| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2866052 | 112 (0.850) | 3 (0.020) | 3/504 | 13.4 | 2.3% | coding (952/1365 nt) | ygbN | putative transporter |
| ? | NC_000913 | = 2866174 | 142 (1.090) | coding (1074/1365 nt) | ygbN | putative transporter | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 146 total aligned reads displayed.
TACGCTACAGCTGATCGGCTCACCAATGGTAGCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACTGGCGCTGCGTGCATCGCAGGGGTCAGCAACCGTAGCAATACTGACAACCGGCGGGTTACTCTCAGAAGCGGTGATGGGATTGAATCCGATTCAGTGCGTATTGGTGACGCTGGCAGCCTGCTTTGGTGGGCTTGGTGCGTCACATATTAATGACTCAGGGTTCTGGATTGTGACCAAATATCTGGGGTTGTCGGTAGCAGACGGTCTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGT > NC_000913/2865907‑2866445 | tACGCTACAGCTGATCGGCTCACCAATGGTAGCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTCCTGGTGCTGGGGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAACTGATTGACCGGCCTCTGTTACCATCCGCATTTATTATTTCACttg > 4:505557/1‑273 (MQ=255)tACGCTACAGCTGATCGGCTCACCAATGGTAGCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGGCGGCGAAGTCCTTGCCGACATGCTCCAATTGATTGACCTGCCTTTGTTACCTGCCGCTATTATTATTTTACttg > 4:315049/1‑273 (MQ=255) tACAGCTGATCGGCTCACCAATGGTAGCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGGTTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTTTTATTTCCTTGGCTCTgt > 2:366887/1‑275 (MQ=255) tACAGCTGATCGGCTCACCAATGGTAGCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAAACTGCTACAAATGCTTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTCTTATTTCACTGGCGCTg > 1:600741/1‑275 (MQ=255) tACAGCTGATCGGCTCACCAATGGTAGCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTCCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGTGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGTTGGAATCGGGCTTCGGCAAAGCCCTTGCCAACGTGCTACAAATGTTTGAGCTGCCTCGGTTCCCGGCCCCATTTATTATTTCACTGccgccg > 3:114974/1‑273 (MQ=255) gCTGATCGGCTCACCAATGGTAGCTCTAAGGATTGCGCTGGTGATGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAAAACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACTGGCGCt < 1:114974/270‑1 (MQ=255) cTGTTCGGCTCACCAATGGTAGCTTTAATGAGTGGGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACTGGCGCTGCGTg < 3:600740/274‑1 (MQ=255) tgggtttaCCAAGGGGATCTCGAATCAGTGCGCTGGTGCTTGTATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACTCCATCGACATTATGGGCTCAGTGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTGTGGTTACTGGTGCTGGAGTGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGTAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACTGGCGCTGCGTGCATCg < 2:242266/268‑1 (MQ=255) cGGCTCACCAATGGTAGCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACTGGCCCTGCGTGCATCGc > 1:629751/1‑275 (MQ=255) gCTCACCAATGGTAGCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACTGGCGCTGCGt < 3:603647/266‑1 (MQ=255) gCTCACCAATGGTAGCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACTGGCGCTGCGTGCATCGCAg > 1:263784/1‑275 (MQ=255) aCCAATGGTAGCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCTCTTATTATTTTACTGCCGCTTCGtcactcccagggcg > 3:9101/1‑262 (MQ=255) cAATGGTAGCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGTGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAACTGATTGACCTGCCTCTGTTAACAGCCGCTTTTATTATTTCTCTGGCGCTGCGTGCATCGCGAGGGTccg > 2:493580/1‑274 (MQ=255) aaTGGTAGCTCTAATGATTGCGCTGGTCGTGGCATTCTGGTTATGGGC‑TTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTTAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACTGGCGCTGCGTGCATCGCAGGGGTCAg < 3:354434/274‑1 (MQ=255) ggTAGCTCTAATGATGGCGCTGGTGCGGGCATTCTGGTTATTGGCGTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACAGTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACTGGCGCTGCGTGCATCGCAGGGGTCAGCAAc < 2:523165/276‑1 (MQ=255) tAGCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACTGGCGCTGCGTGCATCGCAGGGGTCAGCAAc < 1:526504/274‑1 (MQ=255) gCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTTTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACTGGCGCTGCGTTGCTCGCCGGGGTCCGCAACCGTa > 2:180569/1‑276 (MQ=255) gCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACTGGCGCTGCGTGCATCGCGGGGGTCAGCAACCg > 1:124214/1‑274 (MQ=255) gCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACTGGCGCTGCGTGCATCGCAGGGGTCAGCAACCGTa > 2:264131/1‑276 (MQ=255) tttAATGATGGCGCTTGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACTGGCGCTGCGTGCATCGCAGGGGTCAGCAACCGTAg < 1:9101/273‑1 (MQ=255) tctAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACTGGCGCTGCGTGCATCGCAGGGGTCAGCAACCGTAg > 1:475471/1‑275 (MQ=255) ctAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGATGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATTGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACTTGCTTCTGTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACTGGCTCTGCGTGCATCGCAGGGGGCAGGAACCGTAGCa > 2:277129/1‑276 (MQ=255) tGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACTGGCGCTGCGTGCATCGCAGGGGTCAGCAACCGTAGCAATACTg > 1:140960/1‑274 (MQ=255) tGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACTGGCGCTGCGTGCATCGCAGGGGTCAGCAACCGTAGCAATACTGa > 2:57945/1‑275 (MQ=255) tGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGATACAAACGATTGACCTGCGTCTGTTACCAGCCGCATTCATTATTTCAATGGTGTTGGGGGCATCGCAGGGGTCAGCAACCGCAACAATAGTg > 3:207011/1‑274 (MQ=255) 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ggTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACTGGCGCTGCGTGCATCGCAGGGGTCAGCAACCGTAGCAATACTGACAACcg < 3:263784/275‑1 (MQ=255) tGGCATTCTTGTTATTGGCTTTACGTGGCGGCTGGAGCTTACAACACCCCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACTGGCGCTGCGTGCATCGCAGGGGTCAGCAACCGTAGCAATACTGACAACCGGCggg < 1:468196/275‑1 (MQ=255) ggCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACTGGCGCTGCGTGCATCGCAGGGGTCAGCAACCGTAGCAATACTGACAACCGGCGGGt > 1:567792/1‑275 (MQ=255) cATTCGGGTTTTTGGCTTTACGTCGCGGCTGGGGCTTACAACCCACCAGGGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACTGGCGCTGCGTGCATCGCAGGGGTCAGCAACCGTAGCAATACTGACAACCGGCGGGTTa < 3:629750/275‑1 (MQ=255) ggCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACTGGCGCTGCGTGCATCGCAGGGGTCAGCAACCGTAGCAATACTGACAACCGGCGGGTTACTCTCAGAAGCgg < 3:475471/275‑1 (MQ=255) gCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACTGGCGCTGCGTGCATCGCAGGGGTCAGCAACCGTAGCAATACTGACAACcgg < 3:87634/254‑1 (MQ=255) 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ggCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACTGGCGCTGCGTGCATCGCAGGGGTCAGCAACCGTAGCAATACTGACAACCGGCGGGTTACTCTCAGAAGCGGTGATGGGATTGa < 2:603965/274‑1 (MQ=255) ggCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTAGGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACTGGCGCTGCGTGCATCGCAGGGGTCAGCAACCGTAGCAATACTGACAACCGGCGGGTTACTCTCAGAAGCGGTGATGGGATTGAAt < 2:505557/276‑1 (MQ=255) tACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACTGGCGCTGCGTGCATCGCAGGGGTCAGCAACCGTAGCAATACTTACAACCGGAGGGTTACTCGCAGAAGCGGTGATGGGATTGAATCGGTTTCAGt > 2:55064/1‑276 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |