| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 4412327 = | 121 (0.650) | 13 (0.070) | 11/226 | NT | 9.9% | coding (349/399 nt) | yjfL | UPF0719 family inner membrane protein |
| ? | NC_000913 | 4412348 = | 122 (0.690) | coding (370/399 nt) | yjfL | UPF0719 family inner membrane protein | |||||
Only 100 of 167 total aligned reads displayed.
TATTTCGCCTGGGGCGGGATTGCACTGGTGATTCAGTTACTCGTTTTTGCTGGTGTCAGACTTTATATGCCCGCATTAAGCGAAAAAATTATTAATCACAATACCGCAGCAGGAATGTTTATGGGAACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACA > NC_000913/4412201‑4412496 | tATTTCGCCTGGGGCGGGATTGCACTGGTGATTCAGTTACTCGTTTTTGCTGGTGTCAGACTTTATATGCCCGCATTAAGCGAAAAAATTATTAATCACAATACCGCAGCAGGAATGTTTATGGGAACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTAt < 1:1194710/149‑1 (MQ=255) aaaaggattattcggtctaccaatgcgactaatcgctccgtgaccaattttactgttatttcttgatttgcgttttctggccatgatcgtccattaccatgtcatacaagctgcgttaaaaatACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTAt > 2:1603466‑M1/124‑146 (MQ=255) aaaaggattattcggtctaccaatgcgactaatcgctccgtgaccaattttactgttatttcttgatttgcgttttctggccatgatcgtccattaccatgtcatacaagctgcgttaaaaatACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTAt < 1:1603466‑M1/23‑1 (MQ=255) aaaggattattcggtctaccaatgcgactaatcgctccgtgaccaattttactgttatttcttgatttgcgttttctggccatgatcgtccattaccatgtcatacaagctgcgttaaaaatACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTAtt > 2:186904‑M1/123‑146 (MQ=255) aaaggattattcggtctaccaatgcgactaatcgctccgtgaccaattttactgttatttcttgatttgcgttttctggccatgatcgtccattaccatgtcatacaagctgcgttaaaaatACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTAtt < 1:186904‑M1/24‑1 (MQ=255) ggggCGGGATTGCACTGGTGATTCAGTTACTCGTTTTTGCTGGTGTCAGACTTTATATGCCCGCATTAAGCGAAAAAATTATTAATCACAATACCGCAGCAGGAATGTTTATGGGAACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAAc > 2:1827015/1‑146 (MQ=255) gATTGCACTGGTGATTCAGTTACTCGTTTTTGCTGGTGTCAGACTTTATATGCCCGCATTAAGCGAAAAAATTATTAATCACAATACCGCAGCAGGAATGTTTATGGGAACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACGCAGCTTGTa > 3:380621/1‑149 (MQ=255) cTGGTGATTCAGTTACTCGTTTTTGCTGGTGTCAGACTTTATATGCCCGCATTAAGCGAAAAAATTATTAATCACAATACCGCAGCAGGAATGTTTATGGGAACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATg < 2:1629153/149‑1 (MQ=255) aatgcgactaatcgctccgtgaccaattttactgttatttcttgatttgcgttttctggccatgatcgtccattaccatgtcatacaagctgcgttaaaaatACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTAt < 3:489733‑M1/23‑1 (MQ=255) tGGTGATTCAGTTACTCGTTTTTGCTGGTGTCAGACTTTATATGCCCGCATTAAGCGAAAAAATTATTAATCACAATACCGCAGCAGGAATGTTTATGGGAACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATgg < 4:1173503/149‑1 (MQ=255) tGGTGATTCAGTTACTCGTTTTTGCTGGTGTCAGACTTTATATGCCCGCATTAAGCGAAAAAATTATTAATCACAATACCGCAGCAGGAATGTTTATGGGAACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATgg > 3:1173503/1‑149 (MQ=255) aTTCAGTTACTCGTTTTTGCTGGTGTCAGACTTTATATGCCCGCATTAAGCGAAAAAATTATTAATCACAATACCGCAGCAGGAATGTTTATGGGAACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATg < 3:1142420/143‑1 (MQ=255) ttACTCGTTTTTGCTGGTGTCAGACTTTATATGCCCGCATTAAGCGAAAAAATTATTAATCACAATACCGCAGCAGGAATGTTTATGGGAACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGAt < 2:1296606/149‑1 (MQ=255) 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gAACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATg > 4:1692549/1‑49 (MQ=255) gAACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATg < 3:1692549/49‑1 (MQ=255) gAACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGaa > 3:243803/1‑149 (MQ=255) ataccgccagccagcgcggcggtATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTgg > 3:41562‑M2/24‑103 (MQ=255) ataccgccagccagcgcggcggtATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCAtt > 4:489733‑M2/24‑125 (MQ=255) ataccgccagccagcgcggcggtATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCtttt > 2:1603466‑M2/24‑146 (MQ=255) ataccgccagccagcgcggcggtATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCtttt < 1:1603466‑M2/123‑1 (MQ=255) taccgccagccagcgcggcggtATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAAc > 3:196421‑M2/23‑149 (MQ=255) GCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTg > 1:909390‑M1/1‑149 (MQ=255) GCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTg < 4:1376926‑M1/149‑1 (MQ=255) CCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCGTTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGc < 2:349337‑M1/149‑1 (MQ=255) ggctggcGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATc < 1:266568/149‑1 (MQ=255) gctggcGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAAt < 2:865615/147‑1 (MQ=255) tggcGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAGTAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCt < 3:1543065/149‑1 (MQ=255) tggcGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCt < 2:902622/149‑1 (MQ=255) gtATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAGTAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGa > 4:1107123‑M2/3‑93 (MQ=255) gtATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGca > 3:997438‑M2/3‑149 (MQ=255) tATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGc < 2:1247615‑M2/99‑1 (MQ=255) tATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTa > 2:961682‑M2/2‑144 (MQ=255) tATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGcac < 4:1592131‑M2/148‑1 (MQ=255) | TATTTCGCCTGGGGCGGGATTGCACTGGTGATTCAGTTACTCGTTTTTGCTGGTGTCAGACTTTATATGCCCGCATTAAGCGAAAAAATTATTAATCACAATACCGCAGCAGGAATGTTTATGGGAACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACA > NC_000913/4412201‑4412496 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |