| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2151673 = | NA (NA) | 12 (0.090) | 10/156 | NT | NA | intergenic (+27/+38) | yegJ/yegK | uncharacterized protein/ser/thr phosphatase‑related protein |
| ? | NC_000913 | 2151703 = | NA (NA) | intergenic (+57/+8) | yegJ/yegK | uncharacterized protein/ser/thr phosphatase‑related protein | |||||
Only 100 of 157 total aligned reads displayed.
TACCATTGATCCTTTATTGGTCACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCTTCAACCGCCATGAGAAACTCACTCTGCCCACAGCGCCAGTGCCAACGTTTTATCATCATCCGTACGCTCGTTTACCGCC > NC_000913/2151574‑2151771 | tgaattgttaaagcagtttttgtccagcccggcggtaaacgagcgtacggatgatgataaaacgttggcactggcgctgtgggcagagtgagtttctcat < 2:1503317‑M1/1‑1 (MQ=255)taCCATTGATCCTTTATTGGTCACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACt > 1:372921/1‑100 (MQ=255) gaattgttaaagcagtttttgtccagcccggcggtaaacgagcgtacggatgatgataaaacgttggcactggcgctgtgggcagagtgagtttctcat < 1:566635‑M1/1‑1 (MQ=255) cATTGATCCTTTATTGGTCACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGc > 1:159704/1‑100 (MQ=255) cATTGATCCTTTATTGGTCACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGc < 1:3287315/100‑1 (MQ=255) cATTGATCCTTTATTGGTCACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGc < 2:455322/100‑1 (MQ=255) attgttaaagcagtttttgtccagcccggcggtaaacgagcgtacggatgatgataaaacgttggcactggcgctgtgggcagagtgagtttctcaTGGc < 2:1054485‑M1/4‑1 (MQ=255) tgttaaagcagtttttgtccagcccggcggtaaacgagcgtacggatgatgataaaacgttggcactggcgctgtgggcagagtgagtttctcaTGGCgg < 2:4246895‑M1/6‑1 (MQ=255) tgttaaagcagtttttgtccagcccggcggtaaacgagcgtacggatgatgataaaacgttggcactggcgctgtgggcagagtgagtttctcaTGGCgg > 2:3548079‑M1/95‑100 (MQ=255) gATCCTTTATTGGTCACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGtt > 1:1203077/1‑100 (MQ=255) taaagcagtttttgtccagcccggcggtaaacgagcgtacggatgatgataaaacgttggcactggcgctgtgggcagagtgagtttctcaTGGCGGTTg < 1:781866‑M1/9‑1 (MQ=255) ccTTTATTGGTCACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGaa < 1:485178/100‑1 (MQ=255) aagcagtttttgtccagcccggcggtaaacgagcgtacggatgatgataaaacgttggcactggcgctgtgggcagagtgagtttctcaTGGCGGTTGaa > 1:689363‑M1/90‑100 (MQ=255) aagcagtttttgtccagcccggcggtaaacgagcgtacggatgatgataaaacgttggcactggcgctgtgggcagagtgagtttctcaTGGCGGTTGaa > 2:270213‑M1/90‑100 (MQ=255) cTTTATTGGTCACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAAt > 1:103645/1‑100 (MQ=255) cTTTATTGGTCACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAAt < 2:2674793/100‑1 (MQ=255) cTTTATTGGTCACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCGAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAAt > 1:3735084/1‑100 (MQ=255) tttATTGGTCACCTATCCAAAAGAATAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAAtt < 1:447567/100‑1 (MQ=255) ttATTGGTCACCTATCCAAAAGAAGACGCCGACGAGCTAAGTGCAAGCTTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTATAAACTGGCGGTTGAAttg > 1:2442563/1‑100 (MQ=255) ttATTGGTCACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAAtt < 1:30458/99‑1 (MQ=255) ttATTGGGCACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATCTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAAttg < 1:4173276/100‑1 (MQ=255) tATTGGTCACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAAttgt < 2:2958095/100‑1 (MQ=255) tATTGGTCACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAAttgt < 2:3615204/100‑1 (MQ=255) aTTGGTCACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAAttgtt > 1:1453271/1‑100 (MQ=255) aTTGGTCACATATCCAAAAGAAGAGGCCGACGTGTTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAAttg < 1:652732/98‑1 (MQ=255) ttGGTCACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAAttgttg < 2:2462277/100‑1 (MQ=255) tGGTCACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAATtgttgt > 2:84663/1‑100 (MQ=255) tGGTCACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGAGGTTGAATtgttgt > 1:3000180/1‑100 (MQ=255) ggTCACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTc < 2:2724890/100‑1 (MQ=255) ggTCACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTc > 1:1869590/1‑100 (MQ=255) ggTCACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTc > 2:622892/1‑100 (MQ=255) ggTCACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTc > 1:1188556/1‑100 (MQ=255) gttaCCTATCCAAAAGAAGAAGCCAACGAGCTAAAAGCAAAATTAGTTCGCTAATCATCTGTGCTAATTATTAAATAAACTGGCGGTAGAATTGTTGTCt > 1:3588734/4‑100 (MQ=255) tCACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCtt < 2:2921004/100‑1 (MQ=255) cACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCTTc < 1:4083421/100‑1 (MQ=255) tccagcccggcggtaaacgagcgtacggatgatgataaaacgttggcactggcgctgtgggcagagtgagtttctcaTGGCGGTTGAATTGTTGTCTTCa > 1:2581832‑M1/78‑100 (MQ=255) ccTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAGATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTAGTTGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCTTaaa > 1:4174917/1‑100 (MQ=255) ccTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCTTCaa > 2:693740/1‑100 (MQ=255) cTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCTTCAAc < 2:3642860/100‑1 (MQ=255) tATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCTTCAAcc < 2:931177/100‑1 (MQ=255) tATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCTTCAAcc < 2:1599882/100‑1 (MQ=255) agcccggcggtaaacgagcgtacggatgatgataaaacgttggcactggcgctgtgggcagagtgagtttctcaTGGCGGTTGAATTGTTGTCTTCAAcc > 2:2264715‑M1/75‑100 (MQ=255) tCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAGACTGGCGGTTGAATTGTTGTCTTCAACCGc < 2:230975/100‑1 (MQ=255) ccggcggtaaacgagcgtacggatgatgataaaacgttggcactggcgctgtgggcagagtgagtttctcaTGGCGGTTGAATTGTTGTCTTCAACCGcc > 2:173657‑M1/72‑100 (MQ=255) ccAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCTTCAACCGcc < 1:1604899/100‑1 (MQ=255) ccAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCTTCAACCGcc > 2:4052343/1‑100 (MQ=255) ccAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCTTCAACCGcc < 2:3532685/100‑1 (MQ=255) ccAAAAGAAGAAGCCGACGAGATAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATCTTGCTTGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCTTCAACCGc > 1:3281154/1‑99 (MQ=255) cggcggtaaacgagcgtacggatgatgataaaacgttggcactggcgctgtgggcagagtgagtttctcaTGGCGGTTGAATTGTTGTCTTCAACCGc > 1:164699‑M1/71‑98 (MQ=255) cAAGAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGGTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGACTTGTTGTCTTCAACCGcc > 1:3494458/1‑99 (MQ=255) ggcggtaaacgagcgtacggatgatgataaaacgttggcactggcgctgtgggcagagtgagtttctcaTGGCGGTTGAATTGTTGTCTTCAACCGCCAt > 2:2055758‑M1/70‑100 (MQ=255) ggcggtaaacgagcgtacggaggatgataaaacgttggcgctggcgctgtgagcagagtgactttcgcaTGGCGGTTGAATTGTTGTCTTCAACCGcc > 1:42076‑M1/70‑98 (MQ=255) aaaaGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCTTCAACCGCCAt > 2:1398909/1‑100 (MQ=255) gcggtaaacgagcgtacggatgatgataaaacgttggcactggcgctgtgggcagagtgagtttctcaTGGCGGTTGAATTGTTGTCTTCAACCGCCATg > 1:1054481‑M1/69‑100 (MQ=255) agaagaagCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCTTCAACCGCCATgag < 2:2287681/100‑1 (MQ=255) agaagaagCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCTTCAACCGCCATgag < 2:4027734/100‑1 (MQ=255) agaagaagCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCTTCAACCGCCATgag > 1:1572211/1‑100 (MQ=255) gaagCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCTTCAACCGCCATGAGAAac < 1:2057286/100‑1 (MQ=255) gaagCCGACGAGCAAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCTTCAACCGCCATGAGAAac > 1:2720566/1‑100 (MQ=255) aacgagcgtacggatgatgataaaacgttggcactggcgctgtgggcagagtgagtttctcaTGGCGGTTGAATTGTTGTCTTCAACCGCCATGAGAAac > 1:2743006‑M1/63‑100 (MQ=255) gCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCTTCAACCGCCATGAGAAactca > 1:876547/1‑100 (MQ=255) cctacgaGCTAAGAGCAAAATTTGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCTTCAACCGCCATGAGAAactcac < 1:2170826/97‑1 (MQ=255) cgacgaGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCTTCAACCGCCATGAGAAactcact > 1:1478104/1‑100 (MQ=255) cgacgaGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCTTCAACCGCCATGAGAAactcact < 2:3166069/100‑1 (MQ=255) cgaGCTAAGAGCAAAATTATTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGGTGAATTGTTGTTTTCAACCGTCATGAGAAACTTACTCTg > 1:3075390/1‑100 (MQ=255) gaGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGATGTCTTCAACCGCCATGAGAAACTCACTCTGc < 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2:328743/100‑1 (MQ=255) gTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCTTCAACCGCCATGAGAAACTCACTCTGCCCACAGCGCCAGTGCCAACGTTTTATCATCATCCGTACGCTCGtt < 2:3345055/100‑1 (MQ=255) tttAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCTTCAACCGCCATGAGAAACTCACTCTGCCCACAGCGCCAGTGCCAACGTTTTATCATCATCCGTACGCTCGttt > 2:66347/1‑100 (MQ=255) aCTGGCGGTTGAATTGTTGTCTTCAACCGCCATGAGAAACTCACTCTGCCCACAGCGCCAGTGCCAACGTTTTATCATCATCCGTACGCTCGTTTAccgc > 1:644151/1‑100 (MQ=255) cTGGCGGTTGAATTGTTGTCTTCAACCGCCATGAGAAACTCACTCTGCCCACAGCGCCAGTGCCAACGTTTTATCATCATCCGTACGCTCGTTTAccgcc < 1:800840/100‑1 (MQ=255) | TACCATTGATCCTTTATTGGTCACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCTTCAACCGCCATGAGAAACTCACTCTGCCCACAGCGCCAGTGCCAACGTTTTATCATCATCCGTACGCTCGTTTACCGCC > NC_000913/2151574‑2151771 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |