| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 133866 | 110 (0.810) | 20 (0.160) | 11/162 | NT | 16.3% | coding (2252/2598 nt) | acnB | aconitate hydratase 2; aconitase B; 2‑methyl‑cis‑aconitate hydratase |
| ? | NC_000913 | = 133880 | 106 (0.860) | coding (2266/2598 nt) | acnB | aconitate hydratase 2; aconitase B; 2‑methyl‑cis‑aconitate hydratase | |||||
CACTTCCGTGCTGCGGGTAAACTGCTGGATGCGCATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/133760‑133866‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑accgaagaCGCTGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAACTGTGCGGCGTCCATACGGGTTGGCGGTGCCACCCACAGGCGGGTCGGCAACTGACCTTTATGCGCATCCAGCA < NC_000913/133880‑133782 nACTTCCGTGCTGCGGGTAAACTGCTGGATGCGCATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGA > 1:665421/2‑100CACTTCCGTGCTGCGGGTAAACTGCTGGATGCGCATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGA > 1:1081328/1‑100 ACTTCCGTGCTGCGGGTAAACTGCTGGATGCGCATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGAC < 1:1389049/100‑1 CTTCCGTGCTGCGGGTAAACTGCTGGATGCGCATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACC > 2:2634262/1‑100 CTTCCGTGCTGCGGGTAAACTGCTGGATGCGCATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACC > 1:2801718/1‑100 CTTCCGTGCTGCGGGTAAACTGCTGGATGCGCATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACC > 1:3464368/1‑100 CTTCCGTGCTGCGGGTAAACTGCTGGATGCGCATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACC < 2:1925361/100‑1 CTTCCGTGCTGCGGGTAAACTGCTGGATGCGCATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACC < 2:1506519/100‑1 TTCCGTGCTGCGGGTAAACTGCTGGATGCGCATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGACACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCG < 2:2922574/100‑1 TCCGTGCTGCGGGTAAACTGCTGGATGCGCATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGA < 2:2165035/100‑1 CCGTGCTGCGGGTAAACTGCTGGATGCGCATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAA > 2:2294732/1‑100 gcgGCGGGTAAACTGCTGGATGCGCATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGAC < 1:3660424/89‑1 TGCGCATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGACGCTGTAGTAGCCTTCTTCGGT < 2:3329796/100‑1 TGCGCATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGACGCTGTAGTAGCCTTCTTCGGT < 2:3253135/100‑1 TGCGCATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGACGCTGTAGTAGCCTTCTTCGGT < 2:3600303/100‑1 TGCGCATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGACGCTGTAGTAGCCTTCTTCGGT < 2:1563333/100‑1 TGCGCATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGACGCTGTAGTAGCCTTCTTCGGT < 1:1108899/100‑1 TGCGCATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGACGCTGTAGTAGCCTTCTTCGGT < 1:2967140/100‑1 GCGCATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCACCACTCTTACCGAAGACGCTGTAGTAGCCTTCTTCGG < 1:1700777/100‑1 GCGCATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGACGCTGTAGTAGCCTTCTTCGGT < 2:1023470/99‑1 CGCATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGACGCTGTAGTAGCCTTCTTCGGTCA < 1:2147234/100‑1 GCATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGTACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGACGCTGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAA < 1:790223/100‑1 CATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGACGCTGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAAC < 2:3789738/100‑1 CATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGACGCTGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAAC < 2:1924530/100‑1 ATAAAGGTCGGTTGCCGACCCGCCTGTTGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCACA‑CAGT‑TGACCGAAGACGCTGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAACT < 1:579659/100‑1 TAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGACGCTGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAACTG < 2:3106015/100‑1 CAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCACCACTCTTACCGAAGACGCTGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAACTGTGCGn < 1:3680176/100‑2 AGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCACCACTCTTACCGAAGACGCTGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAACTGTGCGGC < 2:3241872/100‑1 AGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCACCACTCTTACCGAAGACGCTGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAACTGTGCGGC < 2:3156635/100‑1 TTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGACGCTGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAACTGTGCGGCGTCC < 2:2668619/100‑1 TGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCACCACTCTTACCGAAGACGCTGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAACTGTGCGGCGTC < 1:48780/100‑1 GCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGACGCTGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAACTGTGCGGCGTCCATACGGGTTGGCGGTGCCACC < 2:2783786/100‑1 ACCGAAGACGCTGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAACTGTGCGGCGTCCATACGGGTTGGCGGTGCCACCCACAGGCGGGTCGGCAACTGACCTTTATGCGCA < 2:564668/100‑1 ACCGAAGACGCTGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAACTGTGCGGCGTCCATACGGGTTGGCGGTGCCACCCACAGGCGGGTCGGCAACTGACCTTTATGCGCA < 2:1813465/100‑1 ACCGAAGACGCTGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAACTGTGCGGCGTCCATACGGGTTGGCGGTACCACCCACAGGCGGGTCGGCAACTGACCTTTATGCGCA < 1:3705820/100‑1 CCGAAGACGCTGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAACTGTGCGGCGTCCATACGGGTTGGCGGTGCCACCCACAGGCGGGTCGGCAACTGACCTTTATGCGCAT > 2:1994833/1‑100 CCGAAGACGCTGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAACTGTGCGGCGTCCATACGGGTTGGCGGTGCCACCCACAGGCGGGTCGGCAACTGACCTTTATGCGCAT < 1:3658494/100‑1 GAAGATGCTGTAGTAGCCTTCTCCGGTCAACTGTGCGGCGTCCATACGGGTTGGCGGTGCCACCCACAGGCGGGTCGGCAACTGACCTTTATGCGCATCC > 1:2213710/1‑100 GAAGACGCTGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAACTGTGCGGCGTCCATACGGGTTGGCGGTGCCACCCACAGGCGGGTCGGCAACTGACCTTTATGCGCATCC > 2:1556496/1‑100 GAAGACGCTGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAACTGTGCGGCGTCCATACGGGTTGGCGGTGCCACCCACAGGCGGGTCGGCAACTGACCTTTATGCGCATCC > 2:3153407/1‑100 AAGACGCTGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAACTGTGCGGCGTCCATACGGGTTGGCGGTGCCACCCACAGGCGGGTCGGCAACTGACCTTTATGCGCATCCA > 1:1054145/1‑100 GACGCTGTAGTAGCTTTCTGCGGGCAACGGTGCGGCGTACATACGGGTTGGCGGTGCAACCCACAGGCGGGTCGGCAACTGACCTTTATGCGCATCCAGC < 2:592848/100‑1 ACGCTCTAGTAGCCTTCTTCGGTCAACTGTGCGGCGTCCATACGCGTTGGCGGTGCCACCCACAGGCGGGTCGGCAACTGACCTTTATGCGCATCCAGCA < 1:2705840/100‑1 CACTTCCGTGCTGCGGGTAAACTGCTGGATGCGCATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/133760‑133866‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑accgaagaCGCTGTAGTAGCCTTCTTCGGTCAACTGTGCGGCGTCCATACGGGTTGGCGGTGCCACCCACAGGCGGGTCGGCAACTGACCTTTATGCGCATCCAGCA < NC_000913/133880‑133782 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |