| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1054940 | 113 (0.830) | 22 (0.170) | 7/170 | NT | 16.4% | coding (1239/2745 nt) | torS | hybrid sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with TorR |
| ? | NC_000913 | = 1054956 | 117 (0.910) | coding (1223/2745 nt) | torS | hybrid sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with TorR | |||||
Only 100 of 167 total aligned reads displayed.
CTGGCTTTTTCTGCTTCCGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTCCCGTACGCCAGCGGTTTCCGGGAAAGGGGAGTCAA > NC_000913/1054857‑1055055 | ctggctTTTTCTGCTTCCGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGt > 2:570525/1‑100 (MQ=255) gCTTTTTCTGCTTCCGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTggc > 2:2052679‑M2/1‑97 (MQ=255) gCTTTTTCTGCTTCCGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTggc > 1:114404‑M2/1‑97 (MQ=255) gCTTTTTCTGCTTCCGCCCATGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTggc < 1:3747030‑M2/100‑4 (MQ=255) cTTTTTCTGCTTCCGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTggcg < 1:3736410‑M2/100‑5 (MQ=255) cTTTTTCTGCTTCCGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTggcg < 2:2454542‑M2/100‑5 (MQ=255) cTTTTTCTGCTTCCGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTggcg < 1:1742069‑M2/100‑5 (MQ=255) ttttCTGCTTCCGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGAt > 1:1396838/1‑100 (MQ=255) ttttCTGCTTCCGCCCATGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGAt < 2:3747054/100‑1 (MQ=255) tttCTGCTTCCGCCCGTACCTCTCGGTGAGCTATCACCAGTTCATGCAATTCCACTGTACGCACATTCACATGAACCGCCAGCTGTTCGCGCTGGc < 1:2470925/96‑1 (MQ=255) ttCTGCTTCCGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTc < 2:658150/100‑1 (MQ=255) tCTGCTTCCGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCa > 2:419117/1‑100 (MQ=255) cTGCTTCCGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCGTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAg < 1:2354720/100‑1 (MQ=255) ccGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATg > 2:3220693/1‑100 (MQ=255) cGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGa > 2:3635756/1‑100 (MQ=255) gCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGaa > 1:74774/1‑100 (MQ=255) ccGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACa < 2:1267221/100‑1 (MQ=255) ccTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATtgct > 2:1843828/1‑100 (MQ=255) cTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATtgctg > 2:517042/1‑100 (MQ=255) tGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCGGTGCATGAACATtgctgc > 1:1051437/1‑100 (MQ=255) tGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATtgctgc > 2:331043/1‑100 (MQ=255) tGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATtgctgc > 2:1661810/1‑100 (MQ=255) tgtTCTATCACCAGTTCCTGTTATTCGGCTGTACGCGCGTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCTATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACg < 1:3441317/100‑1 (MQ=255) gtTCTATCCCCAGTTCCTGCACTTCAGCTGTACGCGCTTTGGCCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGaaa < 1:3018372/97‑1 (MQ=255) gtTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGc > 1:1638652/1‑100 (MQ=255) ttCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGca < 2:1396846/100‑1 (MQ=255) tCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGcat > 2:3441614/1‑100 (MQ=255) tCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGcat > 2:2192641/1‑100 (MQ=255) tCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTACGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAAc > 1:2679937/1‑96 (MQ=255) aTCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGcatcca > 2:459616/1‑100 (MQ=255) aTCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGcatcca > 2:952018/1‑100 (MQ=255) cACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGcatccat > 1:3484167/1‑99 (MQ=255) aCCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCa > 1:1942628/1‑100 (MQ=255) aCCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCa > 2:3056949/1‑100 (MQ=255) ccAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAg < 2:2757894/100‑1 (MQ=255) gTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAgccg < 2:2229875/100‑1 (MQ=255) gccTGCAATTCAGCTGTGCGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAgccgcc < 1:3444216/99‑1 (MQ=255) cTGCAATTCAGCTGGACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCg > 1:2618424/1‑100 (MQ=255) cagttCTGCTGTACGCGCTTTGACCCGCGCCGCCAGATGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATg < 1:2534380/97‑1 (MQ=255) cAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATg < 2:256834/100‑1 (MQ=255) cAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATg < 2:3451569/100‑1 (MQ=255) aTTCTGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATgg < 1:1011617/99‑1 (MQ=255) aTTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATgg < 1:2203367/99‑1 (MQ=255) aTTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGt > 2:1977114/1‑100 (MQ=255) ttCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTa > 1:1039196/1‑100 (MQ=255) tCAACTGTACGCCCTTTGGCCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTAt < 1:3138883/100‑1 (MQ=255) cAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATc > 1:3673107/1‑100 (MQ=255) cAGCTGCACGCGCTTTTACCTGCGCCGCCACCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCCATgg < 1:887868/96‑1 (MQ=255) gCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCa > 1:735970/1‑100 (MQ=255) tGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGc > 1:3219280/1‑100 (MQ=255) tACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTc > 1:2797952/1‑100 (MQ=255) aCGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTcc < 2:628031/100‑1 (MQ=255) aCGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTcc > 2:574584/1‑100 (MQ=255) cgcgCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTccc > 2:2409153/1‑100 (MQ=255) gcgcTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTCCCg > 1:3655376/1‑100 (MQ=255) cgcTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTCCCGt > 2:1515294/1‑100 (MQ=255) gcTTTGACCTGCGGCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTcc < 1:3255661/96‑1 (MQ=255) cTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTCCCGTAc > 2:3264561/1‑100 (MQ=255) ttGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTggcgcaggtcaaagcgcgtacagctgaattgcaggaactggtgatagaacaccgacaggcacgggcggaagc < 2:417666‑M2/100‑73 (MQ=255) ttGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTCCCGTACGc > 1:1215742/1‑100 (MQ=255) ttGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCAGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCCCCCGATGGTATCCAGCGCCCGTACg < 2:2665279/99‑1 (MQ=255) tGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTCCCGTACGcc < 1:324808/100‑1 (MQ=255) gACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTggcgcaggtcaaagcgcgtacagctgaattgcaggaactggtgatagaacaccgacaggcacgggcggaagcag < 2:1647647‑M2/100‑75 (MQ=255) gACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAACCGCATCCATCATCCGCCCGATCGTATCCAGCTCCCGTACGCCa > 2:1062975/1‑100 (MQ=255) aCCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTggcgcaggtcaaagcgcgtacagctgaattgcaggaactggtgatagaacaccgacaggcacgggcggcagcaga < 1:978354‑M2/100‑76 (MQ=255) ccTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTggcgcaggtcaaagcgcgtacagctgaattgcaggaactggtgatagaacaccgacaggcacgggcggaagtagaa < 2:1233277‑M2/100‑77 (MQ=255) ccTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTggcgcaggtcaaagcgcgtacagctgaattgcaggaactggtgatagaacaccgacaggcacgggcggaagcagaa < 2:1159420‑M2/100‑77 (MQ=255) ccTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTggcgcaggtcaaagcgcgtacagctgaattgcaggaactggtgatagaacaccgacaggcacgggcggaagcagaa < 1:2225754‑M2/100‑77 (MQ=255) ccTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTggcgcaggtcaaagcgcgtacagctgaattgcaggaactggtgatagaacaccgacaggcacgggcggaagcagaa < 2:3216677‑M2/100‑77 (MQ=255) ccTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTggcgcaggtcaaagcgcgtacagctgaattgcaggaactggtgatagaacaccgacaggcacgggcggaagcagaa < 2:1560826‑M2/100‑77 (MQ=255) ccTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTCCCGTACGCCAGc > 2:319968/1‑100 (MQ=255) cTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTggcgcaggtcaacgcgcgtacagctgaattgcaggaactggtgatagaacaccgacaggcacgggcggaagcagaaa < 1:1160451‑M2/100‑78 (MQ=255) cTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTggcgcaggtcaaagcgcgtacagctgaattgcaggaactggtgatagaacaccgacaggcacgggcggaagcagaaa < 2:1999967‑M2/100‑78 (MQ=255) tGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTggcgcaggtcaaagcgcgtacagctgaattgcaggaactggtggtagaacaccgacaagcacaggcggaagcagaaa < 1:1670551‑M2/99‑78 (MQ=255) tGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTCCCGTACGCCAGCgg > 1:3565248/1‑100 (MQ=255) tGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTCCCGTACGCCAGCgg < 1:1555344/100‑1 (MQ=255) gccgccAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTCCCGTACGCCAGCGGttt < 2:2363118/100‑1 (MQ=255) gccAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTCCCGTACGCCAGCGGTTTCCg < 1:459610/100‑1 (MQ=255) gccAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTCCCGTACGCCAGCGGTTTCCg < 2:2244352/100‑1 (MQ=255) gccAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGAATGAACATTGCTGCGACACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTCCCGTACGCCAGCGGTTTCCg > 1:2601393/1‑100 (MQ=255) ccAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTCCCGTACGCCAGCGGTTTCCgg < 1:3064482/100‑1 (MQ=255) ccAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTCCCGTACGCCAGCGGTTTCCgg < 2:1446951/100‑1 (MQ=255) ccAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTACATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTCCCGTACGCCAGCGGTTTCCgg > 2:2322844/1‑100 (MQ=255) cAGGTGTTCGCGGTGGAGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTCCCGTACGCCAGCGGTTTCCggg < 1:1592020/100‑1 (MQ=255) cAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTCCCGTACGCCAGCGGTTTCCggg < 1:2760581/100‑1 (MQ=255) gCTGTTCGCGGTGGCAATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTCCCGTACGCCAGCGGTTTCCgg < 1:1896363/97‑1 (MQ=255) cTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTCCCGTACGCCAGCGGTTTCCGGGaaa < 2:3673130/100‑1 (MQ=255) tGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTCCCGTACGCCAGCGGTTTCCGGGAAAg < 1:385058/100‑1 (MQ=255) gTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTCCCGTACGCCAGCGGTTTCCGGGAAAgg > 2:1815833/1‑100 (MQ=255) gTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTCCCGTACGCCAGCGGTTTCCGGGAAAgg < 2:73137/100‑1 (MQ=255) gTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTCCCGTACGCCAGCGGTTTCCGGGAAAgg > 1:633301/1‑100 (MQ=255) ttCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTCCCGTACGCCAGCGGTTTCCGGGAAAggg < 2:3338218/100‑1 (MQ=255) ttCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTCCCGTACGCCAGCGGTTTCCGGGAAAggg < 2:1110285/100‑1 (MQ=255) tCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTCCCGTACGCCAGCGGTTTCCGGGAAAgggg < 2:2344100/100‑1 (MQ=255) tCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTCCCGTACGCCAGCGGTTTCCGGGAAAgggg < 2:2967870/100‑1 (MQ=255) tCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTCCCGTACGCCAGCGGTTTCCGGGAAAgggg < 1:1399335/100‑1 (MQ=255) ggTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTCCCGTACGCCAGCGGTTTCCGGGAAAGGGGAGTc < 2:3565269/100‑1 (MQ=255) ggTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTCCCGTACGCCAGCGGTTTCCGGGAAAGGGGAGTc < 2:1769908/100‑1 (MQ=255) ggTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTCCCGTACGCCAGCGGTTTCCGGGAAAGGGGAGTc < 1:2615556/100‑1 (MQ=255) gTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTCCCGTACGCCAGCGGTTTCCGGGAAAGGGGAGTCa < 1:3754235/100‑1 (MQ=255) | CTGGCTTTTTCTGCTTCCGCCCGTGCCTGTCGGTGTTCTATCACCAGTTCCTGCAATTCAGCTGTACGCGCTTTGACCTGCGCCGCCAGCTGTTCGCGGTGGCGATTCAGTGCATGAACATTGCTGCGAAACGCATCCATCAGCCGCCCGATGGTATCCAGCTCCCGTACGCCAGCGGTTTCCGGGAAAGGGGAGTCAA > NC_000913/1054857‑1055055 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |