| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
CTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCGCAAAAAATTCCCGCAATTACCGGTATGCATGCGGGTGATTTACAGCCCGATGTGATCTTTCCCCATGATCCACTATCACAGAATGCTCTATCATTGGCGCTTAAACTGAA > NC_000913/2828674‑2828970 | cTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGaca < 4:1331285/149‑1 (MQ=255) ttAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGacac > 4:1224355/1‑149 (MQ=255) aGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCt < 4:1752874/149‑1 (MQ=255) ggcTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGtt < 3:1363854/149‑1 (MQ=255) gcTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGttt < 2:1312291/149‑1 (MQ=255) tGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCt < 3:1230991/142‑1 (MQ=255) tGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGt < 2:350952/145‑1 (MQ=255) gCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGa < 1:347212/149‑1 (MQ=255) aaTTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAg > 1:15461/1‑149 (MQ=255) tttCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGa < 2:1690332/149‑1 (MQ=255) tttCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGa < 4:1471509/149‑1 (MQ=255) tttCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGa < 4:1695913/149‑1 (MQ=255) tttCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGa < 4:307019/149‑1 (MQ=255) tcGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGACTg < 2:533114/148‑1 (MQ=255) gTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGACTGAcc > 4:489645/1‑149 (MQ=255) ttttAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGt < 1:1380468/131‑1 (MQ=255) ttttAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGt > 2:1380468/1‑131 (MQ=255) ttttAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGaaa < 1:387735/139‑1 (MQ=255) tttAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGt < 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acacacTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGaaa < 4:1135375/122‑1 (MQ=255) acacacTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGaaa > 3:1135375/1‑122 (MQ=255) acacacTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCGCaa < 1:97881/149‑1 (MQ=255) acTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGc < 3:230011/135‑1 (MQ=255) acTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGc > 4:230011/1‑135 (MQ=255) tGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCGCAAAAAATTcc < 3:1756277/149‑1 (MQ=255) 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gcgcATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCGCAAAAAATTCCCGCAATTACCGGTATGCATGCGGGTGATTTACAGCCCGATGTGATCTTTCCCCATGATCCACTATCACAGaa < 3:1358648/135‑1 (MQ=255) cgcATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCGCAAAAAATTCCCGCAATTACCGGTATGCATGCGGGTGATTTACAGCCCGATGTGATCTTTCCCCATGATCCACTATCACAGAATGCTCTATCATTGgc < 4:435066/149‑1 (MQ=255) tcgACACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCGCAAAAAATTCCCGCAATTACCGGTATGCATGCGGGTGATTTACAGCCCGATGTGATCTTTcc > 3:363247/1‑106 (MQ=255) tcgACACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCGCAAAAAATTCCCGCAATTACCGGTATGCATGCGGGTGATTTACAGCCCGATGTGATCTTTcc < 4:363247/106‑1 (MQ=255) tcgACACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCGCAAAAAATTCCCGCAATTACCGGTATGCATGCGGGTGATTTACAGCCCGATGTGATCTTTCCCCATGATCCACTATCACAGAATGCTCTATCATTGGCGCTTaaa < 1:1470335/149‑1 (MQ=255) tcgACACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCGCAAAAAATTCCCGCAATTACCGGTATGCATGCGGGTGATTTACAGCCCGATGTGATCTTTCCCCATGATCCACTATCACAGAATGCTCTATCATTGGCGCTTaaa < 3:1086338/149‑1 (MQ=255) cgacACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCGCAAAAAATTCCCGCAATTACCGGTATGCATGCGGGTGATTTACAGCCCGATGTGATCTTTCCCCATGATCCACTATCACAGAATGCTCTa < 3:639951‑M2/129‑1 (MQ=255) cgacACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCGCAAAAAATTCCCGCAATTACCGGTATGCATGCGGGTGATTTACAGCCCGATGTGATCTTTCCCCATGATCCACTATCACAGAATGCTCTATCATTGGCGCTTAAAc < 4:136275‑M2/145‑1 (MQ=255) gacACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCGCAAAAAATTCCCGCAATTACCGGTATGCATGCGGGTGATTTACAGCCCGATGTGATCTTTCCCCATGATCCAc < 4:576882‑M2/112‑1 (MQ=255) cACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCGCAAAAAATTCCCGCAATTACCGGTATGCATGCGGGTGATTTACAGCCCGAt < 3:151177‑M2/90‑1 (MQ=255) acCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCGCAAAAAATTCCCGCAATTACCGGTATGCATGCGGGTGATTTACAGCCCGATGTGATCTTTCCCCATGATCCACTATcaca < 2:680786/119‑1 (MQ=255) acCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCGCAAAAAATTCCCGCAATTACCGGTATGCATGCGGGTGATTTACAGCCCGATGTGATCTTTCCCCATGATCCACTATCACAGAATGCTCTATCATTGGCGCTTAAACTGaa > 3:252714/1‑149 (MQ=255) acCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCGCAAAAAATTCCCGCAATTACCGGTATGCATGCGGGTGATTTACAGCCCGATGTGATCTTTCCCCATGATCCACTATCACAGAATGCTCTATCATTGGCGCTTAAACTGaa > 1:722000/1‑149 (MQ=255) | CTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCGCAAAAAATTCCCGCAATTACCGGTATGCATGCGGGTGATTTACAGCCCGATGTGATCTTTCCCCATGATCCACTATCACAGAATGCTCTATCATTGGCGCTTAAACTGAA > NC_000913/2828674‑2828970 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |