New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 4384427 = | 129 (1.110) | 3 (0.030) | 3/252 | NT | 2.5% | coding (589/1503 nt) | yjeM | putative transporter |
? | NC_000913 | 4384467 = | 112 (0.990) | coding (629/1503 nt) | yjeM | putative transporter | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
CGGTGGGCGGTATTGCAGTAATGTGTCTGAATTTAGTATTGCTGTTAGTAAGCATTACTATTTTGTTATTAAATGGTGGGCATTTCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCATCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAATCGGTTATTCGCTGGC > NC_000913/4384320‑4384611 | cGGTGGGCGGTATTGCAGTAATGTGTCTGAATTTAGTATTGCTGTTAGTAAGCATTACTATTTTGTTATTAAATGGTGGGCATTTCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCATCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCt < 4:609674/148‑1 (MQ=255) caatacctttggcaaagttcttttctggattttccgttttatcgaccagaccaccaaccgcttcaattccgccataggcaaaaatggcaaataccacaaacgataGCATCATCGAACCCGGGTTATCAGCCCGGTCTGGCAATGCTATc > 2:490102‑M1/106‑149 (MQ=255) gggCGGTATTGCAGTAATGTGTCTGAATTTAGTATTGCTGTTAGTAAGCATTACTATTTTGTTATTAAATGGTGGGCATTTCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCATCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCg > 4:970163/1‑148 (MQ=255) 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(MQ=255) ATCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTg < 1:892642‑M1/149‑1 (MQ=255) TCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTtgg < 4:278929‑M1/89‑1 (MQ=255) TCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTg < 3:134972‑M1/148‑1 (MQ=255) aCCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCg > 2:266119/1‑149 (MQ=255) aCCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCg > 1:367695/1‑149 (MQ=255) ccGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTg > 4:712697/1‑148 (MQ=255) cGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGtt < 2:426475/149‑1 (MQ=255) cGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGt > 4:453520/1‑148 (MQ=255) ttATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTAttt < 1:47911/149‑1 (MQ=255) aTCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCa > 2:842013/1‑149 (MQ=255) cAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCaa > 4:342335/1‑148 (MQ=255) cAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAAt < 2:68722/149‑1 (MQ=255) cAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAAt < 2:305588/149‑1 (MQ=255) aGTCCGGTCTGGCAATGCTATCTTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAAt > 4:944734/1‑148 (MQ=255) aGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGtt > 2:1008811/1‑125 (MQ=255) aGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGtt < 1:1008811/125‑1 (MQ=255) gTCCGGTCTGGCACTGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGt < 3:94293/118‑1 (MQ=255) tGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAATCGGTTATTc > 4:27097/1‑148 (MQ=255) gCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAATCGGTTATTCGc > 3:481647/1‑148 (MQ=255) cAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAATCGGTTATTCGCt < 3:589062/148‑1 (MQ=255) cAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAATCGGTTATTCGCt < 3:87366/148‑1 (MQ=255) cAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAATCGGTTATTCGCt < 4:174468/148‑1 (MQ=255) tgcTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTAGGGCGGAATTGAAGCGGTTGGAGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAATCGGTTATTCGCTGGc > 4:834721‑M2/4‑148 (MQ=255) | CGGTGGGCGGTATTGCAGTAATGTGTCTGAATTTAGTATTGCTGTTAGTAAGCATTACTATTTTGTTATTAAATGGTGGGCATTTCGCGCAGGATATTAATTTCCTTGCATCACCGAACCCGGGTTATCAGTCCGGTCTGGCAATGCTATCGTTTGTGGTATTTGCCATTTTTGCCTATGGCGGAATTGAAGCGGTTGGTGGTCTGGTCGATAAAACGGAAAATCCAGAAAAGAACTTTGCCAAAGGTATTGTTTTTGCCGCTATTGTTATTTCAATCGGTTATTCGCTGGC > NC_000913/4384320‑4384611 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |