTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGAAACCGTGCttatg < 7:81168/149‑4 (MQ=255) gTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGAGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGt > 5:1105335/1‑149 (MQ=255) ccTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCt < 6:581189/142‑1 (MQ=255) 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atatTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGAc > 8:580268/1‑149 (MQ=255) ttGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGa < 2:694285/100‑1 (MQ=255) ttGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGc > 7:406911/1‑149 (MQ=255) ttGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGc < 3:65260/149‑1 (MQ=255) ttGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTCAACCTGGCGAACGCATCGCCCAGATGATTTTTGTTCCGGTAGTACAGGCTGAATTTAATCTGGTGGAAGATTTCGACGCCACCGACCGCGGTGAAGGCGGCTTTGGTCACTCTgg < 2:376572/274‑1 (MQ=255) cGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCTTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCa < 7:240691/149‑1 (MQ=255) gATCCTTCACTGGCTGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCAc > 5:828235/1‑149 (MQ=255) ttCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTc > 6:704941/1‑149 (MQ=255) cACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTCaa < 6:759476/149‑1 (MQ=255) aCTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTCAAc < 6:443341/149‑1 (MQ=255) tGGCGGCAATGATGCTGCCGCGGTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTCAACCTGGCGAACGCATCGCCCAGATGATTTTTGTTCCGGTAGTACAGGCTGAATTTAATCTGGTGGAAGATTTCGACGCCACCGACCGCGGTGAAGGCGGCTTTGGTCACTCTGGTCGTCAGTAACACATa < 2:102958/275‑1 (MQ=255) tGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTtgat < 7:96459/103‑1 (MQ=255) CGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTCAACCTGGCGAACGCATCGCCCAGATGATTTTTGTTCCGgt < 1:164890‑M1/181‑1 (MQ=255) GGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTtga < 8:388915‑M1/98‑1 (MQ=255) CAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTCAGCCTGGCGAACGCATCGCCCAGATGATTTTTGTTCCGGTAGTACAGGCTGAATTTAATCTGGTGGAAGATTTCGACGCCACCGACCGCGGTGAAGGCGGCTTTGGTCACTCTGGTCGTCAGTAACACATACGCAt > 2:279139‑M1/1‑274 (MQ=255) CAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTCAACCTGGCGaa > 7:467844‑M1/1‑149 (MQ=255) AATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGTCCATTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTCAACCTg < 8:496760‑M1/143‑1 (MQ=255) tgatgCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTCAACCTGGCGAACGc > 5:877975/1‑149 (MQ=255) tgatgCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTCAACCTGGCGAACGc > 5:772056/1‑149 (MQ=255) tgccgcGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTCAACCTGGCGAACGCATCGcc > 5:206035‑M2/7‑149 (MQ=255) cgcGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAAcc < 3:129941‑M2/99‑1 (MQ=255) | TTACCGCTTGAGCGCAAAGAGCTCCTTGGCCAATTATTACTCGACGAGATCGTGACCCGTTATGATGAAAAAAATCGACGTTAAGATTCTGGACCCGCGCGTTGGGAAGGAATTTCCGCTCCCGACTTATGCCACCTCTGGCTCTGCCGGACTTGACCTGCGTGCCTGTCTCAACGACGCCGTAGAACTGGCTCCGGGTGACACTACGCTGGTTCCGACCGGGCTGGCGATTCATATTGCCGATCCTTCACTGGCGGCAATGATGCTGCCGCGCTCCGGATTGGGACATAAGCACGGTATCGTGCTTGGTAACCTGGTAGGATTGATCGATTCTGACTATCAGGGCCAGTTGATGATTTCCGTGTGGAACCGTGGTCAGGACAGCTTCACCATTCAACCTGGCGAACGCATCGCCCAGATGATTTTTGTTCCGGTAGTACAGGCTGAATTTAATCTGGTGGAAGATTTCGACGCCACCGACCGCGGTGAAGGCGGCTTTGGTCACTCTGGTCGTCAGTAACACATACGCATCCGAATAA > NC_000913/3813868‑3814406 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |