| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4384427 = | 183 (0.890) | 3 (0.010) | 3/316 | NT | 1.6% | coding (589/1503 nt) | yjeM | putative transporter |
| ? | NC_000913 | 4384467 = | 189 (0.940) | coding (629/1503 nt) | yjeM | putative transporter | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 214 total aligned reads displayed.
TGACCCAGCACTGGCGTATTGCCGGACTGGAGCCTACGCAGGTGGTTGGTCTGCTGGCTGTGGCATGGATGATTCTGGTCACCGTCGTTGCTTCTAAGGGGATTAATAAAATTGCCCGCATTACTGCGGTGGGCGGTATTGCAGTAATGTGTCTGAATTTAGTATTGCTGTTAGTAAGCATTACTATTTTGTTATTAAATGGTGGGCATTTCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCATCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAATCGGTTATTCGCTGGCAATATTTTTATGGGGCGTCAGCACAAACTGGCAGCAGGTATTAAGTAATGGTTCCGTTAACCTCGGCAATATTACCTATGTGCTGATGAAGAGCCTTGGGATGACGCTGGGTAATG > NC_000913/4384194‑4384727 | gtacccaggcatGGCGGATTTCCGGACGGGGGCCTACGGAGGTGGTTGGTCAGTGTGGTGTGGCAGGGATGATACTGGTCACCGTCTTTGCTTCTAAGGGGAATAATAAAATTGCCCGCATTACTGCGGTGGGCGGTATTGCAGTAATGTGTCTGAATTTAGTATTGCTGTTAGTAAGCATTACTATTTTGTTATTAAATGGTGGGCATTGCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCATCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCt < 4:271788/263‑1 (MQ=255) ttaccGGACTGGAGCCTACGCAGGTGGTTGGTCTGCTGGCTGTGGCATGGATGATTCTGTTCACCGTCGTTGCTTCTAAGGCGCTTACTAAAATTGCCCGCATTACTGCGGTCGGCGGTATTGCAGTCATGGGTCTGAATCTAGTATTGCTGTTAGTACGCAGTCCTATTTTGTTCTTAGCTGTTGGGCATTTCGCGCACGACATCAATTTCTTTGACTCCACAAACCCGGGTTACCCGGCCGGTCTGGCACTTCTTTGTTTtgtgtctcttacc > 4:135570/4‑266 (MQ=255) gACTGGAGCCTACGCAGGTGGTTGGTCTGCTGGCTGTGGCATGGATGATTCTGGTCACCGTCGTTGCTTCTAAGGGGATTAATAAAATTGCCCGCATTACTGCGGTGGGCGGTATTGCAGTAATGTGTCTGAATTTAGTATTGCTGTTAGTAAGCATTACTATTTTGTTATTAAATGGTGGGCATTTCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCATCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTTTGGTATTTGCCTTTTTTGCCt > 1:19662/1‑279 (MQ=255) cTTCTAAGGGGATTAATAAAATTGCCCGCATTACTGCGGTGGGCGGTATTGCAGTAATGTGTCTGAATTTAGTATTGCTGTTAGTAAGCATTACTATTTTGTTATTAAATGGTGGGCATTTCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCATCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCa < 1:142674/279‑1 (MQ=255) tAAGGGGATTAATAAAATTGCCCGCATTACTGCGGTGGGCGGTATTGCAGTAATGTGTCTGAATTTAGTATTGCTGTTAGTAAGCATTACTATTTTGTTATTAAATGGTGGGCATTTCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCATCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCa < 2:182055/275‑1 (MQ=255) cGGTGGGCGGTATTGCAGTAATGTGTCTGAATTTAGTATTGCTGTTAGTAAGCATTACTATTTTGTTATTAAATGGTGGGCATTTCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCATCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCt < 8:609674/148‑1 (MQ=255) gTGGGCGGTATTGCAGTAATGTGTCTGAATTTAGTATTGCTGTTAGTAAGCATTACTATTTTGTTATTAAATGGTGGGCATTTCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCATCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATc > 1:75488/1‑223 (MQ=255) 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ttattaAATGGTGGGCATTTCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCATCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAATCGGTTATTCGCTGGCAATATTTTTATGGGGCGTCAGCACAAACTGgcagc > 1:126958/1‑262 (MQ=255) attaAATGGTGGGCATCTCGCGCAGGATATTTACTTCCTTGCATCATCGAACCCGTGTTTTCTGTCCGGTCTGGTAATGCTATCGTTTTTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGTGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCCGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCTGCTATTGTTATTTCAATCGGTTATTCGCTGGTAATATTTTAATGGGGCGTCAGCATAAACTGGAAGAGGGTATTAAGTAATg > 4:317330/1‑275 (MQ=255) ttaAATGGTGGGCATTTCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCATCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAAc > 5:186124/1‑149 (MQ=255) taAATGGTGGGCATTTCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCATCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAAc > 7:24679/1‑148 (MQ=255) 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5:892642‑M1/149‑1 (MQ=255) TCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTg < 7:134972‑M1/148‑1 (MQ=255) aCCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCg > 6:266119/1‑149 (MQ=255) aCCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCg > 5:367695/1‑149 (MQ=255) ccGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAATCGGTTATTCGCTGGCAATATTTTTATGGGGCGTCAGCACAAACTGGCAGCAGGTATTAAGTAATGGTTCCGTTAACCTCGGCAATATTACCTATGTGCTGATGAaga > 2:341255/1‑271 (MQ=255) 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(MQ=255) cGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAATCGGTTATTCGCTGGCAATATTTTTATGGGGCGTCAGCACAAACTGGCAGCAGGTATTAAGTAATGGTTCCGTTAACCTCGGCAATATTACCTATGTGCTGATGAAGAGCCtt > 2:143713/1‑256 (MQ=255) tCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAATCGGTTATTCGCTGGCAATATTTTTATGGGGCGTCAGCACAAACTGGCAGCAGGTATTAAGTAATGGTTCCGTTAACCTCGGCAATATTACCTATGTGCTGATGAAGAGCCTTGGGATGACGCTGGGTAATg > 2:403550/1‑272 (MQ=255) cTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAATCGGTTATTCGCTGGCAATATTTTTATGGGGCGTCAGCACAAACTGGCAGCAGGTATTAAGTAATGGTTCCGTTAACCTCGGCAATATTACCTATGTGCTGATGAAGAGCCTTGGGa < 4:143713/256‑1 (MQ=255) tGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAATCGGTTATTc > 8:27097/1‑148 (MQ=255) cAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAATCGGTTATTCGCt < 7:87366/148‑1 (MQ=255) tgcTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTAGGGCGGAATTGAAGCGGTTGGAGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAATCGGTTATTCGCTGGc > 8:834721‑M2/4‑148 (MQ=255) | TGACCCAGCACTGGCGTATTGCCGGACTGGAGCCTACGCAGGTGGTTGGTCTGCTGGCTGTGGCATGGATGATTCTGGTCACCGTCGTTGCTTCTAAGGGGATTAATAAAATTGCCCGCATTACTGCGGTGGGCGGTATTGCAGTAATGTGTCTGAATTTAGTATTGCTGTTAGTAAGCATTACTATTTTGTTATTAAATGGTGGGCATTTCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCATCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAATCGGTTATTCGCTGGCAATATTTTTATGGGGCGTCAGCACAAACTGGCAGCAGGTATTAAGTAATGGTTCCGTTAACCTCGGCAATATTACCTATGTGCTGATGAAGAGCCTTGGGATGACGCTGGGTAATG > NC_000913/4384194‑4384727 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |