| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4554509 = | NA (NA) | 6 (0.070) | 5/164 | NT | NA | noncoding (5/34 nt) | REP346 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP346 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences |
| ? | NC_000913 | 4554539 = | NA (NA) | intergenic (+178/‑37) | uxuB/uxuR | D‑mannonate oxidoreductase, NAD‑dependent/fructuronate‑inducible hexuronate regulon transcriptional repressor; autorepressor | |||||
Only 100 of 147 total aligned reads displayed.
TGACCAGTTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCACCTCTGCGCAAAGACCTTAC > NC_000913/4554411‑4554608 | tgaccagtTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGc > 1:2114376‑M2/9‑100 (MQ=255)gttcgcggatcatcgccccgacttcctggtaaggtctttgcgcagaggtggcagatttcatggtgttgtgtccgttaggtgcggttaatcaaatttttGc < 1:1858664‑M1/2‑1 (MQ=255) gaccagtTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGcc < 1:2426876‑M2/93‑1 (MQ=255) atcgcggatcatcgccccgacttcctggtaaggtctttgcgcagaggtggcagatttcatggtgttgtgtccgttaggagcggttaatcaaacttttGcc < 2:1030847‑M1/3‑1 (MQ=255) accagtTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCg < 1:1141206‑M2/94‑1 (MQ=255) accagtTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGGGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCg < 2:2116704‑M2/94‑1 (MQ=255) cgcggatcatcgccccgacttcctggtaaggtctttgcgcagaggtggcagatttcatggtgttgtgtccgttaggtgcggttaatcaaatttttGCCgg < 2:2634386‑M1/5‑1 (MQ=255) cagtTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGa > 1:2545648‑M2/5‑100 (MQ=255) gtTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATa < 2:19432‑M2/98‑1 (MQ=255) tCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGc < 2:1999942/100‑1 (MQ=255) cGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCg < 2:2708041/100‑1 (MQ=255) gTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGCTTAACGGGGGCCGTAAAATTGGCCGTTGTAGGCCGGATCAGGc > 2:2538648/1‑98 (MQ=255) gTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGt > 1:1171840/1‑100 (MQ=255) gTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGt > 1:79809/1‑100 (MQ=255) gTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGt < 2:2643109/100‑1 (MQ=255) ttttttGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTc > 2:525749/1‑100 (MQ=255) ttttGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCAc > 2:2631792/1‑100 (MQ=255) tGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCAcgcc < 1:2247019/100‑1 (MQ=255) tGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCAcgcc > 1:2208822/1‑100 (MQ=255) gCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCAcgccg < 1:1262985/100‑1 (MQ=255) cACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCAt > 2:1989621/1‑100 (MQ=255) cACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCAt < 1:2145793/100‑1 (MQ=255) tGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCgg > 2:565141/1‑100 (MQ=255) tGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCgg > 1:486365/1‑100 (MQ=255) gtaaggtctttgcgcagaggtggcagatttcatggtgttgtgtccgttaggtgcggttaatcaaatttttGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGc > 1:2583326‑M1/71‑100 (MQ=255) gTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCgg < 1:1291178/99‑1 (MQ=255) aggtctttgcgcagaggtggcagatttcatggtgttgtgtccgttaggtgcggttaatcaaatttttGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCaaa > 1:1099540‑M1/68‑100 (MQ=255) gTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCaaaa > 2:1553891/1‑100 (MQ=255) tGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCaaaaa > 2:1767013/1‑100 (MQ=255) gCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAAt < 1:2049232/100‑1 (MQ=255) ccACCTTCCCGTGCTCATGGTATCGTTTGAGATTACCGGCGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCCCATCCGGCAAAAAtt < 2:2041069/100‑1 (MQ=25) aagttCCAGTGCTAATGTCTTTGTTAGGGATTTACCGGGGCCGTAAAATTGTCTGTTGTAGCCCGGACAAGGTGTTCTCACCTCATCCGGGAAAGAtt > 2:649719/4‑98 (MQ=255) aaCTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCGGGCAAAAATTTg < 1:1806264/100‑1 (MQ=255) aaCTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTg < 1:263170/100‑1 (MQ=255) tgcgcagaggtggcagatttcatggtgttgtgtccgttaggtgcggttaatcaaatttttGCCGTATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGa > 2:714057‑M1/61‑100 (MQ=255) cTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCTGGCAAAAATTTGAt > 2:374375/1‑100 (MQ=255) cTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGAt < 1:1040048/100‑1 (MQ=255) cTTCCAGTGCTAATGGTATACTTTGAAATTACCGGGGGCCGTAAACTTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGAt < 2:1191435/100‑1 (MQ=37) actCCAGTGCTAATGGTAGAGTTTAACATTGCCAGGGGCGGTAAAATTGCCCGTTGTAGAACGAATAAGGCGTTCACCCCGCATCCGGCTAAAATTTGAt < 2:149435/98‑1 (MQ=255) ttCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGTCAAAAATTTGAtt < 1:1871060/100‑1 (MQ=255) cgcagaggtggcagatttcatggtgttgtttccgttaggtgcgttttatctaatttttGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGAt > 2:1827680‑M1/59‑99 (MQ=255) tCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTa > 1:587450/1‑100 (MQ=255) tCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTa > 2:1506732/1‑100 (MQ=255) ccAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTAACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTaa > 2:169198/1‑100 (MQ=255) cAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAAc < 2:2276659/100‑1 (MQ=255) cAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAAc > 2:276311/1‑100 (MQ=255) aGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAAc < 1:387398/99‑1 (MQ=255) gTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAGATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATGAACCg < 2:942370/100‑1 (MQ=255) gTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCg > 1:2352907/1‑100 (MQ=255) gTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCg > 2:2085227/1‑100 (MQ=255) gCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCa > 1:196925/1‑100 (MQ=255) cTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCAc < 1:2201895/100‑1 (MQ=255) aaTGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCt > 1:2276211/1‑100 (MQ=255) ggTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAAc < 2:715454/100‑1 (MQ=255) gTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACg < 2:1009501/100‑1 (MQ=255) tataGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACgg < 2:355595/100‑1 (MQ=255) aGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGaca < 1:1704216/100‑1 (MQ=255) gTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGacac < 2:2498489/100‑1 (MQ=255) tttGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGAcaca < 1:1665898/100‑1 (MQ=255) tGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACacaac < 2:1197678/100‑1 (MQ=255) tGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACacaac > 1:2562428/1‑100 (MQ=255) gagaTTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACacaaca > 2:892982/1‑100 (MQ=255) gagaTTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACacaaca > 1:1566536/1‑100 (MQ=255) gagaTTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACacaaca > 1:805399/1‑100 (MQ=255) agaTTAGCGGGGGCCGTAAAATTGCCTGTTGTAGGACGGATAAGGCGTTGACGCCGCATCCGGCAGAAACTTGATTAACAGCACCTAACGGACACAacac > 2:2449892/1‑100 (MQ=25) agaTTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAacac > 1:991998/1‑100 (MQ=255) agaTTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAacac < 2:2193216/100‑1 (MQ=255) gaTTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACAcc > 1:2008083/1‑100 (MQ=255) aTTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGTCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCTCCTAACGGACACAACACCa > 1:588109/1‑100 (MQ=255) aTTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCa > 2:1160970/1‑100 (MQ=255) ttAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCAt > 2:1079820/1‑100 (MQ=255) ctAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCCCCTAACGGACACAacac < 2:1331084/96‑1 (MQ=255) tAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATg < 1:1493665/100‑1 (MQ=255) aaCGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGa < 1:908810/100‑1 (MQ=255) aCGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGaa > 2:1089305/1‑100 (MQ=255) cGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGaaa < 1:1385380/100‑1 (MQ=255) gggggCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAAt > 2:470298/1‑100 (MQ=255) ggggCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACCCAACACCATGAAATc > 1:2708498/1‑100 (MQ=255) ggCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTg < 2:1912222/100‑1 (MQ=255) gCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGc < 2:2465954/100‑1 (MQ=255) gCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGAGTTGACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGa < 2:2663599/93‑1 (MQ=255) cGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCa > 2:1534940/1‑100 (MQ=255) cGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCa > 1:950943/1‑100 (MQ=255) gTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACTCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCAc < 1:365071/100‑1 (MQ=255) gTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCAc > 1:1109908/1‑100 (MQ=255) aaTTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCACctct < 1:2407630/100‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCACctcn < 1:2674937/100‑2 (MQ=255) aTTGCCCGTTGTAGGCCGGATACGGCGTGCACGCCGCATCCGGTAAACGTTTGATTAACCGCGCCTAACGGCCAAAACACCATGAAATCTGCCACct > 2:640994/1‑97 (MQ=255) tGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCACCTCTgcg < 2:867000/100‑1 (MQ=255) gCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCACCTCTgcgc > 1:1244608/1‑100 (MQ=255) cccGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCCTCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCACCTCTacgc > 2:2108174/1‑99 (MQ=255) ccGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCACCTCTGCGCaa > 1:2096529/1‑100 (MQ=255) gTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCACCTCTGCGCAAAg < 1:1687947/100‑1 (MQ=255) tGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCACCTCTGCGCAAAGAc > 1:559937/1‑100 (MQ=255) aGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCACCTCTGCGCAAAGACCtt > 2:1359948/1‑100 (MQ=255) aGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCACCTCTGCGCAAAGACCtt > 1:1654663/1‑100 (MQ=255) aGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACAATGAAATCTGCAACCTCTGCGCAAAGACCtt > 1:1830286/1‑100 (MQ=255) GCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCACCTCTGCGCAAAGACCTTAc < 2:956691‑M1/100‑1 (MQ=255) GCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCACCTCTGCGCAAAGACCTTAc < 1:1835639‑M1/100‑1 (MQ=255) GCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCACCTCTGCGCAAAGACCTTAc > 2:1134555‑M1/1‑100 (MQ=255) | TGACCAGTTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCACCTCTGCGCAAAGACCTTAC > NC_000913/4554411‑4554608 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |