| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1562998 = | 108 (1.090) | 3 (0.030) | 3/518 | 10.5 | 3.0% | coding (79/582 nt) | ddpX | D‑ala‑D‑ala dipeptidase, Zn‑dependent |
| ? | NC_000913 | 1563143 = | 89 (0.900) | intergenic (‑67/+191) | ddpX/dosP | D‑ala‑D‑ala dipeptidase, Zn‑dependent/oxygen sensor, c‑di‑GMP phosphodiesterase, heme‑regulated; cold‑ and stationary phase‑induced bioflim regulator | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
GAGGATGTTCCCGTGCTCATCACGAAGCGTCAGGTCGATCGCCGTGCCACGGCTGTGATTAGAACCGACCGTCACATCAACAACATATTGCGGGTCTGGGCAGGCTTGCCACAACATCGCCTGTGCTTGTTGTGGGCGATACGCATCGTAAATCACCAGTTGTAACCCTGACAGCTGGGCGATGCTGATACTTTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATATTTTTTAACTTTTGATCAACATTTGTGCAGCGTAGTGCAGTTTTGGTGCAAGAGGGGAAGTTAAGGAAGGAATCTCCCGGAATCGTAGCTGAAATCA > NC_000913/1562729‑1563271 | gAGGATGTTCCCGTGCTCATCACGAAGCGTCAGGTCGATCGCCGTGCCACGGCTGTGATTAGAACCGACCGTCACATCAACAACATATTGCGGGTCTGGGCAGGCTTGCCACAACATCGCCTGTGCTTGTTGTGGGCGATACGCATCGTAAATCACCAGTGGTAACCCTGACAGCTGGGAGATGCTGATACTTTTAGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCa > 2:332207/1‑276 (MQ=255) ttCCCGTGCTCATCACGAAGCGTCAGGTCGATCGCCGTGCCACGGCTGTGATTAGAACCGATCGTCACATCAACAACATATTGCGGGTCTGGGCAGGCTTGCCACAACATCGCCTGTGCTTGTTGTGGGCGATACGCATCGTAAATCACCAGTTGTAACCCTGACAGCTGGGCGATGCTGATACTTTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTa > 2:396303/1‑275 (MQ=255) tCCCGTGCTCATCACGAAGCGTCAGGTCGATCGCCGTGCCACGGCTGTGATTAGAACCGACCGTCACATCAACAACATATTGCGGGTCTGGGCAGGCTTGCCACAACATCGCCTGTGCTTGTTGTGGGCGATACGCATCGTAAATCACCAGTTGTAACCCTGACAGCTGGGCGATGCTGATACTTTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTa > 1:88752/1‑274 (MQ=255) tCCCGTGCTCATCACGAAGCGTCAGGTCGATCGCCGTGCCACGGCTGTGATTAGAACCGACCGTCACATCAACAACATATTGCGGGTCTGGGCAGGCTTGCCACAACATCGCCTGTGCTTGTTGTGGGCGATACGCATCGTAAAACACCAGTTGTAACCCTGACAGCTGGGCGCTGCTGATACTTTTCGCCAACGCGGTAATCGCATCATTGTGTAACGGACAACGAGTCTGCTTAAAAATAGCTTTATCTGTGGCGTTGACAGCACAGGCGCAtt > 2:365944/1‑276 (MQ=255) gTGCTCATCACGAAGCGTCAGGTCGATCGCTGTGCCACGGCTGTGATTAGAACCGACCGTCACATCAACAACATATTGCGGTTCTGGGCAGGCTTGCCACAACATCGCCTGTGCTTGTTGTGGGCGATACGCATCGTAAATCACCAGTTGTAACCCTGACAGCTGGGCGCTGCTGATACTTTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTACCAGACAACGCGCTTGCTGATACATAGCTTTACCTGTGATTTTATCAGCCCAGGCGTATTTCa > 1:12651/1‑275 (MQ=255) cacaaCGAAGCGTCAGGGCGATCGCCGTGGCACTGCTGTGATTAGAACCGCACGTCACATCAACAACATATTGCGGGTCTGGGCAGGCTTGCCACAACATCGCCTGTGCTTGTTGTGGGCGATACGCATCGTAAATCACCAGTTGTAACCCTGACAGCTGGGCGATGCTGATACTTTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCg < 4:96100/271‑1 (MQ=255) atcacatggCGGCAGGTCGGTCCGCGGTCCACGGCTGTGATTAGAACCGACCGTCACCTCAACAACATATTGCGGGGCTGGGCAGGCTTGCCACAACATCGCCTGTGCTTGTTGTGGGCGATACGCATCGGAAATCACCAGTTGTAACCCTGACAGCTGGGCGATGCTGATACTTTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCg < 1:102877/266‑1 (MQ=255) atcaCGAAGCGTCAGGTCGATCGCCGTGCCACGGCTGTGATTAGAACCGACCGTCACATCAACAACATATTGCGGGTCTGGGCAGGCTTGCCACAACATCGCCTGTGCTTGTTGTGGGCGATACGCATCGTAAATCACCAGTTGTAACCCTGACAGCTGGGCGATGCTGATACTTTTCGCCAGCGCGGTAATTGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTGCAATTCGAt > 2:390646/1‑276 (MQ=255) atcaCGAAGCGTCAGGTCGATCGCCGTGCCACGGCTGTGATTAGAACCGACCGTCACATCAACAACATATTGCGGGTCTGGGCAGGCTTGCCACAACATCGCCTGTGCTTGTTGTGGGCGATACGCATCGTAAATCACCAGTTGTAACCCTGACAGCTGGGCGATGCTGATACTTTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGAt < 2:464607/276‑1 (MQ=255) aCGAAGCGTCAGGTGGATCGCCGTGCCACGGCTGTAATTACAACCGACCGTCACATCAACAACATATTGCGGGGCTGGCCAGGCTTGCCACAACATCGCCTGTGCTTGTTGTGGGCGATACGCATCGTAAATCACCAGTTGTAACCCTGACAGCTGGGAGATGCTGATACTTTGCGCCAGCGCAGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGAtctc < 2:51093/276‑1 (MQ=255) ccAGGTCGTTCGCCGTGCCACGGCTGTGATTAGACCCGACCGTCACATCAACAACATATTTCGGGTCTGGGCATGCTTGCCACAACATCGCCTGTGCTTGTTGTGCGCGATACGCACCGTAAATCCCCAGTTGTAACCCTGCCAGCTGGGCGATGCTGATACTTTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCa < 3:30863/274‑1 (MQ=255) cAGGTCGAGCGCCGTGCCACGGCTGTGATTAGAACCGACCGTCACATCAACAACATATTGCGGGTCTGGGCAGGCTTGCCACAACATCGCCTGTGCTTGTTGTGGGCGATACGCATCGTAAATCACCAGTTGTAACCCTGACAGCTGGGCGATGCTGATACTTTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCa < 3:88752/274‑1 (MQ=255) gATCGCCGGGCCACGGCTGTGATTAGAACCGACCGTCACATCAACAACATATTGCGGGTCTGGGCAGGCTTGCCACAACATCGCCTGTGCTTGTTGTGGGCGATACGCATCGTAAATCACCAGTTGTAACCCTGACAGCTGGGCGATGCTGATACTTTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGAt < 2:340973/276‑1 (MQ=255) cGTGCAGCGGTTGTGATTAGAACCGACCGGCACATCAACAACATATTGCGGGTCTGGGCAGGCTTGCCACAACATCGCCTGTGCTTGTTGTGGGCGATACGCATCGTAAATCACCAGTTGTAACCCTGACAGCTGGGCGATGCTGATACTTTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACgg < 1:7761/275‑1 (MQ=255) gCTGTGATTGAAACCGCCCGTCACATCAACAACATATTGCGGGTCTGGGCAGGCTTGCCACAACATCGCCTGTGCTTGTTGTGGGCGATACGCATCGTAAATCACCAGTTGTAACCCTGACAGCTGGGCGATGCTGATACTTTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAAc < 2:324552/276‑1 (MQ=255) cgggggATTATAACCCAACCTCACATAAACAATAGTTGGCGGGTTTGGGCCGGCGTGCCACAACATTGCCTGTGCTTGGTGTGGGCGATACGCATCGTAAATCACCAGTTGTAACCCTGACAGCTGGGCGATGCTGATACTTTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAAc < 4:390646/271‑1 (MQ=255) ccttggATTAGAAACGACCGTCACATCAACAACGTAGTGCGGGTCTGGGCAGGCTTGCCACAACATCGCCTGTGCTTGTTGTGGGCGATACGCATCGTAAATCACCAGTTGTAACCCTGACAGCTGGGCGATGCTGATACTTTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAAc < 2:263184/271‑1 (MQ=255) cTGGGATTAGAACCGACCGTCACATCAACAACATATTGCGGGTCTGGGCAGGCTTGCCACAACATCGCCTGTGCTTGTTGTGGGCGATACGCATCGTAAATCACCAGTTGTAACCCTGACAGCTGGGCGATGCTGATACTTTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAAc < 1:105820/275‑1 (MQ=255) ggATTGGAACCGACAGTCACCACAACAAAATATTGCGGGTCGGGGCAGGCTGGCCACACCATCGCCTGTGCTTGTTGTGGGCGATACGCATCGTAAATCACCAGTTGTAACCCTGACAGCTGGGCGATGCTGATACTTTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAAc < 3:265721/271‑1 (MQ=255) aaCCGACCGTCACATCAACAACATATTGCGGGTCTGGGCAGGCTTGCCACAACATCGCCTGTGCTTGTTGTGGGCGATACGCATCGTAAATCACCAGTTGTAACCCTGACAGCTGGGCGATGCTGATACTTTTCGCCAGCGCGGTAATCGCACCCTTGTGTCACAGACAACGCGCTTGCCGATAAATAGCTTTACCTGTGATGCTCTAAGCGCAGGCGTCTTTCCATCCTACCCCCCGATCAGGCAAGATTACGGTAAAATCAACCAGTTCgatc > 4:406108/1‑272 (MQ=255) aaCCGACCGTCACATCAACAACATATTGCGGGTCTGGGCAGGCTTGCCACAACATCGCCTGTGCTTGTTGTGGGCGATACGCAGCGTAAATCACCAGTTGTAACCCTTACAGCTGGGCGATGCTGATACTTTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTCTATCAATTCGTTCTCCAGATCAGGGAAGATTACGTCTAAATAAACCAGTTCggtgg > 4:524756/1‑276 (MQ=255) accgTCACATCAACAACATATTGCGGGTCTGGGCAGGCTTGCCACAACATCGCCTGTGCTTGTTGTGGGCGATACGCATCGTAAATCACCAGTCGTACCCCTGACAGCTGGGCGATGCTGATACTTTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGCTCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTTGTAt > 1:24060/1‑274 (MQ=255) accgTCACATCAACAACATATTGCGGGTCTGGGCAGGCTTGCCACAACATCGCCTGTGCTTGTTGTGGGCGATACGAATCGTAAATCACCAGTTGTAACCCTGACAGCTGGGCGATGCTGATACTTTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTAAATTCGATCTCCATATTAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTAt > 3:296361/1‑274 (MQ=255) gtcaactaaacaacATATTGCGGGTCTGGGAAGGCTTGCCACAACATCGCCTGTGCTTGTTGTGGGCTATACGCATCGTAAATCACCAGTTGTAACCCTGACAGCTGGGCGATGCTGATACTGTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGAc < 2:461881/268‑1 (MQ=255) cacaTCAACAACATATTGCGGGTCTGGGCAGGCTTGCCACAACATCGCCTGTGCTTGTCGTGGACGATACGCATCGTCAATCACCAGTTGTAATCCTGACAGCTGGGCGATGCTGATACTCTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCCTGTGTAACAGACAACGCCCTTGCTGTTACACAGCTTTACCTGTGTTGTTATCCGCGAAGGCGTCTTTCAATTCGATATCCAGACACGGGAGTATTAAGTCTAAATAAAACAGTTCGTGGGTaagcgccga > 4:578937/1‑268 (MQ=255) tcaaatacttccggCGGGGCTGGGCAGCCTTGCACGAACTTCTCCGGTGTGTGTTGTGGGAGGTACGCATCGTAAATCACCAGTTGTAACCCTGACAGCTTGGCGATGCTGATAATTTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATaaa < 4:271727/262‑1 (MQ=255) aacaacATATTGCGGGTCTGGGCAGGCTTGCCACAACATCGCCTGTGCTTGTTGTGGGCGATACGCATCGTAAATCACCAGTTGTAACCCTGACAGCTGGGCGATGCTGATACTTTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGAtt > 1:271478/1‑235 (MQ=255) aacaTATTGCGGTTCTTGGCAGGCTTGCCACAACATCGCCTGTGCTTGTTGTGGGCGATACGCATCGTAAATCACCAGTTGTAACCCTGACAGCTGGGCGATGCTGATACTTTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTc < 2:372162/276‑1 (MQ=255) acaTATTGCGGGTCTGGGCAGGCTTGCCACAACATCGCCTGTGCTTGTTGTGGGCGATACGCATCGTAAATCACCAGTTGTAACCCTGACAGCTGGGCGATGCTGATACTTTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACgg < 3:271478/235‑1 (MQ=255) tatTGCGGGTCTGGGCAGGCTTGCCACAACATCGCCTGTGCTTGTTGTGGGCGATACGCATCGTAAATCACCAGTTGTAACCCTGACAGCTGGGCGATGCTGATACTTTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATTAGCGCAGGCCTATTTCAATTCGTTCCCCAGATCAGTGAAGTTTTAGGCTAAATCCCACAGTTCGGTGGTATCCTAACTAAACGGTTCCTGt > 4:172732/1‑276 (MQ=255) tatTGCGGGTCTGGGCAGGCTTGCCACAACATCGCCTGTGCTTGTTGTGGGCGATACGCATCGTAAATCACCAGTTGTAACCCTGACAGCTGGGCGATGCTGATACTTTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCATGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATACGACATAAACGTTTCCTg > 1:70316/1‑275 (MQ=255) 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tgCTTGTTGTGGGCGATACGCATCGTAAATCACCAGTTGTAACCCTGACAGCTGGGCGATGCTGATACTTTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACCTACACGGTTCCTGTATAATACAAAAATTGCTGCGCTTTCCTCTTATGCAgt > 3:332521/1‑274 (MQ=255) tgtgGGCGATACGCATCGTAAATCACCAGTTGTAACCCTGACAGCTGGGCGATGCTGATACTTTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTcatgc > 2:366531/1‑276 (MQ=255) ggCGATACGCATCGTAAATCACCAGTTGTAACCCTGACAGCTGGGCGATGCTGATACTTTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCa > 3:6144/1‑137 (MQ=255) aTACGCATCGTAAATCACCAGTTGTAACCCTGACAGCTGGGCGATGCTGATACTTTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAgcgc < 1:6144/137‑1 (MQ=255) 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cAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAATTTATTTTTTTTAAATTTTGATTAAATTTTTTGCAGCTTAGTGCAGTTTTTTTGCAAgggg > 4:152428/1‑276 (MQ=255) aaCGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATATTTTTTAACTTTTGATCAACATTTGTGCAGCGTAGTGCAGTTTTGGTGCAAGAGGGGaa > 1:115119/1‑275 (MQ=255) aaCGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCGAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATCAGACAAAAATTGCTGCGATTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATATTCTTTACCTTTTGCTCCACATTTGTGACGCGTAGTGCAGTTTTTGTGTAAGATGTGaa > 4:444330/1‑275 (MQ=255) 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> NC_000913/1562729‑1563271 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |