| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1294420 = | NA (NA) | 8 (0.050) | 6/168 | NT | NA | intergenic (+276/+6) | tdk/insZ | thymidine kinase/deoxyuridine kinase/pseudogene, transposase homolog |
| ? | NC_000913 | 1294445 = | NA (NA) | noncoding (961/980 nt) | ISZ | repeat region | |||||
Only 100 of 180 total aligned reads displayed.
TAGGCGTTATACATCGTCGCAAATATGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATG > NC_000913/1294321‑1294519 | tAGGCGTTATACATCGTCGCAAATATGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAAt > 2:2673102/1‑100 (MQ=255)tAGGCGTTATACAACGTCGCAAATATGATGAAGGCTAAAGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCACCAGAAGGGCAAt > 1:2715192/1‑100 (MQ=255)tAGGCGGTATACATCGTCGCAAATATGATGGATGCTAATGCTGTCAGATTATGGACAAGATGCTTAGAGTAAACAAAAAATACTGCCACAGAAGGGCAAt > 1:1432932/1‑100 (MQ=255) aGGCGTTATACATCGTCGCAAATATGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATg < 1:2632224/100‑1 (MQ=255) ggggttctctggaagtggtgttcataacaaaacgccccctaccatcaaggccgaggtcggttaagatatcaaaaacccgttatcctgtgaaacatagTGc > 1:3833710‑M1/98‑100 (MQ=255) ggCGTTATACATCGTCGCAAATATGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGc > 2:1599977/1‑100 (MQ=255) gggtgctctggaagtggtgttcataacaaaacgcccccgaccatcaaggccgaggtcggttaagatatcaaaaacccgttatcctgtgaaacatagTGcc < 1:3760871‑M1/4‑1 (MQ=255) gggtgctctggaagtggtgttcataacaaaacgcccccgaccatcaaggccgaggtcggttaagatatcaaaaacccgttatcctgtgaaacatagTGcc > 1:668862‑M1/97‑100 (MQ=255) ggtgctctggaagtggtgttcataacaaaacgcccccgaccatcaaggccgaggtcggttaagatatcaaaaacccgttatcctgtgaaacatagTGCCg < 2:1732404‑M1/5‑1 (MQ=255) tataCATCGTCGCAAATATGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTTAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTc < 2:3097991/100‑1 (MQ=255) tataCATCGTCGCAAATATGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTc < 2:576108/100‑1 (MQ=255) tataCATCGTCGCAAATATGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTc > 1:3585650/1‑100 (MQ=255) taCATCGTCGCAAATATGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCAc < 2:3272480/100‑1 (MQ=255) cATCGTCGCAAATATGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAACGGCATTGCCCTTctggg < 2:2823533/100‑5 (MQ=255) aTCGTCGCAAATATGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTa > 1:2455389/1‑100 (MQ=255) aTCGTCGCAAATATGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTa < 2:621330/100‑1 (MQ=255) gtcgCAAATATGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCACTGCCGTTCACTTAaga > 1:553382/1‑100 (MQ=255) gtcgCAAATATGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAaga > 2:3580116/1‑100 (MQ=255) gtcgCAAATATGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAaga < 1:839824/100‑1 (MQ=255) cgCAAATATGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAgagg < 2:256866/100‑1 (MQ=255) cacAAATATGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAgagg > 2:2976245/3‑100 (MQ=255) cAAATATGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAgaggag > 2:1735988/1‑100 (MQ=255) atatGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCgg < 2:1606888/100‑1 (MQ=255) tgatgaAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCAc < 1:356875/100‑1 (MQ=255) ataacaaaacgcccccgaccatcaaggccgaggtcggttaagatatcaaaaacccgttatcctgtgaaacatagTGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCAc > 1:2021944‑M1/75‑100 (MQ=255) atgaAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACt > 1:4289451/1‑99 (MQ=255) atgaAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTa > 2:473631/1‑100 (MQ=255) atgaAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAA‑TTGCTTTCGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTAt < 1:2574045/100‑1 (MQ=255) tgaAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTAt > 2:2047075/1‑100 (MQ=255) gaAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATg > 1:1688408/1‑100 (MQ=255) aaaatgaccccgaccatcaaggactgggtcggtgaagaaatcaaaaacccgttatcctgtgaaacatagTGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATg > 1:905195‑M1/70‑99 (MQ=255) aaGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATg < 2:3866727/99‑1 (MQ=255) aaGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGt > 1:3407381/1‑100 (MQ=255) aaGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGt < 1:3805487/100‑1 (MQ=255) aaGGCTAATGCTGTCGGTATATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCACAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGAACTATg > 1:3681722/1‑99 (MQ=255) ggCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGttt < 2:680267/100‑1 (MQ=255) ggCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGT‑AACAAAAAATACGGCCCCAGAAAGGCAATGCCGGTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGgtt > 1:1370830/1‑99 (MQ=255) gCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTc < 1:1877045/100‑1 (MQ=255) gCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTc < 2:1475860/100‑1 (MQ=255) acgcccccgaccatcaaggccgaggtcggttaagatatcaaaaacccgttatcctgtgaaacatagTGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTc > 2:4157201‑M1/67‑100 (MQ=255) cTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTca > 2:1547996/1‑100 (MQ=255) tAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAAGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTc < 1:106209/98‑1 (MQ=255) tGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAgg < 2:3226258/100‑1 (MQ=255) cTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGAt > 1:128203/1‑100 (MQ=255) tGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAACCAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAggct > 1:2723295/1‑97 (MQ=255) ggcGGTTGATGGAAAAGTGGCGTTGGGTAAATAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATaa > 2:4127017/3‑100 (MQ=255) gTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATaa > 2:1918284/1‑100 (MQ=255) tCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAAc < 1:4197744/100‑1 (MQ=255) ggTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACgg > 2:768074/1‑100 (MQ=255) ggTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACgg < 1:1842223/100‑1 (MQ=255) ggTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACgg > 1:2101110/1‑100 (MQ=255) ggTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACgg > 1:4117269/1‑100 (MQ=255) ggAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTg < 2:3917541/100‑1 (MQ=255) ggAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTg < 1:2229057/100‑1 (MQ=255) ggAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTg > 2:4362264/1‑100 (MQ=255) ggAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTg > 1:3320219/1‑100 (MQ=255) gAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGa > 2:1767654/1‑100 (MQ=255) gAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGa < 2:1284107/100‑1 (MQ=255) gAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGa < 2:332321/100‑1 (MQ=255) gAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGa < 1:768072/100‑1 (MQ=255) gAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGa > 2:452238/1‑100 (MQ=255) aaaaGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGat < 1:1115333/100‑1 (MQ=255) aGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATc > 1:3108384/1‑100 (MQ=255) ttGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCACTGCCGTTCACTTCAGAGGAGCGACACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGAAATCtt > 2:4324431/1‑100 (MQ=255) ttGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCtt < 2:4184231/100‑1 (MQ=255) tGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTa > 2:108052/1‑100 (MQ=255) ttGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCg < 2:2163518/100‑1 (MQ=255) ggTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGAcc < 2:735448/100‑1 (MQ=255) gTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCt < 1:2835558/100‑1 (MQ=255) aaCAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCgg > 2:3760895/1‑100 (MQ=255) aaCAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCgg < 1:2335709/100‑1 (MQ=255) aCAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGc > 1:1787571/1‑100 (MQ=255) cAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGcc > 2:2584476/1‑100 (MQ=255) aaaaaaTACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCt > 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2:1124491/1‑100 (MQ=255) cccAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCgggg > 2:1708958/1‑100 (MQ=255) cAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGc > 2:822053/1‑100 (MQ=255) aGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGt < 1:3014072/98‑1 (MQ=255) gggCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGtttt < 1:3917246/100‑1 (MQ=255) gggCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGtttt > 1:3482737/1‑100 (MQ=255) gccAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTg < 1:2662344/98‑1 (MQ=255) gCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGt < 2:3757315/100‑1 (MQ=255) gCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGt < 2:2832027/100‑1 (MQ=255) gCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGt < 2:2471903/100‑1 (MQ=255) cAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGtt < 2:2923517/100‑1 (MQ=255) aaTGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTa < 2:3794356/100‑1 (MQ=255) | TAGGCGTTATACATCGTCGCAAATATGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATG > NC_000913/1294321‑1294519 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |