| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2516411 | 191 (1.020) | 16 (0.090) | 8/230 | NT | 7.9% | coding (1422/2190 nt) | yfeA | putative diguanylate cyclase |
| ? | NC_000913 | = 2516437 | 186 (1.030) | coding (1396/2190 nt) | yfeA | putative diguanylate cyclase | |||||
Only 100 of 231 total aligned reads displayed.
TCTTTGTTGCGAATTGGCTGGGCGTAGAGCAGCAAATCACCCTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTATTGTTCCAGTGAATTTGCCGACTATTCAGGATGTTAACCATA > NC_000913/2516289‑2516585 | tctTTGTTGCGAATTGGCTGGGCGTAGAGCAGCAAATCACCCTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCa > 3:369496/1‑149 (MQ=255) cTTTGTTGCGAATTGGCTGGGCGTAGAGCAGCAAATCACCCTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAg > 3:753655‑M2/1‑148 (MQ=255) gttgCGAATTGGCTGGGCGTAGAGCAGCAAATCACCCTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGAtt < 4:1453292/149‑1 (MQ=255) ttgCGAATTGGCTGGGCGTAGAGCAGCAAATCACCCTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTg > 1:1554969/1‑149 (MQ=255) tgCGAATTGGCTGGGCGTAGAGCAGCAAATCACCCTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGc < 2:520965/149‑1 (MQ=255) gAATTGGCTGGGCGTAGAGCAGCAAATCACCCTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTcc > 1:1286546/1‑149 (MQ=255) gAATTGGCTGGGCGTAGAGCAGCAAATCACCCTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTcc > 1:1692723/1‑149 (MQ=255) aTTGGCTGGGCGTAGAGCAGCAAATCACCCTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCgc > 1:1388310/1‑149 (MQ=255) cTGGGCGTAGAGCAGCAAATCACCCTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCgccagcc > 4:420167/1‑149 (MQ=255) gggCGTAGAGCAGCAAATTACCCTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGccagccag > 2:370530/1‑149 (MQ=255) gggCGTAGAGCAGCAAATCACCCTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGccagccag > 3:315981/1‑149 (MQ=255) gggCGTAGAGCAGCAAATCACCCTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGccagccag > 3:870820/1‑149 (MQ=255) gggCGTAGAGCAGCAAATCACCCTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGccagccag > 4:1153318/1‑149 (MQ=255) ggCGTAGAGCAGCAAATCACCCTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCcagccagc < 2:428222/149‑1 (MQ=255) gCGTAGAGCAGCAAATCACCCTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCt < 1:1626832/149‑1 (MQ=255) gCGTAGAGCAACAAATCACCCTTATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCGCCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCGGCGCCCTCACATGATGTTGTGCACATGATTGCTCCGCCAGCCAGCt < 4:907378/149‑1 (MQ=255) cagcaAATCACCCTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGcc < 2:1745223/149‑1 (MQ=255) agcaAATCACCCTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGccc > 4:1555943/1‑149 (MQ=255) tCACCCTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCcaacaa < 1:954564/149‑1 (MQ=255) aCCCTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAgg < 3:597385/149‑1 (MQ=255) ccTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAg > 1:866227‑M2/1‑109 (MQ=255) ccTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGt > 4:454786/1‑149 (MQ=255) ccTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGt > 1:1803476/1‑149 (MQ=255) ccTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGt > 2:1650366/1‑149 (MQ=255) ccTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGt > 2:1608103/1‑149 (MQ=255) gATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGc > 2:1287988/1‑149 (MQ=255) aTCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCa < 3:210820/149‑1 (MQ=255) tAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAggg > 4:1577185/1‑149 (MQ=255) tAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAggg > 2:1405824/1‑149 (MQ=255) gCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTc < 1:1673522/149‑1 (MQ=255) cGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTCGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCt < 4:1249933/149‑1 (MQ=255) cGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCt > 2:108891/1‑149 (MQ=255) tGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGa < 3:420167/149‑1 (MQ=255) gCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGAt < 2:1565306/149‑1 (MQ=255) gAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGAttt > 4:1662754/1‑149 (MQ=255) aaTGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTc < 4:761422/149‑1 (MQ=255) ggTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCAt < 3:454786/149‑1 (MQ=255) ttCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCTCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCaaa > 2:257941/1‑149 (MQ=255) ttCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAgg > 4:368195/1‑121 (MQ=255) cAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAAc < 3:1555943/149‑1 (MQ=255) aGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACg > 1:713209/1‑149 (MQ=255) gCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTa > 2:889025/1‑102 (MQ=255) aCCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAAc < 4:1485430/96‑1 (MQ=255) aCCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAAc > 3:1485430/1‑96 (MQ=255) gtctAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAATAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGAtt > 4:143491/4‑124 (MQ=255) gTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGAtt < 3:143491/124‑1 (MQ=255) tttAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCAc < 1:405648/149‑1 (MQ=255) tAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAggatcgc < 3:1025986‑M2/71‑8 (MQ=255) tAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGc < 4:1025986/71‑1 (MQ=255) tAGTGGTCTGCACGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCa > 3:1636733/1‑149 (MQ=255) aGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCAt > 2:117901/1‑149 (MQ=255) tGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTACCTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGAtt > 3:656684/1‑118 (MQ=255) tGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAgg < 1:1365485/107‑1 (MQ=255) tGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGAtt > 3:1117444/1‑118 (MQ=255) tGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGAtt < 4:656684/118‑1 (MQ=255) gTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGcc < 1:108891/149‑1 (MQ=255) tGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCaaa < 3:1412370/122‑1 (MQ=255) tGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCaaa > 4:1412370/1‑122 (MQ=255) tGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCat > 2:645832/1‑149 (MQ=255) ccATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCcaacaa > 4:820913/1‑82 (MQ=255) cATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGtt > 4:123257/1‑86 (MQ=255) cATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCgg > 3:1703170/1‑149 (MQ=255) cATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCgg > 1:377077/1‑149 (MQ=255) aTCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGt < 3:9853/149‑1 (MQ=255) tctcCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTa > 1:305403/1‑149 (MQ=255) ctctctGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTATTGt > 2:800318/1‑149 (MQ=255) ctctctGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTATTGt > 3:88778/1‑149 (MQ=255) ctctctGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTATTGt > 2:1679889/1‑149 (MQ=255) tctctGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTcc > 4:878493/1‑90 (MQ=255) tctctGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTATTGtt < 4:62236/149‑1 (MQ=255) tctctGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTATTGtt > 2:1463567/1‑149 (MQ=255) tctctGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGACTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTATTGtt > 2:314305/1‑149 (MQ=255) tctGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAggattgcagagaggagatggtttccgggcagaccactaaacaggtgctattgctgaataccattcgcacggcgttagatcagggtgatttgctgctctac > 4:569981‑M2/1‑36 (MQ=255) tctGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTATTGTTcc > 4:1829537/1‑149 (MQ=255) tGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCTggatagcagagaggagatggtttccgggcagaccactaaacaggtgctattgctgaataccatt < 2:919089‑M2/98‑65 (MQ=255) cTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAggattgcagagaggagatggtttccgggcagaccactaaacaggtgctattgctgaataccattcgcacggcgttagatcagggtgatttgctgc < 3:220645‑M2/127‑96 (MQ=255) tATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAggatagcagagaggagatggtttccgggcagaccactaaacaggtgctattgctgaataccattcgcacggcgttagatcagggtgatttgctgctctacgcccagccaattcgcaac < 1:644154‑M2/149‑119 (MQ=255) tATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAggatagcagagaggagatggtttccgggcagaccactaaacaggtgctattgctgaataccattcgcacggcgttagatcagggtgatttg < 1:652599‑M2/122‑92 (MQ=255) aTCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTATTGTTCCAGTGaa < 4:349206/149‑1 (MQ=255) aTCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTATTGTTCCAGTGaa < 1:89140/149‑1 (MQ=255) tCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAggatagcagagaggagatggtttccgggcagaccactaaacaggtgctattgctgaataccattcgcacggc > 2:1881876‑M2/1‑29 (MQ=255) ccAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTATTGTTCCAGTGAAtt > 1:1002157/1‑149 (MQ=255) aGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCTggatagcagagaggagatggtttccgggcagaccactaaacaggtgctattgctgaata > 2:704731‑M2/1‑26 (MQ=255) aGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTATTGTTCCAGTGAATTTg > 3:1823994/1‑149 (MQ=255) tcctgcgCACATCACCATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTATTGTTCCa > 1:1412594/7‑139 (MQ=255) ccAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTATTGTTCCAGTGAATTTCCCGa < 1:1598129/149‑1 (MQ=255) acaTGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTATTGTTCCAGTGAATTTGCCGACTAtt > 2:1719091/1‑149 (MQ=255) caTGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTATTGTTCCAGTGAATTTGCCGACTATTc > 3:1362601/1‑149 (MQ=255) atgatgatgTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGgc > 2:1364794/1‑93 (MQ=255) atgatgatgTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGc < 1:1196291/104‑1 (MQ=255) atgatgatgTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTATTGTTCCAGTGAATTTGCCGACTATTCa > 4:210758/1‑149 (MQ=255) tgatgatgTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAgg < 3:1180198/52‑1 (MQ=255) gatgatgTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATa < 4:300295/100‑1 (MQ=255) atgatgTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTATTGTTCCAGTGAATTTGCCGACTATTCAGGa < 4:1679940/149‑1 (MQ=255) tgatgTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTATTGTTCCAGTGAATTTGCCGACTATTCa > 3:1676722/1‑145 (MQ=255) tgatgTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTATTGTTCCAGTGAATTTGCCGACTATTCAGGAt > 3:1476920/1‑149 (MQ=255) gcgcAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGTTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTATTGTTCCAGTGAATTTGCCGACTATTCAGGATGTTAAc < 2:1375887/149‑1 (MQ=255) gcgcAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTATTGTTCCAGTGAATTTGCCGACTATTCAGGATGTTAAc < 1:1719091/149‑1 (MQ=255) cgcAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTATTGTTCCAGTGAATTTGc > 2:1495044/1‑128 (MQ=255) gcGggatagcagagaggagatggtttccgggcagaccactaaacaggtgctattgctgaataccattcgcacggcgttagatcagggtgatttgctgctctacgcccagccaattcgcaacaaagagggtgaaggttatgatgagatcc < 2:1203537‑M2/149‑147 (MQ=255) | TCTTTGTTGCGAATTGGCTGGGCGTAGAGCAGCAAATCACCCTGATCTAACGCCGTGCGAATGGTATTCAGCAATAGCACCTGTTTAGTGGTCTGCCCGGAAACCATCTCCTCTCTGCTATCCAGCGCCAGCACATGATGATGTGCGCAGGATTGCTCCGCCAGCCAGCTTAACTGCCCCAACAAGGGTTGCAGGGTTTCCTGATTTCCATCAAAACGCCCCCAGGCAGCACCATAGCCCATATCCAGCCCGGTATTGTTCCAGTGAATTTGCCGACTATTCAGGATGTTAACCATA > NC_000913/2516289‑2516585 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |