| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 133866 | 110 (0.810) | 20 (0.160) | 11/162 | NT | 16.3% | coding (2252/2598 nt) | acnB | aconitate hydratase 2; aconitase B; 2‑methyl‑cis‑aconitate hydratase |
| ? | NC_000913 | = 133880 | 106 (0.860) | coding (2266/2598 nt) | acnB | aconitate hydratase 2; aconitase B; 2‑methyl‑cis‑aconitate hydratase | |||||
Only 100 of 186 total aligned reads displayed.
GCTGCGGGTAAACTGCTGGATGCGCATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCGTCTTCGGTAAGAGTGGTGCGCGTATCGAGATCCCTGGCTGTTCCCTGTGTATGGGTAACCAGGCGCGTGTGGCGGACGGTGCAAC > NC_000913/133769‑133965 | gctgcGGGTAAACTGCTGGATGCGCATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGaagaag < 2:2180004/100‑1 (MQ=255)gctgcGGGTAAACTGCTGGATGCGCATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGaagaag < 2:3171951/100‑1 (MQ=255) ctgcGGGTAAACTGCTGGATGCGCATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAgg < 2:1629634/100‑1 (MQ=255) ctgcGGGTAAACTGCTGGATGCGCATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAgg < 2:216567/100‑1 (MQ=255) ctgcGGGTAAACTGCTGGATGCGCATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAgg < 2:2396108/100‑1 (MQ=255) tgcGGGTAAACTGCTGGATGCGCATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGc > 2:865370/1‑100 (MQ=255) tgcGGGTAAACTGCTGGATGCGCATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGc < 2:3423957/100‑1 (MQ=255) gcGGGTAAACTGCTGGATGCGCATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGct > 1:457469/1‑100 (MQ=255) gggTAAACTGCTGGATGCGCATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGctac < 1:1212268/100‑1 (MQ=255) gggTAAACTGCTGGATGCGCATAAACGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCACACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGctac > 1:792654/1‑100 (MQ=255) gTAAACTGCTGGATGCGCATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGctacta > 2:1535128/1‑100 (MQ=255) aaCTGCTGGATGCGCATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAg < 1:1056154/100‑1 (MQ=255) ctgctgGATGCGCATAAAGGTCAGTTGCCGTCCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCg < 2:3596424/100‑1 (MQ=255) ctgctgGATGCGCATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCg < 1:1963567/100‑1 (MQ=255) ctgctgGATGCGCATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCg < 2:3552743/100‑1 (MQ=255) tgctgGATGCGCATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACGCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTAGAGCGt < 1:2705840‑M2/100‑2 (MQ=255) gctgGATGCGCATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTTGCACCGCCAACCCGTATGTACGCCGCA‑CCGT‑TGCCCGCAGAAAGCTACTACAGCGtc < 2:592848‑M2/100‑3 (MQ=255) ggATGCGCATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCGtcttc > 2:1556496‑M2/1‑95 (MQ=255) aTGCGCATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCGtcttcgg < 1:3658494‑M2/100‑8 (MQ=255) tGCGCATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGTACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCGtcttcggt < 1:3705820‑M2/100‑9 (MQ=255) tGCGCATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAcgctgtagtagccttcttcggt < 2:3253135‑M1/100‑23 (MQ=255) tGCGCATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCGtcttcggt < 2:564668‑M2/100‑9 (MQ=255) cgcATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAcgctgtagtagccttcttcggtca < 1:2147234‑M1/100‑25 (MQ=255) gcATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGTACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAcgctgtagtagccttcttcggtcaa < 1:790223‑M1/100‑26 (MQ=255) cATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAcgctgtagtagccttcttcggtcaac < 2:1924530‑M1/100‑27 (MQ=255) aTAAAGGTCGGTTGCCGACCCGCCTGTTGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCACA‑CAGT‑TGACCGAAGAcgctgtagtagccttcttcggtcaact < 1:579659‑M1/100‑28 (MQ=255) tAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAcgctgtagtagccttcttcggtcaactg < 2:3106015‑M1/100‑29 (MQ=255) aaGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGCCCGAAGAAGGCTACTACAGCGTCTTCGGTAAGAgtgg > 1:2374812/1‑100 (MQ=255) aaGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCGTCTTCGGTAAGAgtgg > 1:204536/1‑100 (MQ=255) aGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCGTCTTCGGTAAGAgtggt < 2:1549543/100‑1 (MQ=255) ggTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCGTCTTCGGTAAGAgtggtg < 1:1086400/100‑1 (MQ=255) ggTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCGTCTTCGGTAAGAgtggtg > 1:1827302/1‑100 (MQ=255) tCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCGTCTTCGGTAAGAGTGGTgcg < 2:293214/100‑1 (MQ=255) aGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCACCACTCTTACCGAAGAcgctgtagtagccttcttcggtcaactgtgcggc < 2:3156635‑M1/100‑35 (MQ=255) aGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCACCACTCTTACCGAAGAcgctgtagtagccttcttcggtcaactgtgcggc < 2:3241872‑M1/100‑35 (MQ=255) aGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCGTCTTCGGTAAGAGTGGTGcgcg < 1:2661877/100‑1 (MQ=255) gTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCGTCTTCGGTAAGAGTGGTGCGCGt > 2:1854878/1‑100 (MQ=255) gTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCGTCTTCGGTAAGAGTGGTGCGCGt < 1:644146/100‑1 (MQ=255) gatctcccGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCGTCTTCGGTAAGAGTGGTGCGCGTATc < 2:1761419/95‑1 (MQ=255) gACCCGCCTGTGGGTGGCACCACCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCGTCTTCGGTAAGAGTGGTGCGCGTATCgag > 2:3187909/1‑100 (MQ=255) cccGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACGGCGTCTTCGGTAAGAGGGGTGCGCGTATCGAGAt > 1:1696182/1‑100 (MQ=255) cccGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCGTCTTCGGTAAGAGTGGTGCGCGTATCGAGAt > 1:2961706/1‑100 (MQ=255) cGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCGTCTTCGGTAAGAGTGGTGCGCGTATCGAGATcc < 2:1372194/100‑1 (MQ=255) gCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCGTCTTCGGTAAGAGTGGTGCGCGTATCGAGATccc > 2:134486/1‑100 (MQ=255) ccTGTTTGTCGCACCGCCAACCCGTATGTACCCAGTA‑CAGT‑TTTGCGATGAAGGCTACTACAGCTTCTTCGTTAAGAGTATTGCGCGTATCGAGAGccc < 1:2874607/99‑1 (MQ=255) cTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCGTCTTCGGTAAGAGTGGTGCGCGTATCGAGATCCCTg < 1:30040/100‑1 (MQ=255) cTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCGTCTTCGGTAAGAGTGGTGCGCGTATCGAGATCCCTg < 2:3319204/100‑1 (MQ=255) gtgggtggCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCGTCTTCGGTAAGAGTGGTGCGCGTATCGAGATCCCTGGc > 2:2107236/1‑100 (MQ=255) gggtggCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCGTCTTCGGTAAGAGTGGTGCGCGTATCGAGATCCCTGGCTg < 1:14040/100‑1 (MQ=255) ggtggCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCGTCTTCGGTAAGAGTGGTGCGCGTATCGAGATCCCTGGCTGt > 1:1328855/1‑100 (MQ=255) ggtggCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCGTCTTCGGTAAGAGTGGTGCGCGTATCGAGATCCCTGGCTGt > 2:708384/1‑100 (MQ=255) gtggCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCGTCTTCGGTAAGAGTGGTGCGCGTATCGAGATCCCTGGCTGtt > 2:1387324/1‑100 (MQ=255) gtggCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCGTCTTCGGTAAGAGTGGTGCGCGTATCGAGATCCCTGGCTGtt > 2:2856406/1‑100 (MQ=255) tggCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCGTCTTCGGTAAGAGTGGTGCGCGTATCGAGATCCCTGGCTGTTc < 2:326436/100‑1 (MQ=255) gCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAcgctgtagtagccttcttcggtcaactgtgcggcgtccatacgggttggcggtgccacc < 2:2783786‑M1/100‑60 (MQ=255) cACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCGTCTTCGGTAAGAGTGGTGCGCGTATCGAGATCCCTGGCTGTTCCCt > 2:545018/1‑100 (MQ=255) cACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCGTCTTCGGTAAGAGTGGTGCGCGTATCGAGATCCCTGGCTGTTCCCt > 1:599625/1‑100 (MQ=255) aCCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCGTCTTCGGTAAGAGTGGTGCGCGTATCGAGATCCCTGGCTGTTCCCtg < 2:1053980/100‑1 (MQ=255) cGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCGTCTTCGGTAAGAGTGGTGCGCGTATCGAGATCCCTGGCTGTTCCCtgtg < 1:3699698/100‑1 (MQ=255) gCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCGTCTTCGGTAAGAGTGGGGCGCGTATCGAGATCCCTGGCTGTTCCCtgtg < 1:3655297/99‑1 (MQ=255) ccAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCGTCTTCGGTAAGAGTGGTGCGCGTATCGAGATCCCTGGCTGTTCCCTGTGTa < 1:2336388/100‑1 (MQ=255) cAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCGTCTTCGGTAAGAGTGGTGCGCGTATCGAGATCCCTGGCTGTTCCCTGTGTAt < 2:2465908/100‑1 (MQ=255) cgcGTATGGCCTCCGCC‑CAGG‑TGAGCTAAGACGGCGACTACATCTTCTGCTGGAAGAGTGGTGCGAGTATCGAGATCCCTGGc < 1:3289123/81‑1 (MQ=255) cccGTGTGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCGTCTTCGGTAAGAGTGGTGCGCGTATCGAGATCCCTGGCTGTTCCCTGTGTATgg > 1:1854485/1‑99 (MQ=255) cccGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCGTCTTCGGTAAGAGTGGTGCGCGTATCGAGATCCCTGGCTGTTCCCTGTGTATggg > 1:1770668/1‑100 (MQ=255) cccGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCGTCTTCGGTAAGAGTGGTGCGCGTATCGAGATCCCTGGCTGTTCCCTGTGTATggg < 1:1486844/100‑1 (MQ=255) cccGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCGTCTTCGGTAAGAGAGGTGCGCGTATCGAGATCCCTGCCTGTTCCCTGTGTATggg > 1:158304/1‑100 (MQ=255) aTGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCGTCTTCGGTAAGAGTGGTGCGCGTATCGAGATCCCTGGCTGTTCCCTGTGTATGGGTAAcc > 2:3702754/1‑100 (MQ=255) aTGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCGTCTTCGGTAAGAGTGGTGCGCGTATCGAGATCCCTGGCTGTTCCCTGTGTATGGGTAAcc < 2:2850235/100‑1 (MQ=255) tGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCGTCTTCGGTAAGAGTGGTGCGCGTATCGAGATCCCTGGCTGTTCCCTGTGTATGGGTAACCa > 2:2079070/1‑100 (MQ=255) 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a‑caGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCGTCTTCGGTAAGAGTGGTGCGCGTATCGAGATCCCTGGCTGTTCCCTGTGTATGGGTAACCAGGCGCGtgtg < 1:979724/100‑1 (MQ=255) aGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCGTCTTCGGTAAGAGTGGTGCGCGTATCGAGATCCCTGGCTGTTCCCTGTGTATGGGTAACCAGGCGCGTGTGGc < 2:558261/100‑1 (MQ=255) aGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCGTCTTCGGTAAGAGTGGTGCGCGTATCGAGATCCCTGGCTGTTCCCTGTGTATGGGTAACCAGGCGCGTGTGGc < 2:39228/100‑1 (MQ=255) gT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCGtcttcggtcaactgtgcggcgtccatacgggttggcggtgccacccacaggcgggtcggcaactgacctttatg < 2:3789738‑M2/100‑75 (MQ=255) gT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCGTCTTCGGTAAGAGTGGTGCGCGTATCGAGATCCCTGGCTGTTCCCTGTGTATGGGTAACCAGGCGCGTGTgg < 1:3356181/98‑1 (MQ=255) gT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCGTCTTCGGTAAGAGTGGTGCGCGTATCGAGATCCCTGGCTGTTCCCTGTGTATGGGTAACCAGGCGCGTGTGGCg < 1:2840684/100‑1 (MQ=255) gACCGAAGAAGGCTACTACAGCGTCTTCGGTAAGAGTGGTGCGCGTATCGAGATCCCTGGCTGTTCCCTGTGTATGGGTAACCAGGCGCGTGTGGCGGAc < 2:3379170/100‑1 (MQ=255) gACCGAAGAAGGCTACTACAGCGTCTTCGGTAAGAGTGGTGCGCGTATCGAGATCCCTGGCTGTTCCCTGTGTATGGGTAACCAGGCGCGTGTGGCGGAc < 2:457475/100‑1 (MQ=255) aCCGAAGAcgctgtagtagccttcttcggtcaactgtgcggcgtccatacgggttggcggtgccacccacaggcgggtcggcaactgacctttatgcgca < 2:1813465‑M1/100‑93 (MQ=255) aCCGAAGAAGGCTACTACAGCGtcttcggtcaactgtgcggcgtccatacgggttggcggtgccacccacaggcgggtcggcaactgacctttatgcgca < 2:3329796‑M2/100‑79 (MQ=255) aCCGAAGAAGGCTACTACAGCGtcttcggtcaactgtgcggcgtccatacgggttggcggtgccacccacaggcgggtcggcaactgacctttatgcgca < 1:1108899‑M2/100‑79 (MQ=255) aCCGAAGAAGGCTACTACAGCGtcttcggtcaactgtgcggcgtccatacgggttggcggtgccacccacaggcgggtcggcaactgacctttatgcgca < 1:2967140‑M2/100‑79 (MQ=255) aCCGAAGAAGGCTACTACAGCGtcttcggtcaactgtgcggcgtccatacgggttggcggtgccacccacaggcgggtcggcaactgacctttatgcgca < 2:3600303‑M2/100‑79 (MQ=255) aCCGAAGAAGGCTACTACAGCGtcttcggtcaactgtgcggcgtccatacgggttggcggtgccacccacaggcgggtcggcaactgacctttatgcgca < 2:1563333‑M2/100‑79 (MQ=255) aCCGAAGAAGGCTACTACAGCGtcttcggtcaactgtgcggcgtccatacgggttggcggtgccacccacaggcgggtcggcaactgacctttatgcgc < 2:1023470‑M2/99‑78 (MQ=255) ccGAAGAcgctgtagtagccttcttcggtcaactgtgcggcgtccatacgggttggcggtgccacccacaggcgggtcggcaactgacctttatgcgcat > 2:1994833‑M1/1‑7 (MQ=255) ccGAAGAAGGCTACTACAGCGtcttcggtaagagtggtgcggcgtccatacgggttggcggtgccacccacaggcgggtcggcaactgacctttatgcgc < 1:1700777‑M2/100‑80 (MQ=255) gaagaaGGCTACTACAGCGTCTTCGGTAAGAGTGGTGCGCGTATCGAGATCCCTGGCTGTTCCCTGTGTATGGGTAACCAGGCGCGTGTGGCGGACGGTg < 2:1204416/100‑1 (MQ=255) gAAGAtgctgtagtagccttctccggtcaactgtgcggcgtccatacgggttggcggtgccacccacaggcgggtcggcaactgacctttatgcgcatcc > 1:2213710‑M1/1‑5 (MQ=255) gAAGAcgctgtagtagccttcttcggtcaactgtgcggcgtccatacgggttggcggtgccacccacaggcgggtcggcaactgacctttatgcgcatcc > 2:3153407‑M1/1‑5 (MQ=255) aaGAcgctgtagtagccttcttcggtcaactgtgcggcgtccatacgggttggcggtgccacccacaggcgggtcggcaactgacctttatgcgcatcca > 1:1054145‑M1/1‑4 (MQ=255) aagGCTACTACAGCGTCTTCGGTAAGAGTGGTGCGCGTATCGAGATCCCTGGCTGTTCCCTGTGTATGGGTAACCAGGCGCGTGTGGCGGACGGTGCAAc < 1:1813456/100‑1 (MQ=255) aagGCTACTACAGCGTCTTCGGTAAGAGTGGTGCGCGTATCGAGATCCCTGGCTGTTCCCTGTGTATGGGTAACCAGGCGCGTGTGGCGGACGGTGCAAc < 2:2634828/100‑1 (MQ=255) | GCTGCGGGTAAACTGCTGGATGCGCATAAAGGTCAGTTGCCGACCCGCCTGTGGGTGGCACCGCCAACCCGTATGGACGCCGCA‑CAGT‑TGACCGAAGAAGGCTACTACAGCGTCTTCGGTAAGAGTGGTGCGCGTATCGAGATCCCTGGCTGTTCCCTGTGTATGGGTAACCAGGCGCGTGTGGCGGACGGTGCAAC > NC_000913/133769‑133965 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |