| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1054940 | 113 (0.830) | 22 (0.170) | 7/170 | NT | 16.4% | coding (1239/2745 nt) | torS | hybrid sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with TorR |
| ? | NC_000913 | = 1054956 | 117 (0.910) | coding (1223/2745 nt) | torS | hybrid sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with TorR | |||||
Only 100 of 186 total aligned reads displayed.
CGCCGATTTTGCCTGGCTGGCTTTTTCTGCTTCCGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTCCCGTACGCCAGCGGTTT > NC_000913/1054841‑1055037 | cGCCGATTTTGCCTGGCTGGCTTTTTCTGCTTCCGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCC > 1:2581141‑M1/1‑100 (MQ=255)cGCCGATTTTGCCTGGCTGGCTTTTTCTGCTTCCGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCC > 2:180318‑M1/1‑100 (MQ=255) gCCGATTTTGCCTGGCTGGCTTTTTCTGCTTCCGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGcgccg > 2:1059406/1‑100 (MQ=255) cGATTTTGCCTGGCTGGCTTTTTCTGCTTCCGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCgccgcc > 1:2370501/1‑100 (MQ=255) cGATTTTGCCTGGCTGGCTTTTTCTGCTTCCGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCgccgcc < 1:2659068/100‑1 (MQ=255) ttttGCCTGGCTGGCTTTTTCTGCTTCCGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGc < 1:3747283/100‑1 (MQ=255) tGCCTGGCTGGCTTTTTCTGCTTCCGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGt < 2:3127789/100‑1 (MQ=255) ccTGGCTGGCTTTTTCTGCTTCCGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTc > 1:1794975/1‑100 (MQ=255) ctggctggCTTTTTCTGCTTCCGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTcg > 2:125521/1‑100 (MQ=255) ctggctTTTTCTGCTGCCGAGCGGGGATGTCGGTGTTCTCTCTTCAGGTCCTGCAATTCAGCTGTACGGGCTTTGACCGGCGCCGCGAGCTGTTCTCGGt > 1:3179885/1‑100 (MQ=255) gCTTTTTCTGCTTCCGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTggc > 1:3739229‑M2/1‑97 (MQ=255) gCTTTTTCTGCTTCCGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTggc > 2:2052679‑M2/1‑97 (MQ=255) gCTTTTTCTGCTTCCGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTggc > 2:589499‑M2/1‑97 (MQ=255) gCTTTTTCTGCTTCCGCCCATGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTggc < 1:3747030‑M2/100‑4 (MQ=255) ctTTTTCTGCTTCCGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCaccgcgaacagctggcggcg < 2:177261‑M1/100‑21 (MQ=255) ctTTTTCTGCTTCCGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCaccgcgaacagctggcggcg < 2:1369480‑M1/100‑21 (MQ=255) cTTTTTCTGCTTCCGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTggcg < 1:1742069‑M2/100‑5 (MQ=255) cTTTTTCTGCTTCCGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTggcg < 1:3736410‑M2/100‑5 (MQ=255) cTTTTTCTGCTTCCGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTggcg < 2:2454542‑M2/100‑5 (MQ=255) ttttCTGCTTCCGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGAt > 1:1396838/1‑100 (MQ=255) tttCTGCTTCCGCCTGTGCTTGTCGGTGTTCTACCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCaccgcgaacagctggcggcgca < 1:1670551‑M1/99‑23 (MQ=255) tttCTGCTTCCGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCaccgcgaacagctggcggcgcag < 2:1054602‑M1/100‑24 (MQ=255) tttCTGCTTCCGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCGTTGACCTGCGCCaccgcgaacagctggcggcgcag < 1:1160451‑M1/100‑24 (MQ=255) tttCTGCTTCCGCCCGTACCTCTCGGTGAGCTATCACCAGTTCATGCAATTCCACTGTACGCACATTCACATGAACCGCCAGCTGTTCGCGCTGGc < 1:2470925/96‑1 (MQ=255) ttCTGCTTCCGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCaccgcgaacagctggcggcgcagg < 2:3216677‑M1/100‑25 (MQ=255) ttCTGCTTCCGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCaccgcgaacagctggcggcgcagg < 1:415200‑M1/100‑25 (MQ=255) ttCTGCTTCCGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCaccgcgaacagctggcggcgcagg < 2:2743474‑M1/100‑25 (MQ=255) ttCTGCTTCCGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTc < 2:658150/100‑1 (MQ=255) ttCTACTTCCGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCaccgcgaacagctggcggcgcagg < 2:1233277‑M1/100‑25 (MQ=255) tCTGCTTCCGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCa < 2:3080338/100‑1 (MQ=255) tCTGCTGCCGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCaccgcgaacagctggcggcgcaggt < 1:978354‑M1/100‑26 (MQ=255) tCTGCTGCCGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCGGTACGCGCTTTGACCTGCGCCaccgcgaacagctggcggcgcag < 1:2609138‑M1/98‑24 (MQ=255) cTGCTTCCGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCaccgcgaacagctggcggcgcaggtc < 2:571991‑M1/100‑27 (MQ=255) cTGCTTCCGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCaccgcgaacagctggcggcgcaggtc < 2:1647647‑M1/100‑27 (MQ=255) cTGCTTCCGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCGTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAg < 1:2354720/100‑1 (MQ=255) gCTTCCGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTCCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTg < 1:106323/100‑1 (MQ=255) tCCGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCAt > 2:2382708/1‑100 (MQ=255) ccGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCCGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATg < 1:3039385/100‑1 (MQ=255) cGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGa > 2:3635756/1‑100 (MQ=255) ccGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACa < 2:2424164/100‑1 (MQ=255) ccTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATtgct > 2:1843828/1‑100 (MQ=255) cTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATtgctg > 2:517042/1‑100 (MQ=255) tGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATtgctgc > 2:1661810/1‑100 (MQ=255) tGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATtgctgc > 2:331043/1‑100 (MQ=255) atctggTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATtgctgc < 1:3240834/96‑1 (MQ=255) gTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCg > 1:1222659/1‑100 (MQ=255) gTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCg > 2:2992012/1‑100 (MQ=255) cGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGaa > 2:1399343/1‑100 (MQ=255) cGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGa < 2:77949/99‑1 (MQ=255) ggTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATtgctgcagat > 2:3240852/1‑96 (MQ=255) tgtTCTATCACCAGTTCCTGTTATTCGGCTGTACGCGCGTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCTATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACg < 1:3441317/100‑1 (MQ=255) gtTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGc > 1:1638652/1‑100 (MQ=255) gtTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGc > 1:3653449/1‑100 (MQ=255) ttCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGca < 2:1396846/100‑1 (MQ=255) tCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGcat > 2:383809/1‑100 (MQ=255) tCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGcat > 2:2192641/1‑100 (MQ=255) tCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTACGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAAc > 1:2679937/1‑96 (MQ=255) aTCACCAGTTCCTGCTATTCAGCTGTGCGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGcatcca < 2:1521975/100‑1 (MQ=255) aTCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGATCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTCGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGcatcca > 1:736382/1‑100 (MQ=255) aTCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGcatcca > 2:459616/1‑100 (MQ=255) aTCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGcatcca > 2:952018/1‑100 (MQ=255) tCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGcatccat < 2:332624/100‑1 (MQ=255) cACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGcatccat > 1:3484167/1‑99 (MQ=255) aCCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCa > 1:1942628/1‑100 (MQ=255) ccAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAg < 2:2757894/100‑1 (MQ=255) cTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGGTTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCCTCAGCCGccc > 1:1692450/1‑99 (MQ=255) cTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCg > 1:658982/1‑100 (MQ=255) cTGCAATTCAGCTGGACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCg > 1:2618424/1‑100 (MQ=255) cagttCTGCTGTACGCGCTTTGACCCGCGCCGCCAGATGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATg < 1:2534380/97‑1 (MQ=255) cAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATg < 2:256834/100‑1 (MQ=255) cAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATg < 2:3451569/100‑1 (MQ=255) aaTTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATgg < 2:2250466/100‑1 (MQ=255) aTTCTGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATgg < 1:1011617/99‑1 (MQ=255) aTTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATgg < 1:2203367/99‑1 (MQ=255) ttCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTa > 1:1039196/1‑100 (MQ=255) cAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATc > 1:3673107/1‑100 (MQ=255) cAGCTGCACGCGCTTTTACCTGCGCCGCCACCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCCATgg < 1:887868/96‑1 (MQ=255) cTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAg < 1:1185577/100‑1 (MQ=255) tACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTc > 1:2797952/1‑100 (MQ=255) aCGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTcc > 2:574584/1‑100 (MQ=255) cgcgCTTAGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTccc > 2:3395797/1‑100 (MQ=255) gcTTTGACCTGCGGCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTcc < 1:3255661/96‑1 (MQ=255) gcTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTCCCGTa < 2:3219298/100‑1 (MQ=255) cTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTCCCGttc < 2:2587652/100‑3 (MQ=255) ttGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTggcgcaggtcaaagcgcgtacagctgaattgcaggaactggtgatagaacaccgacaggcacgggcggaagc < 2:417666‑M2/100‑73 (MQ=255) tGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTCCCGTACGcc < 2:199508/100‑1 (MQ=255) gACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTggcggcgcaggtcaaagcgcgtacagctgaattgcaggaactggtgatagaacaccgacaggcacgggcggaag < 1:3717405‑M2/100‑75 (MQ=255) gACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAACCGCATCCATCATCCGCCCGATCGTATCCAGCTCCCGTACGCCa > 2:1062975/1‑100 (MQ=255) aCCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTggcgcaggtcaaagcgcgtacagctgaattgcaggaactggtgatagaacaccgacaggcacgggcggaagcaga < 1:1048612‑M2/100‑76 (MQ=255) aCCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTggcgcaggtcaaagcgcgtacagctgaattgcaggaactggtgatagaacaccgacaggcacgggcggaagcaga < 1:1591089‑M2/100‑76 (MQ=255) ccTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTggcgcaggtcaaagcgcgtacagctgaattgcaggaactggtgatagaacaccgacaggcacgggcggaagcagaa < 2:1560826‑M2/100‑77 (MQ=255) ccTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTggcgcaggtcaaagcgcgtacagctgaattgcaggaactggtgatagaacaccgacaggcacgggcggaagcagaa < 2:1159420‑M2/100‑77 (MQ=255) ccTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTggcgcaggtcaaagcgcgtacagctgaattgcaggaactggtgatagaacaccgacaggcacgggcggaagcagaa < 1:2225754‑M2/100‑77 (MQ=255) cTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTggcgcaggtcaaagcgcgtacagctgaattgcaggaactggtgatagaacaccgacaggcacgggcggaagcagaaa < 2:1999967‑M2/100‑78 (MQ=255) cTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTggcgcaggtcaaagcgcgtacagctgaattgcaggaactggtgatagaacaccgacaggcacgggcggaagcagaaa < 2:111594‑M2/100‑78 (MQ=255) tGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTCCCGTACGCCAGCgg < 1:1555344/100‑1 (MQ=255) tGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTCCCGTACGCCAGCgg > 1:3565248/1‑100 (MQ=255) tGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTCCCGTACGCCAGCgg < 1:2894998/100‑1 (MQ=255) gccgccAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTCCCGTACGCCAGCGGttt < 2:2363118/100‑1 (MQ=255) gcCaccgcgaacagctggcggcgcaggtcaaagcgcgtacagctgaattgcaggaactggtgatagaacaccgacaggcacgggcggaagcagaaaaagc > 1:114404‑M1/1‑3 (MQ=255) | CGCCGATTTTGCCTGGCTGGCTTTTTCTGCTTCCGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTCCCGTACGCCAGCGGTTT > NC_000913/1054841‑1055037 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |