| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1937563 | 88 (0.470) | 8 (0.050) | 4/218 | NT | 8.2% | intergenic (+42/‑86) | yebK/pykA | putative DNA‑binding transcriptional regulator/pyruvate kinase II |
| ? | NC_000913 | = 1937592 | 99 (0.580) | intergenic (+71/‑57) | yebK/pykA | putative DNA‑binding transcriptional regulator/pyruvate kinase II | |||||
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
CTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGAAGGCTTCGCAGAACAAAAATCGTTACCACGTTAGGCCCAGCAACAGATCGCGAT > NC_000913/1937415‑1937711 | tttGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAGACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATgag > 3:1620685/1‑149 (MQ=255) tttGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATgag < 3:1044139/149‑1 (MQ=255) ttGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATgaga < 1:682816/149‑1 (MQ=255) aaaTTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATc < 4:870767/144‑1 (MQ=255) aaaTTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATc > 3:870767/1‑144 (MQ=255) aTTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATcg > 4:718428/1‑149 (MQ=255) agagATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATCTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCGTCgcggc < 4:1601403/149‑1 (MQ=255) agaTAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGt > 1:891109/1‑149 (MQ=255) agaTAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGt > 1:790697/1‑149 (MQ=255) aTAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTa > 3:1439291/1‑149 (MQ=255) tAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGGTTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTAt > 1:713623/1‑149 (MQ=255) aaCTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTAtt < 1:298718/149‑1 (MQ=255) ttGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCgcgg > 2:1650014/1‑139 (MQ=255) ttGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCgcgg < 1:1650014/139‑1 (MQ=255) tGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAaataacgccgcgatggcgataaattaatctcat > 1:1670207‑M1/1‑116 (MQ=255) tGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTtcat > 3:718428‑M2/1‑145 (MQ=255) gAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTtcatt > 4:1439291‑M2/1‑144 (MQ=255) cGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAaataacgccgcgatggcgataaattaatctcattcgga < 2:1670207‑M1/149‑39 (MQ=255) tCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCgcggcg > 1:1690484/1‑131 (MQ=255) tCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCgcggcg < 2:1690484/131‑1 (MQ=255) aagaagCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATg > 2:295496/1‑149 (MQ=255) aagCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTc > 1:1520791/1‑149 (MQ=255) gcgcTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCaa < 2:1359048/149‑1 (MQ=255) gcTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGGTTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGc < 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ttttGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAaataacgccgcgatggcgataaattaatctcattcggatgtc > 4:1099982‑M1/1‑82 (MQ=255) ttttGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAaataacgccgcgatggcgataaattaatctcattcggatgtc > 4:441057‑M1/1‑82 (MQ=255) ttttGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAaataacgccgcgatggcgataaattaatctcattcggatgtc < 3:441057‑M1/124‑43 (MQ=255) tttGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTc < 2:790697/149‑1 (MQ=255) aTAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTc < 2:1520791/149‑1 (MQ=255) tAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGGCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCaa > 1:1435509/1‑130 (MQ=255) aaGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCaa < 1:297719/149‑1 (MQ=255) cAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTAtt > 2:95787/1‑101 (MQ=255) cAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTAtt < 1:95787/101‑1 (MQ=255) aGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTGAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTc > 3:1674085/1‑139 (MQ=255) aGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTc < 4:1674085/139‑1 (MQ=255) aGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGa < 1:295496/149‑1 (MQ=255) 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gACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTtcattcggatgtcgtataagattaggacagtgacagtcgtttttagcgatcgtcacttaaattaagtaactgcttatcaaaa < 3:441057‑M2/124‑83 (MQ=255) gACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTtcattcggatgtcgtataagattaggacagtgacagtcgtttttagcgatcgtcacttaaattaagtaactgcttatcaaaa > 4:1099982‑M2/1‑42 (MQ=255) gACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTtcattcggatgtcgtataagattaggacagtgacagtcgtttttagcgatcgtcacttaaattaagtaactgcttatcaaaa < 3:1099982‑M2/124‑83 (MQ=255) cATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGAAGGCTTCGCAGAACAAAAATCGTTACCACGTTAGGCCCAGCAAc < 4:122945/149‑1 (MQ=255) aTCCGAATGAaataacgccgcgatggcgataaattaatctcattcggatgtcgtataagattaggacagtgacagtcgtttttagcga > 2:325252‑M1/1‑10 (MQ=255) tCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTtcattcggatgtcgtataagattaggacagtgacagtcgtttttagcgatcgtcacttaaattaagtaactgcttatcaaaacgcgattccttcagcgcttctttgacccg < 2:729274‑M2/149‑112 (MQ=255) aaTGAaataacgccgcgatggcgataaattaatctcattcggatgtcgtataagattaggacagtgacagtcgtttttagcgatcgtcacttaaattaagtaactgcttatcaaaacgcgattccttcagcgcttctttgacccgcttc > 4:1439291‑M1/1‑5 (MQ=255) aaTGAaataacgccgcgatggcgataaattaatctcattcggatgtcgtataagattaggacagtgacagtcgtttttagcgatcgtcacttaaa < 4:1630459‑M1/95‑91 (MQ=255) aaTGAaataacgccgcgatggcgataaattaatctcattcggatgtcgtataagattaggacagtgacagtcgtttttagcgatcgtcacttaaa > 3:1630459‑M1/1‑5 (MQ=255) aaTGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGAAGGCTTCGCAGAACAAAAATCGTTACCACGtt > 3:1113670/1‑131 (MQ=255) aTGAaataacgccgcgatggcgataaattaatctcattcggatgtcgtataagattaggacagtgacagtcgtttttagcgatcgtcacttaaattaagtaactgcttatcaaaacgcgattccttcagcgcttctttgacccgcttca > 3:718428‑M1/1‑4 (MQ=255) aTGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTtcattcggatgtcgtataagattaggacagtgacagtcgtttttagcgatcgtcacttaaattaagtaactgcttatcaaaacgcgattccttcagcgcttctttgacccgcttca > 1:1670207‑M2/1‑33 (MQ=255) 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CTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGTTTCAGTCAACGGAGTATTACATGTCCAGAAGGCTTCGCAGAACAAAAATCGTTACCACGTTAGGCCCAGCAACAGATCGCGAT > NC_000913/1937415‑1937711 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |