New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 4384427 = | 129 (1.110) | 3 (0.030) | 3/252 | NT | 2.5% | coding (589/1503 nt) | yjeM | putative transporter |
? | NC_000913 | 4384467 = | 112 (0.990) | coding (629/1503 nt) | yjeM | putative transporter | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 142 total aligned reads displayed.
TTGCTTCTAAGGGGATTAATAAAATTGCCCGCATTACTGCGGTGGGCGGTATTGCAGTAATGTGTCTGAATTTAGTATTGCTGTTAGTAAGCATTACTATTTTGTTATTAAATGGTGGGCATTTCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCATCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTT > NC_000913/4384281‑4384573 | ttGCTTCTAAGGGGATTAATAAAATTGCCCGCATTACTGCGGTGGGCGGTATTGCAGTAATGTGTCTGAATTTAGTATTGCTGTTAGTAAGCATTACTATTTTGTTATTAAATGGTGGGCATTTCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGc > 3:985501/1‑148 (MQ=255) ttGCTTCTAAGGGGATTAATAAAATTGCCCGCATTACTGCGGTGGGCGGTATTGCAGTAATGTGTCTGAATTTAGTATTGCTGTTAGTAAGCATTACTATTTTGTTATTAAATGGTGGGCATTTCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCa > 1:1001691/1‑149 (MQ=255) ttGCTTCTAAGGGGATTAATAAAATTGCCCGCATTACTGCGGTGGGCGGTATTGCAGTAATGTGTCTGAATTTAGTATTGCTGTTAGTAAGCATTACTATTTTGTTATTAAATGGTGGGCATTTCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCa > 1:393259/1‑149 (MQ=255) tGCTTCTAAGGGGATTAATAAAATTGCCCGCATTACTGCGGTGGGCGGTATTGCAGTAATGTGTCTGAATTTAGTATTGCTGTTAGTAAGCATTACTATTTTGTTATTAAATGGTGGGCATTTCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCa > 4:419313/1‑148 (MQ=255) gccagcgaataaccgattgaaataacaatagcggcaaaaacaatacctttggcaaagttcttttctggattttccgttttatcgaccagacctccaaccgcttcaattccgccctaggcaaaaatggcaaataccacaaacgataGCa > 4:834721‑M1/146‑148 (MQ=255) ttCTAAGGGGATTAATAAAATTGCCCGCATTACTGCGGTGGGCGGTATTGCAGTAATGTGTCTGAATTTAGTATTGCTGTTAGTAAGCATTACTATTTTGTTATTAAATGGTGGGCATTTCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCATCAc > 1:969551/1‑149 (MQ=255) ggggATTAATAAAATTGCCCGCATTACTGCGGTGGGCGGTATTGCAGTAATGTGTCTGAATTTAGTATTGCTGTTAGTAAGCATTACTATTTTGTTATTAAATGGAGGGCATTTCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCATCACCGAAcc > 1:551738/1‑149 (MQ=255) ggATTAATAAAATTGCCCGCATTACTGCGGTGGGCGGTATTGCAGTAATGTGTCTGAATTTAGTATTGCTGTTAGTAAGCATTACTATTTTGTTATTAAATGGTGGGCATTTCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCATCACCGAACCCg > 1:125251/1‑149 (MQ=255) gATTAATAAAATTGCCCGCATTACTGCGGTGGGCGGTATTGCAGTAATGTGTCTGAATTTAGTATTGCTGTTAGTAAGCATTACTATTTTGTTATTAAATGGTGGGCATTTCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCATCACCGAACCCgg < 2:957601/149‑1 (MQ=255) gATTAATAAAATTGCCCGCATTACTGCGGTGGGCGGTATTGCAGTAATGTGTCTGAATTTAGTATTGCTGTTAGTAAGCATTACTATTTTGTTATTAAATGGTGGGCATTTCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCATCACCGAACCCg < 3:357814/148‑1 (MQ=255) aTTAATAAAATTGCCCGCATTACTGCGGTGGGCGGTATTGCAGTAATGTGTCTGAATTTAGTATTGCTGTTAGTAAGCATTACTATTTTGTTATTAAATGGTGGGCATTTCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCATCACCGAACCCgg > 3:382243/1‑148 (MQ=255) aTTAATAAAATTGCCCGCATTACTGCGGTGGGCGGTATTGCAGTAATGTGTCTGAATTTAGTATTGCTGTTAGTAAGCATTACTATTTTGTTATTAAATGGTGGGCATTTCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCATCACCGAACCCgg > 4:374667/1‑148 (MQ=255) ttAATAAAATTGCCCGCATTACTGCGGTGGGCGGTATTGCAGTAATGTGTCTGAATTTAGTATTGCTGTTAGTAAGCATTACTATTTTGTTATTAAATGGTGGGCATTTCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCATCACCGAACCCGGGt < 1:335296/149‑1 (MQ=255) ataaAATTGCCCGCATTACTGCGGTGGGCGGTATTGCAGTAATGTGTCTGAATTTAGTATTGCTGTTAGTAAGCATTACTATTTTGTTATTAAATGGTGGGCATTTCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCATCACCGAACCCGGGTTa < 4:221575/148‑1 (MQ=255) ataaAATTGCCCGCATTACTGCGGTGGGCGGTATTGCAGTAATGTGTCTGAATTTAGTATTGCTGTTAGTAAGCATTACTATTTTGTTATTAAATGGTGGGCATTTCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCATCACCGAACCCGGGTTa > 4:370820/1‑148 (MQ=255) ataaAATTGCCCGCATTACTGCGGTGGGCGGTATTGCAGTAATGTGTCTGAATTTAGTATTGCTGTTAGTAAGCATTACTATTTTGTTATTAAATGGTGGGCATTTCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCATCACCGAACCCGGGTTAt > 2:1058673/1‑149 (MQ=255) ataaAATTGCCCGCATTACTGCGGTGGGCGGTATTGCAGTAATGTGTCTGAATTTAGTATTGCTGTTAGTAAGCATTACTATTTTGTTATTAAATGGTGGGCATTTCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCATCACCGAACCCGGGTTAt < 2:1011377/149‑1 (MQ=255) ataaAATTGCCCGCATTACTGCGGTGGGCGGTATTGCAGTAATGTGTCTGAATTTAGTATTGCTGTTAGTAAGCATTACTATTTTGTTATTAAATGGTGGGCATTTCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCATCACCGAACCCGGGTTAt > 1:836675/1‑149 (MQ=255) taaAATTGCCCGCATTACTGCGGTGGGCGGTATTGCAGTAATGTGTCTGAATTTAGTATTGCTGTTAGTAAGCATTACTATTTTGTTATTAAATGGTGGGCATTTCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCATCACCGAACCCGGGTTAt > 3:240319/1‑148 (MQ=255) 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ttaAATGGTGGGCATTTCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCATCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAAc > 2:989538/1‑149 (MQ=255) ttaAATGGTGGGCATTTCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCATCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAAc > 1:186124/1‑149 (MQ=255) taAATGGTGGGCATTTCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCATc < 4:741730/43‑1 (MQ=255) taAATGGTGGGCATTTCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCATCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACg < 1:1058673/149‑1 (MQ=255) tggGCATTTCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCATCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATc > 2:1076578/1‑149 (MQ=255) gggCATTTCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCATCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATcc > 1:21887/1‑149 (MQ=255) ggCATTTCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCATCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATcc < 4:236418/148‑1 (MQ=255) ggCATTTCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCATCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCa < 2:125251/149‑1 (MQ=255) ctttCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCATCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATcc > 4:134224/2‑145 (MQ=255) ttCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCATCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGaaaa < 2:186124/149‑1 (MQ=255) aGGATATTAATTTCCTTGCATCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACttt < 2:728702/149‑1 (MQ=255) tatTAATTTCCTTGCATCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGt > 4:346393/1‑102 (MQ=255) tatTAATTTCCTTGCATCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGt < 3:346393/102‑1 (MQ=255) atTAATTTCCTTGCATCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCaa > 1:716168/1‑149 (MQ=255) ttAATTTCCTTGCGTCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTtgg < 4:907842/103‑1 (MQ=255) ttAATTTCCTTGCATCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTtgg > 3:907842/1‑103 (MQ=255) ttAATTTCCTTGCATCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCaaa < 1:1076578/149‑1 (MQ=255) tttCCTTGCATCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTa > 1:68722/1‑149 (MQ=255) tttCCTTGCATCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTa > 1:165986/1‑149 (MQ=255) ttGCATCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGtt > 1:412582/1‑149 (MQ=255) ttGCATCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGtt > 1:1027421/1‑149 (MQ=255) | TTGCTTCTAAGGGGATTAATAAAATTGCCCGCATTACTGCGGTGGGCGGTATTGCAGTAATGTGTCTGAATTTAGTATTGCTGTTAGTAAGCATTACTATTTTGTTATTAAATGGTGGGCATTTCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCATCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTT > NC_000913/4384281‑4384573 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |