| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2866052 | 112 (0.850) | 3 (0.020) | 3/504 | 13.4 | 2.3% | coding (952/1365 nt) | ygbN | putative transporter |
| ? | NC_000913 | = 2866174 | 142 (1.090) | coding (1074/1365 nt) | ygbN | putative transporter | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
ATTAAGCGATAAAATAAATCCACCGGGCGTCGCGCTGGTCACCTCGCTAATTGTTATTCCTATCGCGATTATCATGGCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCTTCGCATCCCCTGCTTGGTACGCTACAGCTGATCGGCTCACCAATGGTAGCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTA‑TGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACTGGCGCTGCGTGCATCGCAGGGGTCAGCAACCGTAGCAATACTGACAACCGGCGGGTTACTCTCAGAAGCGGTGATGGGATTGAATCCGATTCAGTGCGTATTGGTGACGCTGGCAGCCTGCTTTGGTGGGCTTGGTGCGT > NC_000913/2865781‑2866319 | aTTAAGCGATAAAATAAATCCACCGGGCGTCGCGCTGGTCACCTCGCTAATTGTTATTCCTATCTCGATTATCATGGCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCTTCGCATCCCCTGCTTGGTACGCTACAGCTGATCGGCTCACCAATGGTAGCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTA‑TGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGAtt < 2:447515/274‑1 (MQ=255) aGCGATCAAATAAATCCACCGGGCGTCGCGCTGGTCACCTCGCTAATTGTTATTCCTATCGCGATTATCATGGCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCTTCGCATCCCCTGCTTGGTACGCTACAGCTGATCGGCTCACCAATGGTAGCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTA‑TGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGt < 2:607564/275‑1 (MQ=255) aatCCCCCGGTCGTCGCGCTGGTCACCTCGCTAATTGTTATTCCTTTCGGGATTATCCTGGCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCTTCGCATCCCCTGCTTGGTACGCTACAGCTGATCGGCTCACTAATGGTAGCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTA‑TGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGa < 2:312256/276‑1 (MQ=255) atCCACCGGGCGGCGCGCTGGTCACCTCGCTAATTGTTATTCCTATCGCGATTATCATGGCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCTTCGCATCCCCTGCTTGGTACGCTACAGCTGATCGGCTCACCAATGGTAGCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTA‑TGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAg < 2:328682/276‑1 (MQ=255) ccGGGCGTCGCGCTGGTCACCTCGCTAATTGTTATTCCTATCGCGATTATCATGGCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCTTCGCATCCCCTGCTTGGTACGCTACAGCTGATCGGCCCACCAATGGTAGCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTA‑TGGGCTCAGCGCTTCCTTCTGCGGCGGTCGTGATTTTGGTTTCTTGTTCTGGAGGGGt > 1:196687/1‑275 (MQ=255) tAATTGTTATTCCTATCGCGATTATCATGGCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCTTCGCATCCCCTGCTTGGTACGCTACAGCTGATCGGCTCACCAATGGTATCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAAACCACCAGCGACATTA‑TAGGTGCAGTGCTTCCCTTCGCGTCGGTTGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGTGGGGTATTTGGCTAAGTGCTGGTTGAAtt > 1:557279/1‑273 (MQ=255) tttttttCCTTTCGCGATTATCATGGCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCTTCGCATCCCCTGCTTGGTACGCTACAGCTGATCGGCTCACCAATGGTAGCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTA‑TGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCg < 3:337939/270‑1 (MQ=255) tGTTATTCCTATCGCGCTTATTATGGCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCTTCGCATCCCCTGCTTGGTACGCTACAGCTGATCGGCTCACCAATGGTAGCTGTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTA‑TGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCg < 4:486383/275‑1 (MQ=255) aTTCCTATCGCGATTATCATGGCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCTTCGCATCCCCTGCTTGGTACGCTACAGCTGATCGGCTCACCAATGGTAGCTCTAATTATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTTCAAACCCCCAGCGACATTA‑TGGGCTCAGCGCTTCCTTCTGCGGCGGTAGGGATTTTGGTTACTGGTGTTGGTGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGGATCGGGCGTTGGc > 2:226236/1‑276 (MQ=255) aTTCCTATCGCGATTATCATGGCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCTTCGCATCCCCTGCTTGGTACGCTACAGCTGATCGGCTCACCAATGGTAGCTCTAATGATTGCGCCGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAAAACACCAGCGACCTTA‑TGGGCTCAGCGCCTCCTTATGCGGCGGGAGTGATTTTGGTTACTGGTGGTTGAGGGGGATTTGGCAAAGTGGTGGTGGCGTCgggggct > 1:561842/1‑269 (MQ=255) cTATCGCGTTTTTCATGGGGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCTTCGCATCCCCTGCTTGGTACGCTACAGCTGATCGGCTCACCAATGGTAGCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTA‑TGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCtggt < 3:561842/256‑1 (MQ=255) aTCGCGATTATCATGGCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCTTCGCATCCCCTGCTTGGTAAGCTACAGCTGATCGGCTCACCAATGGTAGCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGAAATTAGTGGACT‑AGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGGGCTGGAGGGGGGTTTGGGAAAGTGCGGGGGGAGTCGGGGGTCGGaaagg > 1:640634/1‑272 (MQ=255) cgcgATTATCATGGCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCTTCGCATCCCCTGCTTGGTACGCTACAGCTGATCGGCTCACCAATGGTAGCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGGATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCCGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTA‑TGGGCTCAGCGCTTCCTACCGCGGCGGTTTTGATTTTGGTTGTTGGGGCTGGCGGGGTATTTGGCAAAGGGGTTGGGGTATCGGGGGTCGGCAAAGccc > 2:165455/1‑275 (MQ=255) cttgcggttcacgTTTGCGCCAAACTGATTCCCCCTTCGCATCCCCTGCTTGGTACGCTACAGCTGTTCGGCTCACCAATTGTAGCTCTGATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTA‑TGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATg < 4:273028/264‑1 (MQ=255) attgCGGGTACGGTTTCCTCAACCCTCCTGCCGCCTTCTCAACCCCTGCTTGGTACGCTACAGCTGATCGGCTCACCAATGTTAGCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTA‑TGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATg < 4:165455/273‑1 (MQ=255) tGGCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCTTCGCATCCCCTGCCTGGTACGCTACAGCTGATCGGCTCACCAATGGTAGCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGCGCTTACAACAACCCAGCGACATTA‑TGGGCTCAGCCGTTCCTTCTGCGGGGGTAGGGATTTTTGTTACCTGTGCTGGGGGGGTATTTTGTAAGGTTCTGGTGGAATCGGGGGTCGGTAAAGCCCTTGCCAACCTg > 3:162906/1‑275 (MQ=255) gggTACGTTTTCCGCAACCCTGAGGCCGCCTTCGCATCCCCTGCTTGGTACGCTACAGCTGATCGGCTCACCAATGGTAGCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTA‑TGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGATAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACa < 2:48744/276‑1 (MQ=255) ggTCCGGGTTCCGGAACACTGCTGCCGCCTTCGCATCCCCTGCTTGGTACGCTACAGCTGATCGGCTCACCAATGGTAGCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTA‑TGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACa < 3:576527/275‑1 (MQ=255) ggTACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCTTCGCATCCCCTGCTTGGTACGCTACAGCTGATCGGCTCACCAATGGTAGCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTA‑TGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTCTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCGGGTGGAATTGGGCGGCGGCAAAGCCCTTTCCAACATGCTAc > 1:409141/1‑274 (MQ=255) gggacccTGATCCCGTCTTCGCAGCCCCTGCTTGGTTCGCGACAGCTGATCGGCTCACCCATGGTAGCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTA‑TGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCt < 4:504772/269‑1 (MQ=255) acacTGCTGCCTCCTTCTGCTCCCTTGCTTGGGACGCTCCAGCTGTTCGGCTCACCAATGGTAGTTCTTATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGAAATTA‑TGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCct < 4:563090/276‑1 (MQ=255) acacTGCTGCCGCCTTCGCATCCCCGGCTTGGTACGCTACAGCTGATCGGCTCACCAATGGTAGCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTA‑TGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGc < 1:326674/274‑1 (MQ=255) cacTGATGCCGCCTTCGCATCCCCTGCTTGGTACGCTACAGCTGATCGGCTCACCAATGGTAGCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTA‑TGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATCTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGcc > 1:539131/1‑274 (MQ=255) ccTTCGCATCCCCTGCTTGGTACGCTACAGCTGATCGGCTCACCAATGGTAGCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTA‑TGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAACGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATTCTACAAATGATTGCCGTGCCTCTGTTACCAGcc > 2:563163/1‑276 (MQ=255) ccTTCGCATCCCCTGCTTGGTACGCTACAGCTGATCGGCTCACCAATGGTAGCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTA‑TGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGc > 3:374590/1‑275 (MQ=255) cGCATCCCCTGCTTGGTACGCTACAGCTGATCGGCTCACCAATGGTAGCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTA‑TGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGcc > 1:34415/1‑272 (MQ=255) cccTGCTTGGTACGCTACAGCTGATCGGCTCACCAATGGTAGCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTA‑TGGGATCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGGAGGGGTTTTGGTTACTGGTTCTGGAGGGGTATGTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCGCTTGCCACAATGCTACAAATGAGTGGCCTGCCTCTGTTTCCAGCCGAAtttttt > 1:647077/1‑275 (MQ=255) ccTGCTTGGTACGCTACAGCTGATCGGCTCACCAATGGTAGCGCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTA‑TGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTtattat < 2:354366/276‑1 (MQ=255) tACGCTACAGCTGATCGGCTCACCAATGGTAGCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTA‑TGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTCCTGGTGCTGGGGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAACTGATTGACCGGCCTCTGTTACCATCCGCATTTATTATTTCACttg > 4:505557/1‑273 (MQ=255) tACGCTACAGCTGATCGGCTCACCAATGGTAGCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTA‑TGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGGCGGCGAAGTCCTTGCCGACATGCTCCAATTGATTGACCTGCCTTTGTTACCTGCCGCTATTATTATTTTACttg > 4:315049/1‑273 (MQ=255) ccaCAGCGTATCGGTTAACCAATGGTAGCTTTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGGCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTA‑TGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACTGGCGCt < 1:232678/273‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |