| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 4338982 | 142 (0.980) | 4 (0.030) | 4/498 | 12.7 | 2.7% | coding (1540/2268 nt) | adiA | arginine decarboxylase |
| ? | NC_000913 | 4338986 = | 142 (0.980) | coding (1536/2268 nt) | adiA | arginine decarboxylase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 149 total aligned reads displayed.
TAGTGGCGTTTGAAGGAGCAAAGGGTGTTAACCAGAGTTCCCCATTTCCCACGGGTTACGCCCATAGAGAACAGGAACATAATTTGGAAGTCAGTGGTGCGGGTAGGTACAATGCCGTGGCGACCAAGCCAGGCAGTGACCAGCGCCGCCGGAACACCGGTTTCTTCCAGTTCACCATCTTCACCCATTCCCGGAGCAAGGATGCTGACTTTAATCGGGTCGAGCATACTCCAGTTATCCGGAATATCTTTGAAGCCGTGCCAGCTTTCGCCCGGATGCATTACCCAGCAGTCCTGAACGGTGGTCAGCAGTTTGGTTGGTGCGTCAGCAAAGTCATAGGTTTTGCCGGTTTGTGGGTCGGTGACGACTTCTTTGTTCCACGGTTTGAAGAACCAGCTACCGTCAGCGGTGAACTCTTTATATAGCCGCGCCATCGCCTGACGGAAATCAACCGCTTCGTCAATCACTTCCTGTGTCAGTGACAGGCCGCTGTTGCCGTCCATCATCGACACCGCCACGTCGTTGGATGCGCAGATGGCATACA > NC_000913/4338708‑4339251 | gaGTGGCGTTTGGGAGATGAAAGGGTGGTAACCCGAGTTCCCCATTTCCCACGGGTTACGCCCAGAGGGAACAGGAACATAGTTTGGAGGTCAGTGGTGCGGTTAGGTACAATGCCGTGGCGACCAAGCCAGGCAGTGACCAGCGCCGCCGGAACACCGGTTTCTTCCAGTTCACCATCTTCACCCATTCCCGGAGCAAGGATGCTGACTTTAATCGGGTCGAGCATACTCCAGTTATCCGGAATATCTTTGAAGCCGTGCCAGCTTTCGCCCgg < 4:211231/274‑1 (MQ=255) tttGAAGGAGCAAAGGGTGTTAACCAGAGTTCCCCATTTCCCACGGGTTACGCCCATAGAGAACAGGAACATAATTTGGAAGTCAGTGGTGCGGGTAGGTACAATGCTGTGGCGACCAAGCCAGGCAGTGACCAGCGCCGCCGGAACACCGGTTTCTTCCAGTTCACCATCTTCACCCATTCCCGGAGCAAGGATGCTGACTTTAATCGGGTCGAGCATACTCCAGTTATCCGGAATATCTTTGAAGCCGTGCCAGCTTTCGCCCGGATGCATTAc > 2:540603/1‑276 (MQ=255) ttgaaaggggacaaGGGGGTAAACAAGAATTCCCCACTTCCCAGGGGTTACGCCCATCGAGAACAGGAACATAATTTGGAAGTCAGTGTGGCGGGTAGGTACAATGCCGTGGCGACCAAGCCAGGCAGTGACCAGCGCCGCCGGAACACCGGTTTCTTCCAGTTCACCATCTTCCCCCATTCCCGGAGCAAGGATGCTGACTTTAATCGGGTCGAGCATACTCCAGTTATCCGGAATATCTTTGAAGCCGTGCCAGCTTTCGCCCGGATGCATTa < 4:750091/263‑1 (MQ=255) aGGAGCAAAGGGTGGTAACCAGAGTTCCCCATTTCCCACGGGTTACGCCCATAGAGAACAGGAACATAATTTGGAAGTCAGTGGTGCGGGTAGGTACAATGCCGTGGCGACCAAGCCAGGCAGTGACCAGCGCCGCCGGAACACCGGTTTCTTCCAGTTCACCATCTTCACCCATTCCCGGAGCAAGGATGCTGACTTTAATCGGGTCGAGCATACTCCAGTTATCCGGAATATCTTTGAAGCCGTGCCAGCTTTCGCCCGGATGCATTACCcag < 1:321654/275‑1 (MQ=255) ggAGCAAAGGGTGTTAACCAGAGTTCCCCATTTCCCACGGGTTACGCCCATAGAGAACAGGAACATAATTTGGAAGTCAGTGGTGCGGGTAGGTACAATGCTGTGGCGACCAAGCCAGGCAGTGACCAGCGCCGCCGGAACACCGGTTTCTTCCAGTTCACCATCTTCACCCATTCCCGGAGCAAGGATGCTGACTTTAATCGGGTCGAGCATACTCCAGTTATCCGGAATATCTTTGAAGCCGTGCCAGCTTTCGCCCGGATGCATTACCcagca < 4:540603/276‑1 (MQ=255) gggTGTTAACCAGAGTTCCCCATTTCCCACGGGTTACGCCCATAGAGAACAGGAACATAATTTGGAAGTCAGTGGTGCGGGTAGGTACAATGCCGTGGCGACCAAGCCAGGCAGTGACCAGCGCCGCCGGAACACCGGTTTCTTCCAGTTCACCATCTTCACCCATTCCCGGAGCAAGGATGCTGACTTTAATCGGGTCGAGCATACTCCAGTTATCCGGAATATCTTTGAAGCCGTGCCAGCTTTCGCCCgg < 3:380396/253‑1 (MQ=255) gagtgtaCCAGGGGTCCTCATTTCCAACGGGGTACGCGCCAAGAGAAGAGGAAAATAAGTAGGAAGTCAGTGGGGCGGGTAGGTACAATGCCGTGGCGACCAAGCCAGGCAGTTACCAGCGCCGCCGGAACACCGGTTTCTTCCAGTTCACCATCTTCACCCATTCCCGGAGCAAGGATGCTGACTTTAATCGGGTCGAGCATACTCCAGTTATCCGGAATATCTTTGAAGCCGTGCCAGCTTTCGCCCGGATGCATTACCCAGCAGTCCTGAACg < 4:534197/270‑1 (MQ=255) ttAACCAGAGTTCCCCATTTCCCACGGGTTACGCCCATAGAGAACAGGAACATAATTTGGAAGTCAGTGGTGCGGGTAGGTACAATGCCGTGGCGACCAAGCCAGGCAGTGACCAGCGCCGCCGGAACACCGGTTTCTTCCAGTTCACCATCTTCACCCATTCCCGGAGCAAGGATGCTGACTTTAATCGGGTCGAGCATACTCCAGTTATCCGGAATATCTTTGAAGCCGTGCCAGCTTTCGCCCGGATGCATTAc > 1:350283/1‑257 (MQ=255) agcgTTCCCCATTTCCAACGGGTTACGCCCATAGAGAACAGTAACATAATTTGGAAGTCAGTGGTGCGGGTAGGTACAATGCCGTGGCGACCAACCCAGGCAGTGACCAGCGCCGCCGGAACACCGGTTTCTTCCAGTTCACCATCTTCACCCATTCCCGGAGCAAGGATGCTGACTTTAATCGGGTCGAGCATACTCCAGATATCCGGAATATCTTTGAAGCCGTGCCAGCTTTCGCCCGGATGCATTACCCAGCAGTCCTGAACGGTGGTcagc < 4:460875/273‑1 (MQ=255) agTTCCCCATTTCCCACGGGTTACGCCCATAGAGAACAGGAACATAATTTGGAAGTCAGTGGTGCGGGTAGGTACAATGCCGTGGCGACGAAGCCAGGCAGTGACCAGCGCCGCCGGAACGCCGGTTTCGTACAGTTAACCATCATAACCTATTCCCGGAGCAAGGATGATGACTTTAATCGGTCCGAGCATACGACAGTTATACCGAATATGTTTTAAGTAGTGCCTGCTTGCGCCTGGAAGCATCACCGACCAGCCCTGTAccggtgtcttc > 4:483626/1‑264 (MQ=255) 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ttCCCCATTTCCCACGGGTTACGCCCATAGAGAACAGGAACATAATTTGGAAGTCAGTGGTGCGGGTAGGTACAATGCCGTGGCGACCAAGCCAGGCAGTGACCAGCGCCGCCGGAACACCGGTTTCTTCCAGTTCACCATCTTCACCCATTCCCGGCGCAAGGATGCTGACTTTACTCGGGTCGAGCATCCTCCAGTTATCCGGAATATCTTTGAAGCCGTGCCAGCTTTCGCCCGGATGCATTACCCCGCCGTCCTGAACGGTGTTctgcag > 1:545030/1‑274 (MQ=255) ttCCCCATTTCCCACGGGTTACGCCCATAGAGAACAGGAACATAATTTGGAAGTCAGTGGTGCGGGTAGGTACAATGCCGTGGCGACCAAGCCAGGCAGTGACCAGCGCCGCCGGAACACCGGTTTCTTCCAGTTCACCATCTTCACCCATTCCCGGAGCAAGGATGCTGACTTTAATCGGGTCGAGCATACTCCAGTTATCCGGAATATCTTTGAAGCCGTGCCAGCTTTCGCCCGGATGCATTACCCAGCAGTCCTGAACGGTGGTCAGCAGt > 3:247677/1‑275 (MQ=255) ccccATTTCCCACGGGTTACGCCCATAGAGAACAGGAACATAATTTGGAAGTCAGTGGTGCGGGTAGGTACAATGCCGTGGCGACCAAGCCAGGCAGTGACCAGCGCCGCCGGAACACCGGTTTCTTCCAGTTCACCATCTTCACCCATTCCCGGAGCAAGGATGCTGACTTTAATCGGGTCGAGCATACTCCAGTTATCCGGAATATCTTTTAAGCCGTGCCAGCTTTCGCCCGGATGCATTACCCAGCAGTCCTTAACGGGGGCCAGCAGttt > 2:326702/1‑275 (MQ=255) ttACGCCCATAGAGAACAGGAACATAATTTGGAAGTCAGTGGTGCGGGTAGGTACAATGCCGTGGCGACCAAGCCAGGCAGTGACCAGCGCCGCCGGAACACCGGTTTCTTCCAGTTCACCATCTTCACCCATTCCCGGAGCAAGGATGCTGACTTTAATCGGGTCGAGCATACTCCAGTTATCCGGAATATCTTTGAAGCCGTGCCAGCTTTCGCCCGGATGCATTACCCAGCAGTCCTGAACGGTGGTCAGCAGTTTGGTTGGTGCGTCAGCa < 1:506354/275‑1 (MQ=255) ttACGCCCATAGAGAACAGGAACATAATTTGGAAGTCAGTGGTGCGGGTAGGTACAATGCCGTGGCGACCAAGCCAGGCAGTGACCAGCGACGCCGGAACACCGGTTCCTTCCAGTTCACCATCTTCACCCATTCCCGGAGCAAGGATGCTGACTTTAATCGGGTCGAGCATACTCCAGTTATCCGGAATATCTTTGAAGCCGTTCCAGCTTTCGCCCGGATGCATTACCAAGAAGTCCTGAACGGTGGTAAGCAGTTGGGTTGGTGCGTCAGcg > 3:503698/1‑274 (MQ=255) tgagcgccATAGAGAAAAGGAAGATAATTTGGAAGGAAGGGGTGCGGGGAGGTACAAGGCCGTGGAGACCAAGCCAGGCAGTGACCAGAGCTGCCGGAACACAGGTTTCTTCCAGTTCACCATCTTCACCCATTCCCGGAGCAAGGATGCTGACTTTAATCGGGTCACGCATACTCCAGTTATCCGGAATATCGTTGAAGCCGTGCCAGCTTTCGCCCGGATGCAGTACCCAGCAGTCCTGAACGGTGGTCAGCAGTTTGGTTGGTGCGTCAGCa < 3:49297/269‑1 (MQ=255) aTAGAGAACAGGAACATAATTTGGAAGTCAGTGGTGCGGGTAGGTACAATGCCGTGGCGACCAAGCCAGGCAGTGACCAGCGCCGCCGGAACACCGGTTTCTTCCAGTTCACCATCTTCACCCATTCCCGGAGCAAGGATGCTGACTTTAATCGGGTCGAGCATACTCCAGTTATCCGGAATATCTTTGAAGCCGTGCCAGCTTTCGCCCGGATGCATTACCCAGCAGTCCTGAACGGTGGTCAGCAGTTTGGGTGTTGCGTCAGCCAAGTCAtg > 3:695947/1‑274 (MQ=255) tAGAGAACAGGAACATAATTTGGAAGTCAGTGGTGCGGGTAGGTACAATGCCGTGGCGACCAAGCCAGGCAGTGACCAGCGCCGCCGGAACACCGGTTTCTTCCAGTTCACCATCTTCACCCATTCCCGGAGCAAGGATGCTGACTTTACTCGGGTCGAGCATACTCCAGTTATCCGGAATATCTTTGAAGCCGTGCCAGATTCCGCCCGGATCAATGACCTAGCAGTCCTGAACGGTGGTCAGCAGGTCGGTTGGTGGGTCAGGAAGGACATAg > 1:695748/1‑275 (MQ=255) tAGAGAACAGGAACATAATTTGGAAGTCAGTGGTGCGGGTAGGTACAATGCCGTGGCGACCAAGCCAGGCAGTGACCAGCGCCGCCGGAACACCGGTTTCTTCCAGTTCACCATCTTCACCCATTCCCGGAGCAAGGATGCTGACTTTAATCGGGTCGAGCATACTCCAGTTATCCGGAATATCTTTGAAGCCGTGCCCGCTTTCGCCCGGATGCCTTACCCAGCAGTCCTGACCGGTTGGCCGCAGTTGGGTTGGTTCGTCCGCAAAGttctatg > 4:204519/1‑270 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |