| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4235376 = | NA (NA) | 13 (0.110) +TCGTCGAT |
8/162 | NT | NA | coding (1619/1650 nt) | pgi | glucosephosphate isomerase |
| ? | NC_000913 | 4285300 = | NA (NA) | intergenic (‑87/+113) | yjcH/acs | DUF485 family inner membrane protein/acetyl‑CoA synthetase | |||||
Only 100 of 217 total aligned reads displayed.
GTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATC > NC_000913/4285203‑4285399 | gTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATg < 1:2418284/100‑1 (MQ=255)gTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATg > 1:3699676/1‑100 (MQ=255)gTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATg > 1:3726012/1‑100 (MQ=255) tGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGt < 1:1183430/100‑1 (MQ=255) tGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGt < 2:1057227/100‑1 (MQ=255) ggcATTCATCACACATTCTCCAGAGGTAATGAAGGGATTGTTATAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTa > 2:2572254/3‑100 (MQ=255) gCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTa > 2:328245/1‑100 (MQ=255) gCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTa > 2:2799818/1‑100 (MQ=255) gCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGGTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTa > 2:3578686/1‑100 (MQ=255) gCCATTCATCACAGATTCACCAGAGGTACTGCAGCGATTGTATTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGGAGTTTCACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTa > 1:2079324/1‑100 (MQ=255) ccATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAg > 1:1595679/1‑100 (MQ=255) ccATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAg > 1:2125197/1‑100 (MQ=255) catcaCAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCgg > 1:3160882/1‑100 (MQ=255) catcaCAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCgg > 1:1582768/1‑100 (MQ=255) atcaCAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGa > 2:3157372/1‑100 (MQ=255) atcaCAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGa > 1:3257718/1‑100 (MQ=255) tcaCAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGAt > 2:2015303/1‑100 (MQ=255) cacaGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATa > 1:971856/1‑100 (MQ=255) aGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAgg < 1:1749289/100‑1 (MQ=255) gATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGc < 2:1137951/100‑1 (MQ=255) aTTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCg < 2:3104758/100‑1 (MQ=255) ttCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGt < 2:3123170/100‑1 (MQ=255) tcCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTa > 1:2354863/1‑100 (MQ=255) tcCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTa > 2:1937027/1‑100 (MQ=255) cAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTAcg > 2:53947/1‑100 (MQ=255) cAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCAGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTAcg > 2:3531010/1‑100 (MQ=255) gagGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTAcgcc < 2:1789380/100‑1 (MQ=255) ggTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTAGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTAcgccgc > 1:1110267/1‑100 (MQ=255) cgccttatccggcctacatatcgacgatgattaaccgcgcgacgctttatagcggttaatcatcgtcgatATGTAGGCCGGATAAGGCGTTtacgccgta > 2:2328048‑M2/71‑98 (MQ=255) cgccttatccggcctacatatcgacgatgattaaccgcgccacgctttatagcggttaatcatcgtcgatATGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCa > 2:2643544‑M2/71‑100 (MQ=255) tGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCg < 2:3506982/100‑1 (MQ=255) tGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCg > 2:2913719/1‑100 (MQ=255) gTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCgg < 2:2776851/100‑1 (MQ=255) gTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCGTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCgg > 1:1670015/1‑100 (MQ=255) tAGGGTCTGCTTTAATTATCGCTCCCTCATGGGAGAAGGGTAACGCTCCGGTGACCCTTGCCGAATGTAGGGCGGATAAGATGCTTAcgcggccggatg > 1:2240236/1‑93 (MQ=255) gggATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGcaa < 1:1383458/100‑1 (MQ=255) ggATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGcaat < 2:829320/100‑1 (MQ=255) gATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGcaatc < 2:323509/100‑1 (MQ=255) aTTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGcaatca < 2:2941981/100‑1 (MQ=255) aTTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGcaatca > 2:289223/1‑100 (MQ=255) tGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGCAGGCCACATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGcaatcaat < 1:2203598/100‑1 (MQ=255) gTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATg < 2:3376090‑M2/100‑2 (MQ=255) ttttAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATgc < 2:64548‑M2/100‑3 (MQ=255) ttttAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATgc < 1:104354‑M2/100‑3 (MQ=255) tttAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATgcc < 2:2720837‑M2/100‑4 (MQ=255) tttAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATgcc < 1:304105‑M2/100‑4 (MQ=255) tttAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCACGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATgcc > 1:2743034‑M2/1‑97 (MQ=255) ttAATTCCCGCTCCCTTATGGGCGAAGGTTATCGCTCAGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATgcct > 1:2572241‑M2/1‑96 (MQ=255) tAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATgcctg < 2:2463785‑M2/100‑6 (MQ=255) tAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATgcctg < 2:1377924‑M2/100‑6 (MQ=255) aTTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATgcctgat > 2:2094251‑M2/1‑93 (MQ=255) ttCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATg > 2:3730558/1‑100 (MQ=255) accttcTCCCATAAGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGc > 1:3789343/6‑100 (MQ=37) ccttcTCCCATAAGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCg > 1:604856/5‑100 (MQ=37) cccGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGc > 1:944169/1‑99 (MQ=255) cccGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCg < 2:85416/100‑1 (MQ=255) acgatgattaaccgcgccacgctttatagcggttaatcatcgtcgatATGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCg > 2:3070999‑M2/48‑100 (MQ=255) cttcTCCCATAAGGGAGAAGATTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGAGGCGa > 1:2334607/4‑100 (MQ=25) ccGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGa > 2:725480/1‑100 (MQ=255) atgattaaccgcgccacgctttatagcggttaatcatcgtcgatATGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACg > 2:1189990‑M2/45‑100 (MQ=255) cTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGc < 2:2190725/100‑1 (MQ=255) cccTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTg < 2:3289718/100‑1 (MQ=255) cccTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTg > 1:2864167/1‑100 (MQ=255) attaaccgcgccacgctttatagcggttaatcatcgtcgatATGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGAcgcgg > 2:1856199‑M2/42‑98 (MQ=255) attaaccgcgccacgctttatagcggttaatcatcgtcgatATGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCAGGCAACCGATGCCTGATGCGACGc > 1:775772‑M2/42‑98 (MQ=255) ttATGGGAGAAGGTTTACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTcg < 2:3750780/100‑1 (MQ=255) 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1:3579068/100‑1 (MQ=255) gaAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTAt > 2:1143541/1‑100 (MQ=255) aaGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGTCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATc < 1:476609/100‑1 (MQ=255) ttAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGc < 1:577484/100‑1 (MQ=255) aaCGCTCGGGTGACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCAGCCGGCAATCAATgcctgataagacgcgacagcgtcgcatcaggcat > 1:1228626‑M2/1‑66 (MQ=255) aCGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATgcctgataagacgcgacagcgtcgcatcaggcatt > 1:413425‑M2/1‑65 (MQ=255) aCGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATgcctgataagacgcgacagcgtcgcatcaggcatt > 2:15016‑M2/1‑65 (MQ=255) cGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATgcctgataagacgcgacagcgtcgcatcaggcattg > 2:1329166‑M2/1‑64 (MQ=255) gCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACa < 2:1639328/100‑1 (MQ=255) cgcGGGTAACCCTTGCCGAATGTGGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACaa < 2:2110724/98‑1 (MQ=255) tCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATgcctgatgcgacagcgtcgcatcaggcattgattgccgg > 1:583444‑M2/1‑61 (MQ=255) ggTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCg > 1:2035602/1‑100 (MQ=255) gTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGt > 1:347062/1‑100 (MQ=255) aCCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTAc < 2:758846/100‑1 (MQ=255) cccTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTAcc > 2:1339009/1‑100 (MQ=255) cccTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTAcc < 1:1197183/100‑1 (MQ=255) ccTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTAcca > 1:3762488/1‑99 (MQ=255) ccTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCg < 2:382851/100‑1 (MQ=255) cTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGa < 2:3478540/100‑1 (MQ=255) ttGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGAc < 1:2315131/100‑1 (MQ=255) ttGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGAc < 1:1952907/100‑1 (MQ=255) ttGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGAc < 2:1504180/100‑1 (MQ=255) tGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACt < 2:559261/100‑1 (MQ=255) cGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCCGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGTTACCGACTCGc > 1:946607/1‑100 (MQ=255) gAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCa < 1:874476/100‑1 (MQ=255) aTGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATc < 2:2293244/100‑1 (MQ=255) aTGTAGGCCGGATAAGGCGTGTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGc > 1:2328447/1‑97 (MQ=255) | GTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATC > NC_000913/4285203‑4285399 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |