| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2232735 | NA (NA) | 5 (0.030) | 6/226 | NT | NA | intergenic (+7/‑143) | cdd/sanA | cytidine/deoxycytidine deaminase/DUF218 superfamily vancomycin high temperature exclusion protein |
| ? | NC_000913 | = 2232765 | NA (NA) | noncoding (30/34 nt) | REP155 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP155 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | |||||
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
TCTCAAGGGTTATGATTACCCGGATATCCAGCGCGCGGTTCTGGCAGAAAAAGCCGATGCGCCGTTGATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGATGGAAATTTTCCTTAGATCGAGTCTCCTGCAT > NC_000913/2232587‑2232879 | tctcAAGGGTTATGATTACCCGGATATCCAGCGCGCGGTTCTGGCAGAAAAAGCCGATGCGCCGTTGATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTTGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGt < 4:392857/149‑1 (MQ=255) tcAAGGGTTATGATTACCCGGATATCCAGCGCGCGGTTCTGGCAGAAAAAGCCGATGCGCCGTTGATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTgc > 3:833742‑M1/1‑147 (MQ=255) tcAAGGGTTATGATTACCCGGATATCCAGCGCGCGGTTCTGGCAGAAAAAGCCGATGCGCCGTTGATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTgc > 4:411010‑M1/1‑147 (MQ=255) aTGATTACCCGGATATCCAGCGCGCGGTTCTGGCAGAAAAAGCCGATGCGCCGTTGATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATgcgg > 1:139783/1‑149 (MQ=255) ggATATCCAGCGCGCGGTTCTGGCAGAAAAAGCCGATGCGCCGTTGATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGcc > 2:546193/1‑149 (MQ=255) gATATCCAGCGCGCGGTTCTGGCAGAAAAAGCCGATGCGCCGTTGATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCt > 3:1483808/1‑149 (MQ=255) tatCCAGCGCGCGGTTCTGGCAGAAAAAGCCGATGCGCCGTTGATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGc < 3:1018052/145‑1 (MQ=255) tatCCAGCGCGCGGTTCTGGCAGAAAAAGCCGATGCGCCGTTGATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGc > 4:1018052/1‑145 (MQ=255) tCCAGCGCGCGGTTCTGGCAGAAAAAGCCGATGCGCCGTTGATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTgccggacaaggcgttcacgccgcatc < 2:1426166‑M1/149‑27 (MQ=255) tCCAGCGCGCGGTTCTGGCAGAAAAAGCCGATGCGCCGTTGATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTC > 1:1324340‑M2/1‑149 (MQ=255) tCCAGCGCGCGGTTCTGGCAGAAAAAGCCGATGCGCCGTTGATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTC > 1:56430‑M2/1‑149 (MQ=255) ccAGCGCGCGGTTCTGGCAGAAAAAGCCGATGCGCCGTTGATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCC < 1:871753‑M2/149‑1 (MQ=255) cAGCGCGCGGTTCTGGCAGAAAAAGCCGATGCGCCGTTGATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCG < 4:1464217‑M2/149‑1 (MQ=255) aGCGCGCGGTTCTGGCAGAAAAAGCCGATGCGCCGTTGATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGG > 3:754271‑M2/1‑149 (MQ=255) gcgcgcGGTTCTGGCAGAAAAAGCCGATGCGCCGTTGATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGC > 4:833742‑M2/1‑149 (MQ=255) gcgGTTCTGGCAGAAAAAGCCGATGCGCCGTTGATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGc < 4:522407/149‑1 (MQ=255) cgGTTCTGGCAGAAAAAGCCGATGCGCCGTTGATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGTCCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGAt > 4:440344/1‑121 (MQ=255) cgGTTCTGGCAGAAAAAGCCGATGCGCCGTTGATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGAt < 3:440344/121‑1 (MQ=255) gTTCTGGCAGAAAAAGCCGATGCGCCGTTGATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCtt < 4:528141/135‑1 (MQ=255) gTTCTGGCAGAAAAAGCCGATGCGCCGTTGATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCtt > 3:528141/1‑135 (MQ=255) ttCTGGCAGAAAAAGCCGATGCGCCGTTGATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGc > 3:1615707/1‑149 (MQ=255) tGGCAGAAAAAGCCGATGCGCCGTTGATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGcc > 4:783392/1‑129 (MQ=255) tGGCAGAAAAAGCCGATGCGCCGTTGATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCct > 4:1753795/1‑149 (MQ=255) ggCAGAAAAAGCCGATGCGCCGTTGATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCctc > 3:105928/1‑149 (MQ=255) aGAAAAAGCCGATGCGCCGTTGATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTcc > 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aaaGCCGATGCGCCGTTGATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGgt < 4:1483808/149‑1 (MQ=255) aaaGCCGATGCGCCGTTGATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGgt < 2:965178/149‑1 (MQ=255) aaaGCCGATGCGCCGTTGATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGACAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCaccag < 2:80706‑M2/135‑6 (MQ=255) aaGCCGATGCGCCGTTGATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGgtg > 1:1467340/1‑149 (MQ=255) aGCCGATGCGCCGTTGATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCG > 1:331315‑M2/1‑126 (MQ=255) gCCGATGCGCCGTTGATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTc > 3:182803/1‑149 (MQ=255) gCCGATGCGCCGTTGATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTc > 1:346349/1‑149 (MQ=255) gcCGTTGATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTcc < 3:411010/149‑1 (MQ=255) cGTTGATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCg < 2:346349/149‑1 (MQ=255) cGTTGATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCg < 4:182803/149‑1 (MQ=255) gATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCaa > 2:11780/1‑149 (MQ=255) 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aCCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAAt < 1:1710504/84‑1 (MQ=255) aCCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGATGGAAAtttt > 1:1099595/1‑149 (MQ=255) aCCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGATGGAAAtttt > 4:1594826/1‑149 (MQ=255) ccGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGATGGAAATTTTc < 4:1141434/149‑1 (MQ=255) gAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGt > 2:523857/1‑38 (MQ=255) gAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGt < 1:523857/38‑1 (MQ=255) gAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGATGGAAATTTTCCt > 1:1464558/1‑149 (MQ=255) ttCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGATGGAAATTTTCCTTAGATc > 4:1429875/1‑149 (MQ=255) ctcGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGATGGAAAttt > 3:1570939/1‑137 (MQ=255) ctcGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGATGGAAAttt < 4:1570939/137‑1 (MQ=255) ctcGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGATGGAAATTTTCCTTAGATCGa < 3:1429875/149‑1 (MQ=255) ctcGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGATGGAAATTTTCCTTAGATCGa < 2:1464558/149‑1 (MQ=255) tcGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGATGGAAATTTTCCTTAGATCGAg > 3:923333/1‑149 (MQ=255) cTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGATGGAAAt > 3:519329/1‑131 (MQ=255) cTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGATGGAAAt < 4:519329/131‑1 (MQ=255) ttAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGATGGAAATTTTCCTTAGATCGAGtctc > 2:1062258/1‑149 (MQ=255) aaGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGATGGAAATTTTCCTTAGATCGAGTCTCCt < 2:536959/149‑1 (MQ=255) aGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGATGGAAATTTTCCTTAGATCGAGTCTCCTg < 4:1519860/149‑1 (MQ=255) gCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGAt > 3:299198/1‑120 (MQ=255) cTGGTgccggatgcggcgtgaacgccttgtccggcaccaggcttaagcgagaagcactcggtcgatactgtgacagccgagagctttcagcgttgcggaggtggcatcccactgaatcaacggcgcatcggcttt < 2:80706‑M1/135‑131 (MQ=255) cTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCaccaggcttaagcgagaagcactcggtcgatactgtgacagccgagagctttcagcgttgcggaggtggcatcccactgaatcaacggcgcatcggcttt < 1:80706‑M2/135‑101 (MQ=255) cTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGATGGAAATTTTCCTTAGATCGAGTCTCCTGCAt > 1:23309/1‑149 (MQ=255) tgccggatgcggcgtgaacgccttgtccggcaccaggcttaagcgagaagcactcggtcgatactgtgacagccgagagctttcag < 4:440636‑M1/86‑86 (MQ=255) tGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCaccaggcttaagcgagaagcactcggtcgatactgtgacagccgagagctttcag < 3:440636‑M2/86‑56 (MQ=255) | TCTCAAGGGTTATGATTACCCGGATATCCAGCGCGCGGTTCTGGCAGAAAAAGCCGATGCGCCGTTGATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGATGGAAATTTTCCTTAGATCGAGTCTCCTGCAT > NC_000913/2232587‑2232879 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |