| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2539674 | NA (NA) | 27 (0.190) | 15/164 | NT | NA | intergenic (‑91/+43) | cysM/cysA | cysteine synthase B (O‑acetylserine sulfhydrolase B)/sulfate/thiosulfate transporter subunit |
| ? | NC_000913 | = 2539688 | NA (NA) | intergenic (‑105/+29) | cysM/cysA | cysteine synthase B (O‑acetylserine sulfhydrolase B)/sulfate/thiosulfate transporter subunit | |||||
TTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2539569‑2539674‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcccggaGGCGCTTCCCGCGATCCGGGCTTTTTAATGGCAAGGTTTGTAACCTGTAGACCTGATAAGACGCGCAAGCGTCGCATCAGGCAACACCACGTATGGA < NC_000913/2539688‑2539592 TTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAG < 1:998718/100‑1TTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAG < 1:3403386/100‑1TTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAG < 2:3605142/100‑1TTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAG > 2:2851237/1‑100 TCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGC < 2:1779086/100‑1 TCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGC > 1:3225736/1‑100 TCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGC < 2:2832926/100‑1 CTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCC > 2:1749369/1‑100 CTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCC < 2:1977673/100‑1 CTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCC < 2:233891/100‑1 CTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCC > 1:1413121/1‑100 CTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCC > 2:3908221/1‑100 TAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAGAAAGCCC < 2:2300974/100‑1 TAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCC > 1:2588798/1‑100 TAATGTACTCACGATCTCCATCCATACGTGGTTTTGCCTGATGCGACGCCTGCGCGTCTTATCAGCTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCC > 1:2079117/1‑100 AATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCG > 1:730424/1‑100 AATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCG > 1:1366420/1‑100 AATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCC < 1:2179397/99‑1 AATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTAAAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCG > 2:3716778/1‑100 ATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGG < 2:3252178/100‑1 ATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGG < 2:1032358/100‑1 ATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGG < 2:3088726/100‑1 ATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCACGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGG < 1:2343652/100‑1 TGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGA < 2:2141336/100‑1 ACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAGGC > 1:1686700/1‑100 CATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAGGCGCTTCCCGCGATCCGG < 1:455760/100‑1 ATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAGGCGCTTCCCGCGATCCGGG < 1:3611123/100‑1 ATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAGGCGCTTCCCGCGATCCGGG < 1:1478390/100‑1 TACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAGGCGCTTCCCGCGATCCGGGC < 2:2478808/100‑1 TACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAGGCGCTTCCCGCGATCCGGGC < 2:2803382/100‑1 TACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCGTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAGGCGCTTCCCGCGATCCGGGC < 2:1306656/100‑1 ACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAGGCGCTTCCCGCGATCCGGGCT < 2:499548/100‑1 GTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAGGCGCTTCCCGCGATCCGGGCTTT < 1:1132115/100‑1 GTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAGGCGCTTCCCGCGATCCGGGCTTT < 2:3108942/100‑1 TGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAGGCGCTTCCCGCGATCCGGGCTTTT < 2:1686705/100‑1 TGGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAGGCGCTTCCCGCGATCCGGGCTTTT < 1:996429/100‑1 GGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAACGCCCGGAGGCGCTTCCCGCGATCCGGGCTTTTT < 2:784669/100‑1 GTGTTGCCTCATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAGGCGCTTCCCGCGATCCGGGCTTTTT < 2:2885852/99‑1 TGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGGCCGGAGGCGCTTCCCGCGATCCGGGCTTTTTA < 1:3044965/99‑1 TGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAGGCGCTTCCCGCAATCCGGGCTTTTTAA < 1:1757068/100‑1 GTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAGGCGCTTCCCGCGATCCGGGCTTTTTAAT < 1:589607/100‑1 GTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAGGCGCTTCCCGCGATCCGGGCTTTTTAAT < 2:3147518/100‑1 GTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAGGCGCTTCCCGCGATCCGGGCTTTTTAAT < 1:2198793/100‑1 TTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAGGCGCTTCCCGCGATCCGGGCTTTTTAATG < 1:3198862/100‑1 TGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAGGCGCTTCCCGCGATCCGGGCTTTTTAATGG < 1:1613479/100‑1 TGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAGGCGCTTCCCGCGATCCGGGCTTTTTAATGG < 2:1455223/100‑1 TGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAGGCGCTTCCCGCGATCCGGGCTTTTTAATGG < 2:3317484/100‑1 TGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATT‑AAACGCCCGGAGGCGCTTCCCGCGATCCGGGCTTTTTAATGGC < 1:4195482/100‑1 GCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAATAAGCCCGGAGGCGCTTCCCGCGATCCGGGCTTTTTAATGG < 1:3220050/99‑1 GCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAACGCCCGGAGGCGCTTCCCGCGATCCGGGCTTTTTAATGGC < 1:4308517/100‑1 CCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAGGCGCTTCCCGCGATCCGGGCTTTTTAATGGCA < 2:1801915/100‑1 TGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATT‑AAACGCCCGGAGGCGCTTCCCGCGATCCGGGCTTTTTAATGGCAAGG < 2:653316/100‑1 ctcgccGAGGCGCTTCCCCCGATCCGGGCTTTTTAATGGCAAGTTTTGTAACCTGTAGACCTGATAAGACGCGCAAGCGTCGCATCAGGCAACACCACG < 2:3981285/93‑1 GCCCGGAGGCGCTTCCCGCGATCCGGGCTTTTTAATGGCAAGGTTTGTAACCTGTAGACCTGATAAGACGCGCAAGCGTCGCATCAGGCAACACCACGTA > 2:1366425/1‑100 CCCGGAGGCGCTTCCCGCGATCCGGGCTTTTTAATGGCAAGGTTTGTAACCTGTAGACCTGCTAAGACGCGCAAGCGTCGCATCAGGCAACTCCACGTc > 2:4118105/1‑98 CCCGGAGGCGCTTCCCGCGATCCGGGCTTTTTAATGGCAAGGTTTGTAACCTGTAGACCTGATAAGACGCGCAAGCGTCGCATCAGGCAACACCACGTAT > 2:3720171/1‑100 CGGAGGCGCTTCCCGCGATCCGGGCTTTTTAATGGCAAGGTTTGTAACCTGTAGACCTGATAAGACGCGCAAGCGTCGCATCAGGCAACACCACGTATGG < 2:1939859/100‑1 CGGAGGCGCTTCCCGCGATCCGGGCTTTTTAATGGCAAGGTTTGTAACCTGTAGACCTGATAAGACGCGCAAGCGTCGCATCAGGCAACACCACGTATG < 1:853940/99‑1 GGAGTCGCTTCCCGCGATCCGGGCTTTTTAATGGCAAGGTTTGTAACCTGTAGTCCTGATAAGACGCGCAAGCGTCGCATCAGGCAACACCACGTATGGA < 1:2445945/100‑1 GGAGGCGCTTCCCGCGATCCGGGCTTTTTAATGGCAAGGTTTGTAACCTGTAGACCTGATAAGACGCGCAAGCGTCGCATCAGGCAACACCACGTATGGA < 1:192567/100‑1 GGAGGCGCTTCCCGCGATCCGGGCTTTTTAATGGCAAGGTTTGTAACCTGTAGACCTGATAAGACGCGCAAGCGTCGCATCAGGCAACACCACGTATGGA > 1:2508005/1‑100 GGAGGCGCTTCCCGCGATCCGGGCTTTTTAATGGCAAGGTTTGTAACCTGTAGACCTGATAAGACGCGCAAGCGTCGCATCAGGCAACACCACGTATGGA < 2:1097590/100‑1 TTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2539569‑2539674‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcccggaGGCGCTTCCCGCGATCCGGGCTTTTTAATGGCAAGGTTTGTAACCTGTAGACCTGATAAGACGCGCAAGCGTCGCATCAGGCAACACCACGTATGGA < NC_000913/2539688‑2539592 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |