New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1562998 = | 108 (1.090) | 3 (0.030) | 3/518 | 10.5 | 3.0% | coding (79/582 nt) | ddpX | D‑ala‑D‑ala dipeptidase, Zn‑dependent |
? | NC_000913 | 1563143 = | 89 (0.900) | intergenic (‑67/+191) | ddpX/dosP | D‑ala‑D‑ala dipeptidase, Zn‑dependent/oxygen sensor, c‑di‑GMP phosphodiesterase, heme‑regulated; cold‑ and stationary phase‑induced bioflim regulator | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
CGCATCGTAAATCACCAGTTGTAACCCTGACAGCTGGGCGATGCTGATACTTTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATATTTTTTAACTTTTGATCAACATTTGTGCAGCGTAGTGCAGTTTTGGTGCAAGAGGGGAAGTTAAGGAAGGAATCTCCCGGAATCGTAGCTGAAATCACAGTATTTAAGTGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCGGTAACACGCTGCTCATCCAGCCTGGAATTTCTTCGGCGGGTAGGGGGCGGGAAAAGAAATATCCC > NC_000913/1562870‑1563412 | cGCATCGGAAATCCCCAGTTGTAACCCTAAAAGATGGGCGATTCTGATACTTTTCGCCGGGGCGGTAATCGAAGCCTTGTGTAACAGACAACGCGCATGCTGAGAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGAt < 2:575916/276‑1 (MQ=255) aaaTCACCAGTTGTAACCCTGACAGCTGGGCGATGCTGATACTTTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAgcgc < 1:282974/274‑1 (MQ=255) aaaTCACCAGTTGTAACCCTGACAGCTGGGCGATGCTGATACTTTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAgcgc < 1:270413/274‑1 (MQ=255) ccAGTTGTAACCGTGACAGCTGGGCGATGCTGATACTTTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAGATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATg < 1:32586/275‑1 (MQ=255) ccAGTTGTAACCCTGACAGCTGGGCGATGCTGATACTTTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATg < 1:234545/275‑1 (MQ=255) gTTGTAACCCTGACAGCTGGGCGATGCTGATACTTTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGGTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTAAAAGATAAAAATTGCTGCGCTTTACGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCCCCCGAATGCTgg > 4:470428/1‑276 (MQ=255) tGTAACCCTGACAGGTTGGCGATGCTGATACTGTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAGCGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGTGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCt < 2:279512/276‑1 (MQ=255) gTAACCCTGACAGCTGGGCGATGCTGATACTTTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCt > 1:312679/1‑275 (MQ=255) tAACCCTGACAGCTGGGCGATGCTGATACTTTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTa < 2:445438/276‑1 (MQ=255) aaCCCTGACAGCTGGGCGATGCTGATGATTTTCGCCAGCGCGGTAATCGGATCCGTGGGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTAGTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTa < 3:24060/275‑1 (MQ=255) aaCCCTGACAGCTGGGCGATGCTGATACTTTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCtt < 1:237309/274‑1 (MQ=255) tGACAGCTGGGCGGTGCTGATACGTTTCGCCAGCGAGGTAATCGCATCCTTGTGGAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGAGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTta < 2:470428/276‑1 (MQ=255) ggACAGCTGGGCGATGCTGATACTTTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGGGTAACAGACAACGCGCTTGCTGACAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTGCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTta < 2:82293/275‑1 (MQ=255) ggCGATGCTGATACTTTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACACAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGGCACAGAATGCTGGCTTAAAGTTATAtttttt > 4:360758/1‑275 (MQ=255) aTGCTGATACTTTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATATTTTTTAACtt < 2:360758/276‑1 (MQ=255) aTGCAGATACTTTTCTCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATATTTTTTAACtt < 2:406108/276‑1 (MQ=255) tGCTGATACTTTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATATTTTTTAACttt > 2:96710/1‑276 (MQ=255) cagtttgcccAGCACGGGAATCGCATCGTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATATTTTTTAACTTTTGATc < 3:178733/266‑1 (MQ=255) aCTTTTCGCCAGCGCGGTAAGCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATATTTTTTAACTTTTGATc < 1:30730/274‑1 (MQ=255) attttCGACAGCGCGGGAATAGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTAACTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAAGTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGAGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATATTTTTTAACTTTTGATCaa < 3:12651/274‑1 (MQ=255) tttCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTACGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGTGCCAGAATGATGGCTTAAAGCTATATTTTTTAACTTTTGATCAACAt > 2:234301/1‑276 (MQ=255) tCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGCAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATTCAGTTCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGACTGTGGGCTTAAAGTTATTTTTTTTAAATTTTTATCAACAttt > 4:294553/1‑276 (MQ=255) ccAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATATTTTTTAACTTTTGATCAACATTtgtg < 2:524756/276‑1 (MQ=255) caacgctGTAATTGCATGCTTCTGTAACAGACGACTCTCTTGTGTATAAATATCTTTACCTCTGATGTTATCATCGCAGTCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAATATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATATTTTTTAACTTTTGATCAACATTtgtg < 4:67687/272‑1 (MQ=255) cAGCGCCGTAAACGTATCCTTGTGTACAAGAGAACGCGCTTGGTGAAAAATAGCTTTACCTGGGAGTGTATCAGGGCAGGAGTATTTCCATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGAATACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATATTTTTTAACTTTTGATCAACATTtgtg < 3:86365/275‑1 (MQ=255) aGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACTCGCTAGCTGATAAATAGACTTAACTGGGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTAGATCACCAGATAAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTAAGGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATATTTTTTAACTTTTGATCAACATTTGTGCa < 4:37682/276‑1 (MQ=255) aGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATATTTTTTAACTTTTGATCAACATTTGTGCa < 4:96710/276‑1 (MQ=255) cgGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATATTTTTTAACTTTTGATCAACATTTGTGCAGCg < 1:243722/275‑1 (MQ=255) tCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATATTTTTTAACTTTTGATCAACATTTGTGCAGCGTAGTGCAGtttt > 2:439150/1‑276 (MQ=255) ccTTGTTTAACAGACAACGCGCTTGCTAATAAGTAGCTTTGCCTGTGATGTTATCAGCGCAGTCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATATTTTTTAACTTTTGATCAACATTTGTGCAGCGTAGTACAGttt < 2:578937/274‑1 (MQ=255) cTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATATTTTTTAACTTTTGATCAACCTTTGTGCAGCGTTGTGCATTTTTgg > 2:505392/1‑276 (MQ=255) cTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATATTTTTTAACTTTTGATCAACATTTGTGCAGCGTAGTGCAGttt < 1:238541/273‑1 (MQ=255) gtgtAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCATGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGTCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATATTTTTTAACTTTTGATCAACATTTTTGCAGCGTAGTGCAGTTTTgtgt > 3:167981/1‑272 (MQ=255) ttgaaaaggcAACGCGCTTTCTGTTAAATAGCTTTACCTGGGATGTTATCAGAGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGAACAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATATTTTTTAACTTTTGATCAACATTTGTGCAGCGTAGTGCAGTTTTGGTg < 3:19342/265‑1 (MQ=255) cAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAATTTATTTTTTTTAAATTTTGATTAAATTTTTTGCAGCTTAGTGCAGTTTTTTTGCAAgggg > 4:152428/1‑276 (MQ=255) aaCGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATATTTTTTAACTTTTGATCAACATTTGTGCAGCGTAGTGCAGTTTTGGTGCAAGAGGGGaa > 1:115119/1‑275 (MQ=255) aaCGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCGAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATCAGACAAAAATTGCTGCGATTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATATTCTTTACCTTTTGCTCCACATTTGTGACGCGTAGTGCAGTTTTTGTGTAAGATGTGaa > 4:444330/1‑275 (MQ=255) cgcgCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGACTGCTGGCTTACAGTTATATTTTTTAACTTTTGATCATCATTTGTGCAGCGTAGTGCAGTTTTGGTTCAAGAGGGGAAGt > 2:373285/1‑275 (MQ=255) cgcgCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATCTTTTTTAACTTTTGATCAACATTTGTGCAGCGTAGTGCAGTTTTGGTGCGAGAGGGGAAGt > 3:72270/1‑275 (MQ=255) cgcgCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTACGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCCGCATGCTGGCTTAAAGGTATATTTTTTAACTTTCGATCATCATTTGTGCAGCGTAGTGCAGTTTTGGTGCAAGAGGGGacg > 1:304544/1‑272 (MQ=255) ttGCTGATAAATAGCGTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATATTTTTTAACTTTTGATCAACATTTGTGCAGCGTAGTGCAGTTTTGGTGCAAGAGGGGAAGTTaagga < 2:236772/276‑1 (MQ=255) tacttagaaaaAGCTGTACCTGTGATGTTATCAGAGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGAGCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATATTTTTTAACTTTTGATCAACATTTGTGCAGCGTAGTGCAGTTTTGGTGCAAGAGGGGAAGTTaagga < 3:312679/268‑1 (MQ=255) tAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATATTTTTTAACTTTTGATCAACATTTGTGCAGCGTAGTGCAGTTTTGGTGCAAGAGGGGAAGTTAAGGAAGGAAtc < 2:64753/276‑1 (MQ=255) cTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTAAGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATATTTTTTAACTATTGGTCAACATTTGTGCAGCGTAGTGCAGTTTTGGTTATAGAGGGGAAGTTAAGGAAGGAATCTCCCga > 1:398035/1‑274 (MQ=255) gtgATGTTATCAGCGCAGGCGTATGTCAATTCGAGCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCAAGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATATTTTTTAACTTTTGATCAACATTTGTGCAGCGTAGTGCAGTTTTGGTGCAAGAGGGGAAGTTAAGGAAGGAATCTCCCGGAATCGTAGc < 4:396303/276‑1 (MQ=255) tgtttttgtgaGCGGAGGCGTAGTTAAATTCGATCCCCTGACCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCATTTCGGTGGTATCCTACATAAACGGTTCCTGCATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGTCTTAAAGTTATATTTTTTAACTTTTGATCAACATTTGTGCAGCGTAGTGCAGTTTTGGTGCAAGAGGGGAAGTTAAGGAAGGAATCTCCCGGAATCGTAGc < 3:269285/265‑1 (MQ=255) 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tCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGGTCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATATTTTTTAACTTTTGATCAACATTTGTGCAGCGTAGTGCAGTTTTGGTGCAAGAGGGGAAGTTAAGGAAGGAATCTCCCGGAATCGTAGCTGAAATca < 3:38992/275‑1 (MQ=255) cgcAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATATTTTTTAACTTTTGATCAACATTTGTGCAGCGTAGTGCAGTTTTGGTGCAAGAGGGGAAGTTAAGGAAGGAATCTCCCGGAATCGTAGCTGAAATCACAGTa > 2:509290/1‑276 (MQ=255) cgcAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAAATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATATTTTTTAACTTTTGATCAACATTTGTGCAGCGTAGTGCAGTTTTGGTGCAAGAGGGGAAGTTAAGGAAGGAATCTCCCGGAATCGTAGCTGAAATCACAGt < 1:296361/275‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |