New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_000913 | 3083868 = | 270 (1.070) | intergenic (‑71/+67) | speB/speA | agmatinase/biosynthetic arginine decarboxylase, PLP‑binding |
Only 100 of 369 total aligned reads displayed.
CAGTAATCACCCAGTCTGCATCGCTGTCATACGGCTGGAAGTTCATCGGCAGGCGTAAAAAACCAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTACAAACCTGCCTCGAA > NC_000913/3083683‑3083979 | gTAATCACCCAGTCTGCATCGCTGTCATACGGCTGGAAGTTCATCGGCAGGCGTAAAAAACCAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAAc > 1:380854/1‑149 (MQ=255) tgctgaactgcaacaacagttccttgaagagttcgaggcaggtttgtacggttatacttatcttgaagatgagtaagtcctgtgttacttgaatccgcttaatttagcggtgataatccgccacaatttattgtgacaaatccAACCCt < 4:1669761‑M1/6‑1 (MQ=255) ctgaactgcaacaacagttccttgaagagttcgagtcaggtttgtacggttatacttatcttgaagatgagtaagtcctgtgttacttgaatccgcttaatttagcggtgataatccgccacaatttattgtgacaaatccAACCCTTc > 3:1315062‑M1/142‑149 (MQ=255) 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tgacaaatccAACCCTTCCTCGTCGGGCCTAACGACGCGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTACAAAc < 3:1746537‑M1/139‑1 (MQ=255) tataAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCaa < 3:550316/100‑1 (MQ=255) tataAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCaa > 4:550316/1‑100 (MQ=255) tataAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTACAAACCt > 2:1682658/1‑149 (MQ=255) ataAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTACAAACCTg > 3:2013127/1‑149 (MQ=255) ataAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTAACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTAAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTACAAACCTg > 4:1564139/1‑149 (MQ=255) taAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTgg < 2:477969/66‑1 (MQ=255) taAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGa < 4:385894/109‑1 (MQ=255) taAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTACAAACCTGc < 2:275168/149‑1 (MQ=255) taAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTACAAACCTGc > 4:893061/1‑149 (MQ=255) aaaaaaaCCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCaa > 4:2407634/1‑123 (MQ=255) aaaCCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTACAAACCTGCCTCGa > 2:567278/1‑149 (MQ=255) AACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGATGGGTTGGATTTGTCACAATAAATAGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTACAAACCTGCCTCGaa > 1:720808‑M1/1‑149 (MQ=255) | CAGTAATCACCCAGTCTGCATCGCTGTCATACGGCTGGAAGTTCATCGGCAGGCGTAAAAAACCAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTACAAACCTGCCTCGAA > NC_000913/3083683‑3083979 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |