| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 2828783 = | 144 (0.770) | 7 (0.040) | 5/230 | NT | 5.1% | coding (163/360 nt) | srlM | sorbitol=responsive srl operon transcriptional activator |
| ? | NC_000913 | 2828822 = | 120 (0.670) | coding (202/360 nt) | srlM | sorbitol=responsive srl operon transcriptional activator | |||||
Only 100 of 175 total aligned reads displayed.
CATCACCGTCGCCGTTATCGCCTGGTGTGCGCAACTGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCGCAAAAAATTCCCGCAATTACCGGTATGCATGCGGGTGATTTACAGCCCGATGTGATCTTTCCCCATGATC > NC_000913/2828635‑2828930 | cagtttaagcgccaatgatagagcattctgtgatagtggatcatggggaaagatcacatcgggctgtaaatcacccgcatgcataccggtaattgcgggaattttttgcggtcgggcgaagacggtcagtcctttcataaacaaggtgt > 4:469746‑M1/148‑149 (MQ=255) gtttaagcgccaatgatagagcattctgtgatagtggatcatggggaaagatcacatcgggctgtaaatcacccgcatgcataccggtaattgcgggaattttttgcggtcgggcgaagacggtcagtcctttcataaacaaggtGTCg < 4:136275‑M1/4‑1 (MQ=255) gCCGTTATCGCCTGGTGTGCGCAACTGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATcgc > 3:1695913/1‑149 (MQ=255) cGTTATCGCCTGGTGTGCGCAACTGGCCTTAGGCGGCTGGCAGATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCgcgc < 1:794896/149‑1 (MQ=255) cGTTATCGCCTGGTGTGCGCAACTGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCgcgc > 1:1734055/1‑149 (MQ=255) gTTATCGCCTGGTGTGCGCAACTGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCt > 3:307019/1‑149 (MQ=255) tATCGCCTGGTGTGCGCAACTGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTgg < 1:716545/149‑1 (MQ=255) tagagcattctgtgatagtggatcatggggaaagatcacatcgggctgtaaatcacccgcatgcataccggtaattgcgggaattttttgcggtcgggcgaagacggtcagtcctttcataaacaaggtGTCg > 4:639951‑M1/130‑133 (MQ=255) tagagcattctgtgatagtggatcatggggaaagatcacatcgggctgtaaatcacccgcatgcataccggtaattgcgggaattttttgcggtcgggcgaagacggtcagtcctttcataaacaaggtGTCg < 3:639951‑M1/4‑1 (MQ=255) ccTGGTGTGCGCAACTGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGAc < 3:1477950/146‑1 (MQ=255) gtgtGCGCAACTGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATcagc < 3:125861/149‑1 (MQ=255) tgtgCGCAACTGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATcagca < 1:1487317/149‑1 (MQ=255) tgtgCGCAACTGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATcagca < 1:241594/149‑1 (MQ=255) tgtgCGCAACTGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATcagca < 3:288809/149‑1 (MQ=255) tgCGCAACTGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCagcagc < 1:1846046/149‑1 (MQ=255) aaCTGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCAtc < 2:941812/149‑1 (MQ=255) aaCTGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCAtc > 1:941812/1‑149 (MQ=255) aCTGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCCCGCTGGAc < 3:1330632/133‑1 (MQ=255) tGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCAtcgtc > 2:776288/1‑149 (MQ=255) tGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCAtcgtc > 2:283486/1‑149 (MQ=255) tGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCAtcgtc > 4:1363854/1‑149 (MQ=255) gtggatcatggggaaagatcacatcgggctgtaaatcacccgcatgcataccggtaattgcgggaattttttgcggtcgggcgaagacggtcagtcctttcataaacaaggtGTc > 3:576882‑M1/113‑115 (MQ=255) gtggatcatggggaaagatcacatcgggctgtaaatcacccgcatgcataccggtaattgcgggaattttttgcggtcgggcgaagacggtcagtcctttcataaacaaggtGTc < 4:576882‑M1/3‑1 (MQ=255) ggCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCAtcgtcg > 1:1312291/1‑149 (MQ=255) cTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGAt < 2:1872910/130‑1 (MQ=255) cTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGAt > 1:1872910/1‑130 (MQ=255) cTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATc > 2:483677/1‑131 (MQ=255) cTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGaca < 4:1331285/149‑1 (MQ=255) ttAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGacac > 4:1224355/1‑149 (MQ=255) tAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGt > 4:1040466/1‑109 (MQ=255) tAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGt < 3:1040466/109‑1 (MQ=255) aGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCt < 4:1752874/149‑1 (MQ=255) ggcTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGtt < 3:1363854/149‑1 (MQ=255) ggcTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGtt < 1:776288/149‑1 (MQ=255) gcTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGttt < 2:1312291/149‑1 (MQ=255) tGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCt < 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ctcGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCAtcgtc < 1:1422529/125‑1 (MQ=255) tcGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGACTg < 2:533114/148‑1 (MQ=255) tcGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGACTg > 1:533114/1‑148 (MQ=255) ttttAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGt > 2:1380468/1‑131 (MQ=255) ttttAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGaaa < 1:387735/139‑1 (MQ=255) tttAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGt < 3:890340/149‑1 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gcgGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCGCAAAAAATTCCCGCAATTACCGGTATGCATGCGGGTGATTTACAGCCCGATGTGATCTTTc < 3:1096105/149‑1 (MQ=255) gcgGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCGCAAAAAATTCCCGCAATTACCGGTATGCATGCGGGTGATTTACAGCCCGATGTGATCTTTc < 2:1478579/149‑1 (MQ=255) cgGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCGCAAAAAATTCCCGCAATTACCGGTATGCATGCGGGTGATTTACAGCCCGATGTGATCTTTcc < 4:148138/149‑1 (MQ=255) gTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCGCAAAAAATTCCCGCAATTACCGGTATGCATGCGGGTGATTTACAGCCCGAtgt > 1:1108134/1‑137 (MQ=255) gTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCGCAAAAAATTCCCGCAATTACCGGTATGCATGCGGGTGATTTACAGCCCGAtgt < 2:1108134/137‑1 (MQ=255) tCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCGCAAAAAATTCCCGCAATTACCGGTATGCATGCGGGTGATTTACAGCCCGATGTGa > 1:1508347/1‑138 (MQ=255) tCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCGCAAAAAATTCCCGCAATTACCGGTATGCATGCGGGTGATTTACAGCCCGATGTGa < 2:1117155/138‑1 (MQ=255) tCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCGCAAAAAATTCCCGCAATTACCGGTATGCATGCGGGTGATTTACAGCCCGATGTGa > 1:1117155/1‑138 (MQ=255) tCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCGCAAAAAATTCCCGCAATTACCGGTATGCATGCGCGTGATTTACAGCCCGATGTGa < 2:1508347/138‑1 (MQ=255) ggTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCGCAAAAAATTCCCGCAATTACCGGTATGCATGCGGGTGATTTACAGCCCGATGTGATCTTTCCCCATGATc > 1:657661/1‑149 (MQ=255) | CATCACCGTCGCCGTTATCGCCTGGTGTGCGCAACTGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCGCAAAAAATTCCCGCAATTACCGGTATGCATGCGGGTGATTTACAGCCCGATGTGATCTTTCCCCATGATC > NC_000913/2828635‑2828930 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |