New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 4384427 = | 183 (0.890) | 3 (0.010) | 3/316 | NT | 1.6% | coding (589/1503 nt) | yjeM | putative transporter |
? | NC_000913 | 4384467 = | 189 (0.940) | coding (629/1503 nt) | yjeM | putative transporter | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 208 total aligned reads displayed.
TTCTCAACATTCCTCTATGGTAGCGACATGACCCAGCACTGGCGTATTGCCGGACTGGAGCCTACGCAGGTGGTTGGTCTGCTGGCTGTGGCATGGATGATTCTGGTCACCGTCGTTGCTTCTAAGGGGATTAATAAAATTGCCCGCATTACTGCGGTGGGCGGTATTGCAGTAATGTGTCTGAATTTAGTATTGCTGTTAGTAAGCATTACTATTTTGTTATTAAATGGTGGGCATTTCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCATCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAATCGGTTATTCGCTGGCAATATTTTTATGGGGCGTCAGCACAAACTGGCAGCAGGTATTAAGTAATGGTTCCGTTAACCTCGGCAATATTACCTATGTGCTGATGAAGAG > NC_000913/4384166‑4384704 | ttCTCAACATTCCTCTATGGTAGCGACATGACCCAGCACTGGCGTATTGCCGGACTGGAGCCTACGCAGGTGGTTGGTCTGCTGGCTGTGGCATGGATGATTCTGGTCACCGTCGTTGCTTCTAAGGGGATTAATAAAATTGCCCGCATTACTGCGGTGGGCGGTATTGCAGTAATGTGTCTGAATTTAGTATTGCTGTTAGTAAGCATTACTATTTTGTTATTAAATGGTGGGCATTTCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCATCACCGAAcc < 4:551706/274‑1 (MQ=255) tATGGTAGCGACATGACCCAGCACTGGCGTATTGCCGGACTGGAGCCTACGCAGGTGGTTGGTCTGCTGGCTGTGGCATGGATGATTCTGGTCACCGTCGTTGCTTCTAAGGGGATTAATAAAATTGCCCGCATTACTGCGGTGGGCGGTATTGCAGTAATGTGTCTGAATTTAGTATTGCTGTTAGTAAGCATTACTATTTTGTTATTAAATGGTTGGCATTTCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCATCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCgg > 4:624285/1‑275 (MQ=255) aCCCAGCACTGGCGTATTGCCGGACTGGAGCCTACGCAGGTGGTTGGTTTGCTGGCTGTGGAATGGATGATTCTGGTCACCGTCGTTGCTTCTAAGGGGATTAATAAAATTGCCCGCATTACTGCGGTGGGCGGTATTGCAGTAATGAGTCTGAATTTAGTATTGATGTTAGTAAGCATTACTATTTGGTTATTAAATGGTTGGCATTTCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCATCACTGAACCCGGGTTACACGTCCGGTCTGGCAATGCTATc > 2:271788/1‑275 (MQ=255) ttaccGGACTGGAGCCTACGCAGGTGGTTGGTCTGCTGGCTGTGGCATGGATGATTCTGTTCACCGTCGTTGCTTCTAAGGCGCTTACTAAAATTGCCCGCATTACTGCGGTCGGCGGTATTGCAGTCATGGGTCTGAATCTAGTATTGCTGTTAGTACGCAGTCCTATTTTGTTCTTAGCTGTTGGGCATTTCGCGCACGACATCAATTTCTTTGACTCCACAAACCCGGGTTACCCGGCCGGTCTGGCACTTCTTTGTTTtgtgtctcttacc > 4:135570/4‑266 (MQ=255) 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ttattaAATGGTGGGCATTTCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCATCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAATCGGTTATTCGCTGGCAATATTTTTATGGGGCGTCAGCACAAACTGgcagc > 1:126958/1‑262 (MQ=255) attaAATGGTGGGCATCTCGCGCAGGATATTTACTTCCTTGCATCATCGAACCCGTGTTTTCTGTCCGGTCTGGTAATGCTATCGTTTTTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGTGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCCGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCTGCTATTGTTATTTCAATCGGTTATTCGCTGGTAATATTTTAATGGGGCGTCAGCATAAACTGGAAGAGGGTATTAAGTAATg > 4:317330/1‑275 (MQ=255) ttaAATGGTGGGCATTTCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCATCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAAc > 6:989538/1‑149 (MQ=255) ttaAATGGTGGGCATTTCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCATCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAAc > 5:186124/1‑149 (MQ=255) 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TTCTCAACATTCCTCTATGGTAGCGACATGACCCAGCACTGGCGTATTGCCGGACTGGAGCCTACGCAGGTGGTTGGTCTGCTGGCTGTGGCATGGATGATTCTGGTCACCGTCGTTGCTTCTAAGGGGATTAATAAAATTGCCCGCATTACTGCGGTGGGCGGTATTGCAGTAATGTGTCTGAATTTAGTATTGCTGTTAGTAAGCATTACTATTTTGTTATTAAATGGTGGGCATTTCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCATCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAATCGGTTATTCGCTGGCAATATTTTTATGGGGCGTCAGCACAAACTGGCAGCAGGTATTAAGTAATGGTTCCGTTAACCTCGGCAATATTACCTATGTGCTGATGAAGAG > NC_000913/4384166‑4384704 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |